More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_4244 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010676  Bphyt_4244  Rieske (2Fe-2S) domain protein  100 
 
 
352 aa  732    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4245  Rieske (2Fe-2S) domain protein  34.2 
 
 
371 aa  202  6e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2035  hypothetical protein  33.03 
 
 
345 aa  170  3e-41  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0787  Rieske (2Fe-2S) protein  31.89 
 
 
351 aa  163  4.0000000000000004e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.466147 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2919  Rieske (2Fe-2S) domain protein  32.87 
 
 
338 aa  154  2e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.563703  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2034  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  27.69 
 
 
400 aa  154  2e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.967449  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2143  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  33.43 
 
 
372 aa  154  2.9999999999999998e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.444634  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2918  Rieske (2Fe-2S) domain protein  32.41 
 
 
337 aa  150  4e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.333438  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3567  Rieske (2Fe-2S) domain protein  31.61 
 
 
344 aa  149  8e-35  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1136  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  33.03 
 
 
373 aa  145  1e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.959251  normal  0.28876 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1389  putative oxygenase  30.25 
 
 
359 aa  144  3e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3212  Rieske 2Fe-2S family protein  29.63 
 
 
341 aa  135  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3968  Rieske (2Fe-2S) domain protein  30.9 
 
 
360 aa  134  3e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0886212  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2590  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  29.73 
 
 
341 aa  133  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.225432 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1096  Rieske (2Fe-2S) domain protein  30.34 
 
 
357 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0810231  normal  0.184537 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2036  hypothetical protein  28.61 
 
 
334 aa  131  1.0000000000000001e-29  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.502892  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2037  Rieske (2Fe-2S) domain protein  29.76 
 
 
357 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.950553  normal  0.781731 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2013  Rieske (2Fe-2S) family oxidoreductase large subunit  29.01 
 
 
348 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1718  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  29.41 
 
 
357 aa  130  5.0000000000000004e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.187317  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2305  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  31.96 
 
 
352 aa  129  6e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.560893  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2297  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  31.96 
 
 
352 aa  129  6e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.125012  normal  0.643759 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2258  Rieske (2Fe-2S) region  31.96 
 
 
352 aa  129  6e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.236496  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1184  Rieske (2Fe-2S) domain protein  29.31 
 
 
358 aa  128  1.0000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1185  Rieske (2Fe-2S) domain protein  27.79 
 
 
364 aa  127  4.0000000000000003e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2492  vanillate O-demethylase oxygenase subunit  29.05 
 
 
315 aa  126  4.0000000000000003e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0807  vanillate O-demethylase oxygenase subunit  30.47 
 
 
331 aa  125  8.000000000000001e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1261  hypothetical protein  29.05 
 
 
340 aa  125  9e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0803695 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5685  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  30.95 
 
 
353 aa  123  5e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0319041  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2050  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  30.74 
 
 
327 aa  120  3e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0319051  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6610  vanillate demethylase oxygenase subunit  28.9 
 
 
380 aa  119  7.999999999999999e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.581564  normal  0.184804 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1867  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  28.39 
 
 
388 aa  111  2.0000000000000002e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.687816 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_43309  predicted protein  37.3 
 
 
492 aa  108  2e-22  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.231154  hitchhiker  0.00124797 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1550  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  28.85 
 
 
353 aa  107  3e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.276626  normal  0.0604744 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2686  Rieske (2Fe-2S) protein  37.74 
 
 
376 aa  106  7e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5126  vanillate monooxygenase  31.27 
 
 
352 aa  105  1e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3119  vanillate monooxygenase  28.53 
 
 
358 aa  104  2e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4593  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  30.57 
 
 
353 aa  103  5e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.743349  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0418  Rieske (2Fe-2S) protein  30.62 
 
 
353 aa  101  2e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.842278  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1530  Rieske (2Fe-2S) domain protein  24.71 
 
 
450 aa  101  2e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1557  Rieske (2Fe-2S) domain protein  24.41 
 
 
450 aa  101  2e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0276963  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2285  vanillate monooxygenase  28.38 
 
 
367 aa  99.8  6e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.138524 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0175  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  26.23 
 
 
363 aa  98.6  1e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5546  putative vanillate O-demethylase oxygenase subunit (4-hydroxy- 3-methoxybenzoate demethylase)  24.61 
 
 
347 aa  99  1e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1370  vanillate monooxygenase  26.51 
 
 
363 aa  98.6  2e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1872  Rieske (2Fe-2S) protein  29.89 
 
 
356 aa  98.6  2e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.171768  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0280  Rieske (2Fe-2S) protein  26.76 
 
 
351 aa  95.9  9e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.226935  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7059  Rieske (2Fe-2S) domain protein  26.23 
 
 
364 aa  95.5  1e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.2387  normal  0.465604 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3246  vanillate monooxygenase  26.71 
 
 
347 aa  94.4  3e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.546586  normal  0.604076 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3671  oxidoreductase alpha subunit  32.96 
 
 
407 aa  94  4e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0725789  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1009  vanillate demethylase  29.19 
 
 
353 aa  93.6  4e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0048453  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0436  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  35.95 
 
 
326 aa  93.2  6e-18  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4330  vanillate monooxygenase  31.7 
 
 
366 aa  92.8  7e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0440139 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1103  Rieske (2Fe-2S) domain protein  39.09 
 
 
362 aa  92.4  9e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4269  vanillate monooxygenase  28.43 
 
 
351 aa  92  1e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.846398 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5800  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  27 
 
 
354 aa  91.7  2e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00198597 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3542  vanillate O-demethylase oxygenase subunit  27.39 
 
 
345 aa  91.3  3e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.10385 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1687  vanillate monooxygenase  26.93 
 
 
338 aa  90.1  5e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6483  Rieske (2Fe-2S) region  25.94 
 
 
358 aa  90.1  5e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5029  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  27.01 
 
 
359 aa  90.1  5e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.773131 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3952  Rieske (2Fe-2S) protein  25.57 
 
 
340 aa  90.1  5e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.13771  normal  0.112958 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1442  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  33.14 
 
 
324 aa  90.1  5e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000193123  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4568  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  26.89 
 
 
356 aa  89.7  7e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.380862  hitchhiker  0.000303241 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3570  Rieske (2Fe-2S) region  24.53 
 
 
355 aa  89.4  8e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0161982  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0867  Rieske (2Fe-2S) region  25.15 
 
 
357 aa  89.4  8e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1130  Rieske (2Fe-2S) domain protein  38.89 
 
 
362 aa  89.4  9e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0812255  normal  0.937672 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1355  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  28.1 
 
 
358 aa  89.4  1e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6986  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  26.67 
 
 
374 aa  88.6  1e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.529476  normal  0.476808 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1488  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  33.33 
 
 
321 aa  89  1e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0113839  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4769  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  31.11 
 
 
367 aa  88.2  2e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.289545  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5243  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  27.01 
 
 
359 aa  88.6  2e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0344  Rieske (2Fe-2S) protein  29.35 
 
 
353 aa  88.2  2e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3124  Rieske (2Fe-2S) region  27.01 
 
 
359 aa  88.6  2e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.439622  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4103  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  26.89 
 
 
356 aa  88.6  2e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.119091 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5678  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  34.64 
 
 
408 aa  87.8  3e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.0000120872  normal  0.0293014 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5901  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  34.64 
 
 
408 aa  87.8  3e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00683325  hitchhiker  0.00740172 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0630  Rieske (2Fe-2S) iron-sulfur domain protein  31.91 
 
 
330 aa  87.4  4e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5267  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  27.17 
 
 
370 aa  86.7  5e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6709  Rieske (2Fe-2S) protein  27.17 
 
 
373 aa  87  5e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2979  Rieske (2Fe-2S) domain protein  33.09 
 
 
367 aa  86.7  5e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2189  Pheophorbide a oxygenase  32.47 
 
 
474 aa  87  5e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00477289 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4729  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  26.79 
 
 
370 aa  86.7  5e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3658  Rieske (2Fe-2S) region  25.08 
 
 
356 aa  86.7  6e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4709  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  25.08 
 
 
356 aa  86.7  6e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.700082  normal  0.155037 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1352  vanillate monooxygenase  26.69 
 
 
363 aa  86.3  7e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1781  cell death suppressor protein Lls1-like  33.51 
 
 
456 aa  86.3  7e-16  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.527136  normal  0.0843855 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5591  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  25.66 
 
 
356 aa  86.3  7e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00790855 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1827  Rieske (2Fe-2S) region  36.79 
 
 
347 aa  86.3  8e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1105  Rieske (2Fe-2S) protein  25 
 
 
358 aa  86.3  8e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.080608  normal  0.368914 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3529  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  32.06 
 
 
433 aa  86.3  8e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.551503  normal  0.104416 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2310  vanillate monooxygenase  30.72 
 
 
362 aa  86.3  8e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0218143 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1559  vanillate monooxygenase  32.56 
 
 
347 aa  85.9  9e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.662697  normal  0.47859 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6021  Rieske (2Fe-2S) domain protein  33.33 
 
 
344 aa  85.9  0.000000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.174244  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1336  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  24.84 
 
 
355 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.4835  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2494  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  24.84 
 
 
355 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2164  cell death suppressor protein Lls1-like  25.47 
 
 
461 aa  85.5  0.000000000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.909867  normal  0.138548 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1234  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  24.84 
 
 
355 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0319  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  24.84 
 
 
355 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.456896  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1307  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  24.84 
 
 
355 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.992701  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4591  vanillate monooxygenase  26.69 
 
 
373 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.672566 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4257  Rieske (2Fe-2S) domain protein  38.32 
 
 
349 aa  85.1  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>