More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_C6324 on replicon NC_007336
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007336  Reut_C6324  phthalate 4,5-dioxygenase  100 
 
 
437 aa  907    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5548  putative Phthalate 4,5-dioxygenase subunit alpha  37.22 
 
 
439 aa  239  9e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5781  Rieske (2Fe-2S) region  33.99 
 
 
417 aa  228  2e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7254  Rieske (2Fe-2S) domain protein  36.22 
 
 
430 aa  228  2e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2370  putative phthalate 4,5-dioxygenase oxygenase subunit (OhpA2)  34.51 
 
 
440 aa  216  5e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000399664  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0574  phthalate 4,5-dioxygenase  35.38 
 
 
406 aa  210  4e-53  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.105836  normal  0.217979 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3529  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  35.88 
 
 
433 aa  209  6e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.551503  normal  0.104416 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3537  aromatic acid dioxygenase alpha subunit  34.01 
 
 
440 aa  209  6e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.329598 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3532  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  33 
 
 
446 aa  200  3.9999999999999996e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.048657  normal  0.0515471 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4795  phthalate 4,5-dioxygenase  33.25 
 
 
412 aa  189  7e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.269335  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4882  phthalate 4,5-dioxygenase  33.25 
 
 
422 aa  188  1e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1445  Rieske (2Fe-2S) protein  30.41 
 
 
437 aa  183  6e-45  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.491711  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3201  phthalate 4,5-dioxygenase  29.53 
 
 
436 aa  181  2.9999999999999997e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4881  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  30.22 
 
 
434 aa  180  4.999999999999999e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4805  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  33.03 
 
 
443 aa  179  7e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0495821  normal 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5154  Rieske (2Fe-2S) region  31.14 
 
 
440 aa  179  8e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.291358  normal  0.277417 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4958  Rieske (2Fe-2S) domain protein  33.18 
 
 
443 aa  174  2.9999999999999996e-42  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.879177  normal  0.275764 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2779  Rieske (2Fe-2S) domain protein  33.18 
 
 
443 aa  174  2.9999999999999996e-42  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.261515  normal  0.259625 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0877  putative dioxygenase  30.47 
 
 
452 aa  173  5.999999999999999e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.297728  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1175  Phthalate 4,5-dioxygenase  30 
 
 
452 aa  172  1e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.769494  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2268  Rieske (2Fe-2S) protein  30.75 
 
 
452 aa  171  2e-41  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0946291  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1910  phthalate 4,5-dioxygenase, oxygenase subunit  31.19 
 
 
438 aa  164  3e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.578876  normal  0.581965 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6982  phthalate 4,5-dioxygenase  27.58 
 
 
438 aa  164  4.0000000000000004e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2928  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  31.94 
 
 
445 aa  161  2e-38  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.149906  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8462  Rieske (2Fe-2S) domain protein  30.27 
 
 
448 aa  161  3e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4627  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  31.68 
 
 
417 aa  159  1e-37  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2359  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  29.24 
 
 
410 aa  147  3e-34  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.128163  normal  0.731078 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0555  phthalate 4,5-dioxygenase  32.39 
 
 
470 aa  138  2e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.547165  normal  0.18525 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3062  phthalate 4,5-dioxygenase  29.36 
 
 
431 aa  134  3e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.021682 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4297  phthalate 4,5-dioxygenase  30.2 
 
 
392 aa  133  6.999999999999999e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1687  Rieske (2Fe-2S) domain protein  32.5 
 
 
449 aa  131  3e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2133  twin-arginine translocation pathway signal  26.35 
 
 
484 aa  129  1.0000000000000001e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.395399  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5678  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  39.25 
 
 
408 aa  124  3e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.0000120872  normal  0.0293014 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5901  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  39.25 
 
 
408 aa  124  3e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00683325  hitchhiker  0.00740172 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1001  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  36.57 
 
 
380 aa  122  9.999999999999999e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1044  phthalate 4,5-dioxygenase  29.58 
 
 
454 aa  119  7e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.714091 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1473  Rieske (2Fe-2S) region  31.5 
 
 
398 aa  118  1.9999999999999998e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.826795  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1543  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  31.71 
 
 
519 aa  116  6.9999999999999995e-25  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.453445  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1184  Rieske (2Fe-2S) domain protein  31.58 
 
 
358 aa  100  5e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10960  ferridoxin oxidoreductase subunit  33.33 
 
 
370 aa  99.8  8e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1552  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  34.84 
 
 
367 aa  99.8  9e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.190198 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2919  Rieske (2Fe-2S) domain protein  32.26 
 
 
338 aa  99.4  1e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.563703  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1185  Rieske (2Fe-2S) domain protein  33.56 
 
 
364 aa  97.8  4e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4330  vanillate monooxygenase  31.44 
 
 
366 aa  95.5  2e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0440139 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1559  vanillate monooxygenase  35.15 
 
 
347 aa  94.7  3e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.662697  normal  0.47859 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5546  putative vanillate O-demethylase oxygenase subunit (4-hydroxy- 3-methoxybenzoate demethylase)  32.37 
 
 
347 aa  94  5e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3542  vanillate O-demethylase oxygenase subunit  32.35 
 
 
345 aa  93.2  8e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.10385 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2285  vanillate monooxygenase  28.65 
 
 
367 aa  92  2e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.138524 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2035  hypothetical protein  27.84 
 
 
345 aa  91.7  2e-17  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0787  Rieske (2Fe-2S) protein  30.08 
 
 
351 aa  91.7  3e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.466147 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3119  vanillate monooxygenase  42.24 
 
 
358 aa  91.7  3e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_43309  predicted protein  32.39 
 
 
492 aa  91.7  3e-17  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.231154  hitchhiker  0.00124797 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3671  oxidoreductase alpha subunit  33.92 
 
 
407 aa  90.5  5e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0725789  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4593  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  32.72 
 
 
353 aa  90.5  5e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.743349  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5126  vanillate monooxygenase  32.72 
 
 
352 aa  89.7  8e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6610  vanillate demethylase oxygenase subunit  32.24 
 
 
380 aa  89  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.581564  normal  0.184804 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2050  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  28.48 
 
 
327 aa  88.6  2e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0319051  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1355  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  32.72 
 
 
358 aa  87.8  3e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0418  Rieske (2Fe-2S) protein  40 
 
 
353 aa  87.8  3e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.842278  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2137  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  32.02 
 
 
450 aa  87.8  4e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1687  vanillate monooxygenase  27.27 
 
 
338 aa  87  6e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4769  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  29.34 
 
 
367 aa  85.1  0.000000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.289545  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1370  vanillate monooxygenase  28.16 
 
 
363 aa  84.3  0.000000000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2686  Rieske (2Fe-2S) protein  28.33 
 
 
376 aa  84.3  0.000000000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3567  Rieske (2Fe-2S) domain protein  26.05 
 
 
344 aa  84.3  0.000000000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1009  vanillate demethylase  31.76 
 
 
353 aa  84  0.000000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0048453  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1541  vanillate monooxygenase  29.17 
 
 
423 aa  84.3  0.000000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00031597  hitchhiker  0.00167065 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2590  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  33.33 
 
 
341 aa  84.3  0.000000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.225432 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3968  Rieske (2Fe-2S) domain protein  27.44 
 
 
360 aa  84.3  0.000000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0886212  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4278  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  30.77 
 
 
362 aa  84  0.000000000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.844018 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2918  Rieske (2Fe-2S) domain protein  27.81 
 
 
337 aa  84  0.000000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.333438  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1488  Rieske (2Fe-2S) protein  33.33 
 
 
351 aa  84  0.000000000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1676  Rieske (2Fe-2S) domain protein  31.11 
 
 
349 aa  83.6  0.000000000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.945696  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2036  hypothetical protein  27.91 
 
 
334 aa  83.6  0.000000000000007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.502892  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1872  Rieske (2Fe-2S) protein  28.16 
 
 
356 aa  83.6  0.000000000000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.171768  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1649  Rieske (2Fe-2S) domain protein  31.11 
 
 
370 aa  83.6  0.000000000000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1550  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  31.82 
 
 
353 aa  83.2  0.000000000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.276626  normal  0.0604744 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3212  Rieske 2Fe-2S family protein  33.33 
 
 
341 aa  82.8  0.00000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5789  Rieske (2Fe-2S) region  33.33 
 
 
349 aa  82.8  0.00000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3413  vanillate monooxygenase  27.66 
 
 
345 aa  82.4  0.00000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.166087 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1867  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  29.08 
 
 
388 aa  82  0.00000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.687816 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1718  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  27.17 
 
 
357 aa  82.4  0.00000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.187317  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4139  Vanillate monooxygenase  28.57 
 
 
347 aa  82.4  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.105569  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0993  Rieske (2Fe-2S) region  30.61 
 
 
350 aa  81.6  0.00000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  unclonable  0.00000318811 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2013  Rieske (2Fe-2S) family oxidoreductase large subunit  29.71 
 
 
348 aa  82  0.00000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0336  Rieske (2Fe-2S) protein  25.86 
 
 
370 aa  82  0.00000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2492  vanillate O-demethylase oxygenase subunit  30.77 
 
 
315 aa  82  0.00000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4340  Rieske (2Fe-2S) region  31.33 
 
 
350 aa  81.3  0.00000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3410  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  26.83 
 
 
357 aa  81.3  0.00000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0474443 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1389  putative oxygenase  33.33 
 
 
359 aa  81.3  0.00000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2037  Rieske (2Fe-2S) domain protein  27.17 
 
 
357 aa  81.3  0.00000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.950553  normal  0.781731 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4861  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  31.21 
 
 
365 aa  81.3  0.00000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.641783  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1442  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  30 
 
 
324 aa  80.5  0.00000000000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000193123  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3246  vanillate monooxygenase  30.92 
 
 
347 aa  80.5  0.00000000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.546586  normal  0.604076 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1549  vanillate monooxygenase  30.95 
 
 
359 aa  80.1  0.00000000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.619122  normal  0.0130812 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2825  iron-sulfur cluster-binding protein, Rieske family  32.56 
 
 
358 aa  80.1  0.00000000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.000971916  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0481  Rieske (2Fe-2S) iron-sulfur domain-containing protein  35 
 
 
353 aa  80.1  0.00000000000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0971818  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1241  Rieske (2Fe-2S) domain protein  37.11 
 
 
217 aa  80.1  0.00000000000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.635525  normal  0.124818 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0127  Rieske (2Fe-2S) protein  28.99 
 
 
355 aa  79.7  0.00000000000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2074  Rieske (2Fe-2S) domain protein  37.11 
 
 
217 aa  79.7  0.00000000000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.12491  normal  0.0463704 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>