More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_6508 on replicon NC_008544
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010512  Bcenmc03_6099  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  95.73 
 
 
351 aa  659    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1321  Rieske (2Fe-2S) region  100 
 
 
351 aa  708    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.117089  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6508  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  100 
 
 
351 aa  708    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6098  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  48.55 
 
 
350 aa  306  5.0000000000000004e-82  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1322  Rieske (2Fe-2S) region  48.21 
 
 
350 aa  300  2e-80  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0760232  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6507  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  48.21 
 
 
350 aa  300  2e-80  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.850952  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5949  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  41.04 
 
 
342 aa  239  4e-62  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.193657 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5946  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  39.74 
 
 
341 aa  218  8.999999999999998e-56  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.930147 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4970  Rieske (2Fe-2S) domain protein  34.63 
 
 
328 aa  181  2e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.22227  normal  0.214971 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2516  Rieske (2Fe-2S) domain protein  34.92 
 
 
326 aa  146  5e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00793645  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1464  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  28.75 
 
 
326 aa  125  8.000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.134829  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1220  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  28.75 
 
 
334 aa  125  1e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0507919  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0463  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  28.75 
 
 
334 aa  125  1e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2607  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  28.75 
 
 
334 aa  125  1e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1112  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  28.75 
 
 
334 aa  125  1e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.624843  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1377  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  28.75 
 
 
334 aa  125  1e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0187  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  28.75 
 
 
334 aa  125  1e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.531075  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4325  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  28.97 
 
 
369 aa  123  5e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0576  Rieske (2Fe-2S) region  26.09 
 
 
323 aa  114  2.0000000000000002e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2753  Rieske (2Fe-2S) region  28.05 
 
 
342 aa  111  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.915347 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3784  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  27.75 
 
 
342 aa  110  3e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1769  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  29.88 
 
 
332 aa  110  3e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.501014  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2053  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  30.93 
 
 
398 aa  109  8.000000000000001e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.216867  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1835  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  30.03 
 
 
332 aa  107  2e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1788  Rieske (2Fe-2S) region  30.03 
 
 
332 aa  107  2e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.651662  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4333  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  29.48 
 
 
338 aa  107  3e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.536684 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3649  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  29.7 
 
 
362 aa  107  4e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3569  Rieske (2Fe-2S) region  28.06 
 
 
341 aa  107  4e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3642  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  28.06 
 
 
341 aa  107  4e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.55041  normal  0.365786 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2012  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  29.73 
 
 
339 aa  106  6e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.754296  normal  0.410286 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3307  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  30.93 
 
 
357 aa  104  2e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000352846 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3574  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  27.76 
 
 
341 aa  104  2e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2121  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  28.49 
 
 
377 aa  102  9e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.312892  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4116  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  28.44 
 
 
335 aa  101  2e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.275911  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1448  Rieske (2Fe-2S) protein  25.76 
 
 
359 aa  101  2e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3666  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  28.06 
 
 
359 aa  98.2  2e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3601  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  26.03 
 
 
335 aa  97.4  3e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.022726  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1829  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  28.75 
 
 
365 aa  91.3  2e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.745414  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2492  vanillate O-demethylase oxygenase subunit  34.57 
 
 
315 aa  89  1e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1576  Rieske (2Fe-2S) region  25.47 
 
 
358 aa  87.4  3e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.221742  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4566  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  24.71 
 
 
386 aa  86.7  6e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0832436  normal  0.12498 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3509  Rieske (2Fe-2S) domain protein  24.27 
 
 
386 aa  86.3  8e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.119894  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2518  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  24.92 
 
 
398 aa  85.9  9e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0672  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  31.79 
 
 
344 aa  84  0.000000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.270675  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2500  Rieske (2Fe-2S) region  28.92 
 
 
359 aa  84  0.000000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.455012 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0287  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  24.93 
 
 
378 aa  83.6  0.000000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.831286  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1686  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  27.64 
 
 
357 aa  83.6  0.000000000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3542  vanillate O-demethylase oxygenase subunit  32.98 
 
 
345 aa  83.6  0.000000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.10385 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0306  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  24.93 
 
 
378 aa  82.8  0.000000000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.20897 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0837  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  28.65 
 
 
346 aa  82.8  0.000000000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.558436  normal  0.660482 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0296  Rieske (2Fe-2S) region  24.93 
 
 
378 aa  82.8  0.000000000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.317274  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2036  hypothetical protein  33.33 
 
 
334 aa  82  0.00000000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.502892  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4419  Rieske (2Fe-2S) iron-sulfur domain-containing protein  27.87 
 
 
367 aa  82  0.00000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.257041  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1546  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  25 
 
 
360 aa  80.5  0.00000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.675385  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2239  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  34.73 
 
 
350 aa  80.1  0.00000000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1009  vanillate demethylase  28.83 
 
 
353 aa  80.1  0.00000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0048453  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1067  vanillate monooxygenase  34.13 
 
 
359 aa  79.3  0.00000000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.535746  normal  0.0980736 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2869  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  23.67 
 
 
385 aa  79.3  0.00000000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.455502  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2521  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  33.14 
 
 
343 aa  77  0.0000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.171957  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3849  Rieske (2Fe-2S) iron-sulfur domain protein  23.62 
 
 
393 aa  77  0.0000000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2880  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  24.4 
 
 
377 aa  76.6  0.0000000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.150338  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1549  vanillate monooxygenase  32.93 
 
 
359 aa  76.3  0.0000000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.619122  normal  0.0130812 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4103  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  34.78 
 
 
374 aa  76.3  0.0000000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2502  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  32.95 
 
 
332 aa  75.1  0.000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3266  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  32.1 
 
 
353 aa  75.1  0.000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0113117 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0127  Rieske (2Fe-2S) protein  35.4 
 
 
355 aa  74.3  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5211  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  23.17 
 
 
376 aa  72.8  0.00000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.220934 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1487  Rieske (2Fe-2S) protein  28.9 
 
 
356 aa  72.4  0.00000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5718  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  34.38 
 
 
373 aa  72  0.00000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.592667 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5962  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  34.38 
 
 
373 aa  72  0.00000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.314282  normal  0.602397 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1812  Rieske (2Fe-2S) region  33.12 
 
 
383 aa  70.9  0.00000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0372125 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0993  Rieske (2Fe-2S) region  31.41 
 
 
350 aa  70.5  0.00000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  unclonable  0.00000318811 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13559  oxidoreductase  23.71 
 
 
386 aa  70.1  0.00000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000136875 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2359  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  35.98 
 
 
410 aa  70.1  0.00000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.128163  normal  0.731078 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1559  vanillate monooxygenase  32.23 
 
 
347 aa  70.1  0.00000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.662697  normal  0.47859 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6718  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  35.19 
 
 
371 aa  69.7  0.00000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1872  Rieske (2Fe-2S) protein  31.28 
 
 
356 aa  69.7  0.00000000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.171768  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1589  Rieske (2Fe-2S) region  35.19 
 
 
371 aa  69.7  0.00000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.577114  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6242  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  35.19 
 
 
371 aa  69.7  0.00000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.718979  normal  0.984052 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4728  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  21.89 
 
 
385 aa  69.3  0.00000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5022  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  21.89 
 
 
385 aa  69.3  0.00000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4640  Rieske (2Fe-2S) region  21.89 
 
 
385 aa  69.3  0.00000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7085  Rieske (2Fe-2S) domain protein  33.54 
 
 
406 aa  69.3  0.00000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2310  vanillate monooxygenase  28.06 
 
 
362 aa  68.9  0.0000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0218143 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6662  dioxygenase, iron-sulfur subunit  33.12 
 
 
371 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0364205  normal  0.0470201 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3396  vanillate monooxygenase  27.75 
 
 
348 aa  68.6  0.0000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00111775  normal  0.0140003 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2285  vanillate monooxygenase  32.72 
 
 
367 aa  68.6  0.0000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.138524 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0203  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  32.7 
 
 
406 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0396  Rieske (2Fe-2S) domain protein  30.06 
 
 
360 aa  68.2  0.0000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.547393 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08501  Rieske iron-sulfur protein 2Fe-2S subunit  30.17 
 
 
444 aa  67.4  0.0000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00185666 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5354  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  34.57 
 
 
370 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.111829  normal  0.289416 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2137  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  30.08 
 
 
450 aa  67.8  0.0000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0218  Rieske iron-sulfur protein 2Fe-2S subunit  30.17 
 
 
444 aa  67  0.0000000004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.163513  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4330  vanillate monooxygenase  32.52 
 
 
366 aa  67.4  0.0000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0440139 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0504  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  31.45 
 
 
337 aa  66.2  0.0000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.725699  normal  0.611545 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2672  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  26.95 
 
 
377 aa  65.9  0.0000000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0627264  normal  0.0375363 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5789  Rieske (2Fe-2S) region  28.57 
 
 
349 aa  64.3  0.000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2688  Rieske (2Fe-2S) protein  31.82 
 
 
352 aa  64.3  0.000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1533  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  22.19 
 
 
383 aa  64.3  0.000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3409  vanillate monooxygenase  30.91 
 
 
347 aa  63.2  0.000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0915562 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>