More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_2672 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009953  Sare_2880  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  90.45 
 
 
377 aa  699    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.150338  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2672  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  100 
 
 
377 aa  783    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0627264  normal  0.0375363 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3849  Rieske (2Fe-2S) iron-sulfur domain protein  63.69 
 
 
393 aa  529  1e-149  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13559  oxidoreductase  62.64 
 
 
386 aa  498  1e-140  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000136875 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4640  Rieske (2Fe-2S) region  61.85 
 
 
385 aa  499  1e-140  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4728  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  61.85 
 
 
385 aa  499  1e-140  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5022  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  61.85 
 
 
385 aa  499  1e-140  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0919  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  58.67 
 
 
413 aa  486  1e-136  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.40957  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1533  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  59.04 
 
 
383 aa  484  1e-135  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3509  Rieske (2Fe-2S) domain protein  57.14 
 
 
386 aa  483  1e-135  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.119894  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5225  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  58.87 
 
 
384 aa  479  1e-134  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.532387  normal  0.253584 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5211  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  62.47 
 
 
376 aa  472  1e-132  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.220934 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1546  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  61.97 
 
 
360 aa  465  9.999999999999999e-131  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.675385  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2518  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  56.42 
 
 
398 aa  459  9.999999999999999e-129  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0306  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  57.67 
 
 
378 aa  460  9.999999999999999e-129  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.20897 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0296  Rieske (2Fe-2S) region  57.67 
 
 
378 aa  460  9.999999999999999e-129  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.317274  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0287  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  57.94 
 
 
378 aa  460  9.999999999999999e-129  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.831286  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4566  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  58.63 
 
 
386 aa  457  1e-127  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0832436  normal  0.12498 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2869  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  58.9 
 
 
385 aa  454  1.0000000000000001e-126  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.455502  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1576  Rieske (2Fe-2S) region  49.42 
 
 
358 aa  369  1e-101  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.221742  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1448  Rieske (2Fe-2S) protein  48.98 
 
 
359 aa  360  2e-98  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3307  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  32.45 
 
 
357 aa  158  2e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000352846 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2121  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  30.03 
 
 
377 aa  156  6e-37  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.312892  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2053  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  32.75 
 
 
398 aa  155  1e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.216867  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3666  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  30.68 
 
 
359 aa  150  4e-35  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1220  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  29.53 
 
 
334 aa  132  6.999999999999999e-30  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0507919  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2607  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  29.53 
 
 
334 aa  132  6.999999999999999e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1112  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  29.53 
 
 
334 aa  132  6.999999999999999e-30  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.624843  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0187  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  29.53 
 
 
334 aa  132  6.999999999999999e-30  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.531075  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1377  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  29.53 
 
 
334 aa  132  6.999999999999999e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0463  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  29.53 
 
 
334 aa  132  6.999999999999999e-30  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1464  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  29.85 
 
 
326 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.134829  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3649  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  27.99 
 
 
362 aa  127  5e-28  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0576  Rieske (2Fe-2S) region  27.63 
 
 
323 aa  126  6e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2516  Rieske (2Fe-2S) domain protein  27.58 
 
 
326 aa  124  2e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00793645  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3784  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  25.98 
 
 
342 aa  115  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3601  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  26.88 
 
 
335 aa  115  1.0000000000000001e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.022726  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2012  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  28.05 
 
 
339 aa  114  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.754296  normal  0.410286 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4333  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  28.15 
 
 
338 aa  112  9e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.536684 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3642  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  26.61 
 
 
341 aa  112  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.55041  normal  0.365786 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3574  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  26.61 
 
 
341 aa  111  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3569  Rieske (2Fe-2S) region  26.61 
 
 
341 aa  112  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2753  Rieske (2Fe-2S) region  24.62 
 
 
342 aa  108  2e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.915347 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4116  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  26.9 
 
 
335 aa  108  2e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.275911  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4325  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  25.08 
 
 
369 aa  107  5e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1829  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  27.2 
 
 
365 aa  104  3e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.745414  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1835  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  26.91 
 
 
332 aa  102  1e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1788  Rieske (2Fe-2S) region  26.91 
 
 
332 aa  102  1e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.651662  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1769  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  26.61 
 
 
332 aa  99.8  7e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.501014  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5946  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  26.15 
 
 
341 aa  97.4  4e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.930147 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5949  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  26.76 
 
 
342 aa  96.7  6e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.193657 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2050  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  29.76 
 
 
327 aa  91.3  3e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0319051  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2687  Rieske (2Fe-2S) protein  23.96 
 
 
356 aa  89.4  1e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2036  hypothetical protein  27.09 
 
 
334 aa  88.6  2e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.502892  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2502  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  31.98 
 
 
332 aa  87.8  3e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4419  Rieske (2Fe-2S) iron-sulfur domain-containing protein  27.81 
 
 
367 aa  85.5  0.000000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.257041  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1067  vanillate monooxygenase  33.53 
 
 
359 aa  83.2  0.000000000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.535746  normal  0.0980736 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5267  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  26.11 
 
 
370 aa  82.8  0.000000000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4970  Rieske (2Fe-2S) domain protein  21.98 
 
 
328 aa  82.8  0.000000000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.22227  normal  0.214971 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2297  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  35.03 
 
 
352 aa  81.6  0.00000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.125012  normal  0.643759 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2686  Rieske (2Fe-2S) protein  27.81 
 
 
376 aa  82  0.00000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2258  Rieske (2Fe-2S) region  35.03 
 
 
352 aa  81.6  0.00000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.236496  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2736  PrnD  26.12 
 
 
370 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4729  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  26.11 
 
 
370 aa  82  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2305  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  35.03 
 
 
352 aa  81.6  0.00000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.560893  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5789  Rieske (2Fe-2S) region  29.45 
 
 
349 aa  81.3  0.00000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2888  PrnD  25.84 
 
 
370 aa  80.9  0.00000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.942193  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6709  Rieske (2Fe-2S) protein  25.51 
 
 
373 aa  80.5  0.00000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6986  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  24.65 
 
 
374 aa  80.5  0.00000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.529476  normal  0.476808 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2500  Rieske (2Fe-2S) region  29.03 
 
 
359 aa  80.1  0.00000000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.455012 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0630  Rieske (2Fe-2S) domain protein  30.14 
 
 
353 aa  79.7  0.00000000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.494266  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3542  vanillate O-demethylase oxygenase subunit  27.16 
 
 
345 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.10385 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1118  PrnD  25.71 
 
 
346 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0964  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  30.16 
 
 
341 aa  78.2  0.0000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0127  Rieske (2Fe-2S) protein  33.57 
 
 
355 aa  78.2  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4340  Rieske (2Fe-2S) region  30.07 
 
 
350 aa  77.4  0.0000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1488  Rieske (2Fe-2S) protein  27.88 
 
 
351 aa  77  0.0000000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1185  Rieske (2Fe-2S) domain protein  27.37 
 
 
364 aa  76.6  0.0000000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26080  vanillate demethylase subunit A  31.1 
 
 
377 aa  76.6  0.0000000000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.819244  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3387  Rieske (2Fe-2S) region  31.43 
 
 
369 aa  75.9  0.000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.662042  normal  0.0218971 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1241  Rieske (2Fe-2S) domain protein  37.07 
 
 
217 aa  75.9  0.000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.635525  normal  0.124818 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2133  twin-arginine translocation pathway signal  34.11 
 
 
484 aa  75.5  0.000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.395399  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2074  Rieske (2Fe-2S) domain protein  37.07 
 
 
217 aa  75.1  0.000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.12491  normal  0.0463704 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1389  putative oxygenase  27.14 
 
 
359 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3570  Rieske (2Fe-2S) region  30.97 
 
 
355 aa  74.7  0.000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0161982  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6610  vanillate demethylase oxygenase subunit  31.82 
 
 
380 aa  74.7  0.000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.581564  normal  0.184804 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1321  Rieske (2Fe-2S) region  23.31 
 
 
351 aa  74.3  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.117089  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0837  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  30.28 
 
 
346 aa  74.7  0.000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.558436  normal  0.660482 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6508  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  23.31 
 
 
351 aa  74.3  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4257  Rieske (2Fe-2S) domain protein  34.34 
 
 
349 aa  73.9  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1137  vanillate monooxygenase  28.49 
 
 
350 aa  73.9  0.000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.684708  hitchhiker  0.000140047 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4881  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  29.61 
 
 
434 aa  73.6  0.000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3266  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  27.64 
 
 
353 aa  73.6  0.000000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0113117 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6021  Rieske (2Fe-2S) domain protein  32.74 
 
 
344 aa  72.8  0.000000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.174244  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3967  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  32.03 
 
 
347 aa  72.8  0.00000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1368  vanillate monooxygenase  32.39 
 
 
352 aa  72.4  0.00000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2359  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  29.89 
 
 
410 aa  72.4  0.00000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.128163  normal  0.731078 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6483  Rieske (2Fe-2S) region  31.88 
 
 
358 aa  71.2  0.00000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2688  Rieske (2Fe-2S) protein  30.95 
 
 
352 aa  71.6  0.00000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2184  vanillate O-demethylase oxygenase, iron-sulfur subunit  28.99 
 
 
347 aa  71.2  0.00000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>