More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A0807 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008825  Mpe_A0807  vanillate O-demethylase oxygenase subunit  100 
 
 		 331 aa  672    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1136  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  54.52 
 
 		 373 aa  322  4e-87  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.959251  normal  0.28876 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2143  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  47.04 
 
 		 372 aa  289  4e-77  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.444634  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1389  putative oxygenase  34.23 
 
 		 359 aa  157  2e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3567  Rieske (2Fe-2S) domain protein  33.44 
 
 		 344 aa  146  4.0000000000000006e-34  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1705  hypothetical protein  38.79 
 
 		 287 aa  137  2e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0851207  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5871  hypothetical protein  36.15 
 
 		 301 aa  137  3.0000000000000003e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.789532  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2919  Rieske (2Fe-2S) domain protein  32.43 
 
 		 338 aa  135  9e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.563703  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5416  vanillate O-demethylase oxygenase subunit  37.12 
 
 		 283 aa  134  3e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.221202  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4245  Rieske (2Fe-2S) domain protein  34.33 
 
 		 371 aa  134  3e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3148  hypothetical protein  39.22 
 
 		 288 aa  132  1.0000000000000001e-29  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.282075 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1248  hypothetical protein  36.78 
 
 		 284 aa  129  6e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0789553 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2081  hypothetical protein  38.02 
 
 		 278 aa  129  7.000000000000001e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00119001 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2492  vanillate O-demethylase oxygenase subunit  29.56 
 
 		 315 aa  129  7.000000000000001e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2067  hypothetical protein  32.82 
 
 		 286 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0156668 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1234  hypothetical protein  36.68 
 
 		 286 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0239219  normal  0.493228 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4244  Rieske (2Fe-2S) domain protein  30.47 
 
 		 352 aa  125  7e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2035  hypothetical protein  31.34 
 
 		 345 aa  125  9e-28  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0787  Rieske (2Fe-2S) protein  31.48 
 
 		 351 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.466147 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2297  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  33.23 
 
 		 352 aa  119  4.9999999999999996e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.125012  normal  0.643759 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2258  Rieske (2Fe-2S) region  33.23 
 
 		 352 aa  119  4.9999999999999996e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.236496  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2305  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  33.23 
 
 		 352 aa  119  4.9999999999999996e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.560893  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6468  hypothetical protein  37.61 
 
 		 281 aa  116  5e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2013  Rieske (2Fe-2S) family oxidoreductase large subunit  34.93 
 
 		 348 aa  115  6.9999999999999995e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5432  phenylpropionate dioxygenase  29.36 
 
 		 288 aa  115  2.0000000000000002e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4462  hypothetical protein  36.55 
 
 		 281 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0193122 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3212  Rieske 2Fe-2S family protein  34.62 
 
 		 341 aa  112  9e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2590  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  37.57 
 
 		 341 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.225432 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2034  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  28.57 
 
 		 400 aa  110  3e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.967449  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2036  hypothetical protein  29.08 
 
 		 334 aa  110  3e-23  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.502892  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2918  Rieske (2Fe-2S) domain protein  37.43 
 
 		 337 aa  110  5e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.333438  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2050  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  32.42 
 
 		 327 aa  107  4e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0319051  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6610  vanillate demethylase oxygenase subunit  29.22 
 
 		 380 aa  107  4e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.581564  normal  0.184804 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3154  Rieske (2Fe-2S) domain protein  53.15 
 
 		 221 aa  106  7e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.647374  normal  0.386497 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1261  hypothetical protein  29.19 
 
 		 340 aa  105  1e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0803695 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0535  Rieske (2Fe-2S) region  29.85 
 
 		 460 aa  103  5e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_43309  predicted protein  27.62 
 
 		 492 aa  103  5e-21  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.231154  hitchhiker  0.00124797 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4257  Rieske (2Fe-2S) domain protein  34.13 
 
 		 349 aa  102  8e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1185  Rieske (2Fe-2S) domain protein  27.55 
 
 		 364 aa  102  1e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0436  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  29.9 
 
 		 326 aa  100  4e-20  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2931  Pheophorbide a oxygenase  38.67 
 
 		 477 aa  99  1e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3671  oxidoreductase alpha subunit  34.64 
 
 		 407 aa  99  1e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0725789  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4769  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  36.46 
 
 		 367 aa  97.8  2e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.289545  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2074  Rieske (2Fe-2S) domain protein  45.45 
 
 		 217 aa  97.8  2e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.12491  normal  0.0463704 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1501  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  35.76 
 
 		 355 aa  97.8  2e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1550  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  28.81 
 
 		 353 aa  97.8  2e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.276626  normal  0.0604744 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1241  Rieske (2Fe-2S) domain protein  45.45 
 
 		 217 aa  97.1  4e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.635525  normal  0.124818 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3574  Rieske (2Fe-2S) region  31.46 
 
 		 349 aa  97.1  4e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0127  Rieske (2Fe-2S) protein  28.33 
 
 		 355 aa  96.7  5e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1064  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  34.44 
 
 		 387 aa  96.3  6e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.43547 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1718  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  27.36 
 
 		 357 aa  96.3  6e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.187317  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0993  Rieske (2Fe-2S) region  29.21 
 
 		 350 aa  96.3  7e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000318811 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0795  Rieske (2Fe-2S) domain protein  34.54 
 
 		 497 aa  95.1  1e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.266613  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1009  vanillate demethylase  36 
 
 		 353 aa  95.1  1e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0048453  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2310  vanillate monooxygenase  40.61 
 
 		 362 aa  95.5  1e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0218143 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1336  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  34.55 
 
 		 355 aa  94.4  3e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.4835  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1867  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  36.05 
 
 		 388 aa  94.4  3e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.687816 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1307  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  34.55 
 
 		 355 aa  94.4  3e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.992701  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2494  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  34.55 
 
 		 355 aa  94.4  3e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1234  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  34.55 
 
 		 355 aa  94.4  3e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3968  Rieske (2Fe-2S) domain protein  26.52 
 
 		 360 aa  94.4  3e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0886212  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0319  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  34.55 
 
 		 355 aa  94.4  3e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.456896  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1184  Rieske (2Fe-2S) domain protein  33.16 
 
 		 358 aa  93.6  4e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2037  Rieske (2Fe-2S) domain protein  27.05 
 
 		 357 aa  93.6  4e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.950553  normal  0.781731 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0769  Rieske (2Fe-2S) domain protein  33.51 
 
 		 497 aa  93.6  5e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2958  pheophorbide a oxygenase  35.9 
 
 		 442 aa  93.6  5e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0467803  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1103  Rieske (2Fe-2S) domain protein  32.12 
 
 		 362 aa  93.2  6e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1559  vanillate monooxygenase  35.88 
 
 		 347 aa  92.8  7e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.662697  normal  0.47859 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2164  cell death suppressor protein Lls1-like  36.14 
 
 		 461 aa  92  1e-17  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.909867  normal  0.138548 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1130  Rieske (2Fe-2S) domain protein  31.52 
 
 		 362 aa  92  1e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0812255  normal  0.937672 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1056  Rieske (2Fe-2S) region  32.99 
 
 		 499 aa  91.3  2e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00144994  hitchhiker  0.000116875 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0595  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  33.94 
 
 		 355 aa  91.3  2e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0958903  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3116  Pheophorbide a oxygenase  28.74 
 
 		 442 aa  91.3  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0972  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  33.94 
 
 		 355 aa  91.3  2e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6469  Rieske (2Fe-2S) domain protein  44.26 
 
 		 217 aa  90.9  3e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2825  iron-sulfur cluster-binding protein, Rieske family  36.42 
 
 		 358 aa  90.1  4e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.000971916  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2189  Pheophorbide a oxygenase  32.79 
 
 		 474 aa  90.5  4e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00477289 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1096  Rieske (2Fe-2S) domain protein  34.88 
 
 		 357 aa  90.5  4e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0810231  normal  0.184537 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0964  Rieske (2Fe-2S) domain protein  32.39 
 
 		 468 aa  90.1  5e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.1498 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0175  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  32.53 
 
 		 363 aa  89.7  5e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3246  vanillate monooxygenase  30.39 
 
 		 347 aa  89.7  6e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.546586  normal  0.604076 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1557  Rieske (2Fe-2S) domain protein  27.19 
 
 		 450 aa  89.4  7e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0276963  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1488  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  31.72 
 
 		 321 aa  89.4  7e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0113839  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1442  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  31.72 
 
 		 324 aa  89.7  7e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000193123  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1827  Rieske (2Fe-2S) region  31.06 
 
 		 347 aa  89.4  8e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1105  Rieske (2Fe-2S) protein  32.35 
 
 		 358 aa  89.4  8e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.080608  normal  0.368914 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4103  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  32.35 
 
 		 356 aa  89.4  8e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.119091 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0547  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  25.9 
 
 		 324 aa  89.4  8e-17  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000394367  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4568  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  32.35 
 
 		 356 aa  89.4  8e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.380862  hitchhiker  0.000303241 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2725  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  25.96 
 
 		 354 aa  89.4  9e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0149406 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1303  Rieske (2Fe-2S) region  28.14 
 
 		 443 aa  88.6  1e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.418357  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3214  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  27.81 
 
 		 347 aa  89  1e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0195459 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1530  Rieske (2Fe-2S) domain protein  27.85 
 
 		 450 aa  89  1e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0132  Rieske (2Fe-2S) protein  39.68 
 
 		 343 aa  89  1e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2979  Rieske (2Fe-2S) domain protein  30.29 
 
 		 367 aa  88.2  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0741  Rieske (2Fe-2S) protein  35.23 
 
 		 382 aa  88.2  2e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0606248 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1781  cell death suppressor protein Lls1-like  33.9 
 
 		 456 aa  87.8  2e-16  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.527136  normal  0.0843855 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4461  Rieske (2Fe-2S) domain protein  42.62 
 
 		 216 aa  87.8  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.408386  normal  0.0170957 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3201  phthalate 4,5-dioxygenase  44.35 
 
 		 436 aa  88.2  2e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4709  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  32.32 
 
 		 356 aa  87.8  2e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.700082  normal  0.155037 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>