More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_5800 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010511  M446_5800  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  100 
 
 
354 aa  712    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00198597 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6021  Rieske (2Fe-2S) domain protein  86.63 
 
 
344 aa  607  9.999999999999999e-173  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.174244  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0648  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  59.03 
 
 
361 aa  420  1e-116  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.149026 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0659  Rieske (2Fe-2S) domain protein  59.31 
 
 
361 aa  419  1e-116  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.210033 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0627  Rieske (2Fe-2S) domain protein  58.74 
 
 
361 aa  417  9.999999999999999e-116  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3621  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  60.34 
 
 
377 aa  417  9.999999999999999e-116  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0573672 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2355  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  39.08 
 
 
349 aa  251  9.000000000000001e-66  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.725754  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0481  Rieske (2Fe-2S) iron-sulfur domain-containing protein  39.08 
 
 
353 aa  251  2e-65  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0971818  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1649  Rieske (2Fe-2S) domain protein  35.23 
 
 
370 aa  244  1.9999999999999999e-63  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1064  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  36.83 
 
 
387 aa  243  3e-63  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.43547 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1676  Rieske (2Fe-2S) domain protein  35.45 
 
 
349 aa  243  3.9999999999999997e-63  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.945696  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1235  Rieske (2Fe-2S) domain protein  35.94 
 
 
349 aa  242  7.999999999999999e-63  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2035  hypothetical protein  34.55 
 
 
345 aa  99.4  8e-20  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4769  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  27.12 
 
 
367 aa  98.6  1e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.289545  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2979  Rieske (2Fe-2S) domain protein  30.86 
 
 
367 aa  95.5  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1827  Rieske (2Fe-2S) region  30.49 
 
 
347 aa  95.5  1e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1442  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  27.74 
 
 
324 aa  93.6  4e-18  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000193123  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1488  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  28.01 
 
 
321 aa  93.2  6e-18  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0113839  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1103  Rieske (2Fe-2S) domain protein  30.11 
 
 
362 aa  93.2  6e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4244  Rieske (2Fe-2S) domain protein  28.52 
 
 
352 aa  91.3  2e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3574  Rieske (2Fe-2S) region  29.7 
 
 
349 aa  91.7  2e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1130  Rieske (2Fe-2S) domain protein  28.98 
 
 
362 aa  90.9  3e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0812255  normal  0.937672 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0787  Rieske (2Fe-2S) protein  40.14 
 
 
351 aa  90.5  4e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.466147 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1016  dioxygenase, iron-sulfur subunit, putative  25.65 
 
 
369 aa  90.1  5e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.621392  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2825  iron-sulfur cluster-binding protein, Rieske family  25.24 
 
 
358 aa  90.1  6e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.000971916  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1535  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  23.89 
 
 
331 aa  89.7  7e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1530  Rieske (2Fe-2S) domain protein  28.14 
 
 
450 aa  89.4  1e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1557  Rieske (2Fe-2S) domain protein  28.14 
 
 
450 aa  89.4  1e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0276963  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0218  Rieske iron-sulfur protein 2Fe-2S subunit  23.82 
 
 
444 aa  88.6  2e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.163513  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3542  vanillate O-demethylase oxygenase subunit  35.15 
 
 
345 aa  88.2  2e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.10385 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2036  hypothetical protein  32.12 
 
 
334 aa  87.8  3e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.502892  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08501  Rieske iron-sulfur protein 2Fe-2S subunit  23.82 
 
 
444 aa  87.8  3e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00185666 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0741  Rieske (2Fe-2S) protein  25.79 
 
 
382 aa  86.3  7e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0606248 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1184  Rieske (2Fe-2S) domain protein  26.32 
 
 
358 aa  86.3  8e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1009  vanillate demethylase  32.54 
 
 
353 aa  86.3  8e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0048453  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1867  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  31.98 
 
 
388 aa  84.7  0.000000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.687816 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0547  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  23.81 
 
 
324 aa  84.3  0.000000000000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000394367  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1185  Rieske (2Fe-2S) domain protein  31.71 
 
 
364 aa  84.3  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1136  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  26.57 
 
 
373 aa  83.2  0.000000000000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.959251  normal  0.28876 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3160  Rieske (2Fe-2S) domain protein  34.13 
 
 
347 aa  82.4  0.00000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4257  Rieske (2Fe-2S) domain protein  27.89 
 
 
349 aa  82.4  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0807  vanillate O-demethylase oxygenase subunit  35.06 
 
 
331 aa  82.4  0.00000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5693  Rieske (2Fe-2S) domain protein  32.62 
 
 
352 aa  82.4  0.00000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5685  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  35.44 
 
 
353 aa  81.6  0.00000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0319041  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1575  Rieske (2Fe-2S) protein  25.78 
 
 
346 aa  81.6  0.00000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.869006  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2143  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  31.61 
 
 
372 aa  80.9  0.00000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.444634  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0344  Rieske (2Fe-2S) protein  32.53 
 
 
353 aa  80.5  0.00000000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2359  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  31.69 
 
 
410 aa  80.5  0.00000000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.128163  normal  0.731078 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3532  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  31.39 
 
 
446 aa  80.5  0.00000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.048657  normal  0.0515471 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6610  vanillate demethylase oxygenase subunit  34.71 
 
 
380 aa  80.5  0.00000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.581564  normal  0.184804 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0535  Rieske (2Fe-2S) region  26.52 
 
 
460 aa  80.1  0.00000000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3246  vanillate monooxygenase  34.52 
 
 
347 aa  79.7  0.00000000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.546586  normal  0.604076 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0630  Rieske (2Fe-2S) iron-sulfur domain protein  21.57 
 
 
330 aa  79.7  0.00000000000007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6483  Rieske (2Fe-2S) region  36.14 
 
 
358 aa  78.2  0.0000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3396  vanillate monooxygenase  31.33 
 
 
348 aa  78.2  0.0000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00111775  normal  0.0140003 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2918  Rieske (2Fe-2S) domain protein  25.37 
 
 
337 aa  77.8  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.333438  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2013  Rieske (2Fe-2S) family oxidoreductase large subunit  28.96 
 
 
348 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2492  vanillate O-demethylase oxygenase subunit  32.74 
 
 
315 aa  78.2  0.0000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2305  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  29.21 
 
 
352 aa  77.8  0.0000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.560893  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5789  Rieske (2Fe-2S) region  30.12 
 
 
349 aa  77.8  0.0000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2164  cell death suppressor protein Lls1-like  33.73 
 
 
461 aa  77.4  0.0000000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.909867  normal  0.138548 
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7254  Rieske (2Fe-2S) domain protein  33.33 
 
 
430 aa  77.8  0.0000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2919  Rieske (2Fe-2S) domain protein  31.29 
 
 
338 aa  77.4  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.563703  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1445  Rieske (2Fe-2S) protein  24.9 
 
 
437 aa  77.8  0.0000000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.491711  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2050  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  34.38 
 
 
327 aa  77.8  0.0000000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0319051  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4516  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  31.61 
 
 
373 aa  77.4  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3671  oxidoreductase alpha subunit  32.53 
 
 
407 aa  77.8  0.0000000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0725789  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2258  Rieske (2Fe-2S) region  29.21 
 
 
352 aa  77.8  0.0000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.236496  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2297  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  29.21 
 
 
352 aa  77.8  0.0000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.125012  normal  0.643759 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2500  Rieske (2Fe-2S) region  30.43 
 
 
359 aa  77  0.0000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.455012 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3681  Rieske (2Fe-2S) region  29.23 
 
 
346 aa  76.6  0.0000000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.2267  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1004  putative vanillate O-demethylase oxygenase subunit A  26.67 
 
 
353 aa  76.6  0.0000000000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.413289  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1687  vanillate monooxygenase  30.64 
 
 
338 aa  76.3  0.0000000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0993  Rieske (2Fe-2S) region  29.03 
 
 
350 aa  76.3  0.0000000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  unclonable  0.00000318811 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3984  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  30.3 
 
 
356 aa  75.9  0.0000000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.643695  normal  0.0193847 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1001  putative vanillate O-demethylase oxygenase subunit A  26.06 
 
 
349 aa  75.9  0.0000000000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.8149  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4278  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  31.9 
 
 
362 aa  75.9  0.000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.844018 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1352  vanillate monooxygenase  30.72 
 
 
363 aa  75.9  0.000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4103  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  29.8 
 
 
356 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.119091 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5591  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  30.85 
 
 
356 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00790855 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1550  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  32.17 
 
 
353 aa  75.1  0.000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.276626  normal  0.0604744 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0127  Rieske (2Fe-2S) protein  32.72 
 
 
355 aa  74.7  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1488  Rieske (2Fe-2S) protein  31.29 
 
 
351 aa  75.1  0.000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4568  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  29.8 
 
 
356 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.380862  hitchhiker  0.000303241 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4330  vanillate monooxygenase  28.32 
 
 
366 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0440139 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1370  vanillate monooxygenase  28.66 
 
 
363 aa  74.7  0.000000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3119  vanillate monooxygenase  29.61 
 
 
358 aa  74.7  0.000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5546  putative vanillate O-demethylase oxygenase subunit (4-hydroxy- 3-methoxybenzoate demethylase)  29.94 
 
 
347 aa  74.3  0.000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3658  Rieske (2Fe-2S) region  30.85 
 
 
356 aa  74.3  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4709  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  30.85 
 
 
356 aa  74.3  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.700082  normal  0.155037 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1706  Rieske (2Fe-2S) domain protein  32.19 
 
 
225 aa  73.9  0.000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0736967  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2725  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  31.33 
 
 
354 aa  73.9  0.000000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0149406 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2285  vanillate monooxygenase  30.3 
 
 
367 aa  73.6  0.000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.138524 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4992  Rieske (2Fe-2S) region  21.23 
 
 
366 aa  73.9  0.000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1687  Rieske (2Fe-2S) domain protein  26.7 
 
 
449 aa  73.9  0.000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1105  Rieske (2Fe-2S) protein  29.8 
 
 
358 aa  73.2  0.000000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.080608  normal  0.368914 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0574  phthalate 4,5-dioxygenase  32.6 
 
 
406 aa  73.6  0.000000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.105836  normal  0.217979 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5154  Rieske (2Fe-2S) region  28.05 
 
 
440 aa  73.2  0.000000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.291358  normal  0.277417 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1389  putative oxygenase  35.62 
 
 
359 aa  73.2  0.000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0132  Rieske (2Fe-2S) protein  31.4 
 
 
343 aa  73.2  0.000000000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>