32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_5432 on replicon NC_011988
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011988  Avi_5432  phenylpropionate dioxygenase  100 
 
 		 288 aa  595  1e-169  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2067  hypothetical protein  77.19 
 
 		 286 aa  447  1e-125  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0156668 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1234  hypothetical protein  76.14 
 
 		 286 aa  425  1e-118  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0239219  normal  0.493228 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1248  hypothetical protein  59.93 
 
 		 284 aa  339  2.9999999999999998e-92  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0789553 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2081  hypothetical protein  59.27 
 
 		 278 aa  331  8e-90  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00119001 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5416  vanillate O-demethylase oxygenase subunit  56.1 
 
 		 283 aa  330  2e-89  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.221202  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3148  hypothetical protein  58.57 
 
 		 288 aa  318  5e-86  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.282075 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4462  hypothetical protein  50 
 
 		 281 aa  266  2e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0193122 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6468  hypothetical protein  49.1 
 
 		 281 aa  265  5.999999999999999e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5871  hypothetical protein  43.92 
 
 		 301 aa  239  4e-62  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.789532  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1705  hypothetical protein  42.07 
 
 		 287 aa  217  2e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0851207  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2143  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  38.12 
 
 		 372 aa  124  3e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.444634  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0807  vanillate O-demethylase oxygenase subunit  29.36 
 
 		 331 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1136  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  34.12 
 
 		 373 aa  113  4.0000000000000004e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.959251  normal  0.28876 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1389  putative oxygenase  28.09 
 
 		 359 aa  82  0.000000000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0787  Rieske (2Fe-2S) protein  27.8 
 
 		 351 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.466147 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3567  Rieske (2Fe-2S) domain protein  26.67 
 
 		 344 aa  69.3  0.00000000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2919  Rieske (2Fe-2S) domain protein  40.51 
 
 		 338 aa  63.9  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.563703  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2297  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  25.16 
 
 		 352 aa  60.1  0.00000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.125012  normal  0.643759 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2305  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  25.16 
 
 		 352 aa  60.1  0.00000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.560893  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2258  Rieske (2Fe-2S) region  25.16 
 
 		 352 aa  60.1  0.00000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.236496  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6610  vanillate demethylase oxygenase subunit  28.69 
 
 		 380 aa  57.8  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.581564  normal  0.184804 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2034  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  27.12 
 
 		 400 aa  57.4  0.0000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.967449  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2035  hypothetical protein  26.57 
 
 		 345 aa  49.3  0.00007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4244  Rieske (2Fe-2S) domain protein  24.89 
 
 		 352 aa  48.9  0.00009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2918  Rieske (2Fe-2S) domain protein  24.74 
 
 		 337 aa  48.5  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.333438  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1261  hypothetical protein  22.68 
 
 		 340 aa  48.1  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0803695 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4245  Rieske (2Fe-2S) domain protein  26.63 
 
 		 371 aa  46.2  0.0007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1718  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  26.42 
 
 		 357 aa  44.3  0.002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.187317  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2590  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  26.43 
 
 		 341 aa  43.9  0.003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.225432 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2037  Rieske (2Fe-2S) domain protein  26.42 
 
 		 357 aa  43.5  0.004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.950553  normal  0.781731 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1096  Rieske (2Fe-2S) domain protein  26.42 
 
 		 357 aa  42.7  0.008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0810231  normal  0.184537 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>