More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_3784 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008726  Mvan_3784  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  100 
 
 
342 aa  714    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2753  Rieske (2Fe-2S) region  91.23 
 
 
342 aa  655    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.915347 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3574  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  79.29 
 
 
341 aa  568  1e-161  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3642  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  78.99 
 
 
341 aa  566  1e-160  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.55041  normal  0.365786 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3569  Rieske (2Fe-2S) region  78.99 
 
 
341 aa  566  1e-160  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4325  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  65.26 
 
 
369 aa  462  1e-129  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4116  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  42.4 
 
 
335 aa  257  2e-67  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.275911  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2012  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  37.46 
 
 
339 aa  233  3e-60  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.754296  normal  0.410286 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4333  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  36.47 
 
 
338 aa  230  2e-59  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.536684 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1835  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  37.76 
 
 
332 aa  226  6e-58  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1788  Rieske (2Fe-2S) region  37.76 
 
 
332 aa  226  6e-58  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.651662  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1769  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  37.46 
 
 
332 aa  224  1e-57  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.501014  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2516  Rieske (2Fe-2S) domain protein  34.04 
 
 
326 aa  169  6e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00793645  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1464  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  32 
 
 
326 aa  156  4e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.134829  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1220  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  32 
 
 
334 aa  156  5.0000000000000005e-37  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0507919  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0463  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  32 
 
 
334 aa  156  5.0000000000000005e-37  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2607  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  32 
 
 
334 aa  156  5.0000000000000005e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1112  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  32 
 
 
334 aa  156  5.0000000000000005e-37  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.624843  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0187  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  32 
 
 
334 aa  156  5.0000000000000005e-37  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.531075  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1377  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  32 
 
 
334 aa  156  5.0000000000000005e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3601  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  30.75 
 
 
335 aa  152  1e-35  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.022726  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5946  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  29.14 
 
 
341 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.930147 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3307  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  30.65 
 
 
357 aa  131  1.0000000000000001e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000352846 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3666  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  28.7 
 
 
359 aa  127  3e-28  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3649  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  28.82 
 
 
362 aa  125  1e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2053  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  27.51 
 
 
398 aa  122  6e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.216867  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5949  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  27.13 
 
 
342 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.193657 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4566  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  26.73 
 
 
386 aa  120  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0832436  normal  0.12498 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3509  Rieske (2Fe-2S) domain protein  27.71 
 
 
386 aa  121  1.9999999999999998e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.119894  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1448  Rieske (2Fe-2S) protein  26.13 
 
 
359 aa  119  9e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1576  Rieske (2Fe-2S) region  27.06 
 
 
358 aa  118  9.999999999999999e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.221742  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3849  Rieske (2Fe-2S) iron-sulfur domain protein  27.58 
 
 
393 aa  118  1.9999999999999998e-25  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0287  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  26.71 
 
 
378 aa  117  3e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.831286  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0296  Rieske (2Fe-2S) region  26.4 
 
 
378 aa  116  5e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.317274  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0306  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  26.4 
 
 
378 aa  116  5e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.20897 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2518  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  25.53 
 
 
398 aa  116  6.9999999999999995e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2121  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  25.23 
 
 
377 aa  115  7.999999999999999e-25  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.312892  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2869  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  25.39 
 
 
385 aa  115  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.455502  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1829  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  28.31 
 
 
365 aa  114  2.0000000000000002e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.745414  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0576  Rieske (2Fe-2S) region  24.11 
 
 
323 aa  113  5e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2672  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  25.08 
 
 
377 aa  108  1e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0627264  normal  0.0375363 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1321  Rieske (2Fe-2S) region  26.82 
 
 
351 aa  107  2e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.117089  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6508  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  26.82 
 
 
351 aa  107  2e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13559  oxidoreductase  26.69 
 
 
386 aa  106  6e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000136875 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0919  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  25.5 
 
 
413 aa  105  1e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.40957  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4970  Rieske (2Fe-2S) domain protein  28.48 
 
 
328 aa  105  1e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.22227  normal  0.214971 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6099  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  26.81 
 
 
351 aa  104  2e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1533  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  26.3 
 
 
383 aa  103  4e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4728  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  25.98 
 
 
385 aa  103  5e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4640  Rieske (2Fe-2S) region  25.98 
 
 
385 aa  103  5e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5022  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  25.98 
 
 
385 aa  103  5e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5225  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  27.07 
 
 
384 aa  102  9e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.532387  normal  0.253584 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2687  Rieske (2Fe-2S) protein  34.86 
 
 
356 aa  102  1e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6098  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  26.92 
 
 
350 aa  100  5e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2880  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  25.08 
 
 
377 aa  98.2  2e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.150338  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1546  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  26.49 
 
 
360 aa  97.1  4e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.675385  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2686  Rieske (2Fe-2S) protein  32.94 
 
 
376 aa  96.7  5e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5211  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  30.95 
 
 
376 aa  95.5  1e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.220934 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2500  Rieske (2Fe-2S) region  33.71 
 
 
359 aa  95.1  2e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.455012 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1322  Rieske (2Fe-2S) region  25.78 
 
 
350 aa  94  3e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0760232  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6507  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  25.78 
 
 
350 aa  94  3e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.850952  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0837  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  35.54 
 
 
346 aa  87.4  3e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.558436  normal  0.660482 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2239  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  27.05 
 
 
350 aa  87.4  3e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4419  Rieske (2Fe-2S) iron-sulfur domain-containing protein  29.44 
 
 
367 aa  87.4  3e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.257041  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6709  Rieske (2Fe-2S) protein  25.71 
 
 
373 aa  87  4e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5267  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  26.17 
 
 
370 aa  86.7  5e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4729  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  26.17 
 
 
370 aa  86.3  6e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1118  PrnD  26.17 
 
 
346 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2888  PrnD  26.17 
 
 
370 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.942193  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2736  PrnD  26.17 
 
 
370 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2036  hypothetical protein  28.34 
 
 
334 aa  82.4  0.00000000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.502892  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4103  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  25.82 
 
 
374 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2050  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  27.99 
 
 
327 aa  82  0.00000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0319051  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6986  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  24.32 
 
 
374 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.529476  normal  0.476808 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2285  vanillate monooxygenase  31.18 
 
 
367 aa  80.9  0.00000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.138524 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2688  Rieske (2Fe-2S) protein  28.8 
 
 
352 aa  80.5  0.00000000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0672  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  31.5 
 
 
344 aa  80.5  0.00000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.270675  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0547  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  26.88 
 
 
324 aa  79.7  0.00000000000007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000394367  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1812  Rieske (2Fe-2S) region  26.09 
 
 
383 aa  79.7  0.00000000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0372125 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2502  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  29.65 
 
 
332 aa  78.6  0.0000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1535  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  25.93 
 
 
331 aa  78.6  0.0000000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0504  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  27.83 
 
 
337 aa  77.8  0.0000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.725699  normal  0.611545 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4340  Rieske (2Fe-2S) region  28.49 
 
 
350 aa  75.1  0.000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2521  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  30.77 
 
 
343 aa  75.1  0.000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.171957  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0396  Rieske (2Fe-2S) domain protein  25.41 
 
 
360 aa  74.7  0.000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.547393 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3542  vanillate O-demethylase oxygenase subunit  24.12 
 
 
345 aa  74.3  0.000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.10385 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1686  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  28.92 
 
 
357 aa  73.9  0.000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26080  vanillate demethylase subunit A  27.23 
 
 
377 aa  73.6  0.000000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.819244  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7085  Rieske (2Fe-2S) domain protein  26.29 
 
 
406 aa  73.6  0.000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5354  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  26.78 
 
 
370 aa  73.2  0.000000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.111829  normal  0.289416 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0203  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  26.16 
 
 
406 aa  72.8  0.000000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5718  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  26.88 
 
 
373 aa  72  0.00000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.592667 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2492  vanillate O-demethylase oxygenase subunit  28.41 
 
 
315 aa  72.4  0.00000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1442  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  28.25 
 
 
324 aa  72  0.00000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000193123  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1488  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  27.69 
 
 
321 aa  72  0.00000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0113839  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5962  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  26.88 
 
 
373 aa  72  0.00000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.314282  normal  0.602397 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7105  Rieske (2Fe-2S) domain protein  28.29 
 
 
361 aa  71.2  0.00000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.811582  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6662  dioxygenase, iron-sulfur subunit  26.88 
 
 
371 aa  70.9  0.00000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0364205  normal  0.0470201 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2919  Rieske (2Fe-2S) domain protein  32.45 
 
 
338 aa  70.5  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.563703  normal 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5154  Rieske (2Fe-2S) region  31.36 
 
 
440 aa  69.7  0.00000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.291358  normal  0.277417 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>