More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_2686 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_2686  Rieske (2Fe-2S) protein  100 
 
 		 376 aa  771    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2687  Rieske (2Fe-2S) protein  44.48 
 
 		 356 aa  278  1e-73  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2688  Rieske (2Fe-2S) protein  38.5 
 
 		 352 aa  244  9.999999999999999e-64  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2888  PrnD  33.05 
 
 		 370 aa  205  9e-52  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.942193  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2736  PrnD  32.48 
 
 		 370 aa  203  4e-51  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1118  PrnD  32.95 
 
 		 346 aa  203  4e-51  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6709  Rieske (2Fe-2S) protein  33.04 
 
 		 373 aa  199  9e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5267  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  32.79 
 
 		 370 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4729  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  31.64 
 
 		 370 aa  196  4.0000000000000005e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6986  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  32.31 
 
 		 374 aa  194  2e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.529476  normal  0.476808 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2919  Rieske (2Fe-2S) domain protein  36.48 
 
 		 338 aa  119  7e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.563703  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4419  Rieske (2Fe-2S) iron-sulfur domain-containing protein  31.9 
 
 		 367 aa  119  9e-26  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.257041  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1185  Rieske (2Fe-2S) domain protein  36.11 
 
 		 364 aa  117  3e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2918  Rieske (2Fe-2S) domain protein  37.65 
 
 		 337 aa  117  3e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.333438  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2036  hypothetical protein  37.37 
 
 		 334 aa  115  1.0000000000000001e-24  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.502892  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2516  Rieske (2Fe-2S) domain protein  39.08 
 
 		 326 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00793645  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2502  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  37.28 
 
 		 332 aa  111  2.0000000000000002e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1184  Rieske (2Fe-2S) domain protein  37.72 
 
 		 358 aa  109  8.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2053  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  27.53 
 
 		 398 aa  108  2e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.216867  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3642  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  34.91 
 
 		 341 aa  106  8e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.55041  normal  0.365786 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2500  Rieske (2Fe-2S) region  33.33 
 
 		 359 aa  106  8e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.455012 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3574  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  34.91 
 
 		 341 aa  106  8e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4244  Rieske (2Fe-2S) domain protein  37.74 
 
 		 352 aa  106  8e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4245  Rieske (2Fe-2S) domain protein  31.82 
 
 		 371 aa  106  8e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3569  Rieske (2Fe-2S) region  34.91 
 
 		 341 aa  106  8e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1448  Rieske (2Fe-2S) protein  33.52 
 
 		 359 aa  105  1e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1442  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  30.9 
 
 		 324 aa  104  2e-21  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000193123  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0672  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  36.65 
 
 		 344 aa  103  3e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.270675  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3666  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  35.06 
 
 		 359 aa  104  3e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2492  vanillate O-demethylase oxygenase subunit  33.94 
 
 		 315 aa  104  3e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1488  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  31.03 
 
 		 321 aa  102  8e-21  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0113839  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3307  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  31.82 
 
 		 357 aa  102  1e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000352846 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2753  Rieske (2Fe-2S) region  33.53 
 
 		 342 aa  100  4e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.915347 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2305  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  34.52 
 
 		 352 aa  99.8  6e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.560893  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2297  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  34.52 
 
 		 352 aa  99.8  6e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.125012  normal  0.643759 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0837  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  34.78 
 
 		 346 aa  99.8  6e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.558436  normal  0.660482 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2258  Rieske (2Fe-2S) region  34.52 
 
 		 352 aa  99.8  6e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.236496  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2590  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  33.88 
 
 		 341 aa  99.4  8e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.225432 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1220  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  32.78 
 
 		 334 aa  99.4  9e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0507919  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2607  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  32.78 
 
 		 334 aa  99.4  9e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0463  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  32.78 
 
 		 334 aa  99.4  9e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2013  Rieske (2Fe-2S) family oxidoreductase large subunit  33.89 
 
 		 348 aa  99.4  9e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1112  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  32.78 
 
 		 334 aa  99.4  9e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.624843  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1377  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  32.78 
 
 		 334 aa  99.4  9e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0187  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  32.78 
 
 		 334 aa  99.4  9e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.531075  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1559  vanillate monooxygenase  35.37 
 
 		 347 aa  99  1e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.662697  normal  0.47859 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0436  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  36.81 
 
 		 326 aa  98.2  2e-19  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4325  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  33.72 
 
 		 369 aa  97.1  4e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1464  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  32.58 
 
 		 326 aa  97.1  4e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.134829  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2050  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  36.16 
 
 		 327 aa  96.7  5e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0319051  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1867  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  39.83 
 
 		 388 aa  97.1  5e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.687816 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3784  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  32.94 
 
 		 342 aa  96.7  6e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3212  Rieske 2Fe-2S family protein  32.79 
 
 		 341 aa  96.3  9e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6610  vanillate demethylase oxygenase subunit  29.79 
 
 		 380 aa  96.3  9e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.581564  normal  0.184804 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1535  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  33.15 
 
 		 331 aa  96.3  9e-19  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3968  Rieske (2Fe-2S) domain protein  28.64 
 
 		 360 aa  96.3  9e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0886212  n/a   
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7254  Rieske (2Fe-2S) domain protein  32.16 
 
 		 430 aa  95.5  1e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1576  Rieske (2Fe-2S) region  30.39 
 
 		 358 aa  95.9  1e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.221742  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5693  Rieske (2Fe-2S) domain protein  31.82 
 
 		 352 aa  95.5  1e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2285  vanillate monooxygenase  33.52 
 
 		 367 aa  95.5  1e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.138524 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4769  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  32.56 
 
 		 367 aa  95.5  1e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.289545  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2518  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  30.29 
 
 		 398 aa  95.9  1e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1001  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  31.58 
 
 		 380 aa  94.4  3e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0877  putative dioxygenase  34.29 
 
 		 452 aa  93.6  5e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.297728  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1445  Rieske (2Fe-2S) protein  33.67 
 
 		 437 aa  93.2  7e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.491711  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4566  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  32.46 
 
 		 386 aa  92.8  8e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0832436  normal  0.12498 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1067  vanillate monooxygenase  32.93 
 
 		 359 aa  92.8  8e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.535746  normal  0.0980736 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2239  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  35.67 
 
 		 350 aa  92.8  8e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0630  Rieske (2Fe-2S) iron-sulfur domain protein  26.88 
 
 		 330 aa  92.8  9e-18  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3649  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  29.61 
 
 		 362 aa  92.4  1e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2137  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  32.97 
 
 		 450 aa  92  1e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2035  hypothetical protein  31.28 
 
 		 345 aa  92  2e-17  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1872  Rieske (2Fe-2S) protein  32.54 
 
 		 356 aa  91.3  2e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.171768  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5154  Rieske (2Fe-2S) region  34.66 
 
 		 440 aa  91.7  2e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.291358  normal  0.277417 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1009  vanillate demethylase  32.74 
 
 		 353 aa  91.3  2e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0048453  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2121  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  30.22 
 
 		 377 aa  91.7  2e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.312892  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2869  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  31.07 
 
 		 385 aa  91.3  2e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.455502  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4333  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  35.88 
 
 		 338 aa  92  2e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.536684 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3266  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  31.9 
 
 		 353 aa  91.3  3e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0113117 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1487  Rieske (2Fe-2S) protein  29.89 
 
 		 356 aa  90.9  3e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2310  vanillate monooxygenase  34.91 
 
 		 362 aa  91.3  3e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0218143 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4593  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  35.62 
 
 		 353 aa  90.9  3e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.743349  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1370  vanillate monooxygenase  31.35 
 
 		 363 aa  90.5  4e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2268  Rieske (2Fe-2S) protein  31.84 
 
 		 452 aa  90.5  4e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0946291  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0296  Rieske (2Fe-2S) region  32.4 
 
 		 378 aa  90.5  4e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.317274  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0287  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  32.4 
 
 		 378 aa  90.5  4e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.831286  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0306  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  32.4 
 
 		 378 aa  90.5  4e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.20897 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1485  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  42.45 
 
 		 343 aa  90.1  5e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08501  Rieske iron-sulfur protein 2Fe-2S subunit  32.07 
 
 		 444 aa  90.1  6e-17  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00185666 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0218  Rieske iron-sulfur protein 2Fe-2S subunit  32.07 
 
 		 444 aa  90.1  6e-17  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.163513  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1175  Phthalate 4,5-dioxygenase  31.43 
 
 		 452 aa  89.7  7e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.769494  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5029  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  29.13 
 
 		 359 aa  89.7  8e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.773131 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0630  Rieske (2Fe-2S) domain protein  28.35 
 
 		 353 aa  89.4  9e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.494266  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0504  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  31.89 
 
 		 337 aa  89  1e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.725699  normal  0.611545 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1001  putative vanillate O-demethylase oxygenase subunit A  29.45 
 
 		 349 aa  88.6  1e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.8149  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5781  Rieske (2Fe-2S) region  38.89 
 
 		 417 aa  89.4  1e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3529  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  32 
 
 		 433 aa  89  1e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.551503  normal  0.104416 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4330  vanillate monooxygenase  31.52 
 
 		 366 aa  89  1e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0440139 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0418  Rieske (2Fe-2S) protein  34.81 
 
 		 353 aa  88.6  2e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.842278  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0420  Rieske (2Fe-2S) protein  30.1 
 
 		 373 aa  88.6  2e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>