More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A1473 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007347  Reut_A1473  Rieske (2Fe-2S) region  100 
 
 
398 aa  820    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.826795  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4297  phthalate 4,5-dioxygenase  38.87 
 
 
392 aa  238  2e-61  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0555  phthalate 4,5-dioxygenase  39.36 
 
 
470 aa  226  5.0000000000000005e-58  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.547165  normal  0.18525 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1044  phthalate 4,5-dioxygenase  35.37 
 
 
454 aa  206  9e-52  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.714091 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1543  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  33.93 
 
 
519 aa  184  2.0000000000000003e-45  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.453445  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2268  Rieske (2Fe-2S) protein  30.51 
 
 
452 aa  169  8e-41  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0946291  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8462  Rieske (2Fe-2S) domain protein  31.67 
 
 
448 aa  169  1e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1175  Phthalate 4,5-dioxygenase  30.02 
 
 
452 aa  167  2e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.769494  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0877  putative dioxygenase  29.95 
 
 
452 aa  166  5e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.297728  normal 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5154  Rieske (2Fe-2S) region  31.38 
 
 
440 aa  163  5.0000000000000005e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.291358  normal  0.277417 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3201  phthalate 4,5-dioxygenase  31.81 
 
 
436 aa  157  3e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1445  Rieske (2Fe-2S) protein  31.04 
 
 
437 aa  156  5.0000000000000005e-37  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.491711  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5901  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  31.52 
 
 
408 aa  156  6e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00683325  hitchhiker  0.00740172 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5678  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  31.25 
 
 
408 aa  155  1e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.0000120872  normal  0.0293014 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6982  phthalate 4,5-dioxygenase  29.13 
 
 
438 aa  150  4e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3062  phthalate 4,5-dioxygenase  32.08 
 
 
431 aa  149  1.0000000000000001e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.021682 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5781  Rieske (2Fe-2S) region  31.33 
 
 
417 aa  147  3e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2370  putative phthalate 4,5-dioxygenase oxygenase subunit (OhpA2)  28.73 
 
 
440 aa  144  2e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000399664  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2359  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  31.43 
 
 
410 aa  143  7e-33  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.128163  normal  0.731078 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5548  putative Phthalate 4,5-dioxygenase subunit alpha  28.54 
 
 
439 aa  142  9.999999999999999e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3537  aromatic acid dioxygenase alpha subunit  28.75 
 
 
440 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.329598 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2133  twin-arginine translocation pathway signal  28.33 
 
 
484 aa  140  3.9999999999999997e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.395399  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0574  phthalate 4,5-dioxygenase  30.42 
 
 
406 aa  137  4e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.105836  normal  0.217979 
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7254  Rieske (2Fe-2S) domain protein  27.69 
 
 
430 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3532  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  27.29 
 
 
446 aa  130  5.0000000000000004e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.048657  normal  0.0515471 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1687  Rieske (2Fe-2S) domain protein  28.53 
 
 
449 aa  130  6e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3529  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  32.27 
 
 
433 aa  126  8.000000000000001e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.551503  normal  0.104416 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4805  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  27.18 
 
 
443 aa  125  1e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0495821  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4881  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  32.66 
 
 
434 aa  124  4e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2928  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  27.4 
 
 
445 aa  123  6e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.149906  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2779  Rieske (2Fe-2S) domain protein  27.01 
 
 
443 aa  122  9e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.261515  normal  0.259625 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4958  Rieske (2Fe-2S) domain protein  27.01 
 
 
443 aa  122  9e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.879177  normal  0.275764 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4882  phthalate 4,5-dioxygenase  38.33 
 
 
422 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1910  phthalate 4,5-dioxygenase, oxygenase subunit  26.8 
 
 
438 aa  120  3.9999999999999996e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.578876  normal  0.581965 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6324  phthalate 4,5-dioxygenase  31.5 
 
 
437 aa  118  9.999999999999999e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4795  phthalate 4,5-dioxygenase  28.68 
 
 
412 aa  117  3.9999999999999997e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.269335  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1001  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  27.13 
 
 
380 aa  117  3.9999999999999997e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4627  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  25.94 
 
 
417 aa  115  1.0000000000000001e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1184  Rieske (2Fe-2S) domain protein  31.75 
 
 
358 aa  100  6e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2035  hypothetical protein  30.09 
 
 
345 aa  93.2  7e-18  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3214  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  32.42 
 
 
347 aa  92  2e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0195459 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2050  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  31.58 
 
 
327 aa  89  1e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0319051  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4593  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  32.8 
 
 
353 aa  87  5e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.743349  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2036  hypothetical protein  24.77 
 
 
334 aa  84.7  0.000000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.502892  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1812  Rieske (2Fe-2S) region  27.75 
 
 
383 aa  85.5  0.000000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0372125 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5126  vanillate monooxygenase  32.26 
 
 
352 aa  84.3  0.000000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0344  Rieske (2Fe-2S) protein  30.41 
 
 
353 aa  83.2  0.000000000000007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1185  Rieske (2Fe-2S) domain protein  27.84 
 
 
364 aa  83.2  0.000000000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2825  iron-sulfur cluster-binding protein, Rieske family  26.44 
 
 
358 aa  81.3  0.00000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.000971916  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2688  Rieske (2Fe-2S) protein  32.24 
 
 
352 aa  80.9  0.00000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7085  Rieske (2Fe-2S) domain protein  25.76 
 
 
406 aa  81.3  0.00000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0203  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  26.44 
 
 
406 aa  80.5  0.00000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6610  vanillate demethylase oxygenase subunit  25 
 
 
380 aa  80.1  0.00000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.581564  normal  0.184804 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5354  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  31.19 
 
 
370 aa  79.7  0.00000000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.111829  normal  0.289416 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4244  Rieske (2Fe-2S) domain protein  30.32 
 
 
352 aa  79.7  0.00000000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0418  Rieske (2Fe-2S) protein  32.26 
 
 
353 aa  79.3  0.0000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.842278  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5718  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  29.91 
 
 
373 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.592667 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2919  Rieske (2Fe-2S) domain protein  26.54 
 
 
338 aa  79.3  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.563703  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5962  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  29.91 
 
 
373 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.314282  normal  0.602397 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1485  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  28.09 
 
 
343 aa  78.6  0.0000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6662  dioxygenase, iron-sulfur subunit  30.7 
 
 
371 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0364205  normal  0.0470201 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_26228  predicted protein  30.05 
 
 
668 aa  77.8  0.0000000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.281249  normal  0.273766 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4103  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  28.22 
 
 
374 aa  77.8  0.0000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0222  vanillate O-demethylase oxygenase subunit oxidoreductase protein  28.49 
 
 
342 aa  77.4  0.0000000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.0000016692  normal  0.0221534 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6718  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  30.54 
 
 
371 aa  77.4  0.0000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0787  Rieske (2Fe-2S) protein  33.52 
 
 
351 aa  77.4  0.0000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.466147 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1575  Rieske (2Fe-2S) protein  27.02 
 
 
346 aa  77.4  0.0000000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.869006  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1589  Rieske (2Fe-2S) region  30.54 
 
 
371 aa  77.4  0.0000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.577114  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6242  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  30.54 
 
 
371 aa  77.4  0.0000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.718979  normal  0.984052 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5693  Rieske (2Fe-2S) domain protein  28.18 
 
 
352 aa  77  0.0000000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3119  vanillate monooxygenase  32.57 
 
 
358 aa  77  0.0000000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1335  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  36.28 
 
 
351 aa  76.6  0.0000000000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.819447 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2305  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  28.18 
 
 
352 aa  76.3  0.0000000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.560893  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2297  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  28.18 
 
 
352 aa  76.3  0.0000000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.125012  normal  0.643759 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2258  Rieske (2Fe-2S) region  28.18 
 
 
352 aa  76.3  0.0000000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.236496  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1355  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  31.46 
 
 
358 aa  75.5  0.000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2687  Rieske (2Fe-2S) protein  34.29 
 
 
356 aa  76.3  0.000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3967  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  29.82 
 
 
347 aa  75.9  0.000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5628  vanillate O-demethylase oxygenase subunit  30.29 
 
 
351 aa  75.5  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.834519  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2137  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  27.72 
 
 
450 aa  75.5  0.000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2708  Rieske [2Fe-2S] region  25.84 
 
 
354 aa  74.3  0.000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.104354  normal  0.0620392 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2170  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  26.4 
 
 
355 aa  74.3  0.000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.461217  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0306  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  28.19 
 
 
378 aa  74.7  0.000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.20897 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0296  Rieske (2Fe-2S) region  28.19 
 
 
378 aa  74.7  0.000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.317274  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0287  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  28.19 
 
 
378 aa  74.3  0.000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.831286  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7059  Rieske (2Fe-2S) domain protein  28.84 
 
 
364 aa  73.9  0.000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.2387  normal  0.465604 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3952  Rieske (2Fe-2S) protein  27.68 
 
 
340 aa  73.9  0.000000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.13771  normal  0.112958 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3024  vanillate monooxygenase  27.63 
 
 
361 aa  73.9  0.000000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2045  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  25.28 
 
 
355 aa  73.6  0.000000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3736  Rieske (2Fe-2S) domain protein  25.84 
 
 
355 aa  73.6  0.000000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.554225  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2904  vanillate O-demethylase, oxygenase subunit  25.84 
 
 
354 aa  73.6  0.000000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.179444  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1459  Rieske (2Fe-2S) domain protein  25.23 
 
 
357 aa  73.6  0.000000000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0280358  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0175  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  28.31 
 
 
363 aa  73.6  0.000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3416  vanillate monooxygenase  26.47 
 
 
342 aa  73.6  0.000000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0799476 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4591  vanillate monooxygenase  26.49 
 
 
373 aa  73.6  0.000000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.672566 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0795  Rieske (2Fe-2S) domain protein  25.38 
 
 
497 aa  73.2  0.000000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.266613  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5124  vanillate monooxygenase  26.92 
 
 
359 aa  73.6  0.000000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.14115  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2027  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  25.84 
 
 
355 aa  73.2  0.000000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0396  Rieske (2Fe-2S) domain protein  28.97 
 
 
360 aa  73.2  0.000000000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.547393 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2869  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  27.67 
 
 
385 aa  73.2  0.000000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.455502  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>