More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_2133 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007948  Bpro_2133  twin-arginine translocation pathway signal  100 
 
 
484 aa  998    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.395399  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6982  phthalate 4,5-dioxygenase  57.05 
 
 
438 aa  533  1e-150  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5154  Rieske (2Fe-2S) region  56.02 
 
 
440 aa  535  1e-150  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.291358  normal  0.277417 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1175  Phthalate 4,5-dioxygenase  55.51 
 
 
452 aa  523  1e-147  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.769494  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2268  Rieske (2Fe-2S) protein  55.08 
 
 
452 aa  521  1e-146  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0946291  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8462  Rieske (2Fe-2S) domain protein  55.51 
 
 
448 aa  508  1e-143  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0877  putative dioxygenase  54.39 
 
 
452 aa  501  1e-140  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.297728  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1445  Rieske (2Fe-2S) protein  51.09 
 
 
437 aa  451  1e-125  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.491711  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3201  phthalate 4,5-dioxygenase  33.25 
 
 
436 aa  223  4.9999999999999996e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5781  Rieske (2Fe-2S) region  33.18 
 
 
417 aa  208  2e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2370  putative phthalate 4,5-dioxygenase oxygenase subunit (OhpA2)  32.23 
 
 
440 aa  208  2e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000399664  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3537  aromatic acid dioxygenase alpha subunit  31.87 
 
 
440 aa  203  5e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.329598 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5548  putative Phthalate 4,5-dioxygenase subunit alpha  30.91 
 
 
439 aa  202  8e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3532  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  30.84 
 
 
446 aa  200  5e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.048657  normal  0.0515471 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0574  phthalate 4,5-dioxygenase  30.82 
 
 
406 aa  193  6e-48  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.105836  normal  0.217979 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2928  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  33.1 
 
 
445 aa  184  3e-45  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.149906  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4805  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  32.94 
 
 
443 aa  179  9e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0495821  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3529  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  29.72 
 
 
433 aa  176  7e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.551503  normal  0.104416 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0555  phthalate 4,5-dioxygenase  32.03 
 
 
470 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.547165  normal  0.18525 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2779  Rieske (2Fe-2S) domain protein  31.88 
 
 
443 aa  173  5e-42  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.261515  normal  0.259625 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4958  Rieske (2Fe-2S) domain protein  31.88 
 
 
443 aa  173  5e-42  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.879177  normal  0.275764 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4882  phthalate 4,5-dioxygenase  30.62 
 
 
422 aa  173  5.999999999999999e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1910  phthalate 4,5-dioxygenase, oxygenase subunit  30.98 
 
 
438 aa  171  2e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.578876  normal  0.581965 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4795  phthalate 4,5-dioxygenase  30.09 
 
 
412 aa  167  5e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.269335  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4297  phthalate 4,5-dioxygenase  30.41 
 
 
392 aa  166  6.9999999999999995e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7254  Rieske (2Fe-2S) domain protein  27.68 
 
 
430 aa  164  4.0000000000000004e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4627  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  29.58 
 
 
417 aa  155  2e-36  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2359  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  31.96 
 
 
410 aa  154  2e-36  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.128163  normal  0.731078 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1044  phthalate 4,5-dioxygenase  29.56 
 
 
454 aa  152  8.999999999999999e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.714091 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5678  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  29.95 
 
 
408 aa  152  2e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.0000120872  normal  0.0293014 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5901  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  29.95 
 
 
408 aa  152  2e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00683325  hitchhiker  0.00740172 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3062  phthalate 4,5-dioxygenase  42 
 
 
431 aa  151  3e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.021682 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4881  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  29.95 
 
 
434 aa  144  4e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1687  Rieske (2Fe-2S) domain protein  37.69 
 
 
449 aa  144  5e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1473  Rieske (2Fe-2S) region  28.33 
 
 
398 aa  140  3.9999999999999997e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.826795  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6324  phthalate 4,5-dioxygenase  26.35 
 
 
437 aa  129  9.000000000000001e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1543  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  29.45 
 
 
519 aa  118  3e-25  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.453445  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1185  Rieske (2Fe-2S) domain protein  40.52 
 
 
364 aa  113  7.000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2050  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  40.52 
 
 
327 aa  107  3e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0319051  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1001  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  23.1 
 
 
380 aa  95.5  2e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6610  vanillate demethylase oxygenase subunit  32.77 
 
 
380 aa  95.1  3e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.581564  normal  0.184804 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2492  vanillate O-demethylase oxygenase subunit  32.61 
 
 
315 aa  92.4  1e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1184  Rieske (2Fe-2S) domain protein  33.33 
 
 
358 aa  91.7  3e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1535  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  25.19 
 
 
331 aa  88.2  3e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1488  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  27.74 
 
 
321 aa  86.7  8e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0113839  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1442  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  27.74 
 
 
324 aa  86.7  9e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000193123  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3681  Rieske (2Fe-2S) region  30.29 
 
 
346 aa  84.3  0.000000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.2267  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2137  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  29.89 
 
 
450 aa  84.3  0.000000000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011700  PHATRDRAFT_50613  Tic55 component of chloroplast import machinery  32.99 
 
 
498 aa  84  0.000000000000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2036  hypothetical protein  31.13 
 
 
334 aa  83.6  0.000000000000007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.502892  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1056  Rieske (2Fe-2S) region  38.71 
 
 
499 aa  83.6  0.000000000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00144994  hitchhiker  0.000116875 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1448  Rieske (2Fe-2S) protein  30.69 
 
 
359 aa  82.8  0.00000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2687  Rieske (2Fe-2S) protein  33.13 
 
 
356 aa  82.4  0.00000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2516  Rieske (2Fe-2S) domain protein  34.48 
 
 
326 aa  82.8  0.00000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00793645  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0535  Rieske (2Fe-2S) region  29.78 
 
 
460 aa  81.6  0.00000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7059  Rieske (2Fe-2S) domain protein  32.96 
 
 
364 aa  81.3  0.00000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.2387  normal  0.465604 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1501  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  32.96 
 
 
355 aa  81.6  0.00000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4340  Rieske (2Fe-2S) region  33.1 
 
 
350 aa  81.3  0.00000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2310  vanillate monooxygenase  33.97 
 
 
362 aa  81.3  0.00000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0218143 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2053  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  35.03 
 
 
398 aa  80.9  0.00000000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.216867  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0547  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  25.46 
 
 
324 aa  80.5  0.00000000000006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000394367  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1336  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  32.4 
 
 
355 aa  80.1  0.00000000000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.4835  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2494  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  32.4 
 
 
355 aa  80.1  0.00000000000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0319  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  32.4 
 
 
355 aa  80.1  0.00000000000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.456896  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1307  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  32.4 
 
 
355 aa  80.1  0.00000000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.992701  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1234  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  32.4 
 
 
355 aa  80.1  0.00000000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0972  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  32.4 
 
 
355 aa  80.1  0.00000000000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0595  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  32.4 
 
 
355 aa  80.1  0.00000000000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0958903  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4419  Rieske (2Fe-2S) iron-sulfur domain-containing protein  30.95 
 
 
367 aa  80.1  0.00000000000009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.257041  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1016  dioxygenase, iron-sulfur subunit, putative  39.2 
 
 
369 aa  79.7  0.0000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.621392  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0127  Rieske (2Fe-2S) protein  34.42 
 
 
355 aa  79.3  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0175  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  32.6 
 
 
363 aa  79.3  0.0000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0436  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  27.34 
 
 
326 aa  79.7  0.0000000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3307  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  36.36 
 
 
357 aa  79.7  0.0000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000352846 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3570  Rieske (2Fe-2S) region  30.29 
 
 
355 aa  78.6  0.0000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0161982  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5789  Rieske (2Fe-2S) region  38.68 
 
 
349 aa  78.2  0.0000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2500  Rieske (2Fe-2S) region  38.18 
 
 
359 aa  78.2  0.0000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.455012 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2686  Rieske (2Fe-2S) protein  33.95 
 
 
376 aa  78.2  0.0000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_26228  predicted protein  29.9 
 
 
668 aa  78.2  0.0000000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.281249  normal  0.273766 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1105  Rieske (2Fe-2S) protein  32.22 
 
 
358 aa  77.8  0.0000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.080608  normal  0.368914 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2035  hypothetical protein  29.44 
 
 
345 aa  77.8  0.0000000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3658  Rieske (2Fe-2S) region  29.13 
 
 
356 aa  77.8  0.0000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4709  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  29.13 
 
 
356 aa  77.8  0.0000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.700082  normal  0.155037 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4510  Rieske (2Fe-2S) domain protein  32.26 
 
 
355 aa  77.4  0.0000000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4642  Rieske (2Fe-2S) domain protein  32.26 
 
 
355 aa  77.4  0.0000000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.44027  normal  0.0329483 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1867  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  31.71 
 
 
388 aa  77  0.0000000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.687816 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2979  Rieske (2Fe-2S) domain protein  30.65 
 
 
367 aa  76.6  0.0000000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3666  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  36.94 
 
 
359 aa  76.3  0.000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5591  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  28.82 
 
 
356 aa  75.9  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00790855 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2355  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  29.57 
 
 
349 aa  76.3  0.000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.725754  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4568  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  28.82 
 
 
356 aa  75.9  0.000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.380862  hitchhiker  0.000303241 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2672  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  34.11 
 
 
377 aa  75.5  0.000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0627264  normal  0.0375363 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3984  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  28.7 
 
 
356 aa  75.9  0.000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.643695  normal  0.0193847 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4103  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  31.84 
 
 
356 aa  75.5  0.000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.119091 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1464  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  30.11 
 
 
326 aa  74.3  0.000000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.134829  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1220  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  30.11 
 
 
334 aa  74.7  0.000000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0507919  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1576  Rieske (2Fe-2S) region  31.28 
 
 
358 aa  74.3  0.000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.221742  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1377  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  30.11 
 
 
334 aa  74.7  0.000000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2607  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  30.11 
 
 
334 aa  74.7  0.000000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0187  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  30.11 
 
 
334 aa  74.7  0.000000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.531075  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>