More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_2979 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011729  PCC7424_2979  Rieske (2Fe-2S) domain protein  100 
 
 
367 aa  763    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1827  Rieske (2Fe-2S) region  36.47 
 
 
347 aa  226  5.0000000000000005e-58  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3574  Rieske (2Fe-2S) region  34.53 
 
 
349 aa  214  1.9999999999999998e-54  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1103  Rieske (2Fe-2S) domain protein  34.93 
 
 
362 aa  210  3e-53  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1130  Rieske (2Fe-2S) domain protein  34.03 
 
 
362 aa  202  7e-51  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0812255  normal  0.937672 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4257  Rieske (2Fe-2S) domain protein  34.31 
 
 
349 aa  199  3.9999999999999996e-50  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1016  dioxygenase, iron-sulfur subunit, putative  32.66 
 
 
369 aa  196  4.0000000000000005e-49  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.621392  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1459  Rieske (2Fe-2S) domain protein  30.75 
 
 
357 aa  152  8e-36  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0280358  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2482  Rieske (2Fe-2S) domain protein  30.96 
 
 
362 aa  151  2e-35  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0396  Rieske (2Fe-2S) domain protein  29.28 
 
 
360 aa  147  4.0000000000000006e-34  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.547393 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7085  Rieske (2Fe-2S) domain protein  28.4 
 
 
406 aa  143  4e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0203  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  28.11 
 
 
406 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4992  Rieske (2Fe-2S) region  27.3 
 
 
366 aa  141  1.9999999999999998e-32  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2035  hypothetical protein  30.67 
 
 
345 aa  139  7.999999999999999e-32  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3626  Rieske (2Fe-2S) domain protein  29.1 
 
 
362 aa  139  1e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.54925  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2036  hypothetical protein  29.69 
 
 
334 aa  137  2e-31  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.502892  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1812  Rieske (2Fe-2S) region  25.52 
 
 
383 aa  137  3.0000000000000003e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0372125 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5354  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  27.13 
 
 
370 aa  133  5e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.111829  normal  0.289416 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6718  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  27.78 
 
 
371 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6242  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  27.78 
 
 
371 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.718979  normal  0.984052 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1589  Rieske (2Fe-2S) region  27.78 
 
 
371 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.577114  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6662  dioxygenase, iron-sulfur subunit  27.49 
 
 
371 aa  129  7.000000000000001e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0364205  normal  0.0470201 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5718  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  29.29 
 
 
373 aa  125  9e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.592667 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5962  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  28.93 
 
 
373 aa  124  3e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.314282  normal  0.602397 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4103  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  26.63 
 
 
374 aa  123  6e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1185  Rieske (2Fe-2S) domain protein  38.1 
 
 
364 aa  115  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1184  Rieske (2Fe-2S) domain protein  32.42 
 
 
358 aa  110  6e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1872  Rieske (2Fe-2S) protein  30.69 
 
 
356 aa  107  3e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.171768  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2285  vanillate monooxygenase  35.67 
 
 
367 aa  105  1e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.138524 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3542  vanillate O-demethylase oxygenase subunit  30.54 
 
 
345 aa  102  8e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.10385 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2297  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  29.91 
 
 
352 aa  101  2e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.125012  normal  0.643759 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2305  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  29.91 
 
 
352 aa  101  2e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.560893  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2258  Rieske (2Fe-2S) region  29.91 
 
 
352 aa  101  2e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.236496  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26080  vanillate demethylase subunit A  23.96 
 
 
377 aa  101  2e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.819244  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1368  vanillate monooxygenase  31.53 
 
 
352 aa  100  3e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1352  vanillate monooxygenase  24.7 
 
 
363 aa  100  4e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5789  Rieske (2Fe-2S) region  27.32 
 
 
349 aa  97.4  3e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1687  vanillate monooxygenase  25.97 
 
 
338 aa  97.8  3e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2184  vanillate O-demethylase oxygenase, iron-sulfur subunit  32.1 
 
 
347 aa  97.4  3e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2050  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  31.84 
 
 
327 aa  97.4  3e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0319051  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4330  vanillate monooxygenase  27.46 
 
 
366 aa  97.8  3e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0440139 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7105  Rieske (2Fe-2S) domain protein  32.28 
 
 
361 aa  97.4  3e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.811582  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1575  Rieske (2Fe-2S) protein  32.91 
 
 
346 aa  97.4  4e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.869006  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4769  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  27.75 
 
 
367 aa  96.7  7e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.289545  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0481  Rieske (2Fe-2S) iron-sulfur domain-containing protein  27.1 
 
 
353 aa  95.5  1e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0971818  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6610  vanillate demethylase oxygenase subunit  31.52 
 
 
380 aa  95.9  1e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.581564  normal  0.184804 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1009  vanillate demethylase  30.68 
 
 
353 aa  95.9  1e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0048453  normal 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_43309  predicted protein  30.41 
 
 
492 aa  95.9  1e-18  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.231154  hitchhiker  0.00124797 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6483  Rieske (2Fe-2S) region  30.85 
 
 
358 aa  95.1  2e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1137  vanillate monooxygenase  31.41 
 
 
350 aa  95.1  2e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.684708  hitchhiker  0.000140047 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5800  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  30.86 
 
 
354 aa  95.1  2e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00198597 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2492  vanillate O-demethylase oxygenase subunit  26.67 
 
 
315 aa  94.4  3e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2310  vanillate monooxygenase  24.35 
 
 
362 aa  93.6  4e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0218143 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0127  Rieske (2Fe-2S) protein  34.06 
 
 
355 aa  92.8  8e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1296  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  31.41 
 
 
367 aa  92.4  1e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.85642 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0787  Rieske (2Fe-2S) protein  30.56 
 
 
351 aa  92.4  1e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.466147 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2825  iron-sulfur cluster-binding protein, Rieske family  23.51 
 
 
358 aa  91.7  2e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.000971916  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2725  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  24.93 
 
 
354 aa  92  2e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0149406 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0280  Rieske (2Fe-2S) protein  25.86 
 
 
351 aa  91.3  2e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.226935  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3387  Rieske (2Fe-2S) region  29.34 
 
 
369 aa  91.7  2e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.662042  normal  0.0218971 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4510  Rieske (2Fe-2S) domain protein  34.13 
 
 
355 aa  91.3  2e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4642  Rieske (2Fe-2S) domain protein  34.13 
 
 
355 aa  91.3  2e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.44027  normal  0.0329483 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2355  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  32.77 
 
 
349 aa  91.3  3e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.725754  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2137  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  28.95 
 
 
450 aa  90.5  4e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0741  Rieske (2Fe-2S) protein  24.68 
 
 
382 aa  90.5  5e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0606248 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1867  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  27.05 
 
 
388 aa  90.5  5e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.687816 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5693  Rieske (2Fe-2S) domain protein  23.81 
 
 
352 aa  90.1  6e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3570  Rieske (2Fe-2S) region  36.05 
 
 
355 aa  89.4  9e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0161982  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0964  Rieske (2Fe-2S) domain protein  30.05 
 
 
468 aa  89.4  9e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.1498 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3154  Rieske (2Fe-2S) domain protein  34.04 
 
 
221 aa  89  1e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.647374  normal  0.386497 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0222  vanillate O-demethylase oxygenase subunit oxidoreductase protein  25.3 
 
 
342 aa  88.2  2e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.0000016692  normal  0.0221534 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1557  Rieske (2Fe-2S) domain protein  24.14 
 
 
450 aa  87.8  2e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0276963  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0807  vanillate O-demethylase oxygenase subunit  30.29 
 
 
331 aa  88.2  2e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0707  Rieske (2Fe-2S) protein  29.78 
 
 
341 aa  88.6  2e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.537419  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1530  Rieske (2Fe-2S) domain protein  24.14 
 
 
450 aa  87.8  3e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1908  Rieske (2Fe-2S) protein  29.79 
 
 
347 aa  87.4  3e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.127579  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3214  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  31.21 
 
 
347 aa  87.4  3e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0195459 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3681  Rieske (2Fe-2S) region  30.27 
 
 
346 aa  87.4  4e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.2267  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1067  vanillate monooxygenase  31.79 
 
 
359 aa  86.7  6e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.535746  normal  0.0980736 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1241  Rieske (2Fe-2S) domain protein  33.07 
 
 
217 aa  86.7  6e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.635525  normal  0.124818 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4244  Rieske (2Fe-2S) domain protein  33.09 
 
 
352 aa  86.7  6e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4516  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  22.88 
 
 
373 aa  86.7  6e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0964  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  31.48 
 
 
341 aa  86.3  7e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6021  Rieske (2Fe-2S) domain protein  30.63 
 
 
344 aa  86.3  7e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.174244  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4269  vanillate monooxygenase  30.3 
 
 
351 aa  86.7  7e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.846398 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2074  Rieske (2Fe-2S) domain protein  33.06 
 
 
217 aa  86.7  7e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.12491  normal  0.0463704 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2516  Rieske (2Fe-2S) domain protein  30.54 
 
 
326 aa  85.5  0.000000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00793645  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1543  vanillate monooxygenase  27.1 
 
 
366 aa  85.5  0.000000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.111008  hitchhiker  0.00152746 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2143  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  35.45 
 
 
372 aa  85.9  0.000000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.444634  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4139  Vanillate monooxygenase  29.79 
 
 
347 aa  85.5  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.105569  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4340  Rieske (2Fe-2S) region  28.4 
 
 
350 aa  84.7  0.000000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3024  vanillate monooxygenase  29.14 
 
 
361 aa  85.1  0.000000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7059  Rieske (2Fe-2S) domain protein  31.28 
 
 
364 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.2387  normal  0.465604 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0630  Rieske (2Fe-2S) domain protein  26.67 
 
 
353 aa  85.1  0.000000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.494266  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5546  putative vanillate O-demethylase oxygenase subunit (4-hydroxy- 3-methoxybenzoate demethylase)  29.01 
 
 
347 aa  84.7  0.000000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1687  Rieske (2Fe-2S) domain protein  27.66 
 
 
449 aa  84.7  0.000000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1001  putative vanillate O-demethylase oxygenase subunit A  26.04 
 
 
349 aa  85.5  0.000000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.8149  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0218  Rieske iron-sulfur protein 2Fe-2S subunit  27.37 
 
 
444 aa  84.3  0.000000000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.163513  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08501  Rieske iron-sulfur protein 2Fe-2S subunit  27.37 
 
 
444 aa  84.3  0.000000000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00185666 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1485  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  31.41 
 
 
343 aa  84.7  0.000000000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>