More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlg_2359 on replicon NC_008340
Organism: Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008340  Mlg_2359  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  100 
 
 
410 aa  832    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.128163  normal  0.731078 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1687  Rieske (2Fe-2S) domain protein  39.2 
 
 
449 aa  277  2e-73  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3062  phthalate 4,5-dioxygenase  40.37 
 
 
431 aa  256  5e-67  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.021682 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5678  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  39.94 
 
 
408 aa  236  5.0000000000000005e-61  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.0000120872  normal  0.0293014 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5901  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  39.94 
 
 
408 aa  236  7e-61  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00683325  hitchhiker  0.00740172 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1175  Phthalate 4,5-dioxygenase  35.78 
 
 
452 aa  203  4e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.769494  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5154  Rieske (2Fe-2S) region  35.58 
 
 
440 aa  199  7.999999999999999e-50  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.291358  normal  0.277417 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0877  putative dioxygenase  35.14 
 
 
452 aa  196  6e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.297728  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8462  Rieske (2Fe-2S) domain protein  35.68 
 
 
448 aa  192  8e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4297  phthalate 4,5-dioxygenase  37.76 
 
 
392 aa  188  1e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2268  Rieske (2Fe-2S) protein  33.81 
 
 
452 aa  186  6e-46  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0946291  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6982  phthalate 4,5-dioxygenase  32.84 
 
 
438 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1445  Rieske (2Fe-2S) protein  32.99 
 
 
437 aa  166  8e-40  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.491711  normal 
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7254  Rieske (2Fe-2S) domain protein  32.14 
 
 
430 aa  163  5.0000000000000005e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3201  phthalate 4,5-dioxygenase  32.32 
 
 
436 aa  162  8.000000000000001e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4805  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  31.14 
 
 
443 aa  161  2e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0495821  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1910  phthalate 4,5-dioxygenase, oxygenase subunit  29.83 
 
 
438 aa  160  3e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.578876  normal  0.581965 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4882  phthalate 4,5-dioxygenase  31.66 
 
 
422 aa  159  7e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5548  putative Phthalate 4,5-dioxygenase subunit alpha  30.21 
 
 
439 aa  158  2e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4627  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  31.02 
 
 
417 aa  156  7e-37  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4958  Rieske (2Fe-2S) domain protein  30.2 
 
 
443 aa  155  1e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.879177  normal  0.275764 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2779  Rieske (2Fe-2S) domain protein  30.2 
 
 
443 aa  155  1e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.261515  normal  0.259625 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2133  twin-arginine translocation pathway signal  31.96 
 
 
484 aa  155  2e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.395399  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1044  phthalate 4,5-dioxygenase  33.15 
 
 
454 aa  149  7e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.714091 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6324  phthalate 4,5-dioxygenase  29.24 
 
 
437 aa  147  3e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2928  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  28.71 
 
 
445 aa  145  2e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.149906  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1473  Rieske (2Fe-2S) region  31.43 
 
 
398 aa  143  7e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.826795  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5781  Rieske (2Fe-2S) region  31.69 
 
 
417 aa  143  7e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0555  phthalate 4,5-dioxygenase  34.78 
 
 
470 aa  140  3.9999999999999997e-32  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.547165  normal  0.18525 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3529  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  31.88 
 
 
433 aa  140  6e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.551503  normal  0.104416 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2370  putative phthalate 4,5-dioxygenase oxygenase subunit (OhpA2)  29.68 
 
 
440 aa  137  4e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000399664  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3537  aromatic acid dioxygenase alpha subunit  28.75 
 
 
440 aa  136  8e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.329598 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4881  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  28.75 
 
 
434 aa  135  9e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1001  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  28.8 
 
 
380 aa  132  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0574  phthalate 4,5-dioxygenase  41.49 
 
 
406 aa  130  4.0000000000000003e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.105836  normal  0.217979 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1543  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  37.84 
 
 
519 aa  128  2.0000000000000002e-28  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.453445  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3532  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  28 
 
 
446 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.048657  normal  0.0515471 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4795  phthalate 4,5-dioxygenase  28.5 
 
 
412 aa  124  3e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.269335  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3542  vanillate O-demethylase oxygenase subunit  28.85 
 
 
345 aa  113  7.000000000000001e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.10385 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2036  hypothetical protein  36.72 
 
 
334 aa  110  4.0000000000000004e-23  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.502892  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2035  hypothetical protein  29.56 
 
 
345 aa  108  1e-22  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2137  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  36.9 
 
 
450 aa  108  2e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1185  Rieske (2Fe-2S) domain protein  25.66 
 
 
364 aa  100  6e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2050  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  34.38 
 
 
327 aa  96.7  6e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0319051  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1184  Rieske (2Fe-2S) domain protein  31.74 
 
 
358 aa  92.8  1e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2239  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  31.4 
 
 
350 aa  92  2e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4103  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  33.14 
 
 
374 aa  90.5  5e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0630  Rieske (2Fe-2S) iron-sulfur domain protein  22.81 
 
 
330 aa  90.1  6e-17  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2285  vanillate monooxygenase  30.22 
 
 
367 aa  89.7  7e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.138524 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0481  Rieske (2Fe-2S) iron-sulfur domain-containing protein  27.81 
 
 
353 aa  89  1e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0971818  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3952  Rieske (2Fe-2S) protein  31.68 
 
 
340 aa  89.4  1e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.13771  normal  0.112958 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2919  Rieske (2Fe-2S) domain protein  33.33 
 
 
338 aa  89  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.563703  normal 
 
 
-
 
NC_011700  PHATRDRAFT_50613  Tic55 component of chloroplast import machinery  32.24 
 
 
498 aa  88.6  2e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0418  Rieske (2Fe-2S) protein  32.14 
 
 
353 aa  88.6  2e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.842278  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0132  Rieske (2Fe-2S) protein  31.73 
 
 
343 aa  88.6  2e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3671  oxidoreductase alpha subunit  33.52 
 
 
407 aa  87.8  4e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0725789  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1336  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  27.84 
 
 
355 aa  87  5e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.4835  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2494  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  27.84 
 
 
355 aa  87  5e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0319  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  27.84 
 
 
355 aa  87  5e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.456896  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1307  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  27.84 
 
 
355 aa  87  5e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.992701  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1234  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  27.84 
 
 
355 aa  87  5e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1812  Rieske (2Fe-2S) region  31.79 
 
 
383 aa  87.4  5e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0372125 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6021  Rieske (2Fe-2S) domain protein  33.12 
 
 
344 aa  87  6e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.174244  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0972  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  27.84 
 
 
355 aa  86.7  6e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0595  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  27.84 
 
 
355 aa  86.7  6e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0958903  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1501  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  28.12 
 
 
355 aa  86.7  7e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_43309  predicted protein  32.43 
 
 
492 aa  86.3  0.000000000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.231154  hitchhiker  0.00124797 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7085  Rieske (2Fe-2S) domain protein  33.14 
 
 
406 aa  85.5  0.000000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1056  Rieske (2Fe-2S) region  31.69 
 
 
499 aa  85.1  0.000000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00144994  hitchhiker  0.000116875 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6610  vanillate demethylase oxygenase subunit  31.64 
 
 
380 aa  85.5  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.581564  normal  0.184804 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4769  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  33.13 
 
 
367 aa  84.3  0.000000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.289545  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0127  Rieske (2Fe-2S) protein  37.16 
 
 
355 aa  84.7  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5354  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  32.57 
 
 
370 aa  84.7  0.000000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.111829  normal  0.289416 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5126  vanillate monooxygenase  30.99 
 
 
352 aa  84.3  0.000000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1552  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  31.76 
 
 
367 aa  83.6  0.000000000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.190198 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4593  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  24.91 
 
 
353 aa  83.6  0.000000000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.743349  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2918  Rieske (2Fe-2S) domain protein  34.03 
 
 
337 aa  83.2  0.000000000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.333438  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1136  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  33.67 
 
 
373 aa  83.2  0.000000000000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.959251  normal  0.28876 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0203  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  32.56 
 
 
406 aa  82.8  0.000000000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0576  Rieske (2Fe-2S) region  30.94 
 
 
323 aa  83.2  0.000000000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2492  vanillate O-demethylase oxygenase subunit  24.89 
 
 
315 aa  82.4  0.00000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3984  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  28.41 
 
 
356 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.643695  normal  0.0193847 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1575  Rieske (2Fe-2S) protein  24.73 
 
 
346 aa  81.6  0.00000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.869006  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3212  Rieske 2Fe-2S family protein  30.54 
 
 
341 aa  80.9  0.00000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1355  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  30.98 
 
 
358 aa  80.9  0.00000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5800  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  31.69 
 
 
354 aa  80.9  0.00000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00198597 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2590  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  32.02 
 
 
341 aa  80.9  0.00000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.225432 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4895  Vanillate monooxygenase  31.58 
 
 
336 aa  80.9  0.00000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.802026  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4330  vanillate monooxygenase  25.8 
 
 
366 aa  80.5  0.00000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0440139 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0807  vanillate O-demethylase oxygenase subunit  32.77 
 
 
331 aa  80.5  0.00000000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0837  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  28.74 
 
 
346 aa  80.5  0.00000000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.558436  normal  0.660482 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1459  Rieske (2Fe-2S) domain protein  28.18 
 
 
357 aa  80.1  0.00000000000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0280358  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1535  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  25.45 
 
 
331 aa  80.5  0.00000000000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0547  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  27.22 
 
 
324 aa  80.1  0.00000000000007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000394367  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64800  vanillate O-demethylase oxygenase subunit  28.49 
 
 
351 aa  79.7  0.00000000000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0565633  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4340  Rieske (2Fe-2S) region  29.38 
 
 
350 aa  79  0.0000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1550  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  32.32 
 
 
353 aa  79.3  0.0000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.276626  normal  0.0604744 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0175  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  28.04 
 
 
363 aa  79.3  0.0000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4510  Rieske (2Fe-2S) domain protein  30.19 
 
 
355 aa  79.3  0.0000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4642  Rieske (2Fe-2S) domain protein  30.19 
 
 
355 aa  79.3  0.0000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.44027  normal  0.0329483 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>