More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_4970 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_4970  Rieske (2Fe-2S) domain protein  100 
 
 
328 aa  673    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.22227  normal  0.214971 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1321  Rieske (2Fe-2S) region  35.83 
 
 
351 aa  185  9e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.117089  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6508  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  35.83 
 
 
351 aa  185  9e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6099  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  34.58 
 
 
351 aa  177  2e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5949  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  34.7 
 
 
342 aa  166  4e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.193657 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5946  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  35.13 
 
 
341 aa  166  5.9999999999999996e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.930147 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6098  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  33.75 
 
 
350 aa  159  5e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1322  Rieske (2Fe-2S) region  33.44 
 
 
350 aa  155  1e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0760232  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6507  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  33.44 
 
 
350 aa  155  1e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.850952  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2516  Rieske (2Fe-2S) domain protein  31.8 
 
 
326 aa  138  1e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00793645  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1220  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  31.04 
 
 
334 aa  129  5.0000000000000004e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0507919  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0463  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  31.04 
 
 
334 aa  129  5.0000000000000004e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2607  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  31.04 
 
 
334 aa  129  5.0000000000000004e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1112  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  31.04 
 
 
334 aa  129  5.0000000000000004e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.624843  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1377  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  31.04 
 
 
334 aa  129  5.0000000000000004e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0187  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  31.04 
 
 
334 aa  129  5.0000000000000004e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.531075  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1464  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  31.48 
 
 
326 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.134829  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0576  Rieske (2Fe-2S) region  27.79 
 
 
323 aa  126  6e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3307  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  27.86 
 
 
357 aa  120  3.9999999999999996e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000352846 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3642  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  30.7 
 
 
341 aa  111  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.55041  normal  0.365786 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3509  Rieske (2Fe-2S) domain protein  24.14 
 
 
386 aa  111  2.0000000000000002e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.119894  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3569  Rieske (2Fe-2S) region  30.7 
 
 
341 aa  111  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3784  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  27.96 
 
 
342 aa  109  5e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2239  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  33.16 
 
 
350 aa  109  7.000000000000001e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3574  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  30.4 
 
 
341 aa  109  7.000000000000001e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2521  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  28.52 
 
 
343 aa  108  1e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.171957  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0837  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  37.04 
 
 
346 aa  107  4e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.558436  normal  0.660482 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3666  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  27.68 
 
 
359 aa  106  5e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1576  Rieske (2Fe-2S) region  26.56 
 
 
358 aa  105  2e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.221742  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3849  Rieske (2Fe-2S) iron-sulfur domain protein  23.88 
 
 
393 aa  103  5e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2753  Rieske (2Fe-2S) region  28.27 
 
 
342 aa  103  6e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.915347 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4325  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  27.38 
 
 
369 aa  100  4e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2053  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  29.9 
 
 
398 aa  99.4  8e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.216867  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1448  Rieske (2Fe-2S) protein  23.51 
 
 
359 aa  99.4  8e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4333  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  27.41 
 
 
338 aa  99.4  8e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.536684 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3601  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  27.16 
 
 
335 aa  98.2  2e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.022726  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2012  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  27.41 
 
 
339 aa  97.1  3e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.754296  normal  0.410286 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2518  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  22.29 
 
 
398 aa  96.7  5e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0672  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  33.15 
 
 
344 aa  95.5  1e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.270675  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4566  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  23.49 
 
 
386 aa  94  3e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0832436  normal  0.12498 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4116  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  37.9 
 
 
335 aa  93.2  5e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.275911  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0287  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  22.32 
 
 
378 aa  90.5  3e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.831286  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2869  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  22.22 
 
 
385 aa  90.1  4e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.455502  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2492  vanillate O-demethylase oxygenase subunit  30 
 
 
315 aa  89.7  6e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1835  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  27.11 
 
 
332 aa  89.4  7e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1788  Rieske (2Fe-2S) region  27.11 
 
 
332 aa  89.4  7e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.651662  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0306  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  22.32 
 
 
378 aa  89.4  8e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.20897 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0296  Rieske (2Fe-2S) region  22.32 
 
 
378 aa  89.4  8e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.317274  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1769  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  26.2 
 
 
332 aa  87.8  2e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.501014  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2502  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  30.67 
 
 
332 aa  88.2  2e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13559  oxidoreductase  22.94 
 
 
386 aa  87.8  2e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000136875 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0504  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  32.73 
 
 
337 aa  88.2  2e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.725699  normal  0.611545 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1546  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  23.1 
 
 
360 aa  87.4  3e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.675385  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3649  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  31.52 
 
 
362 aa  87  4e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2121  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  27.45 
 
 
377 aa  87  4e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.312892  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1533  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  21.36 
 
 
383 aa  82  0.00000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5225  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  21.7 
 
 
384 aa  82  0.00000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.532387  normal  0.253584 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2672  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  21.18 
 
 
377 aa  80.9  0.00000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0627264  normal  0.0375363 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0919  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  22.69 
 
 
413 aa  80.9  0.00000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.40957  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4728  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  21.45 
 
 
385 aa  80.5  0.00000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5022  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  21.45 
 
 
385 aa  80.5  0.00000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4640  Rieske (2Fe-2S) region  21.45 
 
 
385 aa  80.5  0.00000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2880  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  22.19 
 
 
377 aa  79.7  0.00000000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.150338  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1829  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  28.57 
 
 
365 aa  77  0.0000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.745414  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2687  Rieske (2Fe-2S) protein  32.07 
 
 
356 aa  75.5  0.000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2036  hypothetical protein  29.24 
 
 
334 aa  75.1  0.000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.502892  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5211  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  26.35 
 
 
376 aa  74.3  0.000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.220934 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3542  vanillate O-demethylase oxygenase subunit  27.49 
 
 
345 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.10385 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1001  putative vanillate O-demethylase oxygenase subunit A  29.45 
 
 
349 aa  72.8  0.000000000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.8149  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1004  putative vanillate O-demethylase oxygenase subunit A  29.45 
 
 
353 aa  72.8  0.000000000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.413289  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4419  Rieske (2Fe-2S) iron-sulfur domain-containing protein  26.95 
 
 
367 aa  72  0.00000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.257041  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2050  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  27.11 
 
 
327 aa  72.4  0.00000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0319051  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8462  Rieske (2Fe-2S) domain protein  25.2 
 
 
448 aa  72.4  0.00000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1445  Rieske (2Fe-2S) protein  30.54 
 
 
437 aa  71.6  0.00000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.491711  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3024  vanillate monooxygenase  27.49 
 
 
361 aa  71.2  0.00000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3409  vanillate monooxygenase  36 
 
 
347 aa  71.2  0.00000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0915562 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10960  ferridoxin oxidoreductase subunit  27.84 
 
 
370 aa  71.6  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1686  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  29.88 
 
 
357 aa  70.5  0.00000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2359  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  27.78 
 
 
410 aa  70.5  0.00000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.128163  normal  0.731078 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4330  vanillate monooxygenase  25.79 
 
 
366 aa  70.5  0.00000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0440139 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3410  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  28.89 
 
 
357 aa  69.7  0.00000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0474443 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1487  Rieske (2Fe-2S) protein  28.24 
 
 
356 aa  70.1  0.00000000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5718  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  35.78 
 
 
373 aa  69.3  0.00000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.592667 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2686  Rieske (2Fe-2S) protein  30.46 
 
 
376 aa  69.7  0.00000000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1589  Rieske (2Fe-2S) region  32.54 
 
 
371 aa  69.7  0.00000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.577114  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6718  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  32.54 
 
 
371 aa  69.3  0.00000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5962  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  35.78 
 
 
373 aa  69.7  0.00000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.314282  normal  0.602397 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6242  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  32.54 
 
 
371 aa  69.7  0.00000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.718979  normal  0.984052 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2500  Rieske (2Fe-2S) region  35.24 
 
 
359 aa  69.3  0.00000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.455012 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1812  Rieske (2Fe-2S) region  29.65 
 
 
383 aa  68.9  0.0000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0372125 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0877  putative dioxygenase  25.29 
 
 
452 aa  68.9  0.0000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.297728  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6982  phthalate 4,5-dioxygenase  24.71 
 
 
438 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4769  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  27.16 
 
 
367 aa  67.8  0.0000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.289545  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3266  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  27.16 
 
 
353 aa  68.2  0.0000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0113117 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6662  dioxygenase, iron-sulfur subunit  35.78 
 
 
371 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0364205  normal  0.0470201 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1009  vanillate demethylase  29.59 
 
 
353 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0048453  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4103  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  33.33 
 
 
374 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2285  vanillate monooxygenase  28.12 
 
 
367 aa  67.4  0.0000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.138524 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3396  vanillate monooxygenase  26.59 
 
 
348 aa  67.4  0.0000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00111775  normal  0.0140003 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2688  Rieske (2Fe-2S) protein  30.06 
 
 
352 aa  67.4  0.0000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>