More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_0919 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013441  Gbro_0919  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  100 
 
 
413 aa  862    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.40957  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5022  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  60.73 
 
 
385 aa  493  9.999999999999999e-139  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4728  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  60.73 
 
 
385 aa  493  9.999999999999999e-139  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4640  Rieske (2Fe-2S) region  60.73 
 
 
385 aa  493  9.999999999999999e-139  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13559  oxidoreductase  59.42 
 
 
386 aa  486  1e-136  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000136875 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1533  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  58.96 
 
 
383 aa  483  1e-135  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5225  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  59.06 
 
 
384 aa  477  1e-133  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.532387  normal  0.253584 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3849  Rieske (2Fe-2S) iron-sulfur domain protein  57.32 
 
 
393 aa  474  1e-132  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2672  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  58.67 
 
 
377 aa  471  1.0000000000000001e-131  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0627264  normal  0.0375363 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2880  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  57.95 
 
 
377 aa  459  9.999999999999999e-129  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.150338  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3509  Rieske (2Fe-2S) domain protein  53.4 
 
 
386 aa  444  1.0000000000000001e-124  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.119894  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2869  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  54.31 
 
 
385 aa  436  1e-121  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.455502  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4566  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  54.57 
 
 
386 aa  437  1e-121  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0832436  normal  0.12498 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0287  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  54.05 
 
 
378 aa  434  1e-120  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.831286  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0296  Rieske (2Fe-2S) region  53.85 
 
 
378 aa  433  1e-120  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.317274  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2518  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  52.68 
 
 
398 aa  434  1e-120  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0306  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  53.85 
 
 
378 aa  433  1e-120  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.20897 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5211  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  52.94 
 
 
376 aa  401  9.999999999999999e-111  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.220934 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1546  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  52.47 
 
 
360 aa  394  1e-108  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.675385  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1448  Rieske (2Fe-2S) protein  48.08 
 
 
359 aa  337  2.9999999999999997e-91  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1576  Rieske (2Fe-2S) region  43.55 
 
 
358 aa  316  5e-85  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.221742  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2053  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  31.12 
 
 
398 aa  166  5.9999999999999996e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.216867  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2121  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  27.25 
 
 
377 aa  152  8e-36  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.312892  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3666  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  31.96 
 
 
359 aa  149  1.0000000000000001e-34  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3307  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  28.21 
 
 
357 aa  146  6e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000352846 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0576  Rieske (2Fe-2S) region  28.3 
 
 
323 aa  130  4.0000000000000003e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3649  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  26.69 
 
 
362 aa  125  2e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1220  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  27.87 
 
 
334 aa  124  3e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0507919  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0463  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  27.87 
 
 
334 aa  124  3e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2607  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  27.87 
 
 
334 aa  124  3e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0187  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  27.87 
 
 
334 aa  124  3e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.531075  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1112  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  27.87 
 
 
334 aa  124  3e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.624843  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1377  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  27.87 
 
 
334 aa  124  3e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1464  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  28.07 
 
 
326 aa  124  4e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.134829  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3642  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  26.61 
 
 
341 aa  120  3e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.55041  normal  0.365786 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3569  Rieske (2Fe-2S) region  26.61 
 
 
341 aa  120  3e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3574  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  26.3 
 
 
341 aa  119  9.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4325  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  28.4 
 
 
369 aa  115  1.0000000000000001e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2516  Rieske (2Fe-2S) domain protein  26.84 
 
 
326 aa  108  1e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00793645  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3601  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  26.19 
 
 
335 aa  107  3e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.022726  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2753  Rieske (2Fe-2S) region  26.84 
 
 
342 aa  107  6e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.915347 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3784  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  25.5 
 
 
342 aa  105  1e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1829  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  26.67 
 
 
365 aa  105  2e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.745414  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4116  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  23.36 
 
 
335 aa  97.1  6e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.275911  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1788  Rieske (2Fe-2S) region  26.61 
 
 
332 aa  95.1  2e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.651662  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1835  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  26.61 
 
 
332 aa  95.1  2e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1769  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  26.32 
 
 
332 aa  92  2e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.501014  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2687  Rieske (2Fe-2S) protein  26.83 
 
 
356 aa  91.7  2e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4333  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  23.33 
 
 
338 aa  88.2  2e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.536684 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2012  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  23.17 
 
 
339 aa  87  6e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.754296  normal  0.410286 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5946  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  24.48 
 
 
341 aa  83.6  0.000000000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.930147 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2686  Rieske (2Fe-2S) protein  30.94 
 
 
376 aa  80.9  0.00000000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3671  oxidoreductase alpha subunit  29.07 
 
 
407 aa  79.3  0.0000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0725789  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4970  Rieske (2Fe-2S) domain protein  21.81 
 
 
328 aa  79  0.0000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.22227  normal  0.214971 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2492  vanillate O-demethylase oxygenase subunit  29.44 
 
 
315 aa  79.3  0.0000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1781  cell death suppressor protein Lls1-like  26.49 
 
 
456 aa  76.6  0.0000000000008  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.527136  normal  0.0843855 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6610  vanillate demethylase oxygenase subunit  30.72 
 
 
380 aa  75.9  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.581564  normal  0.184804 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2189  Pheophorbide a oxygenase  28.49 
 
 
474 aa  75.5  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00477289 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2050  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  27.43 
 
 
327 aa  75.1  0.000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0319051  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2931  Pheophorbide a oxygenase  29.95 
 
 
477 aa  75.5  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5949  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  23.63 
 
 
342 aa  74.3  0.000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.193657 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2359  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  28.57 
 
 
410 aa  73.9  0.000000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.128163  normal  0.731078 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0864  cell death suppressor protein Lls1-like  27.49 
 
 
438 aa  72.8  0.00000000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.658605  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2133  twin-arginine translocation pathway signal  29.61 
 
 
484 aa  70.9  0.00000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.395399  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4346  pheophorbide a oxygenase  27.68 
 
 
465 aa  70.1  0.00000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.18517  normal 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5154  Rieske (2Fe-2S) region  23.67 
 
 
440 aa  69.7  0.00000000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.291358  normal  0.277417 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4419  Rieske (2Fe-2S) iron-sulfur domain-containing protein  27.78 
 
 
367 aa  68.9  0.0000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.257041  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6986  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  24.11 
 
 
374 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.529476  normal  0.476808 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0535  Rieske (2Fe-2S) region  24.24 
 
 
460 aa  69.3  0.0000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2500  Rieske (2Fe-2S) region  28.24 
 
 
359 aa  69.3  0.0000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.455012 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2036  hypothetical protein  31.29 
 
 
334 aa  69.3  0.0000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.502892  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1303  Rieske (2Fe-2S) region  25.27 
 
 
443 aa  68.2  0.0000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.418357  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8462  Rieske (2Fe-2S) domain protein  33.82 
 
 
448 aa  68.9  0.0000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2958  pheophorbide a oxygenase  28.49 
 
 
442 aa  67.8  0.0000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0467803  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2688  Rieske (2Fe-2S) protein  27.33 
 
 
352 aa  67.4  0.0000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3567  Rieske (2Fe-2S) domain protein  32.42 
 
 
344 aa  66.6  0.0000000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4769  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  28.07 
 
 
367 aa  66.6  0.0000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.289545  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3212  Rieske 2Fe-2S family protein  25.74 
 
 
341 aa  65.9  0.000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2736  PrnD  24.05 
 
 
370 aa  66.2  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2502  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  33.33 
 
 
332 aa  65.9  0.000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1056  Rieske (2Fe-2S) region  28.57 
 
 
499 aa  65.1  0.000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00144994  hitchhiker  0.000116875 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2888  PrnD  23.75 
 
 
370 aa  65.5  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.942193  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5546  putative vanillate O-demethylase oxygenase subunit (4-hydroxy- 3-methoxybenzoate demethylase)  27.98 
 
 
347 aa  65.1  0.000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5267  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  22.86 
 
 
370 aa  64.3  0.000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2035  hypothetical protein  27.49 
 
 
345 aa  64.3  0.000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2590  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  26.1 
 
 
341 aa  64.3  0.000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.225432 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1535  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  28.49 
 
 
331 aa  64.7  0.000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0964  Rieske (2Fe-2S) domain protein  26.32 
 
 
468 aa  64.3  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.1498 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1543  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  27.27 
 
 
519 aa  63.9  0.000000005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.453445  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6709  Rieske (2Fe-2S) protein  22.81 
 
 
373 aa  63.9  0.000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1136  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  26.88 
 
 
373 aa  63.9  0.000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.959251  normal  0.28876 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1445  Rieske (2Fe-2S) protein  30.22 
 
 
437 aa  63.5  0.000000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.491711  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3793  pheophorbide a oxygenase  25.84 
 
 
443 aa  63.5  0.000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.726  normal 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_26228  predicted protein  26.81 
 
 
668 aa  63.2  0.000000008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.281249  normal  0.273766 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0769  Rieske (2Fe-2S) domain protein  23.33 
 
 
497 aa  63.2  0.000000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5800  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  29.17 
 
 
354 aa  62.8  0.00000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00198597 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2268  Rieske (2Fe-2S) protein  23.29 
 
 
452 aa  62.8  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0946291  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2013  Rieske (2Fe-2S) family oxidoreductase large subunit  26.04 
 
 
348 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3410  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  28.48 
 
 
357 aa  62.8  0.00000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0474443 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1686  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  28 
 
 
357 aa  62.4  0.00000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>