More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_2521 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009511  Swit_2521  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  100 
 
 
343 aa  704    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.171957  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0837  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  46.55 
 
 
346 aa  312  6.999999999999999e-84  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.558436  normal  0.660482 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0504  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  46.45 
 
 
337 aa  304  1.0000000000000001e-81  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.725699  normal  0.611545 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2239  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  44.82 
 
 
350 aa  288  1e-76  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2502  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  40.61 
 
 
332 aa  257  2e-67  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0672  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  40.37 
 
 
344 aa  252  5.000000000000001e-66  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.270675  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4970  Rieske (2Fe-2S) domain protein  29.57 
 
 
328 aa  107  2e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.22227  normal  0.214971 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2500  Rieske (2Fe-2S) region  31.68 
 
 
359 aa  93.6  4e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.455012 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4419  Rieske (2Fe-2S) iron-sulfur domain-containing protein  31.1 
 
 
367 aa  93.2  5e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.257041  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2036  hypothetical protein  35.82 
 
 
334 aa  89.4  8e-17  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.502892  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2686  Rieske (2Fe-2S) protein  32.47 
 
 
376 aa  86.3  7e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2492  vanillate O-demethylase oxygenase subunit  32.21 
 
 
315 aa  85.1  0.000000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2258  Rieske (2Fe-2S) region  34.88 
 
 
352 aa  85.1  0.000000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.236496  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2297  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  34.88 
 
 
352 aa  85.1  0.000000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.125012  normal  0.643759 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2305  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  34.88 
 
 
352 aa  85.1  0.000000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.560893  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1009  vanillate demethylase  30.91 
 
 
353 aa  83.2  0.000000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0048453  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2050  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  29.31 
 
 
327 aa  81.6  0.00000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0319051  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2869  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  35.71 
 
 
385 aa  79.7  0.00000000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.455502  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1001  putative vanillate O-demethylase oxygenase subunit A  28.9 
 
 
349 aa  80.1  0.00000000000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.8149  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1067  vanillate monooxygenase  37.61 
 
 
359 aa  79.7  0.00000000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.535746  normal  0.0980736 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2012  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  32.56 
 
 
339 aa  78.6  0.0000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.754296  normal  0.410286 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1004  putative vanillate O-demethylase oxygenase subunit A  27.75 
 
 
353 aa  79.3  0.0000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.413289  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4333  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  32.37 
 
 
338 aa  78.6  0.0000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.536684 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4330  vanillate monooxygenase  29.01 
 
 
366 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0440139 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1321  Rieske (2Fe-2S) region  33.14 
 
 
351 aa  77.4  0.0000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.117089  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6508  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  33.14 
 
 
351 aa  77.4  0.0000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2516  Rieske (2Fe-2S) domain protein  35.54 
 
 
326 aa  76.6  0.0000000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00793645  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2919  Rieske (2Fe-2S) domain protein  28.26 
 
 
338 aa  76.3  0.0000000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.563703  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2359  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  27.51 
 
 
410 aa  76.3  0.0000000000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.128163  normal  0.731078 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1220  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  30.91 
 
 
334 aa  75.9  0.0000000000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0507919  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1377  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  30.91 
 
 
334 aa  75.9  0.0000000000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2607  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  30.91 
 
 
334 aa  75.9  0.0000000000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0463  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  30.91 
 
 
334 aa  75.9  0.0000000000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1464  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  30.91 
 
 
326 aa  75.9  0.0000000000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.134829  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0187  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  30.91 
 
 
334 aa  75.9  0.0000000000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.531075  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1112  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  30.91 
 
 
334 aa  75.9  0.0000000000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.624843  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2143  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  33.33 
 
 
372 aa  75.5  0.000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.444634  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4769  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  27.27 
 
 
367 aa  75.9  0.000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.289545  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3784  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  30.77 
 
 
342 aa  75.1  0.000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3574  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  33.13 
 
 
341 aa  74.3  0.000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3542  vanillate O-demethylase oxygenase subunit  28.83 
 
 
345 aa  74.3  0.000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.10385 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1769  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  31.58 
 
 
332 aa  73.9  0.000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.501014  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3642  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  33.13 
 
 
341 aa  73.6  0.000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.55041  normal  0.365786 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3569  Rieske (2Fe-2S) region  33.13 
 
 
341 aa  73.6  0.000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2285  vanillate monooxygenase  31.9 
 
 
367 aa  73.9  0.000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.138524 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1549  vanillate monooxygenase  35.65 
 
 
359 aa  73.6  0.000000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.619122  normal  0.0130812 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6099  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  32 
 
 
351 aa  72.8  0.000000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1448  Rieske (2Fe-2S) protein  27.88 
 
 
359 aa  72.4  0.000000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3601  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  29.79 
 
 
335 aa  72.8  0.000000000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.022726  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1788  Rieske (2Fe-2S) region  30.99 
 
 
332 aa  72.8  0.000000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.651662  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1835  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  30.99 
 
 
332 aa  72.8  0.000000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1137  vanillate monooxygenase  29.01 
 
 
350 aa  72  0.00000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.684708  hitchhiker  0.000140047 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1550  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  29.76 
 
 
353 aa  72.4  0.00000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.276626  normal  0.0604744 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2979  Rieske (2Fe-2S) domain protein  29.75 
 
 
367 aa  72.4  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3574  Rieske (2Fe-2S) region  29.46 
 
 
349 aa  72  0.00000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0222  vanillate O-demethylase oxygenase subunit oxidoreductase protein  28.41 
 
 
342 aa  71.6  0.00000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.0000016692  normal  0.0221534 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1445  Rieske (2Fe-2S) protein  32.21 
 
 
437 aa  71.6  0.00000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.491711  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1687  Rieske (2Fe-2S) domain protein  25.4 
 
 
449 aa  71.6  0.00000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2753  Rieske (2Fe-2S) region  31.58 
 
 
342 aa  71.6  0.00000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.915347 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4257  Rieske (2Fe-2S) domain protein  35.14 
 
 
349 aa  71.2  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6483  Rieske (2Fe-2S) region  33.64 
 
 
358 aa  70.5  0.00000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4116  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  25.78 
 
 
335 aa  70.5  0.00000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.275911  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1103  Rieske (2Fe-2S) domain protein  29.57 
 
 
362 aa  70.1  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3307  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  27.2 
 
 
357 aa  69.7  0.00000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000352846 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0741  Rieske (2Fe-2S) protein  26.74 
 
 
382 aa  69.7  0.00000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0606248 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2688  Rieske (2Fe-2S) protein  28.42 
 
 
352 aa  69.7  0.00000000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0877  putative dioxygenase  34.39 
 
 
452 aa  69.3  0.00000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.297728  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2053  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  29.94 
 
 
398 aa  69.3  0.00000000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.216867  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1001  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  28.46 
 
 
380 aa  69.3  0.00000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5949  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  30.11 
 
 
342 aa  69.3  0.00000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.193657 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0993  Rieske (2Fe-2S) region  27.81 
 
 
350 aa  69.3  0.00000000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  unclonable  0.00000318811 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1130  Rieske (2Fe-2S) domain protein  29.57 
 
 
362 aa  68.9  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0812255  normal  0.937672 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4269  vanillate monooxygenase  29.34 
 
 
351 aa  68.6  0.0000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.846398 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3666  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  28.08 
 
 
359 aa  68.9  0.0000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4245  Rieske (2Fe-2S) domain protein  32.3 
 
 
371 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3024  vanillate monooxygenase  31.25 
 
 
361 aa  68.6  0.0000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2687  Rieske (2Fe-2S) protein  27.11 
 
 
356 aa  67.8  0.0000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3509  Rieske (2Fe-2S) domain protein  31.25 
 
 
386 aa  68.2  0.0000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.119894  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4566  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  32.11 
 
 
386 aa  68.2  0.0000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0832436  normal  0.12498 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64800  vanillate O-demethylase oxygenase subunit  30.3 
 
 
351 aa  68.2  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0565633  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1487  Rieske (2Fe-2S) protein  28.09 
 
 
356 aa  67.8  0.0000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1368  vanillate monooxygenase  30.7 
 
 
352 aa  67.4  0.0000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8462  Rieske (2Fe-2S) domain protein  35.38 
 
 
448 aa  67.4  0.0000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0306  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  31.25 
 
 
378 aa  67  0.0000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.20897 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4882  phthalate 4,5-dioxygenase  28.02 
 
 
422 aa  67.4  0.0000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0787  Rieske (2Fe-2S) protein  31.3 
 
 
351 aa  67  0.0000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.466147 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1185  Rieske (2Fe-2S) domain protein  32.14 
 
 
364 aa  67  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4325  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  30.39 
 
 
369 aa  67.4  0.0000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0296  Rieske (2Fe-2S) region  31.25 
 
 
378 aa  67  0.0000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.317274  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0287  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  31.25 
 
 
378 aa  67  0.0000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.831286  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1535  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  30.3 
 
 
331 aa  67  0.0000000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0576  Rieske (2Fe-2S) region  26.9 
 
 
323 aa  66.2  0.0000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3649  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  30.48 
 
 
362 aa  65.5  0.000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1389  putative oxygenase  33.94 
 
 
359 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6982  phthalate 4,5-dioxygenase  30.68 
 
 
438 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5946  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  28.57 
 
 
341 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.930147 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0127  Rieske (2Fe-2S) protein  32.46 
 
 
355 aa  65.1  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5154  Rieske (2Fe-2S) region  31.79 
 
 
440 aa  65.1  0.000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.291358  normal  0.277417 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3532  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  32.37 
 
 
446 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.048657  normal  0.0515471 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3626  Rieske (2Fe-2S) domain protein  25.61 
 
 
362 aa  64.7  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.54925  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>