More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_1001 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008726  Mvan_1001  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  100 
 
 
380 aa  780    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1687  Rieske (2Fe-2S) domain protein  33.52 
 
 
449 aa  169  7e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3062  phthalate 4,5-dioxygenase  31 
 
 
431 aa  151  2e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.021682 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3201  phthalate 4,5-dioxygenase  29.77 
 
 
436 aa  151  2e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5678  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  31.02 
 
 
408 aa  144  2e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.0000120872  normal  0.0293014 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5901  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  31.02 
 
 
408 aa  144  3e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00683325  hitchhiker  0.00740172 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1445  Rieske (2Fe-2S) protein  27.68 
 
 
437 aa  140  3e-32  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.491711  normal 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5154  Rieske (2Fe-2S) region  25.94 
 
 
440 aa  134  3.9999999999999996e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.291358  normal  0.277417 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2359  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  28.8 
 
 
410 aa  132  1.0000000000000001e-29  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.128163  normal  0.731078 
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7254  Rieske (2Fe-2S) domain protein  29.07 
 
 
430 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5781  Rieske (2Fe-2S) region  28.79 
 
 
417 aa  124  2e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2268  Rieske (2Fe-2S) protein  26.92 
 
 
452 aa  123  6e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0946291  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6982  phthalate 4,5-dioxygenase  26.07 
 
 
438 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6324  phthalate 4,5-dioxygenase  36.57 
 
 
437 aa  122  9.999999999999999e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4297  phthalate 4,5-dioxygenase  30.69 
 
 
392 aa  121  1.9999999999999998e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1175  Phthalate 4,5-dioxygenase  25.9 
 
 
452 aa  121  3e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.769494  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0877  putative dioxygenase  25.63 
 
 
452 aa  119  7e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.297728  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8462  Rieske (2Fe-2S) domain protein  25.85 
 
 
448 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1473  Rieske (2Fe-2S) region  27.13 
 
 
398 aa  117  3.9999999999999997e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.826795  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0574  phthalate 4,5-dioxygenase  26.95 
 
 
406 aa  115  1.0000000000000001e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.105836  normal  0.217979 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3529  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  26.68 
 
 
433 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.551503  normal  0.104416 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3532  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  26.84 
 
 
446 aa  113  6e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.048657  normal  0.0515471 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3537  aromatic acid dioxygenase alpha subunit  27.18 
 
 
440 aa  107  3e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.329598 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5548  putative Phthalate 4,5-dioxygenase subunit alpha  26.22 
 
 
439 aa  107  5e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4795  phthalate 4,5-dioxygenase  24.61 
 
 
412 aa  106  6e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.269335  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1185  Rieske (2Fe-2S) domain protein  33.13 
 
 
364 aa  105  1e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2370  putative phthalate 4,5-dioxygenase oxygenase subunit (OhpA2)  30.36 
 
 
440 aa  105  2e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000399664  normal 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4627  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  26.61 
 
 
417 aa  102  1e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0555  phthalate 4,5-dioxygenase  26.59 
 
 
470 aa  102  1e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.547165  normal  0.18525 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4805  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  26.89 
 
 
443 aa  102  1e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0495821  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4882  phthalate 4,5-dioxygenase  26.13 
 
 
422 aa  102  2e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1044  phthalate 4,5-dioxygenase  25.95 
 
 
454 aa  100  4e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.714091 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1184  Rieske (2Fe-2S) domain protein  36.31 
 
 
358 aa  100  5e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2928  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  27.44 
 
 
445 aa  100  5e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.149906  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2035  hypothetical protein  26.67 
 
 
345 aa  99.8  8e-20  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4958  Rieske (2Fe-2S) domain protein  26.55 
 
 
443 aa  98.6  2e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.879177  normal  0.275764 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4340  Rieske (2Fe-2S) region  31.72 
 
 
350 aa  98.2  2e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2779  Rieske (2Fe-2S) domain protein  26.55 
 
 
443 aa  98.6  2e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.261515  normal  0.259625 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2036  hypothetical protein  32.11 
 
 
334 aa  97.1  5e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.502892  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4881  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  24.05 
 
 
434 aa  96.3  8e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1009  vanillate demethylase  27.27 
 
 
353 aa  96.3  8e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0048453  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1910  phthalate 4,5-dioxygenase, oxygenase subunit  25.32 
 
 
438 aa  95.5  1e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.578876  normal  0.581965 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2133  twin-arginine translocation pathway signal  23.1 
 
 
484 aa  95.5  1e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.395399  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2239  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  35.07 
 
 
350 aa  95.5  1e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1389  putative oxygenase  32.7 
 
 
359 aa  95.9  1e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2686  Rieske (2Fe-2S) protein  31.58 
 
 
376 aa  94.4  3e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4419  Rieske (2Fe-2S) iron-sulfur domain-containing protein  39.67 
 
 
367 aa  94  4e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.257041  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0504  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  31.61 
 
 
337 aa  93.2  7e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.725699  normal  0.611545 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1004  putative vanillate O-demethylase oxygenase subunit A  32.22 
 
 
353 aa  93.2  7e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.413289  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2919  Rieske (2Fe-2S) domain protein  27.03 
 
 
338 aa  92.8  8e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.563703  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2492  vanillate O-demethylase oxygenase subunit  28.45 
 
 
315 aa  90.9  3e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1001  putative vanillate O-demethylase oxygenase subunit A  31.67 
 
 
349 aa  90.9  3e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.8149  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5546  putative vanillate O-demethylase oxygenase subunit (4-hydroxy- 3-methoxybenzoate demethylase)  27.35 
 
 
347 aa  91.3  3e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0576  Rieske (2Fe-2S) region  35.93 
 
 
323 aa  90.9  3e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2516  Rieske (2Fe-2S) domain protein  31.33 
 
 
326 aa  90.9  4e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00793645  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1543  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  28.52 
 
 
519 aa  90.5  4e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.453445  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2918  Rieske (2Fe-2S) domain protein  29.91 
 
 
337 aa  89  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.333438  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6610  vanillate demethylase oxygenase subunit  34.09 
 
 
380 aa  88.2  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.581564  normal  0.184804 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0837  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  29.89 
 
 
346 aa  88.2  2e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.558436  normal  0.660482 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2285  vanillate monooxygenase  30.77 
 
 
367 aa  88.2  2e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.138524 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0993  Rieske (2Fe-2S) region  24.86 
 
 
350 aa  87.8  3e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  unclonable  0.00000318811 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2013  Rieske (2Fe-2S) family oxidoreductase large subunit  32.73 
 
 
348 aa  87  4e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1105  Rieske (2Fe-2S) protein  32.37 
 
 
358 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.080608  normal  0.368914 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3984  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  31.79 
 
 
356 aa  85.9  0.000000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.643695  normal  0.0193847 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3952  Rieske (2Fe-2S) protein  30.06 
 
 
340 aa  85.9  0.000000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.13771  normal  0.112958 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4895  Vanillate monooxygenase  31.88 
 
 
336 aa  85.9  0.000000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.802026  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2305  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  34.68 
 
 
352 aa  85.1  0.000000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.560893  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2297  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  34.68 
 
 
352 aa  85.1  0.000000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.125012  normal  0.643759 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0630  Rieske (2Fe-2S) domain protein  32.14 
 
 
353 aa  85.1  0.000000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.494266  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7085  Rieske (2Fe-2S) domain protein  32.34 
 
 
406 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4769  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  30.22 
 
 
367 aa  85.1  0.000000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.289545  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2137  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  28.07 
 
 
450 aa  84.7  0.000000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2258  Rieske (2Fe-2S) region  34.68 
 
 
352 aa  85.1  0.000000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.236496  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5422  oxidoreductase protein  34.96 
 
 
230 aa  85.1  0.000000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.20856  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4330  vanillate monooxygenase  28.83 
 
 
366 aa  85.5  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0440139 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1103  Rieske (2Fe-2S) domain protein  34.39 
 
 
362 aa  84.7  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5591  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  31.22 
 
 
356 aa  84.3  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00790855 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2825  iron-sulfur cluster-binding protein, Rieske family  22.67 
 
 
358 aa  84.7  0.000000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.000971916  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2500  Rieske (2Fe-2S) region  34.71 
 
 
359 aa  84.3  0.000000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.455012 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0481  Rieske (2Fe-2S) iron-sulfur domain-containing protein  33.14 
 
 
353 aa  84.3  0.000000000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0971818  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3658  Rieske (2Fe-2S) region  31.22 
 
 
356 aa  84.3  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4709  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  31.22 
 
 
356 aa  84.3  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.700082  normal  0.155037 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7059  Rieske (2Fe-2S) domain protein  32.37 
 
 
364 aa  84  0.000000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.2387  normal  0.465604 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4233  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  26.59 
 
 
362 aa  84  0.000000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3671  oxidoreductase alpha subunit  32.02 
 
 
407 aa  84  0.000000000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0725789  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1812  Rieske (2Fe-2S) region  33.33 
 
 
383 aa  83.6  0.000000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0372125 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1535  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  29.17 
 
 
331 aa  83.6  0.000000000000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2979  Rieske (2Fe-2S) domain protein  30.13 
 
 
367 aa  83.6  0.000000000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0175  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  27.38 
 
 
363 aa  83.6  0.000000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0132  Rieske (2Fe-2S) protein  32.59 
 
 
343 aa  83.6  0.000000000000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5789  Rieske (2Fe-2S) region  35.96 
 
 
349 aa  83.2  0.000000000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0396  Rieske (2Fe-2S) domain protein  32.75 
 
 
360 aa  83.2  0.000000000000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.547393 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0203  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  32.34 
 
 
406 aa  83.2  0.000000000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1589  Rieske (2Fe-2S) region  33.13 
 
 
371 aa  83.2  0.000000000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.577114  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6242  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  33.13 
 
 
371 aa  83.2  0.000000000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.718979  normal  0.984052 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3542  vanillate O-demethylase oxygenase subunit  30.06 
 
 
345 aa  82.8  0.000000000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.10385 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3574  Rieske (2Fe-2S) region  31.33 
 
 
349 aa  82.8  0.000000000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4568  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  27.27 
 
 
356 aa  83.2  0.000000000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.380862  hitchhiker  0.000303241 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6718  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  33.13 
 
 
371 aa  82.8  0.000000000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2494  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  27.67 
 
 
355 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>