More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_B0787 on replicon NC_007511
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007511  Bcep18194_B0787  Rieske (2Fe-2S) protein  100 
 
 
351 aa  715    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.466147 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1389  putative oxygenase  57.57 
 
 
359 aa  382  1e-105  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3567  Rieske (2Fe-2S) domain protein  56.08 
 
 
344 aa  379  1e-104  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2143  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  36.23 
 
 
372 aa  171  2e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.444634  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4245  Rieske (2Fe-2S) domain protein  33.24 
 
 
371 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4244  Rieske (2Fe-2S) domain protein  31.89 
 
 
352 aa  163  4.0000000000000004e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2035  hypothetical protein  34.69 
 
 
345 aa  163  5.0000000000000005e-39  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2919  Rieske (2Fe-2S) domain protein  34.03 
 
 
338 aa  156  6e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.563703  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1136  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  33.93 
 
 
373 aa  155  1e-36  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.959251  normal  0.28876 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2918  Rieske (2Fe-2S) domain protein  31.97 
 
 
337 aa  150  2e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.333438  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1096  Rieske (2Fe-2S) domain protein  31.95 
 
 
357 aa  149  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0810231  normal  0.184537 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1718  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  31.76 
 
 
357 aa  146  4.0000000000000006e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.187317  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2037  Rieske (2Fe-2S) domain protein  31.76 
 
 
357 aa  145  1e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.950553  normal  0.781731 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2590  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  32.53 
 
 
341 aa  144  3e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.225432 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1261  hypothetical protein  31.56 
 
 
340 aa  140  3e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0803695 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2013  Rieske (2Fe-2S) family oxidoreductase large subunit  33.33 
 
 
348 aa  139  7e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3212  Rieske 2Fe-2S family protein  30.7 
 
 
341 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2036  hypothetical protein  29.66 
 
 
334 aa  136  5e-31  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.502892  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6610  vanillate demethylase oxygenase subunit  31.69 
 
 
380 aa  130  5.0000000000000004e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.581564  normal  0.184804 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2492  vanillate O-demethylase oxygenase subunit  27.44 
 
 
315 aa  129  6e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1185  Rieske (2Fe-2S) domain protein  29.06 
 
 
364 aa  127  3e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5685  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  31.08 
 
 
353 aa  124  2e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0319041  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3968  Rieske (2Fe-2S) domain protein  28.32 
 
 
360 aa  122  7e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0886212  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0807  vanillate O-demethylase oxygenase subunit  31.48 
 
 
331 aa  122  9.999999999999999e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1184  Rieske (2Fe-2S) domain protein  29.79 
 
 
358 aa  121  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2297  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  31.23 
 
 
352 aa  117  3e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.125012  normal  0.643759 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2258  Rieske (2Fe-2S) region  31.23 
 
 
352 aa  117  3e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.236496  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2034  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  27.83 
 
 
400 aa  117  3e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.967449  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2305  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  31.23 
 
 
352 aa  117  3e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.560893  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2050  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  28.57 
 
 
327 aa  116  6.9999999999999995e-25  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0319051  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1530  Rieske (2Fe-2S) domain protein  31.3 
 
 
450 aa  112  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1557  Rieske (2Fe-2S) domain protein  31.3 
 
 
450 aa  112  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0276963  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1550  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  34.5 
 
 
353 aa  108  1e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.276626  normal  0.0604744 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4769  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  28.28 
 
 
367 aa  105  1e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.289545  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3967  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  27.67 
 
 
347 aa  104  2e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1686  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  35.93 
 
 
357 aa  101  2e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1352  vanillate monooxygenase  32.47 
 
 
363 aa  101  2e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0344  Rieske (2Fe-2S) protein  28.3 
 
 
353 aa  100  3e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1501  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  27.69 
 
 
355 aa  100  4e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1105  Rieske (2Fe-2S) protein  27.69 
 
 
358 aa  99.4  8e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.080608  normal  0.368914 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3681  Rieske (2Fe-2S) region  26.07 
 
 
346 aa  99.4  8e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.2267  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3246  vanillate monooxygenase  43.64 
 
 
347 aa  99.4  9e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.546586  normal  0.604076 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1336  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  27.38 
 
 
355 aa  99  1e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.4835  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0319  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  27.38 
 
 
355 aa  99  1e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.456896  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2494  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  27.38 
 
 
355 aa  99  1e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7059  Rieske (2Fe-2S) domain protein  27.08 
 
 
364 aa  99  1e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.2387  normal  0.465604 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1234  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  27.38 
 
 
355 aa  99  1e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3984  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  27.08 
 
 
356 aa  98.6  1e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.643695  normal  0.0193847 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1307  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  27.38 
 
 
355 aa  99  1e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.992701  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0963  vanillate O-demethylase oxygenase subunit  27.61 
 
 
350 aa  97.8  2e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0595  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  27.38 
 
 
355 aa  98.2  2e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0958903  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0972  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  27.38 
 
 
355 aa  98.2  2e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2285  vanillate monooxygenase  34.52 
 
 
367 aa  97.1  4e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.138524 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3658  Rieske (2Fe-2S) region  27.52 
 
 
356 aa  97.1  4e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4709  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  27.52 
 
 
356 aa  97.1  4e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.700082  normal  0.155037 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0867  Rieske (2Fe-2S) region  27.56 
 
 
357 aa  97.1  5e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4103  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  28.44 
 
 
356 aa  96.7  5e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.119091 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2904  vanillate O-demethylase, oxygenase subunit  27.04 
 
 
354 aa  96.7  6e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.179444  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2708  Rieske [2Fe-2S] region  28.06 
 
 
354 aa  96.3  6e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.104354  normal  0.0620392 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3570  Rieske (2Fe-2S) region  26.18 
 
 
355 aa  96.7  6e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0161982  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0175  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  27.22 
 
 
363 aa  96.7  6e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5591  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  27.52 
 
 
356 aa  96.3  7e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00790855 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4233  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  27.38 
 
 
362 aa  96.3  7e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4568  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  28.13 
 
 
356 aa  95.5  1e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.380862  hitchhiker  0.000303241 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0336  Rieske (2Fe-2S) protein  26.3 
 
 
370 aa  95.9  1e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4278  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  33.33 
 
 
362 aa  94.7  2e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.844018 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5781  Rieske (2Fe-2S) region  28.71 
 
 
417 aa  95.1  2e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5693  Rieske (2Fe-2S) domain protein  26.65 
 
 
352 aa  94.7  2e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0132  Rieske (2Fe-2S) protein  27.44 
 
 
343 aa  95.1  2e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0535  Rieske (2Fe-2S) region  29.04 
 
 
460 aa  94.4  3e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1067  vanillate monooxygenase  28.93 
 
 
359 aa  94  3e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.535746  normal  0.0980736 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1549  vanillate monooxygenase  29.23 
 
 
359 aa  92.4  9e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.619122  normal  0.0130812 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0222  vanillate O-demethylase oxygenase subunit oxidoreductase protein  31.91 
 
 
342 aa  92  1e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.0000016692  normal  0.0221534 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2979  Rieske (2Fe-2S) domain protein  30.56 
 
 
367 aa  92.4  1e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5029  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  26.03 
 
 
359 aa  92.4  1e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.773131 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2725  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  28.57 
 
 
354 aa  92  1e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0149406 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4330  vanillate monooxygenase  29.06 
 
 
366 aa  92.4  1e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0440139 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3736  Rieske (2Fe-2S) domain protein  26.52 
 
 
355 aa  91.7  2e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.554225  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6324  phthalate 4,5-dioxygenase  30.08 
 
 
437 aa  91.7  2e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1575  Rieske (2Fe-2S) protein  27.03 
 
 
346 aa  91.3  2e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.869006  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2027  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  26.52 
 
 
355 aa  91.7  2e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3124  Rieske (2Fe-2S) region  26.03 
 
 
359 aa  91.3  2e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.439622  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5243  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  26.03 
 
 
359 aa  91.3  2e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1687  Rieske (2Fe-2S) domain protein  33.14 
 
 
449 aa  90.9  3e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3574  Rieske (2Fe-2S) region  30.72 
 
 
349 aa  90.9  3e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1687  vanillate monooxygenase  31.03 
 
 
338 aa  90.9  3e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0420  Rieske (2Fe-2S) protein  25.76 
 
 
373 aa  90.5  4e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0741  Rieske (2Fe-2S) protein  30.12 
 
 
382 aa  90.5  4e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0606248 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1559  vanillate monooxygenase  31.69 
 
 
347 aa  90.5  4e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.662697  normal  0.47859 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3952  Rieske (2Fe-2S) protein  28.3 
 
 
340 aa  90.5  4e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.13771  normal  0.112958 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2170  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  27.16 
 
 
355 aa  90.5  4e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.461217  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5800  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  40.14 
 
 
354 aa  90.1  5e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00198597 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3409  vanillate monooxygenase  31.9 
 
 
347 aa  90.1  5e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0915562 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1103  Rieske (2Fe-2S) domain protein  32.14 
 
 
362 aa  90.1  5e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5678  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  32.76 
 
 
408 aa  89.7  7e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.0000120872  normal  0.0293014 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_43309  predicted protein  25.92 
 
 
492 aa  89.7  8e-17  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.231154  hitchhiker  0.00124797 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5901  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  32.76 
 
 
408 aa  89.7  8e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00683325  hitchhiker  0.00740172 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1488  Rieske (2Fe-2S) protein  26.93 
 
 
351 aa  88.6  1e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1130  Rieske (2Fe-2S) domain protein  32.14 
 
 
362 aa  89  1e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0812255  normal  0.937672 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3062  phthalate 4,5-dioxygenase  33.92 
 
 
431 aa  88.6  1e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.021682 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>