38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_1705 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_1705  hypothetical protein  100 
 
 		 287 aa  593  1e-168  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0851207  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5871  hypothetical protein  51.72 
 
 		 301 aa  241  9e-63  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.789532  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5416  vanillate O-demethylase oxygenase subunit  42.76 
 
 		 283 aa  230  2e-59  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.221202  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1248  hypothetical protein  46.21 
 
 		 284 aa  229  4e-59  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0789553 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2081  hypothetical protein  45.2 
 
 		 278 aa  226  3e-58  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00119001 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5432  phenylpropionate dioxygenase  42.07 
 
 		 288 aa  217  2e-55  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6468  hypothetical protein  40.71 
 
 		 281 aa  214  9.999999999999999e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3148  hypothetical protein  43.42 
 
 		 288 aa  213  3.9999999999999995e-54  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.282075 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2067  hypothetical protein  42.61 
 
 		 286 aa  212  7e-54  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0156668 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1234  hypothetical protein  48.66 
 
 		 286 aa  210  2e-53  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0239219  normal  0.493228 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4462  hypothetical protein  40 
 
 		 281 aa  210  2e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0193122 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1136  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  37.34 
 
 		 373 aa  145  7.0000000000000006e-34  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.959251  normal  0.28876 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2143  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  40.69 
 
 		 372 aa  140  1.9999999999999998e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.444634  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0807  vanillate O-demethylase oxygenase subunit  38.79 
 
 		 331 aa  137  1e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1389  putative oxygenase  26.18 
 
 		 359 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3567  Rieske (2Fe-2S) domain protein  26.69 
 
 		 344 aa  70.1  0.00000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4245  Rieske (2Fe-2S) domain protein  26.64 
 
 		 371 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2297  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  27.8 
 
 		 352 aa  67.8  0.0000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.125012  normal  0.643759 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2305  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  27.8 
 
 		 352 aa  67.8  0.0000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.560893  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2258  Rieske (2Fe-2S) region  27.8 
 
 		 352 aa  67.8  0.0000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.236496  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4244  Rieske (2Fe-2S) domain protein  28.45 
 
 		 352 aa  67  0.0000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2034  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  25.42 
 
 		 400 aa  64.3  0.000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.967449  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2036  hypothetical protein  27.39 
 
 		 334 aa  58.9  0.00000008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.502892  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0787  Rieske (2Fe-2S) protein  26.89 
 
 		 351 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.466147 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5685  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  28.08 
 
 		 353 aa  58.2  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0319041  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0217  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  26.16 
 
 		 437 aa  57.4  0.0000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2035  hypothetical protein  24.78 
 
 		 345 aa  56.2  0.0000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1096  Rieske (2Fe-2S) domain protein  27.86 
 
 		 357 aa  53.9  0.000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0810231  normal  0.184537 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1718  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  27.36 
 
 		 357 aa  53.1  0.000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.187317  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2013  Rieske (2Fe-2S) family oxidoreductase large subunit  28.12 
 
 		 348 aa  53.1  0.000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2037  Rieske (2Fe-2S) domain protein  27.36 
 
 		 357 aa  52.4  0.000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.950553  normal  0.781731 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3212  Rieske 2Fe-2S family protein  26.67 
 
 		 341 aa  52.4  0.00001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2590  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  34.88 
 
 		 341 aa  50.4  0.00003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.225432 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2919  Rieske (2Fe-2S) domain protein  25.64 
 
 		 338 aa  50.4  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.563703  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2918  Rieske (2Fe-2S) domain protein  24.78 
 
 		 337 aa  47  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.333438  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0127  Rieske (2Fe-2S) protein  25.68 
 
 		 355 aa  46.6  0.0004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6610  vanillate demethylase oxygenase subunit  21.98 
 
 		 380 aa  47  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.581564  normal  0.184804 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1261  hypothetical protein  33.33 
 
 		 340 aa  46.2  0.0006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0803695 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>