More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_2121 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009901  Spea_2121  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  100 
 
 
377 aa  790    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.312892  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2053  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  54.78 
 
 
398 aa  400  9.999999999999999e-111  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.216867  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3649  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  51.65 
 
 
362 aa  375  1e-103  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3666  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  47.79 
 
 
359 aa  343  4e-93  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3307  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  49.43 
 
 
357 aa  342  5e-93  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000352846 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1829  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  47.47 
 
 
365 aa  322  6e-87  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.745414  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1448  Rieske (2Fe-2S) protein  31.12 
 
 
359 aa  171  1e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4566  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  31.74 
 
 
386 aa  170  3e-41  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0832436  normal  0.12498 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2869  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  30.17 
 
 
385 aa  169  6e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.455502  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2518  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  31.23 
 
 
398 aa  169  6e-41  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0306  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  31.53 
 
 
378 aa  169  1e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.20897 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0296  Rieske (2Fe-2S) region  31.53 
 
 
378 aa  169  1e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.317274  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1576  Rieske (2Fe-2S) region  30.56 
 
 
358 aa  167  2.9999999999999998e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.221742  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0287  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  31.23 
 
 
378 aa  166  4e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.831286  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1533  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  30.33 
 
 
383 aa  159  5e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3509  Rieske (2Fe-2S) domain protein  31.07 
 
 
386 aa  158  1e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.119894  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5225  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  30.03 
 
 
384 aa  157  2e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.532387  normal  0.253584 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13559  oxidoreductase  30.33 
 
 
386 aa  157  4e-37  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000136875 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4728  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  30.63 
 
 
385 aa  156  5.0000000000000005e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4640  Rieske (2Fe-2S) region  30.63 
 
 
385 aa  156  5.0000000000000005e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5022  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  30.63 
 
 
385 aa  156  5.0000000000000005e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3849  Rieske (2Fe-2S) iron-sulfur domain protein  30.75 
 
 
393 aa  155  1e-36  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0919  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  27.25 
 
 
413 aa  152  7e-36  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.40957  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2672  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  30.03 
 
 
377 aa  150  5e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0627264  normal  0.0375363 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2880  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  30.24 
 
 
377 aa  149  6e-35  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.150338  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5211  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  29.59 
 
 
376 aa  147  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.220934 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1220  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  29.19 
 
 
334 aa  145  2e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0507919  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1112  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  29.19 
 
 
334 aa  145  2e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.624843  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2607  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  29.19 
 
 
334 aa  145  2e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1377  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  29.19 
 
 
334 aa  145  2e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0463  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  29.19 
 
 
334 aa  145  2e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0187  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  29.19 
 
 
334 aa  145  2e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.531075  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1464  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  29.19 
 
 
326 aa  144  2e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.134829  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1546  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  29.38 
 
 
360 aa  142  7e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.675385  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2516  Rieske (2Fe-2S) domain protein  28.96 
 
 
326 aa  141  1.9999999999999998e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00793645  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0576  Rieske (2Fe-2S) region  27.75 
 
 
323 aa  139  6e-32  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3601  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  27.25 
 
 
335 aa  127  5e-28  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.022726  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4333  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  26.59 
 
 
338 aa  121  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.536684 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1835  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  27.54 
 
 
332 aa  120  3e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1788  Rieske (2Fe-2S) region  27.54 
 
 
332 aa  120  3e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.651662  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1769  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  27.25 
 
 
332 aa  120  3.9999999999999996e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.501014  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2012  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  25.97 
 
 
339 aa  119  9e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.754296  normal  0.410286 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2753  Rieske (2Fe-2S) region  25.3 
 
 
342 aa  117  3.9999999999999997e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.915347 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3784  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  25.23 
 
 
342 aa  115  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3574  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  27.08 
 
 
341 aa  113  6e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3642  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  27.08 
 
 
341 aa  112  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.55041  normal  0.365786 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3569  Rieske (2Fe-2S) region  27.08 
 
 
341 aa  112  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4325  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  25.59 
 
 
369 aa  104  3e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1321  Rieske (2Fe-2S) region  27.3 
 
 
351 aa  100  6e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.117089  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6508  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  27.3 
 
 
351 aa  100  6e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6099  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  27.3 
 
 
351 aa  97.8  3e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2492  vanillate O-demethylase oxygenase subunit  32.97 
 
 
315 aa  96.7  5e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2888  PrnD  26.86 
 
 
370 aa  93.6  5e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.942193  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2736  PrnD  26.86 
 
 
370 aa  93.6  5e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1118  PrnD  26.86 
 
 
346 aa  93.2  7e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2050  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  30.85 
 
 
327 aa  92  1e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0319051  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4419  Rieske (2Fe-2S) iron-sulfur domain-containing protein  29.83 
 
 
367 aa  91.3  2e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.257041  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2500  Rieske (2Fe-2S) region  34.96 
 
 
359 aa  91.7  2e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.455012 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2686  Rieske (2Fe-2S) protein  30.22 
 
 
376 aa  91.7  2e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2036  hypothetical protein  32.31 
 
 
334 aa  90.9  3e-17  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.502892  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6986  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  24.78 
 
 
374 aa  88.6  2e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.529476  normal  0.476808 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5946  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  23.95 
 
 
341 aa  88.6  2e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.930147 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1322  Rieske (2Fe-2S) region  25.86 
 
 
350 aa  88.6  2e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0760232  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4116  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  25.29 
 
 
335 aa  88.6  2e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.275911  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6507  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  25.86 
 
 
350 aa  88.6  2e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.850952  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2687  Rieske (2Fe-2S) protein  27.68 
 
 
356 aa  87.8  3e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6709  Rieske (2Fe-2S) protein  25.2 
 
 
373 aa  87  5e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4970  Rieske (2Fe-2S) domain protein  27.45 
 
 
328 aa  87  5e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.22227  normal  0.214971 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1686  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  29.84 
 
 
357 aa  86.7  6e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1067  vanillate monooxygenase  31.86 
 
 
359 aa  86.3  9e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.535746  normal  0.0980736 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4729  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  25.42 
 
 
370 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5949  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  29.26 
 
 
342 aa  84.3  0.000000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.193657 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5267  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  25.14 
 
 
370 aa  83.6  0.000000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3542  vanillate O-demethylase oxygenase subunit  32.4 
 
 
345 aa  80.1  0.00000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.10385 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6098  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  24.63 
 
 
350 aa  79.7  0.00000000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26080  vanillate demethylase subunit A  32.46 
 
 
377 aa  79  0.0000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.819244  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0127  Rieske (2Fe-2S) protein  31.89 
 
 
355 aa  79.3  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4278  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  32 
 
 
362 aa  79  0.0000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.844018 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1184  Rieske (2Fe-2S) domain protein  28.32 
 
 
358 aa  79  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4769  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  24.92 
 
 
367 aa  79.3  0.0000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.289545  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3952  Rieske (2Fe-2S) protein  33.7 
 
 
340 aa  78.6  0.0000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.13771  normal  0.112958 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3266  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  27.17 
 
 
353 aa  76.6  0.0000000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0113117 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1557  Rieske (2Fe-2S) domain protein  27.08 
 
 
450 aa  75.5  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0276963  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1827  Rieske (2Fe-2S) region  27.84 
 
 
347 aa  75.9  0.000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1530  Rieske (2Fe-2S) domain protein  27.08 
 
 
450 aa  74.7  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3264  vanillate monooxygenase  33.72 
 
 
350 aa  75.1  0.000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00112363 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1064  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  23.85 
 
 
387 aa  75.1  0.000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.43547 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1185  Rieske (2Fe-2S) domain protein  27.41 
 
 
364 aa  75.1  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0963  vanillate O-demethylase oxygenase subunit  30.11 
 
 
350 aa  74.3  0.000000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1781  cell death suppressor protein Lls1-like  25.09 
 
 
456 aa  74.3  0.000000000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.527136  normal  0.0843855 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2502  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  29.28 
 
 
332 aa  74.3  0.000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2688  Rieske (2Fe-2S) protein  24.58 
 
 
352 aa  73.9  0.000000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0535  Rieske (2Fe-2S) region  25.68 
 
 
460 aa  73.6  0.000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0627  Rieske (2Fe-2S) domain protein  28.71 
 
 
361 aa  73.2  0.000000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10960  ferridoxin oxidoreductase subunit  23.36 
 
 
370 aa  73.2  0.000000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2310  vanillate monooxygenase  30.22 
 
 
362 aa  73.2  0.000000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0218143 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1004  putative vanillate O-demethylase oxygenase subunit A  26.53 
 
 
353 aa  73.2  0.000000000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.413289  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2297  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  33.8 
 
 
352 aa  73.2  0.000000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.125012  normal  0.643759 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2305  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  33.8 
 
 
352 aa  73.2  0.000000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.560893  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2258  Rieske (2Fe-2S) region  33.8 
 
 
352 aa  73.2  0.000000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.236496  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>