More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_0504 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009511  Swit_0504  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  100 
 
 
337 aa  702    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.725699  normal  0.611545 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2502  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  51.88 
 
 
332 aa  359  4e-98  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2239  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  45.54 
 
 
350 aa  307  2.0000000000000002e-82  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2521  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  47.96 
 
 
343 aa  301  8.000000000000001e-81  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.171957  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0672  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  46.77 
 
 
344 aa  291  1e-77  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.270675  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0837  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  44.74 
 
 
346 aa  283  2.0000000000000002e-75  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.558436  normal  0.660482 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4419  Rieske (2Fe-2S) iron-sulfur domain-containing protein  25.24 
 
 
367 aa  114  3e-24  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.257041  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2500  Rieske (2Fe-2S) region  36.29 
 
 
359 aa  101  2e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.455012 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1001  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  31.61 
 
 
380 aa  93.2  6e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2686  Rieske (2Fe-2S) protein  31.89 
 
 
376 aa  89  1e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4970  Rieske (2Fe-2S) domain protein  32.73 
 
 
328 aa  88.2  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.22227  normal  0.214971 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2297  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  34.46 
 
 
352 aa  87  4e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.125012  normal  0.643759 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2258  Rieske (2Fe-2S) region  34.46 
 
 
352 aa  87  4e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.236496  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2305  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  34.46 
 
 
352 aa  87  4e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.560893  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2869  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  35.59 
 
 
385 aa  85.9  9e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.455502  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2036  hypothetical protein  30.17 
 
 
334 aa  84  0.000000000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.502892  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2516  Rieske (2Fe-2S) domain protein  38.02 
 
 
326 aa  84.3  0.000000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00793645  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3574  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  28.3 
 
 
341 aa  80.9  0.00000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0576  Rieske (2Fe-2S) region  30.95 
 
 
323 aa  80.5  0.00000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3642  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  28.3 
 
 
341 aa  80.1  0.00000000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.55041  normal  0.365786 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3569  Rieske (2Fe-2S) region  28.3 
 
 
341 aa  80.1  0.00000000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1220  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  33.14 
 
 
334 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0507919  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0187  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  33.14 
 
 
334 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.531075  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0463  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  33.14 
 
 
334 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2607  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  33.14 
 
 
334 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1377  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  33.14 
 
 
334 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1112  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  33.14 
 
 
334 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.624843  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2012  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  30.94 
 
 
339 aa  78.6  0.0000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.754296  normal  0.410286 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1004  putative vanillate O-demethylase oxygenase subunit A  31.54 
 
 
353 aa  78.2  0.0000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.413289  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4566  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  33.9 
 
 
386 aa  78.2  0.0000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0832436  normal  0.12498 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1464  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  33.14 
 
 
326 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.134829  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3784  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  27.83 
 
 
342 aa  77.8  0.0000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5422  oxidoreductase protein  35.25 
 
 
230 aa  77.8  0.0000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.20856  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0993  Rieske (2Fe-2S) region  29.49 
 
 
350 aa  77.4  0.0000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  unclonable  0.00000318811 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1009  vanillate demethylase  30.95 
 
 
353 aa  77.4  0.0000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0048453  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1001  putative vanillate O-demethylase oxygenase subunit A  31.54 
 
 
349 aa  76.6  0.0000000000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.8149  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1185  Rieske (2Fe-2S) domain protein  30.57 
 
 
364 aa  76.3  0.0000000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2919  Rieske (2Fe-2S) domain protein  31.18 
 
 
338 aa  75.5  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.563703  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5949  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  29.59 
 
 
342 aa  75.9  0.000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.193657 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0287  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  32.2 
 
 
378 aa  75.9  0.000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.831286  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4333  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  30.77 
 
 
338 aa  75.5  0.000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.536684 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0296  Rieske (2Fe-2S) region  32.2 
 
 
378 aa  75.9  0.000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.317274  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0306  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  32.2 
 
 
378 aa  75.9  0.000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.20897 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1687  Rieske (2Fe-2S) domain protein  29.88 
 
 
449 aa  75.1  0.000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2753  Rieske (2Fe-2S) region  27.36 
 
 
342 aa  74.7  0.000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.915347 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2687  Rieske (2Fe-2S) protein  31.43 
 
 
356 aa  74.3  0.000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1067  vanillate monooxygenase  33.94 
 
 
359 aa  73.2  0.000000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.535746  normal  0.0980736 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3509  Rieske (2Fe-2S) domain protein  32.2 
 
 
386 aa  72.8  0.000000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.119894  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3307  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  32.43 
 
 
357 aa  72  0.00000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000352846 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1448  Rieske (2Fe-2S) protein  29.01 
 
 
359 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5946  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  30.89 
 
 
341 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.930147 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6324  phthalate 4,5-dioxygenase  25.97 
 
 
437 aa  71.6  0.00000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2888  PrnD  38.38 
 
 
370 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.942193  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2285  vanillate monooxygenase  33.09 
 
 
367 aa  71.2  0.00000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.138524 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1118  PrnD  37.37 
 
 
346 aa  70.5  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4325  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  26.97 
 
 
369 aa  70.9  0.00000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2979  Rieske (2Fe-2S) domain protein  31.88 
 
 
367 aa  70.9  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2736  PrnD  37.37 
 
 
370 aa  70.5  0.00000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6709  Rieske (2Fe-2S) protein  38.38 
 
 
373 aa  70.5  0.00000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5267  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  37.37 
 
 
370 aa  70.5  0.00000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1769  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  28.73 
 
 
332 aa  70.5  0.00000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.501014  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1322  Rieske (2Fe-2S) region  27.83 
 
 
350 aa  70.5  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0760232  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1788  Rieske (2Fe-2S) region  28.73 
 
 
332 aa  70.5  0.00000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.651662  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6507  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  27.83 
 
 
350 aa  70.5  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.850952  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1835  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  28.73 
 
 
332 aa  70.5  0.00000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6982  phthalate 4,5-dioxygenase  31.2 
 
 
438 aa  70.1  0.00000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1549  vanillate monooxygenase  33.63 
 
 
359 aa  70.1  0.00000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.619122  normal  0.0130812 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4330  vanillate monooxygenase  27.11 
 
 
366 aa  70.1  0.00000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0440139 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4729  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  31.78 
 
 
370 aa  70.1  0.00000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3849  Rieske (2Fe-2S) iron-sulfur domain protein  34.78 
 
 
393 aa  70.1  0.00000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4245  Rieske (2Fe-2S) domain protein  30.46 
 
 
371 aa  70.1  0.00000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2518  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  30.95 
 
 
398 aa  69.7  0.00000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2688  Rieske (2Fe-2S) protein  33 
 
 
352 aa  69.3  0.00000000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2050  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  27.03 
 
 
327 aa  68.9  0.0000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0319051  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2143  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  33.65 
 
 
372 aa  68.6  0.0000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.444634  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6610  vanillate demethylase oxygenase subunit  31.08 
 
 
380 aa  68.6  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.581564  normal  0.184804 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3666  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  32.35 
 
 
359 aa  68.6  0.0000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2359  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  28.14 
 
 
410 aa  68.9  0.0000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.128163  normal  0.731078 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3266  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  28.81 
 
 
353 aa  69.3  0.0000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0113117 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0877  putative dioxygenase  29.87 
 
 
452 aa  68.2  0.0000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.297728  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4116  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  25.91 
 
 
335 aa  68.2  0.0000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.275911  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1557  Rieske (2Fe-2S) domain protein  27.42 
 
 
450 aa  67.8  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0276963  normal 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6469  Rieske (2Fe-2S) domain protein  34.26 
 
 
217 aa  68.6  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2053  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  29.1 
 
 
398 aa  68.2  0.0000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.216867  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2137  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  32.2 
 
 
450 aa  68.2  0.0000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1576  Rieske (2Fe-2S) region  28.33 
 
 
358 aa  67.4  0.0000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.221742  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2035  hypothetical protein  29.34 
 
 
345 aa  67.8  0.0000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13559  oxidoreductase  27.78 
 
 
386 aa  67.4  0.0000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000136875 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3529  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  29.57 
 
 
433 aa  67.8  0.0000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.551503  normal  0.104416 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1530  Rieske (2Fe-2S) domain protein  27.42 
 
 
450 aa  67.4  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3062  phthalate 4,5-dioxygenase  28.78 
 
 
431 aa  67.8  0.0000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.021682 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3601  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  30.82 
 
 
335 aa  67.4  0.0000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.022726  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2672  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  29.36 
 
 
377 aa  67  0.0000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0627264  normal  0.0375363 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5154  Rieske (2Fe-2S) region  31.3 
 
 
440 aa  67  0.0000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.291358  normal  0.277417 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4769  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  27.21 
 
 
367 aa  66.6  0.0000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.289545  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1389  putative oxygenase  30.26 
 
 
359 aa  67  0.0000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0127  Rieske (2Fe-2S) protein  29.69 
 
 
355 aa  66.6  0.0000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4257  Rieske (2Fe-2S) domain protein  30.43 
 
 
349 aa  66.6  0.0000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2492  vanillate O-demethylase oxygenase subunit  30.17 
 
 
315 aa  66.6  0.0000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6986  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  37.37 
 
 
374 aa  66.2  0.0000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.529476  normal  0.476808 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>