More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_4516 on replicon NC_010515
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010515  Bcenmc03_4516  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  100 
 
 
373 aa  772    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0741  Rieske (2Fe-2S) protein  66.67 
 
 
382 aa  470  1.0000000000000001e-131  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0606248 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2825  iron-sulfur cluster-binding protein, Rieske family  61.11 
 
 
358 aa  451  1e-125  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.000971916  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4769  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  45.91 
 
 
367 aa  272  6e-72  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.289545  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2035  hypothetical protein  26.88 
 
 
345 aa  115  1.0000000000000001e-24  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2036  hypothetical protein  29.12 
 
 
334 aa  114  3e-24  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.502892  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1185  Rieske (2Fe-2S) domain protein  36.27 
 
 
364 aa  111  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1184  Rieske (2Fe-2S) domain protein  31.11 
 
 
358 aa  108  2e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5693  Rieske (2Fe-2S) domain protein  32.71 
 
 
352 aa  103  4e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2492  vanillate O-demethylase oxygenase subunit  32.4 
 
 
315 aa  102  1e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26080  vanillate demethylase subunit A  26.37 
 
 
377 aa  102  1e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.819244  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1488  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  26.6 
 
 
321 aa  102  1e-20  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0113839  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1442  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  26.6 
 
 
324 aa  102  1e-20  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000193123  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2050  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  28.16 
 
 
327 aa  99.8  7e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0319051  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1827  Rieske (2Fe-2S) region  26.69 
 
 
347 aa  99.8  7e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3542  vanillate O-demethylase oxygenase subunit  29.72 
 
 
345 aa  96.3  7e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.10385 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0436  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  36.08 
 
 
326 aa  96.3  8e-19  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6610  vanillate demethylase oxygenase subunit  36.05 
 
 
380 aa  95.9  1e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.581564  normal  0.184804 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0864  cell death suppressor protein Lls1-like  28.38 
 
 
438 aa  95.5  1e-18  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.658605  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4895  Vanillate monooxygenase  28.21 
 
 
336 aa  94.7  2e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.802026  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2919  Rieske (2Fe-2S) domain protein  33.71 
 
 
338 aa  94.4  3e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.563703  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1009  vanillate demethylase  31.53 
 
 
353 aa  94  4e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0048453  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1687  vanillate monooxygenase  35.32 
 
 
338 aa  93.2  6e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5124  vanillate monooxygenase  35.29 
 
 
359 aa  93.2  6e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.14115  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1296  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  32.84 
 
 
367 aa  92.4  1e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.85642 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1368  vanillate monooxygenase  33.73 
 
 
352 aa  92.4  1e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5243  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  33.5 
 
 
359 aa  91.7  2e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0420  Rieske (2Fe-2S) protein  33.33 
 
 
373 aa  91.7  2e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1130  Rieske (2Fe-2S) domain protein  29.12 
 
 
362 aa  92  2e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0812255  normal  0.937672 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3671  oxidoreductase alpha subunit  33.93 
 
 
407 aa  91.3  2e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0725789  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3124  Rieske (2Fe-2S) region  33.5 
 
 
359 aa  91.7  2e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.439622  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1781  cell death suppressor protein Lls1-like  26.21 
 
 
456 aa  90.9  3e-17  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.527136  normal  0.0843855 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0344  Rieske (2Fe-2S) protein  35.33 
 
 
353 aa  90.9  3e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0222  vanillate O-demethylase oxygenase subunit oxidoreductase protein  35.09 
 
 
342 aa  90.9  4e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.0000016692  normal  0.0221534 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2164  cell death suppressor protein Lls1-like  27.76 
 
 
461 aa  90.5  4e-17  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.909867  normal  0.138548 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1686  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  31.98 
 
 
357 aa  90.5  5e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_43309  predicted protein  27.45 
 
 
492 aa  89.7  7e-17  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.231154  hitchhiker  0.00124797 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5029  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  33 
 
 
359 aa  89.7  7e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.773131 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4278  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  33.84 
 
 
362 aa  89.7  8e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.844018 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2482  Rieske (2Fe-2S) domain protein  24.68 
 
 
362 aa  89.7  8e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1355  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  26.98 
 
 
358 aa  89.4  9e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3214  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  35.67 
 
 
347 aa  88.6  1e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0195459 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2931  Pheophorbide a oxygenase  28 
 
 
477 aa  89  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0630  Rieske (2Fe-2S) iron-sulfur domain protein  24.35 
 
 
330 aa  89  1e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2725  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  35.54 
 
 
354 aa  89  1e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0149406 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5546  putative vanillate O-demethylase oxygenase subunit (4-hydroxy- 3-methoxybenzoate demethylase)  27.27 
 
 
347 aa  89  1e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4591  vanillate monooxygenase  33.53 
 
 
373 aa  89  1e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.672566 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2037  Rieske (2Fe-2S) domain protein  29.5 
 
 
357 aa  89  1e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.950553  normal  0.781731 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10960  ferridoxin oxidoreductase subunit  33.52 
 
 
370 aa  89.4  1e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1103  Rieske (2Fe-2S) domain protein  32.52 
 
 
362 aa  88.2  2e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1718  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  29.5 
 
 
357 aa  88.2  2e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.187317  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3626  Rieske (2Fe-2S) domain protein  30.18 
 
 
362 aa  88.6  2e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.54925  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1559  vanillate monooxygenase  32.65 
 
 
347 aa  87.4  3e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.662697  normal  0.47859 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2184  vanillate O-demethylase oxygenase, iron-sulfur subunit  33.73 
 
 
347 aa  87.8  3e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1557  Rieske (2Fe-2S) domain protein  24.26 
 
 
450 aa  87.8  3e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0276963  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4992  Rieske (2Fe-2S) region  27.65 
 
 
366 aa  87.8  3e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1530  Rieske (2Fe-2S) domain protein  24.26 
 
 
450 aa  87  4e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6483  Rieske (2Fe-2S) region  29.95 
 
 
358 aa  87  5e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2310  vanillate monooxygenase  31.61 
 
 
362 aa  86.7  5e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0218143 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4340  Rieske (2Fe-2S) region  28 
 
 
350 aa  86.7  6e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7059  Rieske (2Fe-2S) domain protein  25.75 
 
 
364 aa  86.7  6e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.2387  normal  0.465604 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2979  Rieske (2Fe-2S) domain protein  22.88 
 
 
367 aa  86.7  6e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1137  vanillate monooxygenase  30.3 
 
 
350 aa  86.7  7e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.684708  hitchhiker  0.000140047 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64800  vanillate O-demethylase oxygenase subunit  35.37 
 
 
351 aa  86.7  7e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0565633  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0844  Rieske (2Fe-2S) region  31.67 
 
 
349 aa  86.7  7e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4245  Rieske (2Fe-2S) domain protein  34.72 
 
 
371 aa  86.3  8e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1352  vanillate monooxygenase  35.54 
 
 
363 aa  85.9  0.000000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2143  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  25.3 
 
 
372 aa  85.9  0.000000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.444634  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1096  Rieske (2Fe-2S) domain protein  29.12 
 
 
357 aa  85.9  0.000000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0810231  normal  0.184537 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3574  Rieske (2Fe-2S) region  25.37 
 
 
349 aa  85.5  0.000000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1016  dioxygenase, iron-sulfur subunit, putative  33.65 
 
 
369 aa  85.1  0.000000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.621392  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0535  Rieske (2Fe-2S) region  26.93 
 
 
460 aa  85.1  0.000000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1485  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  33.89 
 
 
343 aa  84.7  0.000000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2137  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  30.34 
 
 
450 aa  85.1  0.000000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1105  Rieske (2Fe-2S) protein  25.58 
 
 
358 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.080608  normal  0.368914 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3266  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  30.9 
 
 
353 aa  84.7  0.000000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0113117 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5685  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  28.09 
 
 
353 aa  84.7  0.000000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0319041  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1136  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  31.75 
 
 
373 aa  85.1  0.000000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.959251  normal  0.28876 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4709  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  25.58 
 
 
356 aa  84.3  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.700082  normal  0.155037 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1552  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  31.28 
 
 
367 aa  84.7  0.000000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.190198 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0175  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  25.29 
 
 
363 aa  84.7  0.000000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1389  putative oxygenase  30.04 
 
 
359 aa  84.3  0.000000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3658  Rieske (2Fe-2S) region  25.58 
 
 
356 aa  84.3  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1064  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  26.01 
 
 
387 aa  84.7  0.000000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.43547 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7105  Rieske (2Fe-2S) domain protein  29.32 
 
 
361 aa  84  0.000000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.811582  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5789  Rieske (2Fe-2S) region  25.99 
 
 
349 aa  84  0.000000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3387  Rieske (2Fe-2S) region  32.79 
 
 
369 aa  84  0.000000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.662042  normal  0.0218971 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5628  vanillate O-demethylase oxygenase subunit  34.76 
 
 
351 aa  84  0.000000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.834519  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0787  Rieske (2Fe-2S) protein  28.57 
 
 
351 aa  83.6  0.000000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.466147 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5591  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  25.58 
 
 
356 aa  83.6  0.000000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00790855 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2355  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  25.73 
 
 
349 aa  83.6  0.000000000000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.725754  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1370  vanillate monooxygenase  31.71 
 
 
363 aa  83.6  0.000000000000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1335  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  33.54 
 
 
351 aa  83.6  0.000000000000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.819447 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3160  Rieske (2Fe-2S) domain protein  28.23 
 
 
347 aa  83.2  0.000000000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0280  Rieske (2Fe-2S) protein  32.78 
 
 
351 aa  83.2  0.000000000000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.226935  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1235  Rieske (2Fe-2S) domain protein  26.3 
 
 
349 aa  83.2  0.000000000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1487  Rieske (2Fe-2S) protein  30.29 
 
 
356 aa  82.8  0.000000000000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4244  Rieske (2Fe-2S) domain protein  25.96 
 
 
352 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4568  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  24.81 
 
 
356 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.380862  hitchhiker  0.000303241 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4103  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  24.81 
 
 
356 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.119091 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>