More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_3201 on replicon NC_010623
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010623  Bphy_3201  phthalate 4,5-dioxygenase  100 
 
 
436 aa  909    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1175  Phthalate 4,5-dioxygenase  38.24 
 
 
452 aa  270  4e-71  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.769494  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5154  Rieske (2Fe-2S) region  37.6 
 
 
440 aa  267  4e-70  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.291358  normal  0.277417 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2268  Rieske (2Fe-2S) protein  36.95 
 
 
452 aa  261  2e-68  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0946291  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8462  Rieske (2Fe-2S) domain protein  37.76 
 
 
448 aa  260  4e-68  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6982  phthalate 4,5-dioxygenase  37.14 
 
 
438 aa  258  1e-67  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0877  putative dioxygenase  37.11 
 
 
452 aa  257  4e-67  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.297728  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1445  Rieske (2Fe-2S) protein  36.1 
 
 
437 aa  244  3e-63  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.491711  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5781  Rieske (2Fe-2S) region  36.77 
 
 
417 aa  224  2e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2133  twin-arginine translocation pathway signal  33.33 
 
 
484 aa  223  4.9999999999999996e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.395399  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4882  phthalate 4,5-dioxygenase  33.85 
 
 
422 aa  204  2e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7254  Rieske (2Fe-2S) domain protein  33.77 
 
 
430 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4297  phthalate 4,5-dioxygenase  34.69 
 
 
392 aa  193  5e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4805  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  33.02 
 
 
443 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0495821  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3529  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  33.76 
 
 
433 aa  183  5.0000000000000004e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.551503  normal  0.104416 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3062  phthalate 4,5-dioxygenase  33.33 
 
 
431 aa  183  6e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.021682 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6324  phthalate 4,5-dioxygenase  29.53 
 
 
437 aa  181  2.9999999999999997e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4958  Rieske (2Fe-2S) domain protein  34.38 
 
 
443 aa  179  7e-44  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.879177  normal  0.275764 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2779  Rieske (2Fe-2S) domain protein  34.38 
 
 
443 aa  179  7e-44  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.261515  normal  0.259625 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3537  aromatic acid dioxygenase alpha subunit  31.97 
 
 
440 aa  174  2.9999999999999996e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.329598 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2370  putative phthalate 4,5-dioxygenase oxygenase subunit (OhpA2)  31.54 
 
 
440 aa  174  2.9999999999999996e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000399664  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1910  phthalate 4,5-dioxygenase, oxygenase subunit  33.68 
 
 
438 aa  172  7.999999999999999e-42  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.578876  normal  0.581965 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3532  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  31.01 
 
 
446 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.048657  normal  0.0515471 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1687  Rieske (2Fe-2S) domain protein  30.83 
 
 
449 aa  167  2.9999999999999998e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5548  putative Phthalate 4,5-dioxygenase subunit alpha  31.13 
 
 
439 aa  167  2.9999999999999998e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0574  phthalate 4,5-dioxygenase  29.95 
 
 
406 aa  165  1.0000000000000001e-39  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.105836  normal  0.217979 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2359  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  32.32 
 
 
410 aa  162  8.000000000000001e-39  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.128163  normal  0.731078 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4881  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  28.98 
 
 
434 aa  162  9e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0555  phthalate 4,5-dioxygenase  33.07 
 
 
470 aa  161  2e-38  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.547165  normal  0.18525 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4627  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  31.27 
 
 
417 aa  160  3e-38  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2928  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  32.56 
 
 
445 aa  159  9e-38  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.149906  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1473  Rieske (2Fe-2S) region  31.81 
 
 
398 aa  157  3e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.826795  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1044  phthalate 4,5-dioxygenase  31.17 
 
 
454 aa  157  3e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.714091 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4795  phthalate 4,5-dioxygenase  27.47 
 
 
412 aa  155  2e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.269335  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5678  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  30.67 
 
 
408 aa  151  2e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.0000120872  normal  0.0293014 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1001  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  29.77 
 
 
380 aa  151  3e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5901  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  30.67 
 
 
408 aa  151  3e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00683325  hitchhiker  0.00740172 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1543  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  32.98 
 
 
519 aa  127  4.0000000000000003e-28  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.453445  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1185  Rieske (2Fe-2S) domain protein  26.69 
 
 
364 aa  100  6e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1184  Rieske (2Fe-2S) domain protein  26.74 
 
 
358 aa  97.4  4e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2919  Rieske (2Fe-2S) domain protein  32 
 
 
338 aa  92  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.563703  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2050  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  35.37 
 
 
327 aa  90.1  6e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0319051  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3984  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  27.22 
 
 
356 aa  89.7  8e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.643695  normal  0.0193847 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2492  vanillate O-demethylase oxygenase subunit  30.67 
 
 
315 aa  89  1e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0807  vanillate O-demethylase oxygenase subunit  44.35 
 
 
331 aa  88.2  3e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2686  Rieske (2Fe-2S) protein  34.59 
 
 
376 aa  87.4  5e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2036  hypothetical protein  26.82 
 
 
334 aa  86.7  8e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.502892  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4568  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  27.46 
 
 
356 aa  85.9  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.380862  hitchhiker  0.000303241 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0595  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  25.41 
 
 
355 aa  84.3  0.000000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0958903  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7059  Rieske (2Fe-2S) domain protein  32.78 
 
 
364 aa  84.7  0.000000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.2387  normal  0.465604 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0972  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  25.41 
 
 
355 aa  84.3  0.000000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1336  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  25.41 
 
 
355 aa  84.3  0.000000000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.4835  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2494  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  25.41 
 
 
355 aa  84.3  0.000000000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0319  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  25.41 
 
 
355 aa  84.3  0.000000000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.456896  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1307  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  25.41 
 
 
355 aa  84.3  0.000000000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.992701  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1234  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  25.41 
 
 
355 aa  84.3  0.000000000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1501  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  25 
 
 
355 aa  84  0.000000000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3658  Rieske (2Fe-2S) region  26.76 
 
 
356 aa  83.6  0.000000000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0436  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  34.23 
 
 
326 aa  83.6  0.000000000000007  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1136  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  40.18 
 
 
373 aa  83.6  0.000000000000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.959251  normal  0.28876 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4709  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  26.76 
 
 
356 aa  83.6  0.000000000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.700082  normal  0.155037 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0481  Rieske (2Fe-2S) iron-sulfur domain-containing protein  31.21 
 
 
353 aa  82.4  0.00000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0971818  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1442  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  25.71 
 
 
324 aa  82.8  0.00000000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000193123  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0787  Rieske (2Fe-2S) protein  31.52 
 
 
351 aa  82.8  0.00000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.466147 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2688  Rieske (2Fe-2S) protein  34.84 
 
 
352 aa  82.8  0.00000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0175  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  26.22 
 
 
363 aa  82.8  0.00000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5591  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  26.76 
 
 
356 aa  82.8  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00790855 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1488  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  25.71 
 
 
321 aa  82.4  0.00000000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0113839  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4103  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  27.17 
 
 
356 aa  82.8  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.119091 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4244  Rieske (2Fe-2S) domain protein  31.25 
 
 
352 aa  82.8  0.00000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2137  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  32.35 
 
 
450 aa  82.8  0.00000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_26228  predicted protein  32.12 
 
 
668 aa  82  0.00000000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.281249  normal  0.273766 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2143  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  34.31 
 
 
372 aa  82  0.00000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.444634  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0769  Rieske (2Fe-2S) domain protein  35.54 
 
 
497 aa  81.3  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4769  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  31.46 
 
 
367 aa  80.9  0.00000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.289545  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2687  Rieske (2Fe-2S) protein  39.29 
 
 
356 aa  81.3  0.00000000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3570  Rieske (2Fe-2S) region  25.64 
 
 
355 aa  80.5  0.00000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0161982  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4103  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  30.64 
 
 
374 aa  80.9  0.00000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011700  PHATRDRAFT_50613  Tic55 component of chloroplast import machinery  30.46 
 
 
498 aa  80.5  0.00000000000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0795  Rieske (2Fe-2S) domain protein  33.88 
 
 
497 aa  80.5  0.00000000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.266613  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4330  vanillate monooxygenase  28.86 
 
 
366 aa  80.5  0.00000000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0440139 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2297  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  32.1 
 
 
352 aa  80.1  0.00000000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.125012  normal  0.643759 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2258  Rieske (2Fe-2S) region  32.1 
 
 
352 aa  80.1  0.00000000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.236496  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2305  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  32.1 
 
 
352 aa  80.1  0.00000000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.560893  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2918  Rieske (2Fe-2S) domain protein  30 
 
 
337 aa  79.7  0.00000000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.333438  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6610  vanillate demethylase oxygenase subunit  27.23 
 
 
380 aa  80.1  0.00000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.581564  normal  0.184804 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1812  Rieske (2Fe-2S) region  31.43 
 
 
383 aa  80.1  0.00000000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0372125 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4233  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  31.33 
 
 
362 aa  80.1  0.00000000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2013  Rieske (2Fe-2S) family oxidoreductase large subunit  27.92 
 
 
348 aa  79.7  0.00000000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1016  dioxygenase, iron-sulfur subunit, putative  36.09 
 
 
369 aa  79  0.0000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.621392  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0127  Rieske (2Fe-2S) protein  32.89 
 
 
355 aa  79.7  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2310  vanillate monooxygenase  33.13 
 
 
362 aa  79  0.0000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0218143 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3212  Rieske 2Fe-2S family protein  30.04 
 
 
341 aa  78.2  0.0000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1056  Rieske (2Fe-2S) region  36.36 
 
 
499 aa  78.6  0.0000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00144994  hitchhiker  0.000116875 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2590  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  29.72 
 
 
341 aa  78.2  0.0000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.225432 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1105  Rieske (2Fe-2S) protein  26.36 
 
 
358 aa  78.2  0.0000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.080608  normal  0.368914 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1575  Rieske (2Fe-2S) protein  28.66 
 
 
346 aa  77.8  0.0000000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.869006  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1867  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  34.39 
 
 
388 aa  77.8  0.0000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.687816 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2035  hypothetical protein  31.25 
 
 
345 aa  77.8  0.0000000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0132  Rieske (2Fe-2S) protein  31.74 
 
 
343 aa  77.4  0.0000000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>