More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_0964 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011729  PCC7424_0964  Rieske (2Fe-2S) domain protein  100 
 
 
468 aa  978    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.1498 
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_40637  predicted protein  36.5 
 
 
510 aa  320  3e-86  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0769  Rieske (2Fe-2S) domain protein  32.55 
 
 
497 aa  257  3e-67  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0795  Rieske (2Fe-2S) domain protein  32.4 
 
 
497 aa  254  2.0000000000000002e-66  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.266613  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1056  Rieske (2Fe-2S) region  32.49 
 
 
499 aa  246  6e-64  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00144994  hitchhiker  0.000116875 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_43309  predicted protein  29.89 
 
 
492 aa  205  2e-51  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.231154  hitchhiker  0.00124797 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_26228  predicted protein  29.41 
 
 
668 aa  194  2e-48  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.281249  normal  0.273766 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1303  Rieske (2Fe-2S) region  32.46 
 
 
443 aa  187  5e-46  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.418357  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2958  pheophorbide a oxygenase  29.75 
 
 
442 aa  184  3e-45  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0467803  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3116  Pheophorbide a oxygenase  30.27 
 
 
442 aa  184  4.0000000000000006e-45  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0535  Rieske (2Fe-2S) region  32.18 
 
 
460 aa  177  3e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3793  pheophorbide a oxygenase  29.8 
 
 
443 aa  173  5e-42  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.726  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2189  Pheophorbide a oxygenase  31 
 
 
474 aa  170  4e-41  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00477289 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0864  cell death suppressor protein Lls1-like  30.56 
 
 
438 aa  168  2e-40  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.658605  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2931  Pheophorbide a oxygenase  29.59 
 
 
477 aa  167  2.9999999999999998e-40  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011700  PHATRDRAFT_50613  Tic55 component of chloroplast import machinery  28.18 
 
 
498 aa  164  3e-39  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1781  cell death suppressor protein Lls1-like  30.1 
 
 
456 aa  161  3e-38  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.527136  normal  0.0843855 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1557  Rieske (2Fe-2S) domain protein  29.57 
 
 
450 aa  156  7e-37  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0276963  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1530  Rieske (2Fe-2S) domain protein  29.57 
 
 
450 aa  155  1e-36  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4346  pheophorbide a oxygenase  28.12 
 
 
465 aa  154  4e-36  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.18517  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2164  cell death suppressor protein Lls1-like  27.19 
 
 
461 aa  150  6e-35  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.909867  normal  0.138548 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4257  Rieske (2Fe-2S) domain protein  28.01 
 
 
349 aa  100  5e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1067  vanillate monooxygenase  29.84 
 
 
359 aa  90.1  8e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.535746  normal  0.0980736 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0807  vanillate O-demethylase oxygenase subunit  32.39 
 
 
331 aa  90.1  8e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2979  Rieske (2Fe-2S) domain protein  30.05 
 
 
367 aa  89.7  9e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3574  Rieske (2Fe-2S) region  28.1 
 
 
349 aa  86.3  0.000000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1136  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  32.82 
 
 
373 aa  85.5  0.000000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.959251  normal  0.28876 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4419  Rieske (2Fe-2S) iron-sulfur domain-containing protein  30.17 
 
 
367 aa  84.7  0.000000000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.257041  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3671  oxidoreductase alpha subunit  31.43 
 
 
407 aa  85.1  0.000000000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0725789  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2590  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  30.46 
 
 
341 aa  84.3  0.000000000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.225432 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2013  Rieske (2Fe-2S) family oxidoreductase large subunit  29.21 
 
 
348 aa  82  0.00000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3212  Rieske 2Fe-2S family protein  30.46 
 
 
341 aa  81.6  0.00000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2500  Rieske (2Fe-2S) region  34.38 
 
 
359 aa  80.9  0.00000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.455012 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2268  Rieske (2Fe-2S) protein  29.71 
 
 
452 aa  80.1  0.00000000000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0946291  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0972  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  28.09 
 
 
355 aa  79.3  0.0000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1336  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  28.09 
 
 
355 aa  79.7  0.0000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.4835  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1234  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  28.09 
 
 
355 aa  79.7  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2494  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  28.09 
 
 
355 aa  79.7  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0319  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  28.09 
 
 
355 aa  79.7  0.0000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.456896  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1307  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  28.09 
 
 
355 aa  79.7  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.992701  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0595  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  28.09 
 
 
355 aa  79.3  0.0000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0958903  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3154  Rieske (2Fe-2S) domain protein  33.56 
 
 
221 aa  79  0.0000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.647374  normal  0.386497 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1501  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  28.89 
 
 
355 aa  79  0.0000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1175  Phthalate 4,5-dioxygenase  29.14 
 
 
452 aa  79  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.769494  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3396  vanillate monooxygenase  27.6 
 
 
348 aa  77.4  0.0000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00111775  normal  0.0140003 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4642  Rieske (2Fe-2S) domain protein  28.57 
 
 
355 aa  77.8  0.0000000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.44027  normal  0.0329483 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4510  Rieske (2Fe-2S) domain protein  28.57 
 
 
355 aa  77.8  0.0000000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0877  putative dioxygenase  28.89 
 
 
452 aa  77  0.0000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.297728  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0175  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  28.9 
 
 
363 aa  77  0.0000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8462  Rieske (2Fe-2S) domain protein  28.65 
 
 
448 aa  77.4  0.0000000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1867  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  28.09 
 
 
388 aa  77  0.0000000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.687816 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2143  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  31.22 
 
 
372 aa  77  0.0000000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.444634  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7059  Rieske (2Fe-2S) domain protein  27.75 
 
 
364 aa  76.3  0.000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.2387  normal  0.465604 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2050  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  28.37 
 
 
327 aa  76.3  0.000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0319051  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2687  Rieske (2Fe-2S) protein  30.46 
 
 
356 aa  76.3  0.000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2036  hypothetical protein  27.89 
 
 
334 aa  75.9  0.000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.502892  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1184  Rieske (2Fe-2S) domain protein  26.34 
 
 
358 aa  75.5  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3984  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  28.32 
 
 
356 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.643695  normal  0.0193847 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6610  vanillate demethylase oxygenase subunit  26.74 
 
 
380 aa  74.7  0.000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.581564  normal  0.184804 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2688  Rieske (2Fe-2S) protein  32.97 
 
 
352 aa  74.7  0.000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0132  Rieske (2Fe-2S) protein  29.94 
 
 
343 aa  74.7  0.000000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0741  Rieske (2Fe-2S) protein  25.71 
 
 
382 aa  74.3  0.000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0606248 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1009  vanillate demethylase  30.05 
 
 
353 aa  74.3  0.000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0048453  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3621  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  30.91 
 
 
377 aa  73.9  0.000000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0573672 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1687  Rieske (2Fe-2S) domain protein  25.54 
 
 
449 aa  73.6  0.000000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6021  Rieske (2Fe-2S) domain protein  26.9 
 
 
344 aa  73.6  0.000000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.174244  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1105  Rieske (2Fe-2S) protein  26.32 
 
 
358 aa  73.2  0.000000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.080608  normal  0.368914 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3062  phthalate 4,5-dioxygenase  23.89 
 
 
431 aa  73.6  0.000000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.021682 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2074  Rieske (2Fe-2S) domain protein  31.65 
 
 
217 aa  73.2  0.000000000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.12491  normal  0.0463704 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0127  Rieske (2Fe-2S) protein  27.65 
 
 
355 aa  73.2  0.000000000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4568  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  26.4 
 
 
356 aa  73.2  0.000000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.380862  hitchhiker  0.000303241 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4103  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  26.4 
 
 
356 aa  73.2  0.000000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.119091 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5789  Rieske (2Fe-2S) region  30.11 
 
 
349 aa  73.2  0.00000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3387  Rieske (2Fe-2S) region  31.21 
 
 
369 aa  72.8  0.00000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.662042  normal  0.0218971 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0627  Rieske (2Fe-2S) domain protein  26.97 
 
 
361 aa  72.8  0.00000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3658  Rieske (2Fe-2S) region  26.32 
 
 
356 aa  72.8  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4709  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  26.32 
 
 
356 aa  72.8  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.700082  normal  0.155037 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3214  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  26.11 
 
 
347 aa  72.4  0.00000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0195459 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3201  phthalate 4,5-dioxygenase  26.92 
 
 
436 aa  72.4  0.00000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1442  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  24.73 
 
 
324 aa  72  0.00000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000193123  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2137  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  30.23 
 
 
450 aa  72  0.00000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4769  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  25.58 
 
 
367 aa  72  0.00000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.289545  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4278  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  30.77 
 
 
362 aa  71.6  0.00000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.844018 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1488  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  25.14 
 
 
321 aa  71.6  0.00000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0113839  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1827  Rieske (2Fe-2S) region  24.6 
 
 
347 aa  71.2  0.00000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1686  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  29.14 
 
 
357 aa  71.2  0.00000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2918  Rieske (2Fe-2S) domain protein  28.64 
 
 
337 aa  71.2  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.333438  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4330  vanillate monooxygenase  27.55 
 
 
366 aa  71.2  0.00000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0440139 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5591  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  25.73 
 
 
356 aa  70.9  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00790855 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3266  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  28.72 
 
 
353 aa  71.2  0.00000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0113117 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5422  oxidoreductase protein  30.63 
 
 
230 aa  70.9  0.00000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.20856  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2919  Rieske (2Fe-2S) domain protein  30 
 
 
338 aa  70.9  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.563703  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2492  vanillate O-demethylase oxygenase subunit  24.37 
 
 
315 aa  70.9  0.00000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1872  Rieske (2Fe-2S) protein  28.14 
 
 
356 aa  70.9  0.00000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.171768  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0648  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  26.44 
 
 
361 aa  70.5  0.00000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.149026 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1103  Rieske (2Fe-2S) domain protein  26.4 
 
 
362 aa  70.5  0.00000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1241  Rieske (2Fe-2S) domain protein  30.6 
 
 
217 aa  70.1  0.00000000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.635525  normal  0.124818 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1549  vanillate monooxygenase  31.58 
 
 
359 aa  70.1  0.00000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.619122  normal  0.0130812 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5154  Rieske (2Fe-2S) region  28.65 
 
 
440 aa  70.1  0.00000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.291358  normal  0.277417 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1130  Rieske (2Fe-2S) domain protein  30.66 
 
 
362 aa  70.1  0.00000000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0812255  normal  0.937672 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>