More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_1910 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012856  Rpic12D_2779  Rieske (2Fe-2S) domain protein  78.62 
 
 
443 aa  684    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.261515  normal  0.259625 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4627  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  77.94 
 
 
417 aa  684    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1910  phthalate 4,5-dioxygenase, oxygenase subunit  100 
 
 
438 aa  914    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.578876  normal  0.581965 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4958  Rieske (2Fe-2S) domain protein  78.62 
 
 
443 aa  684    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.879177  normal  0.275764 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2928  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  73.27 
 
 
445 aa  652    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.149906  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4805  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  76.91 
 
 
443 aa  689    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0495821  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5781  Rieske (2Fe-2S) region  41.13 
 
 
417 aa  288  2e-76  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4882  phthalate 4,5-dioxygenase  34.57 
 
 
422 aa  253  7e-66  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5548  putative Phthalate 4,5-dioxygenase subunit alpha  35.17 
 
 
439 aa  233  5e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7254  Rieske (2Fe-2S) domain protein  33.76 
 
 
430 aa  231  2e-59  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0574  phthalate 4,5-dioxygenase  35.28 
 
 
406 aa  226  8e-58  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.105836  normal  0.217979 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4795  phthalate 4,5-dioxygenase  34.11 
 
 
412 aa  223  4e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.269335  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4881  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  32.96 
 
 
434 aa  219  7e-56  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2370  putative phthalate 4,5-dioxygenase oxygenase subunit (OhpA2)  33.79 
 
 
440 aa  219  8.999999999999998e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000399664  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0877  putative dioxygenase  35.02 
 
 
452 aa  216  8e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.297728  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6982  phthalate 4,5-dioxygenase  33.65 
 
 
438 aa  215  1.9999999999999998e-54  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3537  aromatic acid dioxygenase alpha subunit  35.29 
 
 
440 aa  214  2.9999999999999995e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.329598 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5154  Rieske (2Fe-2S) region  33.25 
 
 
440 aa  214  3.9999999999999995e-54  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.291358  normal  0.277417 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2268  Rieske (2Fe-2S) protein  33.66 
 
 
452 aa  209  9e-53  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0946291  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1175  Phthalate 4,5-dioxygenase  34.09 
 
 
452 aa  208  2e-52  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.769494  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1445  Rieske (2Fe-2S) protein  32.6 
 
 
437 aa  206  5e-52  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.491711  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3532  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  34.7 
 
 
446 aa  205  2e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.048657  normal  0.0515471 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8462  Rieske (2Fe-2S) domain protein  33.49 
 
 
448 aa  204  3e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3529  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  34.32 
 
 
433 aa  199  1.0000000000000001e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.551503  normal  0.104416 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3201  phthalate 4,5-dioxygenase  33.68 
 
 
436 aa  184  3e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2133  twin-arginine translocation pathway signal  31.38 
 
 
484 aa  180  4.999999999999999e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.395399  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6324  phthalate 4,5-dioxygenase  31.19 
 
 
437 aa  178  2e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1044  phthalate 4,5-dioxygenase  32.56 
 
 
454 aa  177  4e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.714091 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3062  phthalate 4,5-dioxygenase  31.55 
 
 
431 aa  172  1e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.021682 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2359  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  29.83 
 
 
410 aa  172  1e-41  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.128163  normal  0.731078 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4297  phthalate 4,5-dioxygenase  30.4 
 
 
392 aa  163  5.0000000000000005e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1687  Rieske (2Fe-2S) domain protein  29.95 
 
 
449 aa  156  6e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0555  phthalate 4,5-dioxygenase  31.43 
 
 
470 aa  154  2e-36  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.547165  normal  0.18525 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5901  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  29.4 
 
 
408 aa  147  5e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00683325  hitchhiker  0.00740172 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5678  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  30.4 
 
 
408 aa  146  8.000000000000001e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.0000120872  normal  0.0293014 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1473  Rieske (2Fe-2S) region  28.39 
 
 
398 aa  128  2.0000000000000002e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.826795  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1543  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  27.8 
 
 
519 aa  127  3e-28  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.453445  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1001  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  25.38 
 
 
380 aa  104  3e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2036  hypothetical protein  29.38 
 
 
334 aa  97.4  4e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.502892  normal 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_43309  predicted protein  28.95 
 
 
492 aa  88.2  2e-16  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.231154  hitchhiker  0.00124797 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1184  Rieske (2Fe-2S) domain protein  23.18 
 
 
358 aa  89  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2492  vanillate O-demethylase oxygenase subunit  28.42 
 
 
315 aa  85.5  0.000000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2050  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  29.52 
 
 
327 aa  84.3  0.000000000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0319051  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2686  Rieske (2Fe-2S) protein  33.33 
 
 
376 aa  84.3  0.000000000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2687  Rieske (2Fe-2S) protein  32.48 
 
 
356 aa  84  0.000000000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2137  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  28.12 
 
 
450 aa  81.6  0.00000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6610  vanillate demethylase oxygenase subunit  28.39 
 
 
380 aa  79  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.581564  normal  0.184804 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2035  hypothetical protein  25.99 
 
 
345 aa  78.6  0.0000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5029  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  27.23 
 
 
359 aa  78.2  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.773131 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4245  Rieske (2Fe-2S) domain protein  30.43 
 
 
371 aa  77.4  0.0000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5693  Rieske (2Fe-2S) domain protein  25.97 
 
 
352 aa  76.6  0.0000000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64800  vanillate O-demethylase oxygenase subunit  27.17 
 
 
351 aa  76.6  0.0000000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0565633  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1827  Rieske (2Fe-2S) region  28.57 
 
 
347 aa  76.3  0.000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3214  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  26.88 
 
 
347 aa  76.3  0.000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0195459 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1185  Rieske (2Fe-2S) domain protein  23.81 
 
 
364 aa  76.3  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3124  Rieske (2Fe-2S) region  26.7 
 
 
359 aa  76.3  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.439622  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5243  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  26.7 
 
 
359 aa  76.3  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0344  Rieske (2Fe-2S) protein  26.63 
 
 
353 aa  75.1  0.000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0795  Rieske (2Fe-2S) domain protein  28.86 
 
 
497 aa  74.7  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.266613  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4278  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  23.78 
 
 
362 aa  74.7  0.000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.844018 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2725  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  25.4 
 
 
354 aa  74.3  0.000000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0149406 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1103  Rieske (2Fe-2S) domain protein  28.12 
 
 
362 aa  74.3  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4591  vanillate monooxygenase  25.62 
 
 
373 aa  74.3  0.000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.672566 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1649  Rieske (2Fe-2S) domain protein  29.89 
 
 
370 aa  73.9  0.000000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0481  Rieske (2Fe-2S) iron-sulfur domain-containing protein  29.61 
 
 
353 aa  73.9  0.000000000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0971818  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3410  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  27.51 
 
 
357 aa  73.6  0.000000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0474443 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2045  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  25.82 
 
 
355 aa  73.6  0.000000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5124  vanillate monooxygenase  25.79 
 
 
359 aa  73.6  0.000000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.14115  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1550  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  23.05 
 
 
353 aa  73.6  0.000000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.276626  normal  0.0604744 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0769  Rieske (2Fe-2S) domain protein  29.29 
 
 
497 aa  73.6  0.000000000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4769  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  28.08 
 
 
367 aa  73.6  0.000000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.289545  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2074  Rieske (2Fe-2S) domain protein  36.63 
 
 
217 aa  73.2  0.000000000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.12491  normal  0.0463704 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2825  iron-sulfur cluster-binding protein, Rieske family  31.62 
 
 
358 aa  73.2  0.000000000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.000971916  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5789  Rieske (2Fe-2S) region  26.36 
 
 
349 aa  73.2  0.000000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1530  Rieske (2Fe-2S) domain protein  23.67 
 
 
450 aa  72.4  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3736  Rieske (2Fe-2S) domain protein  25.27 
 
 
355 aa  71.6  0.00000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.554225  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1220  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  30.73 
 
 
334 aa  72.4  0.00000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0507919  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1056  Rieske (2Fe-2S) region  26.67 
 
 
499 aa  72  0.00000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00144994  hitchhiker  0.000116875 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1377  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  30.73 
 
 
334 aa  72.4  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2170  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  25.82 
 
 
355 aa  72  0.00000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.461217  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2607  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  30.73 
 
 
334 aa  72.4  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1241  Rieske (2Fe-2S) domain protein  34.96 
 
 
217 aa  72.4  0.00000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.635525  normal  0.124818 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0463  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  30.73 
 
 
334 aa  72.4  0.00000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1296  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  25.54 
 
 
367 aa  72.4  0.00000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.85642 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0187  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  30.73 
 
 
334 aa  72.4  0.00000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.531075  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1557  Rieske (2Fe-2S) domain protein  23.67 
 
 
450 aa  72  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0276963  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1485  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  25.97 
 
 
343 aa  72  0.00000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1112  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  30.73 
 
 
334 aa  72.4  0.00000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.624843  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1464  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  30.73 
 
 
326 aa  72  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.134829  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1130  Rieske (2Fe-2S) domain protein  26.88 
 
 
362 aa  71.6  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0812255  normal  0.937672 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5628  vanillate O-demethylase oxygenase subunit  27.12 
 
 
351 aa  71.2  0.00000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.834519  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1676  Rieske (2Fe-2S) domain protein  29.61 
 
 
349 aa  71.2  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.945696  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2027  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  24.86 
 
 
355 aa  71.2  0.00000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4419  Rieske (2Fe-2S) iron-sulfur domain-containing protein  31.94 
 
 
367 aa  70.9  0.00000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.257041  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0420  Rieske (2Fe-2S) protein  27.22 
 
 
373 aa  70.9  0.00000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2919  Rieske (2Fe-2S) domain protein  28.21 
 
 
338 aa  70.9  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.563703  normal 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_26228  predicted protein  28.85 
 
 
668 aa  70.5  0.00000000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.281249  normal  0.273766 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1355  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  26.88 
 
 
358 aa  70.5  0.00000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3567  Rieske (2Fe-2S) domain protein  27.98 
 
 
344 aa  70.5  0.00000000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0222  vanillate O-demethylase oxygenase subunit oxidoreductase protein  22.35 
 
 
342 aa  69.7  0.0000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.0000016692  normal  0.0221534 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>