More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_B2370 on replicon NC_007952
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007951  Bxe_A3537  aromatic acid dioxygenase alpha subunit  90.23 
 
 
440 aa  843    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.329598 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2370  putative phthalate 4,5-dioxygenase oxygenase subunit (OhpA2)  100 
 
 
440 aa  914    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000399664  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5548  putative Phthalate 4,5-dioxygenase subunit alpha  64.32 
 
 
439 aa  598  1e-170  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7254  Rieske (2Fe-2S) domain protein  35.49 
 
 
430 aa  272  9e-72  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3529  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  37.56 
 
 
433 aa  266  5.999999999999999e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.551503  normal  0.104416 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5781  Rieske (2Fe-2S) region  35.66 
 
 
417 aa  265  1e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3532  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  38.44 
 
 
446 aa  258  1e-67  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.048657  normal  0.0515471 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0574  phthalate 4,5-dioxygenase  36.32 
 
 
406 aa  253  6e-66  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.105836  normal  0.217979 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1175  Phthalate 4,5-dioxygenase  35.58 
 
 
452 aa  234  3e-60  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.769494  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0877  putative dioxygenase  35.04 
 
 
452 aa  231  1e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.297728  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2268  Rieske (2Fe-2S) protein  33.66 
 
 
452 aa  223  6e-57  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0946291  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8462  Rieske (2Fe-2S) domain protein  33.73 
 
 
448 aa  220  3.9999999999999997e-56  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6982  phthalate 4,5-dioxygenase  33.41 
 
 
438 aa  220  3.9999999999999997e-56  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4795  phthalate 4,5-dioxygenase  33.26 
 
 
412 aa  219  7e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.269335  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6324  phthalate 4,5-dioxygenase  34.51 
 
 
437 aa  216  5e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5154  Rieske (2Fe-2S) region  31.53 
 
 
440 aa  212  9e-54  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.291358  normal  0.277417 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4805  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  34.49 
 
 
443 aa  210  4e-53  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0495821  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4882  phthalate 4,5-dioxygenase  34.55 
 
 
422 aa  209  7e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1445  Rieske (2Fe-2S) protein  31.86 
 
 
437 aa  209  8e-53  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.491711  normal 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4958  Rieske (2Fe-2S) domain protein  34.57 
 
 
443 aa  208  2e-52  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.879177  normal  0.275764 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2779  Rieske (2Fe-2S) domain protein  34.57 
 
 
443 aa  208  2e-52  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.261515  normal  0.259625 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1910  phthalate 4,5-dioxygenase, oxygenase subunit  33.33 
 
 
438 aa  208  2e-52  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.578876  normal  0.581965 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2133  twin-arginine translocation pathway signal  32.72 
 
 
484 aa  207  2e-52  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.395399  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2928  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  34.16 
 
 
445 aa  196  8.000000000000001e-49  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.149906  normal 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4627  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  33.68 
 
 
417 aa  186  5e-46  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5678  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  33.82 
 
 
408 aa  184  3e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.0000120872  normal  0.0293014 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5901  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  33.57 
 
 
408 aa  184  3e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00683325  hitchhiker  0.00740172 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3062  phthalate 4,5-dioxygenase  32.84 
 
 
431 aa  182  9.000000000000001e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.021682 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4881  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  31.28 
 
 
434 aa  182  1e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3201  phthalate 4,5-dioxygenase  31.54 
 
 
436 aa  174  2.9999999999999996e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0555  phthalate 4,5-dioxygenase  36.52 
 
 
470 aa  172  6.999999999999999e-42  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.547165  normal  0.18525 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1687  Rieske (2Fe-2S) domain protein  29.53 
 
 
449 aa  158  2e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1044  phthalate 4,5-dioxygenase  30.17 
 
 
454 aa  156  9e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.714091 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4297  phthalate 4,5-dioxygenase  30.83 
 
 
392 aa  154  2.9999999999999998e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1473  Rieske (2Fe-2S) region  28.73 
 
 
398 aa  144  2e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.826795  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2359  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  29.68 
 
 
410 aa  137  4e-31  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.128163  normal  0.731078 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1543  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  34.21 
 
 
519 aa  131  2.0000000000000002e-29  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.453445  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1184  Rieske (2Fe-2S) domain protein  34.21 
 
 
358 aa  108  2e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2036  hypothetical protein  31.12 
 
 
334 aa  106  1e-21  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.502892  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1001  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  30.36 
 
 
380 aa  105  2e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6610  vanillate demethylase oxygenase subunit  32.03 
 
 
380 aa  103  6e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.581564  normal  0.184804 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2137  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  36.53 
 
 
450 aa  99.4  1e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2305  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  34.22 
 
 
352 aa  97.1  5e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.560893  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2297  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  34.22 
 
 
352 aa  97.1  5e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.125012  normal  0.643759 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2050  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  31.25 
 
 
327 aa  97.1  5e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0319051  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2258  Rieske (2Fe-2S) region  34.22 
 
 
352 aa  97.1  5e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.236496  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1185  Rieske (2Fe-2S) domain protein  25.7 
 
 
364 aa  96.7  8e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1649  Rieske (2Fe-2S) domain protein  32.42 
 
 
370 aa  96.3  1e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1235  Rieske (2Fe-2S) domain protein  33.9 
 
 
349 aa  95.5  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2035  hypothetical protein  34.3 
 
 
345 aa  95.1  2e-18  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1676  Rieske (2Fe-2S) domain protein  32.58 
 
 
349 aa  94.4  4e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.945696  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2725  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  29.48 
 
 
354 aa  91.7  2e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0149406 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1016  dioxygenase, iron-sulfur subunit, putative  33.52 
 
 
369 aa  89.4  1e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.621392  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5693  Rieske (2Fe-2S) domain protein  31.06 
 
 
352 aa  89.4  1e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5789  Rieske (2Fe-2S) region  32.56 
 
 
349 aa  88.6  2e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5546  putative vanillate O-demethylase oxygenase subunit (4-hydroxy- 3-methoxybenzoate demethylase)  29.8 
 
 
347 aa  88.6  2e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0420  Rieske (2Fe-2S) protein  28.33 
 
 
373 aa  87.8  3e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1442  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  31.33 
 
 
324 aa  87  5e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000193123  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1488  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  31.48 
 
 
321 aa  87  7e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0113839  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5243  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  28.25 
 
 
359 aa  85.9  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5029  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  28.25 
 
 
359 aa  86.3  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.773131 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3124  Rieske (2Fe-2S) region  28.25 
 
 
359 aa  85.9  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.439622  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4340  Rieske (2Fe-2S) region  30.5 
 
 
350 aa  85.1  0.000000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2492  vanillate O-demethylase oxygenase subunit  31.37 
 
 
315 aa  85.5  0.000000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5628  vanillate O-demethylase oxygenase subunit  32.08 
 
 
351 aa  85.5  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.834519  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2686  Rieske (2Fe-2S) protein  31.41 
 
 
376 aa  85.1  0.000000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0481  Rieske (2Fe-2S) iron-sulfur domain-containing protein  30.29 
 
 
353 aa  85.1  0.000000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0971818  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0963  vanillate O-demethylase oxygenase subunit  29.81 
 
 
350 aa  84.7  0.000000000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5124  vanillate monooxygenase  27.68 
 
 
359 aa  84.3  0.000000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.14115  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64800  vanillate O-demethylase oxygenase subunit  30.82 
 
 
351 aa  84.3  0.000000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0565633  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2919  Rieske (2Fe-2S) domain protein  31.4 
 
 
338 aa  84  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.563703  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2687  Rieske (2Fe-2S) protein  34.68 
 
 
356 aa  84.3  0.000000000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0132  Rieske (2Fe-2S) protein  34.1 
 
 
343 aa  84.3  0.000000000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1867  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  30.73 
 
 
388 aa  84  0.000000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.687816 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3984  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  30.81 
 
 
356 aa  84  0.000000000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.643695  normal  0.0193847 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0396  Rieske (2Fe-2S) domain protein  30.99 
 
 
360 aa  83.6  0.000000000000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.547393 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_43309  predicted protein  32.95 
 
 
492 aa  83.6  0.000000000000007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.231154  hitchhiker  0.00124797 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4591  vanillate monooxygenase  27.07 
 
 
373 aa  83.6  0.000000000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.672566 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2170  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  32.12 
 
 
355 aa  83.2  0.000000000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.461217  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3570  Rieske (2Fe-2S) region  30.32 
 
 
355 aa  82.8  0.00000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0161982  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2500  Rieske (2Fe-2S) region  34.38 
 
 
359 aa  82.8  0.00000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.455012 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3214  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  26.42 
 
 
347 aa  82.8  0.00000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0195459 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0280  Rieske (2Fe-2S) protein  27.17 
 
 
351 aa  82.8  0.00000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.226935  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1389  putative oxygenase  34.57 
 
 
359 aa  82.8  0.00000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1352  vanillate monooxygenase  30.6 
 
 
363 aa  82  0.00000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4419  Rieske (2Fe-2S) iron-sulfur domain-containing protein  26.24 
 
 
367 aa  82  0.00000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.257041  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0175  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  28.4 
 
 
363 aa  81.6  0.00000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0344  Rieske (2Fe-2S) protein  28.57 
 
 
353 aa  80.5  0.00000000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4568  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  28.24 
 
 
356 aa  80.9  0.00000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.380862  hitchhiker  0.000303241 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2074  Rieske (2Fe-2S) domain protein  37.93 
 
 
217 aa  80.5  0.00000000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.12491  normal  0.0463704 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4103  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  31.93 
 
 
356 aa  80.1  0.00000000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.119091 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2045  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  30.91 
 
 
355 aa  80.1  0.00000000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3416  vanillate monooxygenase  26.54 
 
 
342 aa  80.1  0.00000000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0799476 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1004  putative vanillate O-demethylase oxygenase subunit A  30.14 
 
 
353 aa  80.1  0.00000000000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.413289  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1485  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  23.9 
 
 
343 aa  80.1  0.00000000000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_40637  predicted protein  33.33 
 
 
510 aa  80.1  0.00000000000007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1550  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  29.56 
 
 
353 aa  80.1  0.00000000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.276626  normal  0.0604744 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1001  putative vanillate O-demethylase oxygenase subunit A  29.05 
 
 
349 aa  79.7  0.00000000000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.8149  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5591  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  31.93 
 
 
356 aa  79.7  0.00000000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00790855 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1335  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  32.91 
 
 
351 aa  79.7  0.00000000000009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.819447 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>