More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aaci_2050 on replicon NC_013205
Organism: Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013205  Aaci_2050  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  100 
 
 
327 aa  661    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0319051  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2492  vanillate O-demethylase oxygenase subunit  48.85 
 
 
315 aa  330  1e-89  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1184  Rieske (2Fe-2S) domain protein  33.44 
 
 
358 aa  154  1e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1442  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  32.92 
 
 
324 aa  152  5e-36  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000193123  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1488  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  33.02 
 
 
321 aa  152  8e-36  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0113839  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2035  hypothetical protein  33.97 
 
 
345 aa  149  7e-35  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1185  Rieske (2Fe-2S) domain protein  30.5 
 
 
364 aa  144  1e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0630  Rieske (2Fe-2S) iron-sulfur domain protein  27.53 
 
 
330 aa  142  6e-33  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1535  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  28.62 
 
 
331 aa  136  6.0000000000000005e-31  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0547  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  30.31 
 
 
324 aa  134  1.9999999999999998e-30  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000394367  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2919  Rieske (2Fe-2S) domain protein  31.92 
 
 
338 aa  130  2.0000000000000002e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.563703  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6610  vanillate demethylase oxygenase subunit  30.84 
 
 
380 aa  128  2.0000000000000002e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.581564  normal  0.184804 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2036  hypothetical protein  29.01 
 
 
334 aa  125  1e-27  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.502892  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0436  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  31.63 
 
 
326 aa  124  2e-27  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4244  Rieske (2Fe-2S) domain protein  30.74 
 
 
352 aa  120  3e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1136  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  31.23 
 
 
373 aa  117  3e-25  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.959251  normal  0.28876 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1389  putative oxygenase  30.33 
 
 
359 aa  116  5e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0787  Rieske (2Fe-2S) protein  28.57 
 
 
351 aa  116  6.9999999999999995e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.466147 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1175  Phthalate 4,5-dioxygenase  36.14 
 
 
452 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.769494  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2268  Rieske (2Fe-2S) protein  34.27 
 
 
452 aa  114  3e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0946291  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2143  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  29.84 
 
 
372 aa  112  1.0000000000000001e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.444634  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4769  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  28.66 
 
 
367 aa  112  1.0000000000000001e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.289545  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0877  putative dioxygenase  34.83 
 
 
452 aa  110  3e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.297728  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6982  phthalate 4,5-dioxygenase  38.12 
 
 
438 aa  108  9.000000000000001e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3567  Rieske (2Fe-2S) domain protein  28.25 
 
 
344 aa  108  1e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2918  Rieske (2Fe-2S) domain protein  27.47 
 
 
337 aa  108  2e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.333438  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2133  twin-arginine translocation pathway signal  40.52 
 
 
484 aa  107  2e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.395399  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1867  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  32.37 
 
 
388 aa  107  3e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.687816 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0807  vanillate O-demethylase oxygenase subunit  32.42 
 
 
331 aa  107  4e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5548  putative Phthalate 4,5-dioxygenase subunit alpha  36.97 
 
 
439 aa  106  6e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0555  phthalate 4,5-dioxygenase  38.89 
 
 
470 aa  105  8e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.547165  normal  0.18525 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8462  Rieske (2Fe-2S) domain protein  37.5 
 
 
448 aa  105  1e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3532  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  34.76 
 
 
446 aa  103  5e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.048657  normal  0.0515471 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5781  Rieske (2Fe-2S) region  36.73 
 
 
417 aa  102  1e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1445  Rieske (2Fe-2S) protein  33.14 
 
 
437 aa  102  1e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.491711  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3542  vanillate O-demethylase oxygenase subunit  28.85 
 
 
345 aa  101  1e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.10385 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5154  Rieske (2Fe-2S) region  35.62 
 
 
440 aa  101  2e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.291358  normal  0.277417 
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7254  Rieske (2Fe-2S) domain protein  35.26 
 
 
430 aa  101  2e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1448  Rieske (2Fe-2S) protein  34.94 
 
 
359 aa  100  3e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2825  iron-sulfur cluster-binding protein, Rieske family  27.1 
 
 
358 aa  100  5e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.000971916  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4516  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  28.16 
 
 
373 aa  99.8  6e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1718  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  27.71 
 
 
357 aa  99.4  8e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.187317  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1487  Rieske (2Fe-2S) protein  31.02 
 
 
356 aa  99.4  8e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1044  phthalate 4,5-dioxygenase  28.34 
 
 
454 aa  99.4  8e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.714091 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1096  Rieske (2Fe-2S) domain protein  28.34 
 
 
357 aa  99  9e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0810231  normal  0.184537 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3537  aromatic acid dioxygenase alpha subunit  30.99 
 
 
440 aa  98.6  1e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.329598 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2037  Rieske (2Fe-2S) domain protein  27.71 
 
 
357 aa  98.6  1e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.950553  normal  0.781731 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5789  Rieske (2Fe-2S) region  26.38 
 
 
349 aa  98.2  2e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3214  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  34.13 
 
 
347 aa  98.2  2e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0195459 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4882  phthalate 4,5-dioxygenase  32.47 
 
 
422 aa  98.2  2e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1261  hypothetical protein  26.79 
 
 
340 aa  97.8  2e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0803695 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2979  Rieske (2Fe-2S) domain protein  31.84 
 
 
367 aa  97.4  3e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0535  Rieske (2Fe-2S) region  34.46 
 
 
460 aa  97.1  4e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2686  Rieske (2Fe-2S) protein  36.16 
 
 
376 aa  96.7  4e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2370  putative phthalate 4,5-dioxygenase oxygenase subunit (OhpA2)  31.25 
 
 
440 aa  97.1  4e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000399664  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2359  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  34.38 
 
 
410 aa  96.7  4e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.128163  normal  0.731078 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6483  Rieske (2Fe-2S) region  32.66 
 
 
358 aa  96.7  5e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2305  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  27.06 
 
 
352 aa  96.7  5e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.560893  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2258  Rieske (2Fe-2S) region  27.06 
 
 
352 aa  96.7  5e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.236496  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2297  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  27.06 
 
 
352 aa  96.7  5e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.125012  normal  0.643759 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2518  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  29.79 
 
 
398 aa  96.7  5e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1557  Rieske (2Fe-2S) domain protein  31.64 
 
 
450 aa  96.7  6e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0276963  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1530  Rieske (2Fe-2S) domain protein  31.64 
 
 
450 aa  96.3  6e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2074  Rieske (2Fe-2S) domain protein  39.83 
 
 
217 aa  96.3  7e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.12491  normal  0.0463704 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1009  vanillate demethylase  32.17 
 
 
353 aa  96.3  7e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0048453  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2590  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  27.02 
 
 
341 aa  95.9  7e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.225432 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1241  Rieske (2Fe-2S) domain protein  39.83 
 
 
217 aa  96.3  7e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.635525  normal  0.124818 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1103  Rieske (2Fe-2S) domain protein  31.68 
 
 
362 aa  95.9  8e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1016  dioxygenase, iron-sulfur subunit, putative  29.2 
 
 
369 aa  95.5  1e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.621392  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4245  Rieske (2Fe-2S) domain protein  27.01 
 
 
371 aa  95.1  1e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0963  vanillate O-demethylase oxygenase subunit  35.84 
 
 
350 aa  95.5  1e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4881  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  36.6 
 
 
434 aa  94.4  2e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7059  Rieske (2Fe-2S) domain protein  29.14 
 
 
364 aa  94.7  2e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.2387  normal  0.465604 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5693  Rieske (2Fe-2S) domain protein  31.03 
 
 
352 aa  94.4  2e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_43309  predicted protein  30.17 
 
 
492 aa  94.4  2e-18  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.231154  hitchhiker  0.00124797 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1533  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  30.12 
 
 
383 aa  94  3e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4593  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  35.15 
 
 
353 aa  94  3e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.743349  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3119  vanillate monooxygenase  28.29 
 
 
358 aa  93.6  4e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4103  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  31.98 
 
 
374 aa  93.6  4e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4103  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  27.91 
 
 
356 aa  93.6  4e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.119091 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0418  Rieske (2Fe-2S) protein  26.82 
 
 
353 aa  93.2  5e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.842278  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0741  Rieske (2Fe-2S) protein  24.92 
 
 
382 aa  93.2  5e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0606248 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2687  Rieske (2Fe-2S) protein  37.08 
 
 
356 aa  93.2  5e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3529  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  32.34 
 
 
433 aa  93.2  5e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.551503  normal  0.104416 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4568  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  27.57 
 
 
356 aa  92.8  7e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.380862  hitchhiker  0.000303241 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2928  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  34.87 
 
 
445 aa  92.8  7e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.149906  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2034  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  29.18 
 
 
400 aa  92.4  1e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.967449  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1781  cell death suppressor protein Lls1-like  26.64 
 
 
456 aa  92  1e-17  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.527136  normal  0.0843855 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2121  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  30.85 
 
 
377 aa  92  1e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.312892  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3266  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  32.4 
 
 
353 aa  92  1e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0113117 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5225  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  29.52 
 
 
384 aa  91.7  1e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.532387  normal  0.253584 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4805  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  39.83 
 
 
443 aa  92.4  1e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0495821  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5546  putative vanillate O-demethylase oxygenase subunit (4-hydroxy- 3-methoxybenzoate demethylase)  29.73 
 
 
347 aa  92.4  1e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0867  Rieske (2Fe-2S) region  24.2 
 
 
357 aa  92  1e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2672  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  29.76 
 
 
377 aa  91.3  2e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0627264  normal  0.0375363 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1872  Rieske (2Fe-2S) protein  35 
 
 
356 aa  91.7  2e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.171768  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1130  Rieske (2Fe-2S) domain protein  30.43 
 
 
362 aa  90.9  2e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0812255  normal  0.937672 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0344  Rieske (2Fe-2S) protein  30.17 
 
 
353 aa  90.9  2e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13559  oxidoreductase  29.52 
 
 
386 aa  91.3  2e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000136875 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1056  Rieske (2Fe-2S) region  34.67 
 
 
499 aa  90.5  3e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00144994  hitchhiker  0.000116875 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>