More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_2687 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007777  Francci3_2687  Rieske (2Fe-2S) protein  100 
 
 
356 aa  722    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2686  Rieske (2Fe-2S) protein  44.48 
 
 
376 aa  278  1e-73  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2688  Rieske (2Fe-2S) protein  42.12 
 
 
352 aa  257  2e-67  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6986  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  36.18 
 
 
374 aa  206  4e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.529476  normal  0.476808 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6709  Rieske (2Fe-2S) protein  36.49 
 
 
373 aa  205  8e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5267  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  36.39 
 
 
370 aa  204  2e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2888  PrnD  37.46 
 
 
370 aa  204  2e-51  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.942193  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4729  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  37.09 
 
 
370 aa  204  2e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1118  PrnD  36.87 
 
 
346 aa  202  5e-51  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2736  PrnD  36.87 
 
 
370 aa  202  6e-51  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4419  Rieske (2Fe-2S) iron-sulfur domain-containing protein  40.22 
 
 
367 aa  137  3.0000000000000003e-31  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.257041  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2500  Rieske (2Fe-2S) region  39.24 
 
 
359 aa  120  3e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.455012 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3642  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  37.29 
 
 
341 aa  108  2e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.55041  normal  0.365786 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3569  Rieske (2Fe-2S) region  37.29 
 
 
341 aa  108  2e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3574  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  37.29 
 
 
341 aa  107  3e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2590  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  38.15 
 
 
341 aa  107  4e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.225432 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3212  Rieske 2Fe-2S family protein  36.99 
 
 
341 aa  104  2e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2516  Rieske (2Fe-2S) domain protein  35.96 
 
 
326 aa  103  4e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00793645  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1445  Rieske (2Fe-2S) protein  36.71 
 
 
437 aa  102  9e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.491711  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3784  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  34.86 
 
 
342 aa  102  1e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2919  Rieske (2Fe-2S) domain protein  37.43 
 
 
338 aa  102  1e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.563703  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2753  Rieske (2Fe-2S) region  36.57 
 
 
342 aa  102  1e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.915347 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1185  Rieske (2Fe-2S) domain protein  29.41 
 
 
364 aa  101  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1867  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  36.9 
 
 
388 aa  101  2e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.687816 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2918  Rieske (2Fe-2S) domain protein  38.01 
 
 
337 aa  98.2  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.333438  normal 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5154  Rieske (2Fe-2S) region  35.37 
 
 
440 aa  98.2  2e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.291358  normal  0.277417 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1220  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  33.14 
 
 
334 aa  97.4  4e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0507919  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2607  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  33.14 
 
 
334 aa  97.4  4e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1112  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  33.14 
 
 
334 aa  97.4  4e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.624843  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0187  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  33.14 
 
 
334 aa  97.4  4e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.531075  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1448  Rieske (2Fe-2S) protein  25.79 
 
 
359 aa  97.1  4e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2268  Rieske (2Fe-2S) protein  34.76 
 
 
452 aa  97.4  4e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0946291  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0877  putative dioxygenase  37.5 
 
 
452 aa  97.1  4e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.297728  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0463  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  33.14 
 
 
334 aa  97.4  4e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1377  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  33.14 
 
 
334 aa  97.4  4e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1464  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  33.14 
 
 
326 aa  97.1  4e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.134829  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2013  Rieske (2Fe-2S) family oxidoreductase large subunit  35.26 
 
 
348 aa  97.1  5e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4769  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  33.51 
 
 
367 aa  96.7  5e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.289545  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8462  Rieske (2Fe-2S) domain protein  36.81 
 
 
448 aa  96.3  8e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2036  hypothetical protein  33.95 
 
 
334 aa  95.9  8e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.502892  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2305  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  33.73 
 
 
352 aa  95.5  1e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.560893  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2297  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  33.73 
 
 
352 aa  95.5  1e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.125012  normal  0.643759 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0436  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  37.82 
 
 
326 aa  95.9  1e-18  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2258  Rieske (2Fe-2S) region  33.73 
 
 
352 aa  95.5  1e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.236496  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5225  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  23.98 
 
 
384 aa  95.1  2e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.532387  normal  0.253584 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1533  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  24.12 
 
 
383 aa  94.7  2e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1067  vanillate monooxygenase  32.39 
 
 
359 aa  94.7  2e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.535746  normal  0.0980736 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0547  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  26.99 
 
 
324 aa  94.4  3e-18  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000394367  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1004  putative vanillate O-demethylase oxygenase subunit A  28.65 
 
 
353 aa  94  3e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.413289  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1535  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  32.76 
 
 
331 aa  94.4  3e-18  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1175  Phthalate 4,5-dioxygenase  34.36 
 
 
452 aa  94.4  3e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.769494  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1001  putative vanillate O-demethylase oxygenase subunit A  28.99 
 
 
349 aa  94  4e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.8149  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5546  putative vanillate O-demethylase oxygenase subunit (4-hydroxy- 3-methoxybenzoate demethylase)  25.72 
 
 
347 aa  93.6  4e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2050  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  37.08 
 
 
327 aa  93.2  6e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0319051  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4728  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  24.34 
 
 
385 aa  93.2  6e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4640  Rieske (2Fe-2S) region  24.34 
 
 
385 aa  93.2  6e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5022  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  24.34 
 
 
385 aa  93.2  6e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3666  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  32.2 
 
 
359 aa  92.8  8e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4325  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  33.92 
 
 
369 aa  92.4  9e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1686  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  31.41 
 
 
357 aa  92.4  1e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4333  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  35.67 
 
 
338 aa  92  1e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.536684 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1718  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  34.52 
 
 
357 aa  91.3  2e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.187317  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0919  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  26.83 
 
 
413 aa  91.7  2e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.40957  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3968  Rieske (2Fe-2S) domain protein  27.17 
 
 
360 aa  91.7  2e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0886212  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1442  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  29.07 
 
 
324 aa  90.9  3e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000193123  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2037  Rieske (2Fe-2S) domain protein  34.52 
 
 
357 aa  90.9  3e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.950553  normal  0.781731 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0576  Rieske (2Fe-2S) region  30.3 
 
 
323 aa  91.3  3e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0672  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  34.52 
 
 
344 aa  90.5  4e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.270675  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0287  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  24.86 
 
 
378 aa  90.5  4e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.831286  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2053  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  25.71 
 
 
398 aa  90.5  5e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.216867  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1576  Rieske (2Fe-2S) region  31.21 
 
 
358 aa  90.1  5e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.221742  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1096  Rieske (2Fe-2S) domain protein  34.52 
 
 
357 aa  89.7  6e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0810231  normal  0.184537 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1488  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  29.76 
 
 
321 aa  89.7  7e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0113839  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3509  Rieske (2Fe-2S) domain protein  24.78 
 
 
386 aa  89.4  8e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.119894  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4566  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  24.23 
 
 
386 aa  89.4  9e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0832436  normal  0.12498 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1184  Rieske (2Fe-2S) domain protein  31.58 
 
 
358 aa  89.4  9e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26080  vanillate demethylase subunit A  32.93 
 
 
377 aa  89  1e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.819244  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3952  Rieske (2Fe-2S) protein  30.68 
 
 
340 aa  89  1e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.13771  normal  0.112958 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3542  vanillate O-demethylase oxygenase subunit  29.52 
 
 
345 aa  89  1e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.10385 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0296  Rieske (2Fe-2S) region  29.41 
 
 
378 aa  89.4  1e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.317274  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0306  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  29.41 
 
 
378 aa  89.4  1e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.20897 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13559  oxidoreductase  23.46 
 
 
386 aa  87.8  2e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000136875 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2502  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  30.36 
 
 
332 aa  87.8  2e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3529  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  34.83 
 
 
433 aa  87.8  2e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.551503  normal  0.104416 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2492  vanillate O-demethylase oxygenase subunit  33.11 
 
 
315 aa  87.8  2e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2121  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  27.68 
 
 
377 aa  87.8  3e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.312892  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0630  Rieske (2Fe-2S) iron-sulfur domain protein  27.98 
 
 
330 aa  86.7  5e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2869  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  22.88 
 
 
385 aa  86.7  6e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.455502  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3266  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  30.49 
 
 
353 aa  86.3  7e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0113117 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2672  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  23.67 
 
 
377 aa  86.3  8e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0627264  normal  0.0375363 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5781  Rieske (2Fe-2S) region  33.33 
 
 
417 aa  85.5  0.000000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3671  oxidoreductase alpha subunit  32.54 
 
 
407 aa  85.5  0.000000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0725789  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3649  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  28.5 
 
 
362 aa  85.1  0.000000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1303  Rieske (2Fe-2S) region  24.86 
 
 
443 aa  84.7  0.000000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.418357  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2958  pheophorbide a oxygenase  24.86 
 
 
442 aa  84.7  0.000000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0467803  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5126  vanillate monooxygenase  29.83 
 
 
352 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2880  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  23.21 
 
 
377 aa  84.3  0.000000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.150338  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3537  aromatic acid dioxygenase alpha subunit  34.1 
 
 
440 aa  84  0.000000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.329598 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2370  putative phthalate 4,5-dioxygenase oxygenase subunit (OhpA2)  34.68 
 
 
440 aa  84.3  0.000000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000399664  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4244  Rieske (2Fe-2S) domain protein  36.42 
 
 
352 aa  84  0.000000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>