More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_2137 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008699  Noca_2137  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  100 
 
 
450 aa  941    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2359  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  36.9 
 
 
410 aa  108  2e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.128163  normal  0.731078 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1535  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  32.76 
 
 
331 aa  107  3e-22  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4769  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  37.65 
 
 
367 aa  105  2e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.289545  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1445  Rieske (2Fe-2S) protein  34.52 
 
 
437 aa  103  7e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.491711  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0630  Rieske (2Fe-2S) iron-sulfur domain protein  31.33 
 
 
330 aa  102  1e-20  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5548  putative Phthalate 4,5-dioxygenase subunit alpha  35.12 
 
 
439 aa  100  5e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_43309  predicted protein  32.95 
 
 
492 aa  100  7e-20  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.231154  hitchhiker  0.00124797 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5591  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  32.6 
 
 
356 aa  99.4  1e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00790855 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4709  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  32.6 
 
 
356 aa  99  1e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.700082  normal  0.155037 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7059  Rieske (2Fe-2S) domain protein  32.37 
 
 
364 aa  99  1e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.2387  normal  0.465604 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2370  putative phthalate 4,5-dioxygenase oxygenase subunit (OhpA2)  36.53 
 
 
440 aa  99.4  1e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000399664  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3658  Rieske (2Fe-2S) region  32.6 
 
 
356 aa  99  1e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1105  Rieske (2Fe-2S) protein  32.6 
 
 
358 aa  98.6  2e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.080608  normal  0.368914 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3984  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  30.73 
 
 
356 aa  98.6  2e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.643695  normal  0.0193847 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0175  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  32.95 
 
 
363 aa  99  2e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2036  hypothetical protein  35.47 
 
 
334 aa  97.1  5e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.502892  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5901  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  33.51 
 
 
408 aa  97.1  6e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00683325  hitchhiker  0.00740172 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5678  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  33.51 
 
 
408 aa  97.1  6e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.0000120872  normal  0.0293014 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6610  vanillate demethylase oxygenase subunit  34.71 
 
 
380 aa  96.7  8e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.581564  normal  0.184804 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0547  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  31.61 
 
 
324 aa  95.9  1e-18  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000394367  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1336  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  31.49 
 
 
355 aa  95.1  2e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.4835  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0972  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  31.49 
 
 
355 aa  95.1  2e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0319  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  31.49 
 
 
355 aa  95.1  2e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.456896  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1234  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  31.49 
 
 
355 aa  95.1  2e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2494  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  31.49 
 
 
355 aa  95.1  2e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4568  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  31.49 
 
 
356 aa  95.1  2e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.380862  hitchhiker  0.000303241 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1307  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  31.49 
 
 
355 aa  95.1  2e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.992701  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0595  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  31.49 
 
 
355 aa  95.1  2e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0958903  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8462  Rieske (2Fe-2S) domain protein  32.37 
 
 
448 aa  94.7  3e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1867  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  34.46 
 
 
388 aa  94.4  3e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.687816 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4103  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  31.49 
 
 
356 aa  95.1  3e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.119091 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1184  Rieske (2Fe-2S) domain protein  32.14 
 
 
358 aa  94.7  3e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1501  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  31.49 
 
 
355 aa  94  5e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4233  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  32 
 
 
362 aa  92.8  1e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5154  Rieske (2Fe-2S) region  33.71 
 
 
440 aa  92.8  1e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.291358  normal  0.277417 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3570  Rieske (2Fe-2S) region  29.05 
 
 
355 aa  91.7  2e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0161982  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5781  Rieske (2Fe-2S) region  35.36 
 
 
417 aa  92  2e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2686  Rieske (2Fe-2S) protein  32.97 
 
 
376 aa  92  2e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1185  Rieske (2Fe-2S) domain protein  31.21 
 
 
364 aa  92  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1442  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  33.14 
 
 
324 aa  91.3  3e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000193123  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1488  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  33.14 
 
 
321 aa  91.3  3e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0113839  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3537  aromatic acid dioxygenase alpha subunit  33.53 
 
 
440 aa  91.3  3e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.329598 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3542  vanillate O-demethylase oxygenase subunit  33.33 
 
 
345 aa  91.7  3e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.10385 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4510  Rieske (2Fe-2S) domain protein  31.55 
 
 
355 aa  90.9  4e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4642  Rieske (2Fe-2S) domain protein  31.55 
 
 
355 aa  90.9  4e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.44027  normal  0.0329483 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0877  putative dioxygenase  32.76 
 
 
452 aa  90.9  4e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.297728  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2979  Rieske (2Fe-2S) domain protein  28.95 
 
 
367 aa  90.5  6e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1687  Rieske (2Fe-2S) domain protein  30.99 
 
 
449 aa  90.5  6e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2918  Rieske (2Fe-2S) domain protein  34.1 
 
 
337 aa  90.1  7e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.333438  normal 
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7254  Rieske (2Fe-2S) domain protein  31.58 
 
 
430 aa  90.1  7e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2492  vanillate O-demethylase oxygenase subunit  31.98 
 
 
315 aa  89.7  9e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2285  vanillate monooxygenase  34.72 
 
 
367 aa  89.7  1e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.138524 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0132  Rieske (2Fe-2S) protein  31.94 
 
 
343 aa  89.4  1e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3062  phthalate 4,5-dioxygenase  34.88 
 
 
431 aa  89  2e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.021682 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4805  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  32.3 
 
 
443 aa  88.6  2e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0495821  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3529  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  31.58 
 
 
433 aa  88.6  2e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.551503  normal  0.104416 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3532  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  31.64 
 
 
446 aa  88.6  2e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.048657  normal  0.0515471 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2928  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  31.25 
 
 
445 aa  89  2e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.149906  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3224  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  30.37 
 
 
411 aa  87.8  3e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.841797  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1575  Rieske (2Fe-2S) protein  34.29 
 
 
346 aa  88.2  3e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.869006  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6982  phthalate 4,5-dioxygenase  32.18 
 
 
438 aa  87.8  3e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6324  phthalate 4,5-dioxygenase  32.02 
 
 
437 aa  87.8  4e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0436  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  34.94 
 
 
326 aa  87.8  4e-16  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1175  Phthalate 4,5-dioxygenase  30.36 
 
 
452 aa  87.8  4e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.769494  n/a   
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4627  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  33.33 
 
 
417 aa  87.4  4e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1296  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  30 
 
 
367 aa  87.4  5e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.85642 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1827  Rieske (2Fe-2S) region  25.71 
 
 
347 aa  87.4  5e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5546  putative vanillate O-demethylase oxygenase subunit (4-hydroxy- 3-methoxybenzoate demethylase)  32.76 
 
 
347 aa  87.4  5e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0481  Rieske (2Fe-2S) iron-sulfur domain-containing protein  33.91 
 
 
353 aa  87  5e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0971818  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3225  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  27.04 
 
 
412 aa  87  7e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0731874  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2919  Rieske (2Fe-2S) domain protein  32.76 
 
 
338 aa  86.7  9e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.563703  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4795  phthalate 4,5-dioxygenase  33.52 
 
 
412 aa  85.9  0.000000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.269335  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1009  vanillate demethylase  32.75 
 
 
353 aa  85.9  0.000000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0048453  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0741  Rieske (2Fe-2S) protein  35.16 
 
 
382 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0606248 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2050  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  30.12 
 
 
327 aa  85.1  0.000000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0319051  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1559  vanillate monooxygenase  36.31 
 
 
347 aa  85.1  0.000000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.662697  normal  0.47859 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4516  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  30.34 
 
 
373 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2725  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  32.76 
 
 
354 aa  85.5  0.000000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0149406 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0555  phthalate 4,5-dioxygenase  31.91 
 
 
470 aa  85.1  0.000000000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.547165  normal  0.18525 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1001  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  28.07 
 
 
380 aa  84.7  0.000000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3160  Rieske (2Fe-2S) domain protein  29.57 
 
 
347 aa  84.7  0.000000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7085  Rieske (2Fe-2S) domain protein  31.28 
 
 
406 aa  84.7  0.000000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4346  pheophorbide a oxygenase  30.17 
 
 
465 aa  85.1  0.000000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.18517  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3952  Rieske (2Fe-2S) protein  34.92 
 
 
340 aa  84  0.000000000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.13771  normal  0.112958 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2133  twin-arginine translocation pathway signal  29.89 
 
 
484 aa  84.3  0.000000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.395399  normal 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4958  Rieske (2Fe-2S) domain protein  30.86 
 
 
443 aa  84  0.000000000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.879177  normal  0.275764 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2779  Rieske (2Fe-2S) domain protein  30.86 
 
 
443 aa  84  0.000000000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.261515  normal  0.259625 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3214  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  33.14 
 
 
347 aa  84  0.000000000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0195459 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2355  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  30.51 
 
 
349 aa  83.6  0.000000000000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.725754  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0222  vanillate O-demethylase oxygenase subunit oxidoreductase protein  30.86 
 
 
342 aa  83.6  0.000000000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.0000016692  normal  0.0221534 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4297  phthalate 4,5-dioxygenase  32.77 
 
 
392 aa  83.6  0.000000000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3396  vanillate monooxygenase  32 
 
 
348 aa  83.2  0.000000000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00111775  normal  0.0140003 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3967  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  31.75 
 
 
347 aa  83.2  0.000000000000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1549  vanillate monooxygenase  32.35 
 
 
359 aa  83.2  0.000000000000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.619122  normal  0.0130812 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1044  phthalate 4,5-dioxygenase  31.33 
 
 
454 aa  82.4  0.00000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.714091 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3201  phthalate 4,5-dioxygenase  32.35 
 
 
436 aa  82.8  0.00000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0574  phthalate 4,5-dioxygenase  30.29 
 
 
406 aa  82.8  0.00000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.105836  normal  0.217979 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0993  Rieske (2Fe-2S) region  36.08 
 
 
350 aa  82.8  0.00000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  unclonable  0.00000318811 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4895  Vanillate monooxygenase  34.32 
 
 
336 aa  82.8  0.00000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.802026  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>