More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_3601 on replicon NC_009427
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009427  Saro_3601  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  100 
 
 
335 aa  697    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.022726  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1220  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  38.75 
 
 
334 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0507919  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1377  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  38.75 
 
 
334 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1112  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  38.75 
 
 
334 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.624843  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2607  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  38.75 
 
 
334 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0187  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  38.75 
 
 
334 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.531075  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1464  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  39.62 
 
 
326 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.134829  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0463  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  38.75 
 
 
334 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2516  Rieske (2Fe-2S) domain protein  34.75 
 
 
326 aa  207  2e-52  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00793645  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2869  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  31.61 
 
 
385 aa  157  2e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.455502  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3784  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  30.75 
 
 
342 aa  152  1e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0576  Rieske (2Fe-2S) region  28.21 
 
 
323 aa  149  7e-35  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2753  Rieske (2Fe-2S) region  31.37 
 
 
342 aa  148  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.915347 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0287  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  29.91 
 
 
378 aa  145  9e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.831286  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0306  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  29.91 
 
 
378 aa  144  2e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.20897 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3574  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  30.63 
 
 
341 aa  144  2e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0296  Rieske (2Fe-2S) region  29.91 
 
 
378 aa  144  2e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.317274  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3642  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  30.63 
 
 
341 aa  143  3e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.55041  normal  0.365786 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4566  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  29.41 
 
 
386 aa  144  3e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0832436  normal  0.12498 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3569  Rieske (2Fe-2S) region  30.63 
 
 
341 aa  143  3e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4333  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  32.31 
 
 
338 aa  143  5e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.536684 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1576  Rieske (2Fe-2S) region  29 
 
 
358 aa  142  6e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.221742  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1448  Rieske (2Fe-2S) protein  28.4 
 
 
359 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2012  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  32 
 
 
339 aa  139  7.999999999999999e-32  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.754296  normal  0.410286 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3509  Rieske (2Fe-2S) domain protein  29.61 
 
 
386 aa  137  3.0000000000000003e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.119894  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4325  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  31.48 
 
 
369 aa  135  9.999999999999999e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1769  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  30.98 
 
 
332 aa  132  7.999999999999999e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.501014  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3307  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  27.78 
 
 
357 aa  129  5.0000000000000004e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000352846 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1835  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  30.06 
 
 
332 aa  128  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1788  Rieske (2Fe-2S) region  30.06 
 
 
332 aa  128  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.651662  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2121  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  27.25 
 
 
377 aa  127  4.0000000000000003e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.312892  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5225  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  28.91 
 
 
384 aa  125  1e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.532387  normal  0.253584 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3849  Rieske (2Fe-2S) iron-sulfur domain protein  27.51 
 
 
393 aa  124  2e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3666  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  29.85 
 
 
359 aa  123  4e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3649  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  27.89 
 
 
362 aa  123  4e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1533  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  28.06 
 
 
383 aa  122  7e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2518  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  25.95 
 
 
398 aa  121  9.999999999999999e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13559  oxidoreductase  26.9 
 
 
386 aa  120  4.9999999999999996e-26  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000136875 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4116  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  31.12 
 
 
335 aa  119  7.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.275911  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4728  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  28.53 
 
 
385 aa  118  9.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4640  Rieske (2Fe-2S) region  28.53 
 
 
385 aa  118  9.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5022  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  28.53 
 
 
385 aa  118  9.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2053  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  28.48 
 
 
398 aa  117  3e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.216867  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2880  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  25.3 
 
 
377 aa  113  5e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.150338  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2672  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  26.09 
 
 
377 aa  112  8.000000000000001e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0627264  normal  0.0375363 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1322  Rieske (2Fe-2S) region  26.53 
 
 
350 aa  108  1e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0760232  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6507  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  26.53 
 
 
350 aa  108  1e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.850952  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0919  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  26.19 
 
 
413 aa  107  2e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.40957  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1546  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  26.79 
 
 
360 aa  108  2e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.675385  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1829  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  28.83 
 
 
365 aa  103  3e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.745414  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5211  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  26.24 
 
 
376 aa  103  3e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.220934 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6099  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  26.98 
 
 
351 aa  103  3e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6098  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  26.01 
 
 
350 aa  100  5e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5949  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  25.78 
 
 
342 aa  99.4  8e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.193657 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1321  Rieske (2Fe-2S) region  26.03 
 
 
351 aa  97.8  2e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.117089  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6508  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  26.03 
 
 
351 aa  97.8  2e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5946  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  24.92 
 
 
341 aa  95.9  9e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.930147 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4419  Rieske (2Fe-2S) iron-sulfur domain-containing protein  36.57 
 
 
367 aa  95.1  1e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.257041  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4970  Rieske (2Fe-2S) domain protein  26.07 
 
 
328 aa  92  1e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.22227  normal  0.214971 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2502  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  29.69 
 
 
332 aa  86.7  5e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2500  Rieske (2Fe-2S) region  39.82 
 
 
359 aa  83.6  0.000000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.455012 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2687  Rieske (2Fe-2S) protein  31.58 
 
 
356 aa  82.8  0.000000000000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2686  Rieske (2Fe-2S) protein  30.23 
 
 
376 aa  81.3  0.00000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2492  vanillate O-demethylase oxygenase subunit  31.4 
 
 
315 aa  81.3  0.00000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1535  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  25.99 
 
 
331 aa  78.6  0.0000000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0547  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  31.14 
 
 
324 aa  77.4  0.0000000000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000394367  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2036  hypothetical protein  29.38 
 
 
334 aa  75.1  0.000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.502892  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2888  PrnD  26.84 
 
 
370 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.942193  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2979  Rieske (2Fe-2S) domain protein  28.87 
 
 
367 aa  74.7  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1118  PrnD  26.41 
 
 
346 aa  74.3  0.000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1686  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  28.65 
 
 
357 aa  73.9  0.000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2736  PrnD  26.41 
 
 
370 aa  73.9  0.000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1488  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  30.59 
 
 
321 aa  73.2  0.000000000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0113839  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1184  Rieske (2Fe-2S) domain protein  29.09 
 
 
358 aa  73.6  0.000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1442  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  30.59 
 
 
324 aa  73.2  0.000000000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000193123  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2688  Rieske (2Fe-2S) protein  30.99 
 
 
352 aa  72.8  0.000000000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3542  vanillate O-demethylase oxygenase subunit  25.3 
 
 
345 aa  72  0.00000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.10385 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0964  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  27.9 
 
 
341 aa  72.4  0.00000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6610  vanillate demethylase oxygenase subunit  27.32 
 
 
380 aa  71.2  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.581564  normal  0.184804 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2305  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  25.08 
 
 
352 aa  70.9  0.00000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.560893  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2297  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  25.08 
 
 
352 aa  70.9  0.00000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.125012  normal  0.643759 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2258  Rieske (2Fe-2S) region  25.08 
 
 
352 aa  70.9  0.00000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.236496  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2521  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  30.18 
 
 
343 aa  70.9  0.00000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.171957  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0837  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  25.3 
 
 
346 aa  68.9  0.0000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.558436  normal  0.660482 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4340  Rieske (2Fe-2S) region  30.82 
 
 
350 aa  68.9  0.0000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0627  Rieske (2Fe-2S) domain protein  25.56 
 
 
361 aa  68.9  0.0000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5267  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  29.22 
 
 
370 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4729  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  29.22 
 
 
370 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1185  Rieske (2Fe-2S) domain protein  25.85 
 
 
364 aa  68.6  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0504  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  30.82 
 
 
337 aa  67.4  0.0000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.725699  normal  0.611545 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3671  oxidoreductase alpha subunit  26 
 
 
407 aa  65.9  0.000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0725789  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3984  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  25.33 
 
 
356 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.643695  normal  0.0193847 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6709  Rieske (2Fe-2S) protein  28.57 
 
 
373 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2050  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  29.51 
 
 
327 aa  65.5  0.000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0319051  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1001  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  27.98 
 
 
380 aa  64.7  0.000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2239  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  26.55 
 
 
350 aa  65.1  0.000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1105  Rieske (2Fe-2S) protein  26.06 
 
 
358 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.080608  normal  0.368914 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5591  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  26.45 
 
 
356 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00790855 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3658  Rieske (2Fe-2S) region  26.45 
 
 
356 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0807  vanillate O-demethylase oxygenase subunit  27.71 
 
 
331 aa  64.7  0.000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>