More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_4627 on replicon NC_008760
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012856  Rpic12D_2779  Rieske (2Fe-2S) domain protein  76.46 
 
 
443 aa  650    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.261515  normal  0.259625 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2928  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  76.41 
 
 
445 aa  648    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.149906  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1910  phthalate 4,5-dioxygenase, oxygenase subunit  77.94 
 
 
438 aa  684    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.578876  normal  0.581965 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4958  Rieske (2Fe-2S) domain protein  76.46 
 
 
443 aa  650    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.879177  normal  0.275764 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4627  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  100 
 
 
417 aa  870    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4805  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  76.7 
 
 
443 aa  656    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0495821  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5781  Rieske (2Fe-2S) region  38.06 
 
 
417 aa  263  4.999999999999999e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4882  phthalate 4,5-dioxygenase  35.83 
 
 
422 aa  224  3e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5548  putative Phthalate 4,5-dioxygenase subunit alpha  33.81 
 
 
439 aa  213  2.9999999999999995e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7254  Rieske (2Fe-2S) domain protein  33.33 
 
 
430 aa  213  5.999999999999999e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0574  phthalate 4,5-dioxygenase  34.07 
 
 
406 aa  204  3e-51  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.105836  normal  0.217979 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0877  putative dioxygenase  33.69 
 
 
452 aa  199  7.999999999999999e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.297728  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3532  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  34.63 
 
 
446 aa  199  9e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.048657  normal  0.0515471 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3537  aromatic acid dioxygenase alpha subunit  34.91 
 
 
440 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.329598 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2370  putative phthalate 4,5-dioxygenase oxygenase subunit (OhpA2)  34.21 
 
 
440 aa  198  2.0000000000000003e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000399664  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4881  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  33.42 
 
 
434 aa  194  3e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3529  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  34.68 
 
 
433 aa  194  3e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.551503  normal  0.104416 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1175  Phthalate 4,5-dioxygenase  33.09 
 
 
452 aa  192  9e-48  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.769494  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6982  phthalate 4,5-dioxygenase  31.63 
 
 
438 aa  191  2e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1445  Rieske (2Fe-2S) protein  32.39 
 
 
437 aa  190  4e-47  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.491711  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2268  Rieske (2Fe-2S) protein  33.42 
 
 
452 aa  188  1e-46  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0946291  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4795  phthalate 4,5-dioxygenase  31.33 
 
 
412 aa  187  2e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.269335  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8462  Rieske (2Fe-2S) domain protein  33.68 
 
 
448 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5154  Rieske (2Fe-2S) region  32.46 
 
 
440 aa  183  6e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.291358  normal  0.277417 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3201  phthalate 4,5-dioxygenase  31.54 
 
 
436 aa  172  1e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6324  phthalate 4,5-dioxygenase  31.76 
 
 
437 aa  172  1e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2359  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  31.02 
 
 
410 aa  168  2e-40  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.128163  normal  0.731078 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2133  twin-arginine translocation pathway signal  30.25 
 
 
484 aa  165  2.0000000000000002e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.395399  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1044  phthalate 4,5-dioxygenase  44.85 
 
 
454 aa  161  2e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.714091 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4297  phthalate 4,5-dioxygenase  31.09 
 
 
392 aa  154  2e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3062  phthalate 4,5-dioxygenase  30.89 
 
 
431 aa  147  3e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.021682 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0555  phthalate 4,5-dioxygenase  43.01 
 
 
470 aa  146  9e-34  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.547165  normal  0.18525 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5678  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  30.65 
 
 
408 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.0000120872  normal  0.0293014 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5901  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  30.65 
 
 
408 aa  142  1.9999999999999998e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00683325  hitchhiker  0.00740172 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1687  Rieske (2Fe-2S) domain protein  28.46 
 
 
449 aa  137  3.0000000000000003e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1473  Rieske (2Fe-2S) region  26.26 
 
 
398 aa  123  7e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.826795  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1543  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  31.16 
 
 
519 aa  120  6e-26  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.453445  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1001  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  26.61 
 
 
380 aa  112  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2036  hypothetical protein  30.64 
 
 
334 aa  101  2e-20  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.502892  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2050  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  31.33 
 
 
327 aa  93.6  6e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0319051  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2492  vanillate O-demethylase oxygenase subunit  29.21 
 
 
315 aa  91.3  3e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2687  Rieske (2Fe-2S) protein  35.48 
 
 
356 aa  91.3  3e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2137  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  33.33 
 
 
450 aa  90.9  4e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6610  vanillate demethylase oxygenase subunit  31.36 
 
 
380 aa  87.8  3e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.581564  normal  0.184804 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2686  Rieske (2Fe-2S) protein  33.33 
 
 
376 aa  87.8  3e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1184  Rieske (2Fe-2S) domain protein  28.1 
 
 
358 aa  87.4  4e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_43309  predicted protein  29.25 
 
 
492 aa  87.4  5e-16  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.231154  hitchhiker  0.00124797 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2035  hypothetical protein  27.84 
 
 
345 aa  87  5e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1185  Rieske (2Fe-2S) domain protein  25.29 
 
 
364 aa  83.2  0.000000000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1112  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  32.96 
 
 
334 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.624843  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1220  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  32.96 
 
 
334 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0507919  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2607  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  32.96 
 
 
334 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1377  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  32.96 
 
 
334 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0187  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  32.96 
 
 
334 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.531075  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0463  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  32.96 
 
 
334 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1464  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  32.96 
 
 
326 aa  82  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.134829  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5546  putative vanillate O-demethylase oxygenase subunit (4-hydroxy- 3-methoxybenzoate demethylase)  24.32 
 
 
347 aa  82  0.00000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0175  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  24.41 
 
 
363 aa  81.3  0.00000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0576  Rieske (2Fe-2S) region  29.41 
 
 
323 aa  81.3  0.00000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5693  Rieske (2Fe-2S) domain protein  28.99 
 
 
352 aa  80.5  0.00000000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4510  Rieske (2Fe-2S) domain protein  24.32 
 
 
355 aa  79.3  0.0000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_26228  predicted protein  31.75 
 
 
668 aa  79.3  0.0000000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.281249  normal  0.273766 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4642  Rieske (2Fe-2S) domain protein  24.32 
 
 
355 aa  79.3  0.0000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.44027  normal  0.0329483 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7059  Rieske (2Fe-2S) domain protein  24.35 
 
 
364 aa  79  0.0000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.2387  normal  0.465604 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4419  Rieske (2Fe-2S) iron-sulfur domain-containing protein  30.12 
 
 
367 aa  78.2  0.0000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.257041  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4769  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  28 
 
 
367 aa  77.8  0.0000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.289545  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64800  vanillate O-demethylase oxygenase subunit  27.72 
 
 
351 aa  77.4  0.0000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0565633  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3984  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  24.91 
 
 
356 aa  77  0.0000000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.643695  normal  0.0193847 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2825  iron-sulfur cluster-binding protein, Rieske family  32.35 
 
 
358 aa  77  0.0000000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.000971916  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1136  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  31.61 
 
 
373 aa  77  0.0000000000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.959251  normal  0.28876 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0963  vanillate O-demethylase oxygenase subunit  29.08 
 
 
350 aa  77  0.0000000000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0132  Rieske (2Fe-2S) protein  29.51 
 
 
343 aa  76.3  0.0000000000009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1530  Rieske (2Fe-2S) domain protein  24.26 
 
 
450 aa  75.9  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5789  Rieske (2Fe-2S) region  26.27 
 
 
349 aa  75.5  0.000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2725  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  26.56 
 
 
354 aa  75.1  0.000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0149406 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1557  Rieske (2Fe-2S) domain protein  24.26 
 
 
450 aa  75.5  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0276963  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1559  vanillate monooxygenase  26.77 
 
 
347 aa  75.1  0.000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.662697  normal  0.47859 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5029  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  25.69 
 
 
359 aa  75.5  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.773131 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0481  Rieske (2Fe-2S) iron-sulfur domain-containing protein  28.95 
 
 
353 aa  75.1  0.000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0971818  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2919  Rieske (2Fe-2S) domain protein  29.08 
 
 
338 aa  75.1  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.563703  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1056  Rieske (2Fe-2S) region  29.03 
 
 
499 aa  74.7  0.000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00144994  hitchhiker  0.000116875 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0741  Rieske (2Fe-2S) protein  27.38 
 
 
382 aa  74.7  0.000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0606248 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5243  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  25.38 
 
 
359 aa  73.9  0.000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0280  Rieske (2Fe-2S) protein  27.78 
 
 
351 aa  73.9  0.000000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.226935  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1485  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  26.23 
 
 
343 aa  73.9  0.000000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3124  Rieske (2Fe-2S) region  25.38 
 
 
359 aa  73.9  0.000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.439622  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2074  Rieske (2Fe-2S) domain protein  35.64 
 
 
217 aa  73.9  0.000000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.12491  normal  0.0463704 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1296  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  25.79 
 
 
367 aa  73.6  0.000000000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.85642 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2688  Rieske (2Fe-2S) protein  41.18 
 
 
352 aa  73.6  0.000000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1336  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  23.99 
 
 
355 aa  73.2  0.000000000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.4835  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0319  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  23.99 
 
 
355 aa  73.2  0.000000000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.456896  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2494  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  23.99 
 
 
355 aa  73.2  0.000000000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1307  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  23.99 
 
 
355 aa  73.2  0.000000000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.992701  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1234  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  23.99 
 
 
355 aa  73.2  0.000000000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4233  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  24.14 
 
 
362 aa  73.2  0.000000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0972  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  23.99 
 
 
355 aa  72.8  0.00000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5124  vanillate monooxygenase  25.95 
 
 
359 aa  72.8  0.00000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.14115  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1355  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  27.75 
 
 
358 aa  72.4  0.00000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0595  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  23.99 
 
 
355 aa  72.8  0.00000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0958903  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4278  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  30.97 
 
 
362 aa  71.6  0.00000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.844018 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>