More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_4103 on replicon NC_010623
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010623  Bphy_4103  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  100 
 
 		 374 aa  776    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7085  Rieske (2Fe-2S) domain protein  75.66 
 
 		 406 aa  587  1e-167  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0203  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  75.66 
 
 		 406 aa  588  1e-167  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6718  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  75.87 
 
 		 371 aa  573  1.0000000000000001e-162  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6242  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  76.84 
 
 		 371 aa  573  1.0000000000000001e-162  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.718979  normal  0.984052 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1589  Rieske (2Fe-2S) region  76.84 
 
 		 371 aa  573  1.0000000000000001e-162  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.577114  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6662  dioxygenase, iron-sulfur subunit  76.02 
 
 		 371 aa  568  1e-161  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0364205  normal  0.0470201 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5718  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  75.48 
 
 		 373 aa  566  1e-160  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.592667 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5962  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  75.2 
 
 		 373 aa  565  1e-160  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.314282  normal  0.602397 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5354  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  74.86 
 
 		 370 aa  564  1.0000000000000001e-159  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.111829  normal  0.289416 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1812  Rieske (2Fe-2S) region  76.15 
 
 		 383 aa  551  1e-156  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0372125 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0396  Rieske (2Fe-2S) domain protein  66.47 
 
 		 360 aa  468  1.0000000000000001e-131  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.547393 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1459  Rieske (2Fe-2S) domain protein  61.06 
 
 		 357 aa  437  1e-121  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0280358  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4992  Rieske (2Fe-2S) region  50.28 
 
 		 366 aa  378  1e-104  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2482  Rieske (2Fe-2S) domain protein  51.31 
 
 		 362 aa  370  1e-101  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3626  Rieske (2Fe-2S) domain protein  50.73 
 
 		 362 aa  365  1e-100  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.54925  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1016  dioxygenase, iron-sulfur subunit, putative  30.46 
 
 		 369 aa  147  4.0000000000000006e-34  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.621392  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1103  Rieske (2Fe-2S) domain protein  28.69 
 
 		 362 aa  130  3e-29  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1130  Rieske (2Fe-2S) domain protein  28.27 
 
 		 362 aa  125  9e-28  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0812255  normal  0.937672 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1827  Rieske (2Fe-2S) region  38.31 
 
 		 347 aa  124  3e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2979  Rieske (2Fe-2S) domain protein  26.63 
 
 		 367 aa  123  6e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4895  Vanillate monooxygenase  39.05 
 
 		 336 aa  121  1.9999999999999998e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.802026  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0630  Rieske (2Fe-2S) domain protein  35.76 
 
 		 353 aa  120  6e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.494266  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4257  Rieske (2Fe-2S) domain protein  26.06 
 
 		 349 aa  119  7.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1549  vanillate monooxygenase  41.51 
 
 		 359 aa  119  9.999999999999999e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.619122  normal  0.0130812 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3574  Rieske (2Fe-2S) region  32.39 
 
 		 349 aa  118  1.9999999999999998e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3542  vanillate O-demethylase oxygenase subunit  37.95 
 
 		 345 aa  116  6.9999999999999995e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.10385 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1575  Rieske (2Fe-2S) protein  38.06 
 
 		 346 aa  115  1.0000000000000001e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.869006  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0993  Rieske (2Fe-2S) region  36.02 
 
 		 350 aa  112  1.0000000000000001e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000318811 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2035  hypothetical protein  36.53 
 
 		 345 aa  111  3e-23  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5546  putative vanillate O-demethylase oxygenase subunit (4-hydroxy- 3-methoxybenzoate demethylase)  33.17 
 
 		 347 aa  110  4.0000000000000004e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1552  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  36.53 
 
 		 367 aa  108  1e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.190198 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1550  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  31.84 
 
 		 353 aa  108  2e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.276626  normal  0.0604744 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1687  vanillate monooxygenase  37.13 
 
 		 338 aa  108  2e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0418  Rieske (2Fe-2S) protein  36 
 
 		 353 aa  107  3e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.842278  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1543  vanillate monooxygenase  35.19 
 
 		 366 aa  107  4e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.111008  hitchhiker  0.00152746 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4861  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  37.04 
 
 		 365 aa  107  5e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.641783  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10960  ferridoxin oxidoreductase subunit  35.94 
 
 		 370 aa  105  2e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6309  Rieske (2Fe-2S) domain protein  33.13 
 
 		 341 aa  104  2e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.241664  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2036  hypothetical protein  35.47 
 
 		 334 aa  104  3e-21  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.502892  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1488  Rieske (2Fe-2S) protein  31.1 
 
 		 351 aa  104  3e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5126  vanillate monooxygenase  33.68 
 
 		 352 aa  103  4e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1368  vanillate monooxygenase  34.55 
 
 		 352 aa  103  4e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4593  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  33.16 
 
 		 353 aa  103  5e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.743349  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4340  Rieske (2Fe-2S) region  32.47 
 
 		 350 aa  103  6e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1355  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  34.22 
 
 		 358 aa  103  7e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0127  Rieske (2Fe-2S) protein  34.48 
 
 		 355 aa  102  8e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4278  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  36.88 
 
 		 362 aa  102  2e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.844018 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3952  Rieske (2Fe-2S) protein  33.55 
 
 		 340 aa  100  3e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.13771  normal  0.112958 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_43309  predicted protein  35.23 
 
 		 492 aa  101  3e-20  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.231154  hitchhiker  0.00124797 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26080  vanillate demethylase subunit A  31.9 
 
 		 377 aa  100  4e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.819244  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0707  Rieske (2Fe-2S) protein  35.58 
 
 		 341 aa  100  4e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.537419  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3416  vanillate monooxygenase  33.14 
 
 		 342 aa  100  4e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0799476 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5789  Rieske (2Fe-2S) region  32.72 
 
 		 349 aa  99.8  7e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2184  vanillate O-demethylase oxygenase, iron-sulfur subunit  33.33 
 
 		 347 aa  99.8  7e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1137  vanillate monooxygenase  31.29 
 
 		 350 aa  99  1e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.684708  hitchhiker  0.000140047 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4591  vanillate monooxygenase  34.55 
 
 		 373 aa  99  1e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.672566 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5678  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  31.84 
 
 		 408 aa  98.2  2e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.0000120872  normal  0.0293014 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5029  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  34.55 
 
 		 359 aa  98.6  2e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.773131 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6483  Rieske (2Fe-2S) region  33.33 
 
 		 358 aa  98.2  2e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5901  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  31.84 
 
 		 408 aa  97.8  2e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00683325  hitchhiker  0.00740172 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0344  Rieske (2Fe-2S) protein  34.97 
 
 		 353 aa  97.8  2e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5124  vanillate monooxygenase  34.55 
 
 		 359 aa  98.2  2e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.14115  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3413  vanillate monooxygenase  32.78 
 
 		 345 aa  98.6  2e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.166087 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3396  vanillate monooxygenase  34.03 
 
 		 348 aa  97.1  5e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00111775  normal  0.0140003 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3387  Rieske (2Fe-2S) region  33.74 
 
 		 369 aa  96.7  6e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.662042  normal  0.0218971 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3124  Rieske (2Fe-2S) region  33.94 
 
 		 359 aa  96.7  7e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.439622  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5243  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  33.94 
 
 		 359 aa  96.7  7e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0420  Rieske (2Fe-2S) protein  34.36 
 
 		 373 aa  96.3  8e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1370  vanillate monooxygenase  32.29 
 
 		 363 aa  95.9  9e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4273  vanillate monooxygenase  35.67 
 
 		 350 aa  95.5  1e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.35045 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3024  vanillate monooxygenase  25.84 
 
 		 361 aa  95.5  1e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0280  Rieske (2Fe-2S) protein  34.55 
 
 		 351 aa  95.5  1e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.226935  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1009  vanillate demethylase  32.35 
 
 		 353 aa  95.9  1e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0048453  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3224  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  35.71 
 
 		 411 aa  95.1  2e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.841797  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1559  vanillate monooxygenase  36.05 
 
 		 347 aa  94  4e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.662697  normal  0.47859 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3119  vanillate monooxygenase  31.98 
 
 		 358 aa  94  4e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2725  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  36.55 
 
 		 354 aa  94  4e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0149406 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1185  Rieske (2Fe-2S) domain protein  32 
 
 		 364 aa  94  4e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0963  vanillate O-demethylase oxygenase subunit  32.94 
 
 		 350 aa  93.6  5e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2050  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  31.98 
 
 		 327 aa  93.6  5e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0319051  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2826  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  34.36 
 
 		 424 aa  93.6  5e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0328786  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7105  Rieske (2Fe-2S) domain protein  35.98 
 
 		 361 aa  92.8  9e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.811582  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2285  vanillate monooxygenase  34.42 
 
 		 367 aa  92.4  1e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.138524 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3410  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  33.33 
 
 		 357 aa  92.4  1e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0474443 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0222  vanillate O-demethylase oxygenase subunit oxidoreductase protein  36.55 
 
 		 342 aa  91.7  2e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.0000016692  normal  0.0221534 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4769  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  36.02 
 
 		 367 aa  91.7  2e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.289545  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3246  vanillate monooxygenase  36.75 
 
 		 347 aa  92  2e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.546586  normal  0.604076 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3409  vanillate monooxygenase  35.8 
 
 		 347 aa  92  2e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0915562 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5628  vanillate O-demethylase oxygenase subunit  33.74 
 
 		 351 aa  92  2e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.834519  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3214  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  33.74 
 
 		 347 aa  91.3  3e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0195459 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4330  vanillate monooxygenase  29.7 
 
 		 366 aa  91.3  3e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0440139 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0336  Rieske (2Fe-2S) protein  32.1 
 
 		 370 aa  90.5  4e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2359  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  33.14 
 
 		 410 aa  90.5  4e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.128163  normal  0.731078 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1184  Rieske (2Fe-2S) domain protein  33.53 
 
 		 358 aa  89.7  8e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1488  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  27.81 
 
 		 321 aa  88.6  1e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0113839  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1352  vanillate monooxygenase  34.97 
 
 		 363 aa  89  1e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1818  putative Rieske iron-sulfur protein  41.55 
 
 		 330 aa  89  1e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2331  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  46.22 
 
 		 326 aa  89  1e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.86077  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2310  vanillate monooxygenase  32.08 
 
 		 362 aa  89.4  1e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0218143 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>