More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_1812 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007973  Rmet_1812  Rieske (2Fe-2S) region  100 
 
 		 383 aa  795    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0372125 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5354  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  76.73 
 
 		 370 aa  585  1e-166  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.111829  normal  0.289416 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6662  dioxygenase, iron-sulfur subunit  75.82 
 
 		 371 aa  583  1.0000000000000001e-165  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0364205  normal  0.0470201 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5718  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  78.22 
 
 		 373 aa  580  1e-164  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.592667 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6718  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  77.84 
 
 		 371 aa  578  1e-164  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6242  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  78.12 
 
 		 371 aa  580  1e-164  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.718979  normal  0.984052 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1589  Rieske (2Fe-2S) region  78.12 
 
 		 371 aa  580  1e-164  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.577114  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5962  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  78.22 
 
 		 373 aa  580  1e-164  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.314282  normal  0.602397 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7085  Rieske (2Fe-2S) domain protein  74.66 
 
 		 406 aa  567  1e-160  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0203  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  74.31 
 
 		 406 aa  562  1.0000000000000001e-159  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4103  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  74.02 
 
 		 374 aa  552  1e-156  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0396  Rieske (2Fe-2S) domain protein  65.07 
 
 		 360 aa  456  1e-127  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.547393 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1459  Rieske (2Fe-2S) domain protein  61.1 
 
 		 357 aa  446  1.0000000000000001e-124  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0280358  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4992  Rieske (2Fe-2S) region  50 
 
 		 366 aa  353  2e-96  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3626  Rieske (2Fe-2S) domain protein  50 
 
 		 362 aa  353  2.9999999999999997e-96  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.54925  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2482  Rieske (2Fe-2S) domain protein  49.85 
 
 		 362 aa  351  1e-95  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1016  dioxygenase, iron-sulfur subunit, putative  31.4 
 
 		 369 aa  162  1e-38  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.621392  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2979  Rieske (2Fe-2S) domain protein  25.79 
 
 		 367 aa  137  5e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1103  Rieske (2Fe-2S) domain protein  29.78 
 
 		 362 aa  132  6.999999999999999e-30  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1130  Rieske (2Fe-2S) domain protein  28.29 
 
 		 362 aa  127  5e-28  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0812255  normal  0.937672 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1827  Rieske (2Fe-2S) region  40.34 
 
 		 347 aa  121  1.9999999999999998e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4257  Rieske (2Fe-2S) domain protein  34.83 
 
 		 349 aa  121  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3574  Rieske (2Fe-2S) region  32.99 
 
 		 349 aa  118  1.9999999999999998e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0630  Rieske (2Fe-2S) domain protein  35.37 
 
 		 353 aa  117  3e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.494266  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3542  vanillate O-demethylase oxygenase subunit  36.75 
 
 		 345 aa  117  3.9999999999999997e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.10385 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0993  Rieske (2Fe-2S) region  33.51 
 
 		 350 aa  113  4.0000000000000004e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000318811 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1575  Rieske (2Fe-2S) protein  36.77 
 
 		 346 aa  113  6e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.869006  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1549  vanillate monooxygenase  39.62 
 
 		 359 aa  112  7.000000000000001e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.619122  normal  0.0130812 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4895  Vanillate monooxygenase  36.9 
 
 		 336 aa  111  2.0000000000000002e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.802026  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5546  putative vanillate O-demethylase oxygenase subunit (4-hydroxy- 3-methoxybenzoate demethylase)  28.75 
 
 		 347 aa  109  1e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1687  vanillate monooxygenase  35.36 
 
 		 338 aa  108  2e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4861  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  36.57 
 
 		 365 aa  107  4e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.641783  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2184  vanillate O-demethylase oxygenase, iron-sulfur subunit  36.59 
 
 		 347 aa  105  1e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1009  vanillate demethylase  35.5 
 
 		 353 aa  105  1e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0048453  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4340  Rieske (2Fe-2S) region  34.15 
 
 		 350 aa  105  2e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1488  Rieske (2Fe-2S) protein  29.88 
 
 		 351 aa  105  2e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2285  vanillate monooxygenase  36.36 
 
 		 367 aa  103  5e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.138524 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2035  hypothetical protein  34.73 
 
 		 345 aa  103  6e-21  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3413  vanillate monooxygenase  27.88 
 
 		 345 aa  103  7e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.166087 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10960  ferridoxin oxidoreductase subunit  35.68 
 
 		 370 aa  103  7e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2036  hypothetical protein  33.72 
 
 		 334 aa  101  2e-20  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.502892  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0418  Rieske (2Fe-2S) protein  34.32 
 
 		 353 aa  100  4e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.842278  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1550  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  35.46 
 
 		 353 aa  100  5e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.276626  normal  0.0604744 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26080  vanillate demethylase subunit A  32.1 
 
 		 377 aa  100  6e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.819244  normal  1 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6483  Rieske (2Fe-2S) region  33.92 
 
 		 358 aa  98.6  1e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1368  vanillate monooxygenase  33.54 
 
 		 352 aa  99  1e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1355  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  32.8 
 
 		 358 aa  99  1e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6309  Rieske (2Fe-2S) domain protein  31.48 
 
 		 341 aa  98.6  1e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.241664  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1543  vanillate monooxygenase  34.97 
 
 		 366 aa  99.4  1e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.111008  hitchhiker  0.00152746 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3387  Rieske (2Fe-2S) region  36.23 
 
 		 369 aa  98.2  2e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.662042  normal  0.0218971 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3416  vanillate monooxygenase  30.41 
 
 		 342 aa  97.8  3e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0799476 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1552  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  33.17 
 
 		 367 aa  97.8  3e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.190198 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4278  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  35.11 
 
 		 362 aa  97.4  4e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.844018 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1185  Rieske (2Fe-2S) domain protein  32.76 
 
 		 364 aa  97.4  4e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0127  Rieske (2Fe-2S) protein  36.47 
 
 		 355 aa  97.1  5e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7105  Rieske (2Fe-2S) domain protein  34.36 
 
 		 361 aa  96.7  6e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.811582  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4330  vanillate monooxygenase  29.55 
 
 		 366 aa  96.7  6e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0440139 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1137  vanillate monooxygenase  31.48 
 
 		 350 aa  96.7  7e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.684708  hitchhiker  0.000140047 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1067  vanillate monooxygenase  32.81 
 
 		 359 aa  96.3  8e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.535746  normal  0.0980736 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2919  Rieske (2Fe-2S) domain protein  34.64 
 
 		 338 aa  95.5  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.563703  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5126  vanillate monooxygenase  31.64 
 
 		 352 aa  94.7  2e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3952  Rieske (2Fe-2S) protein  34.81 
 
 		 340 aa  95.1  2e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.13771  normal  0.112958 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0963  vanillate O-demethylase oxygenase subunit  34.34 
 
 		 350 aa  94.7  2e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4269  vanillate monooxygenase  38.61 
 
 		 351 aa  95.1  2e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.846398 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1370  vanillate monooxygenase  32.63 
 
 		 363 aa  94.4  3e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3671  oxidoreductase alpha subunit  29.52 
 
 		 407 aa  94  4e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0725789  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1872  Rieske (2Fe-2S) protein  32.28 
 
 		 356 aa  94  4e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.171768  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2310  vanillate monooxygenase  34.59 
 
 		 362 aa  94  4e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0218143 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1184  Rieske (2Fe-2S) domain protein  32.93 
 
 		 358 aa  93.6  5e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5678  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  29.83 
 
 		 408 aa  93.2  6e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.0000120872  normal  0.0293014 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5901  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  29.83 
 
 		 408 aa  93.2  6e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00683325  hitchhiker  0.00740172 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1686  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  34.32 
 
 		 357 aa  93.2  7e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4273  vanillate monooxygenase  34.5 
 
 		 350 aa  93.2  7e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.35045 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2826  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  31.91 
 
 		 424 aa  93.2  8e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0328786  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5029  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  32.32 
 
 		 359 aa  92.8  9e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.773131 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5789  Rieske (2Fe-2S) region  30.49 
 
 		 349 aa  92.4  1e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5693  Rieske (2Fe-2S) domain protein  34.76 
 
 		 352 aa  92  1e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1559  vanillate monooxygenase  35.67 
 
 		 347 aa  92.4  1e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.662697  normal  0.47859 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2454  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  31.89 
 
 		 421 aa  92  1e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000486629  normal  0.341461 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5124  vanillate monooxygenase  31.71 
 
 		 359 aa  91.3  2e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.14115  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0627  Rieske (2Fe-2S) domain protein  31.91 
 
 		 361 aa  91.7  2e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4593  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  30.51 
 
 		 353 aa  91.7  2e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.743349  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5243  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  31.71 
 
 		 359 aa  90.9  3e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7059  Rieske (2Fe-2S) domain protein  32.44 
 
 		 364 aa  91.3  3e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.2387  normal  0.465604 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2013  Rieske (2Fe-2S) family oxidoreductase large subunit  36.31 
 
 		 348 aa  91.3  3e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3124  Rieske (2Fe-2S) region  31.71 
 
 		 359 aa  90.9  3e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.439622  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0420  Rieske (2Fe-2S) protein  32.1 
 
 		 373 aa  90.5  4e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3214  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  32.72 
 
 		 347 aa  90.9  4e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0195459 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4769  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  32.99 
 
 		 367 aa  90.1  5e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.289545  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4591  vanillate monooxygenase  29.67 
 
 		 373 aa  90.5  5e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.672566 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2050  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  29.65 
 
 		 327 aa  90.1  6e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0319051  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0707  Rieske (2Fe-2S) protein  33.54 
 
 		 341 aa  90.1  6e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.537419  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0175  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  32.44 
 
 		 363 aa  90.1  6e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1001  putative vanillate O-demethylase oxygenase subunit A  32.73 
 
 		 349 aa  89.7  7e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.8149  normal  1 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_43309  predicted protein  32.57 
 
 		 492 aa  89.4  9e-17  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.231154  hitchhiker  0.00124797 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3212  Rieske 2Fe-2S family protein  31.34 
 
 		 341 aa  89.4  1e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0769  Rieske (2Fe-2S) domain protein  27.45 
 
 		 497 aa  89  1e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2725  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  34.25 
 
 		 354 aa  89.4  1e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0149406 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0280  Rieske (2Fe-2S) protein  31.71 
 
 		 351 aa  89  1e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.226935  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0344  Rieske (2Fe-2S) protein  31.48 
 
 		 353 aa  89  1e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>