More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_4245 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010676  Bphyt_4245  Rieske (2Fe-2S) domain protein  100 
 
 
371 aa  770    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4244  Rieske (2Fe-2S) domain protein  34.2 
 
 
352 aa  202  7e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0787  Rieske (2Fe-2S) protein  33.24 
 
 
351 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.466147 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3567  Rieske (2Fe-2S) domain protein  33.63 
 
 
344 aa  164  2.0000000000000002e-39  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1389  putative oxygenase  32.27 
 
 
359 aa  159  6e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6610  vanillate demethylase oxygenase subunit  30.46 
 
 
380 aa  141  1.9999999999999998e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.581564  normal  0.184804 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2143  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  29.38 
 
 
372 aa  138  1e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.444634  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1136  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  30.38 
 
 
373 aa  134  1.9999999999999998e-30  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.959251  normal  0.28876 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0807  vanillate O-demethylase oxygenase subunit  34.33 
 
 
331 aa  134  3e-30  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2034  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  28.45 
 
 
400 aa  131  2.0000000000000002e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.967449  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2919  Rieske (2Fe-2S) domain protein  27.76 
 
 
338 aa  123  6e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.563703  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2035  hypothetical protein  29.19 
 
 
345 aa  122  8e-27  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1261  hypothetical protein  29 
 
 
340 aa  116  6.9999999999999995e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0803695 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2918  Rieske (2Fe-2S) domain protein  26.67 
 
 
337 aa  115  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.333438  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2297  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  29.55 
 
 
352 aa  115  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.125012  normal  0.643759 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2305  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  29.55 
 
 
352 aa  115  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.560893  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2258  Rieske (2Fe-2S) region  29.55 
 
 
352 aa  115  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.236496  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1184  Rieske (2Fe-2S) domain protein  28.49 
 
 
358 aa  112  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3212  Rieske 2Fe-2S family protein  28.27 
 
 
341 aa  110  3e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2590  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  28.92 
 
 
341 aa  109  9.000000000000001e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.225432 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2037  Rieske (2Fe-2S) domain protein  27.06 
 
 
357 aa  107  4e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.950553  normal  0.781731 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2686  Rieske (2Fe-2S) protein  31.82 
 
 
376 aa  106  8e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1096  Rieske (2Fe-2S) domain protein  27.63 
 
 
357 aa  105  2e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0810231  normal  0.184537 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1718  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  26.73 
 
 
357 aa  104  2e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.187317  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1185  Rieske (2Fe-2S) domain protein  34.07 
 
 
364 aa  102  8e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3968  Rieske (2Fe-2S) domain protein  26.54 
 
 
360 aa  100  4e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0886212  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2013  Rieske (2Fe-2S) family oxidoreductase large subunit  28.14 
 
 
348 aa  99.4  9e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2492  vanillate O-demethylase oxygenase subunit  26.77 
 
 
315 aa  97.4  3e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2036  hypothetical protein  32.53 
 
 
334 aa  96.7  7e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.502892  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1559  vanillate monooxygenase  32.93 
 
 
347 aa  95.9  1e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.662697  normal  0.47859 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2050  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  27.01 
 
 
327 aa  95.1  2e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0319051  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1009  vanillate demethylase  32.96 
 
 
353 aa  93.2  6e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0048453  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5685  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  29.03 
 
 
353 aa  92.8  8e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0319041  normal 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_43309  predicted protein  27.37 
 
 
492 aa  89.7  6e-17  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.231154  hitchhiker  0.00124797 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3671  oxidoreductase alpha subunit  34.08 
 
 
407 aa  87.8  3e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0725789  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4516  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  34.72 
 
 
373 aa  86.3  8e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1687  Rieske (2Fe-2S) domain protein  30.42 
 
 
449 aa  85.9  9e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3570  Rieske (2Fe-2S) region  31.72 
 
 
355 aa  85.5  0.000000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0161982  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5267  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  24.72 
 
 
370 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4729  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  24.72 
 
 
370 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1336  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  34.71 
 
 
355 aa  84  0.000000000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.4835  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2494  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  34.71 
 
 
355 aa  84  0.000000000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1307  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  34.71 
 
 
355 aa  84  0.000000000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.992701  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1234  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  34.71 
 
 
355 aa  84  0.000000000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2888  PrnD  24.28 
 
 
370 aa  84  0.000000000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.942193  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0319  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  34.71 
 
 
355 aa  84  0.000000000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.456896  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0595  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  34.71 
 
 
355 aa  83.6  0.000000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0958903  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1827  Rieske (2Fe-2S) region  34.42 
 
 
347 aa  83.6  0.000000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0972  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  34.71 
 
 
355 aa  83.6  0.000000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1501  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  34.71 
 
 
355 aa  82.8  0.000000000000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1530  Rieske (2Fe-2S) domain protein  27.25 
 
 
450 aa  82  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6709  Rieske (2Fe-2S) protein  29.06 
 
 
373 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2928  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  38.16 
 
 
445 aa  82  0.00000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.149906  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0535  Rieske (2Fe-2S) region  33.52 
 
 
460 aa  81.6  0.00000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1118  PrnD  23.7 
 
 
346 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6986  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  28.08 
 
 
374 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.529476  normal  0.476808 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1557  Rieske (2Fe-2S) domain protein  31.43 
 
 
450 aa  81.6  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0276963  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2736  PrnD  23.7 
 
 
370 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1044  phthalate 4,5-dioxygenase  32.12 
 
 
454 aa  81.3  0.00000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.714091 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4568  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  32.54 
 
 
356 aa  81.3  0.00000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.380862  hitchhiker  0.000303241 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4257  Rieske (2Fe-2S) domain protein  34.32 
 
 
349 aa  81.3  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1105  Rieske (2Fe-2S) protein  32.37 
 
 
358 aa  80.9  0.00000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.080608  normal  0.368914 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1130  Rieske (2Fe-2S) domain protein  33.33 
 
 
362 aa  81.3  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0812255  normal  0.937672 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3658  Rieske (2Fe-2S) region  32.54 
 
 
356 aa  80.9  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4103  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  32.54 
 
 
356 aa  81.3  0.00000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.119091 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4709  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  32.54 
 
 
356 aa  80.9  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.700082  normal  0.155037 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7059  Rieske (2Fe-2S) domain protein  32.54 
 
 
364 aa  80.9  0.00000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.2387  normal  0.465604 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4346  pheophorbide a oxygenase  29.51 
 
 
465 aa  80.5  0.00000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.18517  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5781  Rieske (2Fe-2S) region  31.36 
 
 
417 aa  80.1  0.00000000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2825  iron-sulfur cluster-binding protein, Rieske family  31.82 
 
 
358 aa  79.7  0.00000000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.000971916  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5591  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  31.95 
 
 
356 aa  79.3  0.00000000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00790855 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2688  Rieske (2Fe-2S) protein  28.47 
 
 
352 aa  79.3  0.0000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0877  putative dioxygenase  32.14 
 
 
452 aa  79.3  0.0000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.297728  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2725  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  30 
 
 
354 aa  79.3  0.0000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0149406 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0555  phthalate 4,5-dioxygenase  31.95 
 
 
470 aa  79  0.0000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.547165  normal  0.18525 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1352  vanillate monooxygenase  29.2 
 
 
363 aa  78.6  0.0000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2164  cell death suppressor protein Lls1-like  32.57 
 
 
461 aa  78.6  0.0000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.909867  normal  0.138548 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1488  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  31.95 
 
 
321 aa  77.8  0.0000000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0113839  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0420  Rieske (2Fe-2S) protein  26.83 
 
 
373 aa  77.8  0.0000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4642  Rieske (2Fe-2S) domain protein  29.57 
 
 
355 aa  77.4  0.0000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.44027  normal  0.0329483 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0280  Rieske (2Fe-2S) protein  27.37 
 
 
351 aa  77.8  0.0000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.226935  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3984  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  31.95 
 
 
356 aa  77.8  0.0000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.643695  normal  0.0193847 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4233  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  30.46 
 
 
362 aa  77.8  0.0000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4510  Rieske (2Fe-2S) domain protein  29.57 
 
 
355 aa  77.4  0.0000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1442  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  31.21 
 
 
324 aa  77.8  0.0000000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000193123  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1103  Rieske (2Fe-2S) domain protein  32.54 
 
 
362 aa  77  0.0000000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3532  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  28.21 
 
 
446 aa  77  0.0000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.048657  normal  0.0515471 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4769  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  28.98 
 
 
367 aa  76.6  0.0000000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.289545  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3154  Rieske (2Fe-2S) domain protein  36.92 
 
 
221 aa  76.3  0.0000000000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.647374  normal  0.386497 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3952  Rieske (2Fe-2S) protein  32.35 
 
 
340 aa  76.3  0.0000000000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.13771  normal  0.112958 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0175  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  31.03 
 
 
363 aa  76.3  0.0000000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3124  Rieske (2Fe-2S) region  27.72 
 
 
359 aa  76.3  0.0000000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.439622  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5243  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  27.72 
 
 
359 aa  76.3  0.0000000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5029  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  27.72 
 
 
359 aa  76.3  0.0000000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.773131 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4958  Rieske (2Fe-2S) domain protein  33.33 
 
 
443 aa  75.9  0.000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.879177  normal  0.275764 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1867  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  27.98 
 
 
388 aa  75.5  0.000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.687816 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1575  Rieske (2Fe-2S) protein  30.05 
 
 
346 aa  75.9  0.000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.869006  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2779  Rieske (2Fe-2S) domain protein  33.33 
 
 
443 aa  75.9  0.000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.261515  normal  0.259625 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1910  phthalate 4,5-dioxygenase, oxygenase subunit  33.56 
 
 
438 aa  75.1  0.000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.578876  normal  0.581965 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5693  Rieske (2Fe-2S) domain protein  27.13 
 
 
352 aa  75.1  0.000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>