More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_3307 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009511  Swit_3307  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  100 
 
 
357 aa  746    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000352846 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3666  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  60.66 
 
 
359 aa  439  9.999999999999999e-123  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3649  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  55.87 
 
 
362 aa  402  1e-111  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2053  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  57.66 
 
 
398 aa  383  1e-105  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.216867  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2121  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  49.43 
 
 
377 aa  342  4e-93  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.312892  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1829  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  44.35 
 
 
365 aa  281  1e-74  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.745414  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2869  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  33.62 
 
 
385 aa  181  2e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.455502  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1448  Rieske (2Fe-2S) protein  32.72 
 
 
359 aa  178  1e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5225  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  29.85 
 
 
384 aa  173  3.9999999999999995e-42  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.532387  normal  0.253584 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4566  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  31.14 
 
 
386 aa  173  3.9999999999999995e-42  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0832436  normal  0.12498 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1576  Rieske (2Fe-2S) region  31.61 
 
 
358 aa  172  5.999999999999999e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.221742  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0287  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  32.09 
 
 
378 aa  171  2e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.831286  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0296  Rieske (2Fe-2S) region  32.09 
 
 
378 aa  171  2e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.317274  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0306  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  32.09 
 
 
378 aa  171  2e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.20897 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1533  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  29.25 
 
 
383 aa  169  6e-41  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5022  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  29.97 
 
 
385 aa  165  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4728  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  29.97 
 
 
385 aa  165  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4640  Rieske (2Fe-2S) region  29.97 
 
 
385 aa  165  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13559  oxidoreductase  30.9 
 
 
386 aa  164  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000136875 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2518  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  31.94 
 
 
398 aa  164  3e-39  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3849  Rieske (2Fe-2S) iron-sulfur domain protein  29.23 
 
 
393 aa  160  2e-38  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3509  Rieske (2Fe-2S) domain protein  29.76 
 
 
386 aa  160  5e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.119894  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2516  Rieske (2Fe-2S) domain protein  30.03 
 
 
326 aa  158  1e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00793645  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2672  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  31.36 
 
 
377 aa  152  7e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0627264  normal  0.0375363 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2880  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  30.37 
 
 
377 aa  150  4e-35  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.150338  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0919  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  28.21 
 
 
413 aa  146  5e-34  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.40957  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5211  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  30.26 
 
 
376 aa  145  7.0000000000000006e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.220934 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1546  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  29.91 
 
 
360 aa  145  9e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.675385  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0576  Rieske (2Fe-2S) region  27.66 
 
 
323 aa  139  7.999999999999999e-32  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1464  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  28.35 
 
 
326 aa  138  1e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.134829  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1112  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  28.35 
 
 
334 aa  138  2e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.624843  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1220  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  28.35 
 
 
334 aa  138  2e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0507919  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1377  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  28.35 
 
 
334 aa  138  2e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2607  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  28.35 
 
 
334 aa  138  2e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0187  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  28.35 
 
 
334 aa  138  2e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.531075  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0463  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  28.35 
 
 
334 aa  138  2e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3574  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  31.82 
 
 
341 aa  134  3e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3642  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  31.82 
 
 
341 aa  133  3.9999999999999996e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.55041  normal  0.365786 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3569  Rieske (2Fe-2S) region  31.82 
 
 
341 aa  133  3.9999999999999996e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3784  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  30.65 
 
 
342 aa  131  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2753  Rieske (2Fe-2S) region  31.04 
 
 
342 aa  130  5.0000000000000004e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.915347 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3601  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  27.78 
 
 
335 aa  129  6e-29  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.022726  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1788  Rieske (2Fe-2S) region  29.04 
 
 
332 aa  129  9.000000000000001e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.651662  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1835  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  29.04 
 
 
332 aa  129  9.000000000000001e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1769  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  29.04 
 
 
332 aa  129  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.501014  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2012  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  27.46 
 
 
339 aa  128  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.754296  normal  0.410286 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4333  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  27.05 
 
 
338 aa  127  3e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.536684 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4970  Rieske (2Fe-2S) domain protein  28.31 
 
 
328 aa  119  9e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.22227  normal  0.214971 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4325  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  28.7 
 
 
369 aa  111  2.0000000000000002e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5946  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  27.38 
 
 
341 aa  107  3e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.930147 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2500  Rieske (2Fe-2S) region  39.39 
 
 
359 aa  107  5e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.455012 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4419  Rieske (2Fe-2S) iron-sulfur domain-containing protein  32.97 
 
 
367 aa  104  3e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.257041  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2686  Rieske (2Fe-2S) protein  31.82 
 
 
376 aa  102  1e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4116  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  27.04 
 
 
335 aa  102  1e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.275911  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5949  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  26.52 
 
 
342 aa  102  1e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.193657 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1321  Rieske (2Fe-2S) region  30.03 
 
 
351 aa  97.8  3e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.117089  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6508  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  30.03 
 
 
351 aa  97.8  3e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2736  PrnD  24.93 
 
 
370 aa  97.1  4e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2888  PrnD  24.93 
 
 
370 aa  97.4  4e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.942193  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1118  PrnD  24.86 
 
 
346 aa  96.7  5e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2036  hypothetical protein  35.81 
 
 
334 aa  95.9  9e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.502892  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6099  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  29.55 
 
 
351 aa  95.5  1e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2310  vanillate monooxygenase  31.76 
 
 
362 aa  94  3e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0218143 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2688  Rieske (2Fe-2S) protein  34.46 
 
 
352 aa  94  3e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6986  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  24.93 
 
 
374 aa  94  3e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.529476  normal  0.476808 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4729  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  25.79 
 
 
370 aa  92.4  9e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2035  hypothetical protein  30.77 
 
 
345 aa  90.9  3e-17  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5267  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  25.79 
 
 
370 aa  91.3  3e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1322  Rieske (2Fe-2S) region  27.08 
 
 
350 aa  90.5  4e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0760232  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6507  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  27.08 
 
 
350 aa  90.5  4e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.850952  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6709  Rieske (2Fe-2S) protein  25.43 
 
 
373 aa  88.6  2e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1389  putative oxygenase  29.89 
 
 
359 aa  88.2  2e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2492  vanillate O-demethylase oxygenase subunit  34.88 
 
 
315 aa  88.6  2e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6098  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  26.57 
 
 
350 aa  88.2  2e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3062  phthalate 4,5-dioxygenase  30.26 
 
 
431 aa  87.8  3e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.021682 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0807  vanillate O-demethylase oxygenase subunit  32.97 
 
 
331 aa  87.4  4e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2502  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  34.12 
 
 
332 aa  87  4e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3574  Rieske (2Fe-2S) region  30.77 
 
 
349 aa  86.7  6e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1067  vanillate monooxygenase  29.67 
 
 
359 aa  85.5  0.000000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.535746  normal  0.0980736 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3409  vanillate monooxygenase  31.58 
 
 
347 aa  85.9  0.000000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0915562 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1136  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  31.02 
 
 
373 aa  84.7  0.000000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.959251  normal  0.28876 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2050  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  28.46 
 
 
327 aa  84.3  0.000000000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0319051  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4257  Rieske (2Fe-2S) domain protein  27.38 
 
 
349 aa  83.2  0.000000000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1103  Rieske (2Fe-2S) domain protein  27.54 
 
 
362 aa  83.2  0.000000000000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2239  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  26.92 
 
 
350 aa  82.8  0.000000000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2687  Rieske (2Fe-2S) protein  29.05 
 
 
356 aa  82.8  0.000000000000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3266  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  30.6 
 
 
353 aa  82  0.00000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0113117 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1185  Rieske (2Fe-2S) domain protein  29.71 
 
 
364 aa  81.3  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1686  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  29.71 
 
 
357 aa  81.6  0.00000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1009  vanillate demethylase  29.55 
 
 
353 aa  80.9  0.00000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0048453  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2285  vanillate monooxygenase  27.91 
 
 
367 aa  80.9  0.00000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.138524 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1130  Rieske (2Fe-2S) domain protein  26.95 
 
 
362 aa  80.5  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0812255  normal  0.937672 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1488  Rieske (2Fe-2S) protein  32.96 
 
 
351 aa  79.7  0.00000000000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3410  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  27.72 
 
 
357 aa  79.7  0.00000000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0474443 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4881  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  25.4 
 
 
434 aa  79.3  0.00000000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2133  twin-arginine translocation pathway signal  36.36 
 
 
484 aa  79.3  0.00000000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.395399  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1442  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  25.3 
 
 
324 aa  79  0.0000000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000193123  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1488  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  25.3 
 
 
321 aa  79.3  0.0000000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0113839  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1549  vanillate monooxygenase  29.85 
 
 
359 aa  78.2  0.0000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.619122  normal  0.0130812 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4269  vanillate monooxygenase  26.06 
 
 
351 aa  77.4  0.0000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.846398 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>