More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_6507 on replicon NC_008544
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010512  Bcenmc03_6098  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  96.1 
 
 
350 aa  663    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1322  Rieske (2Fe-2S) region  100 
 
 
350 aa  722    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0760232  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6507  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  100 
 
 
350 aa  722    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.850952  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6099  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  48.21 
 
 
351 aa  300  3e-80  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1321  Rieske (2Fe-2S) region  48.21 
 
 
351 aa  299  4e-80  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.117089  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6508  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  48.21 
 
 
351 aa  299  4e-80  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5946  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  37.18 
 
 
341 aa  207  2e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.930147 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5949  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  37.26 
 
 
342 aa  200  3e-50  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.193657 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4970  Rieske (2Fe-2S) domain protein  32.4 
 
 
328 aa  149  1.0000000000000001e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.22227  normal  0.214971 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2516  Rieske (2Fe-2S) domain protein  31.65 
 
 
326 aa  147  3e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00793645  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1220  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  28.57 
 
 
334 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0507919  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1112  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  28.57 
 
 
334 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.624843  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0463  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  28.57 
 
 
334 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1377  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  28.57 
 
 
334 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2607  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  28.57 
 
 
334 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0187  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  28.57 
 
 
334 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.531075  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1464  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  28.62 
 
 
326 aa  119  7e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.134829  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0576  Rieske (2Fe-2S) region  25.47 
 
 
323 aa  114  3e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2012  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  29.11 
 
 
339 aa  113  5e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.754296  normal  0.410286 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3601  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  26.53 
 
 
335 aa  108  1e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.022726  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4333  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  28.41 
 
 
338 aa  108  2e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.536684 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3569  Rieske (2Fe-2S) region  28.96 
 
 
341 aa  108  2e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3642  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  28.96 
 
 
341 aa  108  2e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.55041  normal  0.365786 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4325  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  28.31 
 
 
369 aa  107  3e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3574  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  28.66 
 
 
341 aa  106  6e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1769  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  28.99 
 
 
332 aa  98.2  2e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.501014  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2053  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  27.38 
 
 
398 aa  97.4  3e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.216867  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1788  Rieske (2Fe-2S) region  28.32 
 
 
332 aa  96.7  5e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.651662  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1835  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  28.32 
 
 
332 aa  96.7  5e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4419  Rieske (2Fe-2S) iron-sulfur domain-containing protein  29.94 
 
 
367 aa  94.7  2e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.257041  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2753  Rieske (2Fe-2S) region  32.16 
 
 
342 aa  94  4e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.915347 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3784  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  25.78 
 
 
342 aa  94  4e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3307  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  27.08 
 
 
357 aa  90.5  4e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000352846 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4116  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  26.38 
 
 
335 aa  89.7  7e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.275911  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2500  Rieske (2Fe-2S) region  28.93 
 
 
359 aa  89  1e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.455012 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2121  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  25.86 
 
 
377 aa  88.6  1e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.312892  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1829  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  34.46 
 
 
365 aa  87  5e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.745414  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1448  Rieske (2Fe-2S) protein  31.61 
 
 
359 aa  84.3  0.000000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1576  Rieske (2Fe-2S) region  24.13 
 
 
358 aa  83.2  0.000000000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.221742  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3666  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  28 
 
 
359 aa  83.2  0.000000000000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3849  Rieske (2Fe-2S) iron-sulfur domain protein  26.21 
 
 
393 aa  82.8  0.000000000000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3649  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  27.64 
 
 
362 aa  82.4  0.00000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1546  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  22.59 
 
 
360 aa  80.9  0.00000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.675385  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2502  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  42.86 
 
 
332 aa  80.1  0.00000000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4566  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  23.71 
 
 
386 aa  78.2  0.0000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0832436  normal  0.12498 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6718  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  33.54 
 
 
371 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1589  Rieske (2Fe-2S) region  33.54 
 
 
371 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.577114  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6242  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  33.54 
 
 
371 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.718979  normal  0.984052 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6662  dioxygenase, iron-sulfur subunit  33.54 
 
 
371 aa  77.8  0.0000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0364205  normal  0.0470201 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2239  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  33.78 
 
 
350 aa  77  0.0000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7085  Rieske (2Fe-2S) domain protein  32.92 
 
 
406 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2036  hypothetical protein  29.7 
 
 
334 aa  75.1  0.000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.502892  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5962  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  32.93 
 
 
373 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.314282  normal  0.602397 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5718  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  32.93 
 
 
373 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.592667 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4103  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  33.74 
 
 
374 aa  74.3  0.000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0672  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  28.42 
 
 
344 aa  73.6  0.000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.270675  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0837  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  27.64 
 
 
346 aa  73.6  0.000000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.558436  normal  0.660482 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0203  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  29.29 
 
 
406 aa  73.2  0.000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0396  Rieske (2Fe-2S) domain protein  30.77 
 
 
360 aa  73.2  0.000000000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.547393 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0287  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  21.95 
 
 
378 aa  72.8  0.000000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.831286  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0296  Rieske (2Fe-2S) region  21.95 
 
 
378 aa  72.8  0.000000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.317274  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0306  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  21.95 
 
 
378 aa  72.8  0.000000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.20897 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3509  Rieske (2Fe-2S) domain protein  25.07 
 
 
386 aa  72.4  0.00000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.119894  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1812  Rieske (2Fe-2S) region  36.59 
 
 
383 aa  71.6  0.00000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0372125 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2050  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  30.35 
 
 
327 aa  70.9  0.00000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0319051  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2518  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  22 
 
 
398 aa  70.9  0.00000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1067  vanillate monooxygenase  27.83 
 
 
359 aa  70.5  0.00000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.535746  normal  0.0980736 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0504  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  27.83 
 
 
337 aa  70.5  0.00000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.725699  normal  0.611545 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1686  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  29.38 
 
 
357 aa  70.5  0.00000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1459  Rieske (2Fe-2S) domain protein  30.29 
 
 
357 aa  70.1  0.00000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0280358  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2687  Rieske (2Fe-2S) protein  29.61 
 
 
356 aa  69.7  0.00000000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5693  Rieske (2Fe-2S) domain protein  28.42 
 
 
352 aa  69.7  0.00000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3410  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  30.99 
 
 
357 aa  69.7  0.00000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0474443 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5354  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  37.27 
 
 
370 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.111829  normal  0.289416 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2492  vanillate O-demethylase oxygenase subunit  26.22 
 
 
315 aa  68.2  0.0000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2869  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  30.06 
 
 
385 aa  68.2  0.0000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.455502  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3160  Rieske (2Fe-2S) domain protein  34.29 
 
 
347 aa  67.4  0.0000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13559  oxidoreductase  26.04 
 
 
386 aa  66.6  0.0000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000136875 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4769  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  32.72 
 
 
367 aa  66.6  0.0000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.289545  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2686  Rieske (2Fe-2S) protein  33.89 
 
 
376 aa  66.6  0.0000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2133  twin-arginine translocation pathway signal  30.91 
 
 
484 aa  66.6  0.0000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.395399  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1533  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  29.1 
 
 
383 aa  66.2  0.0000000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0547  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  25.27 
 
 
324 aa  66.2  0.0000000009  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000394367  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0964  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  32.85 
 
 
341 aa  65.9  0.000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5211  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  20.48 
 
 
376 aa  65.5  0.000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.220934 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2880  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  20.4 
 
 
377 aa  65.5  0.000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.150338  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0630  Rieske (2Fe-2S) iron-sulfur domain protein  23.53 
 
 
330 aa  65.5  0.000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4278  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  31.36 
 
 
362 aa  64.7  0.000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.844018 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5029  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  29.56 
 
 
359 aa  64.3  0.000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.773131 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2672  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  27.22 
 
 
377 aa  63.9  0.000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0627264  normal  0.0375363 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6709  Rieske (2Fe-2S) protein  31.89 
 
 
373 aa  63.9  0.000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1535  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  27.68 
 
 
331 aa  63.9  0.000000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64800  vanillate O-demethylase oxygenase subunit  33.61 
 
 
351 aa  63.9  0.000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0565633  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2725  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  27.33 
 
 
354 aa  63.5  0.000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0149406 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5225  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  28.36 
 
 
384 aa  63.5  0.000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.532387  normal  0.253584 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5022  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  25.15 
 
 
385 aa  63.2  0.000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4640  Rieske (2Fe-2S) region  25.15 
 
 
385 aa  63.2  0.000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1352  vanillate monooxygenase  28.93 
 
 
363 aa  63.2  0.000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4728  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  25.15 
 
 
385 aa  63.2  0.000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1009  vanillate demethylase  26.67 
 
 
353 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0048453  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>