More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_1459 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011365  Gdia_1459  Rieske (2Fe-2S) domain protein  100 
 
 		 357 aa  741    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0280358  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0396  Rieske (2Fe-2S) domain protein  71.43 
 
 		 360 aa  510  1e-143  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.547393 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1589  Rieske (2Fe-2S) region  60.11 
 
 		 371 aa  453  1.0000000000000001e-126  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.577114  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6718  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  59.83 
 
 		 371 aa  452  1.0000000000000001e-126  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6242  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  60.11 
 
 		 371 aa  453  1.0000000000000001e-126  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.718979  normal  0.984052 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5718  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  60.22 
 
 		 373 aa  448  1e-125  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.592667 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6662  dioxygenase, iron-sulfur subunit  61.16 
 
 		 371 aa  447  1.0000000000000001e-124  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0364205  normal  0.0470201 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1812  Rieske (2Fe-2S) region  61.1 
 
 		 383 aa  447  1.0000000000000001e-124  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0372125 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5962  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  59.94 
 
 		 373 aa  447  1.0000000000000001e-124  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.314282  normal  0.602397 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5354  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  60.58 
 
 		 370 aa  442  1e-123  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.111829  normal  0.289416 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7085  Rieske (2Fe-2S) domain protein  60.12 
 
 		 406 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4103  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  61.06 
 
 		 374 aa  437  1e-121  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0203  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  58.67 
 
 		 406 aa  429  1e-119  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3626  Rieske (2Fe-2S) domain protein  48.08 
 
 		 362 aa  343  2e-93  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.54925  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4992  Rieske (2Fe-2S) region  46.2 
 
 		 366 aa  337  9.999999999999999e-92  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2482  Rieske (2Fe-2S) domain protein  46.75 
 
 		 362 aa  337  1.9999999999999998e-91  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1016  dioxygenase, iron-sulfur subunit, putative  31.9 
 
 		 369 aa  161  2e-38  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.621392  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2979  Rieske (2Fe-2S) domain protein  30.75 
 
 		 367 aa  152  8e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1827  Rieske (2Fe-2S) region  29.94 
 
 		 347 aa  134  3e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1103  Rieske (2Fe-2S) domain protein  28.49 
 
 		 362 aa  129  6e-29  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1130  Rieske (2Fe-2S) domain protein  28.9 
 
 		 362 aa  127  3e-28  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0812255  normal  0.937672 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3574  Rieske (2Fe-2S) region  28.11 
 
 		 349 aa  126  7e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1550  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  38.41 
 
 		 353 aa  117  1.9999999999999998e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.276626  normal  0.0604744 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1687  vanillate monooxygenase  31.91 
 
 		 338 aa  117  3e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26080  vanillate demethylase subunit A  36.81 
 
 		 377 aa  115  1.0000000000000001e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.819244  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4257  Rieske (2Fe-2S) domain protein  32.66 
 
 		 349 aa  113  6e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2184  vanillate O-demethylase oxygenase, iron-sulfur subunit  37.42 
 
 		 347 aa  110  3e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0127  Rieske (2Fe-2S) protein  38.24 
 
 		 355 aa  110  4.0000000000000004e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0963  vanillate O-demethylase oxygenase subunit  32.82 
 
 		 350 aa  109  6e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3416  vanillate monooxygenase  36.97 
 
 		 342 aa  108  1e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0799476 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1549  vanillate monooxygenase  37.11 
 
 		 359 aa  108  2e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.619122  normal  0.0130812 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3542  vanillate O-demethylase oxygenase subunit  32.53 
 
 		 345 aa  107  2e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.10385 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1137  vanillate monooxygenase  35.58 
 
 		 350 aa  108  2e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.684708  hitchhiker  0.000140047 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4273  vanillate monooxygenase  37.65 
 
 		 350 aa  106  5e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.35045 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0630  Rieske (2Fe-2S) domain protein  35.12 
 
 		 353 aa  106  5e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.494266  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4895  Vanillate monooxygenase  36.14 
 
 		 336 aa  106  6e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.802026  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4861  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  38.55 
 
 		 365 aa  105  8e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.641783  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10960  ferridoxin oxidoreductase subunit  33.65 
 
 		 370 aa  105  1e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4278  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  39.62 
 
 		 362 aa  104  2e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.844018 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4340  Rieske (2Fe-2S) region  32.57 
 
 		 350 aa  105  2e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2035  hypothetical protein  34.52 
 
 		 345 aa  105  2e-21  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1575  Rieske (2Fe-2S) protein  36.77 
 
 		 346 aa  104  2e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.869006  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4591  vanillate monooxygenase  34.97 
 
 		 373 aa  103  4e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.672566 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5124  vanillate monooxygenase  34.97 
 
 		 359 aa  102  8e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.14115  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6309  Rieske (2Fe-2S) domain protein  32.1 
 
 		 341 aa  102  9e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.241664  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1370  vanillate monooxygenase  33.89 
 
 		 363 aa  102  9e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5029  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  34.97 
 
 		 359 aa  102  1e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.773131 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2310  vanillate monooxygenase  35.85 
 
 		 362 aa  102  1e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0218143 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1488  Rieske (2Fe-2S) protein  28.65 
 
 		 351 aa  102  1e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3124  Rieske (2Fe-2S) region  34.97 
 
 		 359 aa  102  1e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.439622  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5243  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  34.97 
 
 		 359 aa  102  1e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0420  Rieske (2Fe-2S) protein  34.36 
 
 		 373 aa  101  2e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1368  vanillate monooxygenase  35.98 
 
 		 352 aa  101  2e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3387  Rieske (2Fe-2S) region  34.97 
 
 		 369 aa  101  2e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.662042  normal  0.0218971 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3214  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  35.58 
 
 		 347 aa  101  2e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0195459 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0993  Rieske (2Fe-2S) region  34.16 
 
 		 350 aa  100  3e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000318811 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5628  vanillate O-demethylase oxygenase subunit  36.2 
 
 		 351 aa  100  3e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.834519  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2285  vanillate monooxygenase  34.15 
 
 		 367 aa  100  5e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.138524 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1352  vanillate monooxygenase  37.42 
 
 		 363 aa  100  5e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5546  putative vanillate O-demethylase oxygenase subunit (4-hydroxy- 3-methoxybenzoate demethylase)  31.9 
 
 		 347 aa  100  5e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1543  vanillate monooxygenase  33.13 
 
 		 366 aa  99.8  7e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.111008  hitchhiker  0.00152746 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6483  Rieske (2Fe-2S) region  35.5 
 
 		 358 aa  99  1e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3024  vanillate monooxygenase  32.95 
 
 		 361 aa  99.4  1e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2826  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  36.36 
 
 		 424 aa  99  1e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0328786  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4269  vanillate monooxygenase  37.97 
 
 		 351 aa  98.6  2e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.846398 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5693  Rieske (2Fe-2S) domain protein  27.3 
 
 		 352 aa  96.7  5e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0280  Rieske (2Fe-2S) protein  35.15 
 
 		 351 aa  95.9  8e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.226935  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4139  Vanillate monooxygenase  35.21 
 
 		 347 aa  95.5  1e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.105569  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1185  Rieske (2Fe-2S) domain protein  34.32 
 
 		 364 aa  95.9  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3413  vanillate monooxygenase  32.78 
 
 		 345 aa  95.5  1e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.166087 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0418  Rieske (2Fe-2S) protein  33.53 
 
 		 353 aa  95.9  1e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.842278  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2725  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  36.2 
 
 		 354 aa  95.1  1e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0149406 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0222  vanillate O-demethylase oxygenase subunit oxidoreductase protein  34.97 
 
 		 342 aa  94.7  2e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.0000016692  normal  0.0221534 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1908  Rieske (2Fe-2S) protein  35.25 
 
 		 347 aa  94.7  2e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.127579  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3671  oxidoreductase alpha subunit  31.58 
 
 		 407 aa  94.7  2e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0725789  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1067  vanillate monooxygenase  33.16 
 
 		 359 aa  95.1  2e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.535746  normal  0.0980736 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64800  vanillate O-demethylase oxygenase subunit  34.36 
 
 		 351 aa  95.1  2e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0565633  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1485  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  27.62 
 
 		 343 aa  94.4  3e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2036  hypothetical protein  27.3 
 
 		 334 aa  94  3e-18  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.502892  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5126  vanillate monooxygenase  32.2 
 
 		 352 aa  94.4  3e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1552  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  34.5 
 
 		 367 aa  94.4  3e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.190198 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1296  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  31.52 
 
 		 367 aa  93.6  4e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.85642 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4593  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  31.64 
 
 		 353 aa  94  4e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.743349  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1235  Rieske (2Fe-2S) domain protein  35.26 
 
 		 349 aa  93.6  5e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7105  Rieske (2Fe-2S) domain protein  36.2 
 
 		 361 aa  93.2  7e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.811582  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5789  Rieske (2Fe-2S) region  30.25 
 
 		 349 aa  92.8  8e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1009  vanillate demethylase  32.74 
 
 		 353 aa  92.8  8e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0048453  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0336  Rieske (2Fe-2S) protein  34.97 
 
 		 370 aa  92.8  8e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4769  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  27.48 
 
 		 367 aa  92.4  1e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.289545  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4461  Rieske (2Fe-2S) domain protein  41.07 
 
 		 216 aa  91.7  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.408386  normal  0.0170957 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1355  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  32.54 
 
 		 358 aa  90.9  3e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3246  vanillate monooxygenase  34.5 
 
 		 347 aa  90.9  3e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.546586  normal  0.604076 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1872  Rieske (2Fe-2S) protein  32.28 
 
 		 356 aa  90.9  3e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.171768  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3410  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  33.74 
 
 		 357 aa  91.3  3e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0474443 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4330  vanillate monooxygenase  32.12 
 
 		 366 aa  90.9  3e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0440139 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6469  Rieske (2Fe-2S) domain protein  41.07 
 
 		 217 aa  89.7  6e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0707  Rieske (2Fe-2S) protein  31.1 
 
 		 341 aa  89.7  7e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.537419  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3264  vanillate monooxygenase  33.33 
 
 		 350 aa  89.4  1e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00112363 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0344  Rieske (2Fe-2S) protein  32.12 
 
 		 353 aa  88.6  1e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0844  Rieske (2Fe-2S) region  31.89 
 
 		 349 aa  88.6  1e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>