More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_1136 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008752  Aave_1136  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  100 
 
 		 373 aa  756    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.959251  normal  0.28876 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2143  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  72.59 
 
 		 372 aa  489  1e-137  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.444634  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0807  vanillate O-demethylase oxygenase subunit  54.52 
 
 		 331 aa  322  5e-87  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1389  putative oxygenase  34.99 
 
 		 359 aa  169  7e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3567  Rieske (2Fe-2S) domain protein  34.73 
 
 		 344 aa  163  5.0000000000000005e-39  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0787  Rieske (2Fe-2S) protein  33.93 
 
 		 351 aa  155  1e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.466147 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5871  hypothetical protein  38.1 
 
 		 301 aa  151  2e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.789532  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2035  hypothetical protein  31.86 
 
 		 345 aa  149  7e-35  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4244  Rieske (2Fe-2S) domain protein  33.03 
 
 		 352 aa  145  1e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1705  hypothetical protein  37.34 
 
 		 287 aa  145  1e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0851207  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3148  hypothetical protein  36.69 
 
 		 288 aa  139  7.999999999999999e-32  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.282075 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2036  hypothetical protein  30.3 
 
 		 334 aa  134  1.9999999999999998e-30  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.502892  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4245  Rieske (2Fe-2S) domain protein  30.38 
 
 		 371 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2918  Rieske (2Fe-2S) domain protein  30.51 
 
 		 337 aa  132  1.0000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.333438  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2492  vanillate O-demethylase oxygenase subunit  27.3 
 
 		 315 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2067  hypothetical protein  31.23 
 
 		 286 aa  130  3e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0156668 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5416  vanillate O-demethylase oxygenase subunit  39.51 
 
 		 283 aa  130  5.0000000000000004e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.221202  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2034  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  29.5 
 
 		 400 aa  130  5.0000000000000004e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.967449  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1185  Rieske (2Fe-2S) domain protein  30.12 
 
 		 364 aa  128  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1248  hypothetical protein  35.71 
 
 		 284 aa  125  9e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0789553 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1234  hypothetical protein  36.13 
 
 		 286 aa  124  3e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0239219  normal  0.493228 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2919  Rieske (2Fe-2S) domain protein  29.7 
 
 		 338 aa  124  3e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.563703  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2081  hypothetical protein  35.71 
 
 		 278 aa  124  4e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00119001 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3574  Rieske (2Fe-2S) region  36.08 
 
 		 349 aa  122  9.999999999999999e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5685  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  34.48 
 
 		 353 aa  118  1.9999999999999998e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0319041  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2050  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  31.23 
 
 		 327 aa  117  3e-25  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0319051  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2590  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  29.25 
 
 		 341 aa  116  5e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.225432 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1184  Rieske (2Fe-2S) domain protein  27.19 
 
 		 358 aa  115  8.999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1550  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  36.55 
 
 		 353 aa  114  3e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.276626  normal  0.0604744 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5432  phenylpropionate dioxygenase  34.12 
 
 		 288 aa  113  6e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_43309  predicted protein  30.88 
 
 		 492 aa  113  7.000000000000001e-24  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.231154  hitchhiker  0.00124797 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6468  hypothetical protein  35.53 
 
 		 281 aa  112  7.000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3212  Rieske 2Fe-2S family protein  27.46 
 
 		 341 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2305  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  30.28 
 
 		 352 aa  112  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.560893  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0436  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  28.88 
 
 		 326 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2258  Rieske (2Fe-2S) region  30.28 
 
 		 352 aa  112  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.236496  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2297  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  30.28 
 
 		 352 aa  112  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.125012  normal  0.643759 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4769  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  36.55 
 
 		 367 aa  111  2.0000000000000002e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.289545  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6610  vanillate demethylase oxygenase subunit  28.61 
 
 		 380 aa  110  4.0000000000000004e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.581564  normal  0.184804 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4462  hypothetical protein  35.06 
 
 		 281 aa  109  6e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0193122 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1442  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  26.61 
 
 		 324 aa  108  1e-22  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000193123  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1488  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  26.61 
 
 		 321 aa  108  2e-22  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0113839  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4257  Rieske (2Fe-2S) domain protein  32.77 
 
 		 349 aa  106  5e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1103  Rieske (2Fe-2S) domain protein  31.49 
 
 		 362 aa  106  8e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5789  Rieske (2Fe-2S) region  28.57 
 
 		 349 aa  105  1e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2013  Rieske (2Fe-2S) family oxidoreductase large subunit  33.33 
 
 		 348 aa  105  2e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2958  pheophorbide a oxygenase  33.33 
 
 		 442 aa  103  4e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0467803  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1130  Rieske (2Fe-2S) domain protein  32.57 
 
 		 362 aa  103  6e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0812255  normal  0.937672 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1530  Rieske (2Fe-2S) domain protein  32.4 
 
 		 450 aa  102  1e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1557  Rieske (2Fe-2S) domain protein  32.4 
 
 		 450 aa  101  2e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0276963  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3154  Rieske (2Fe-2S) domain protein  49.52 
 
 		 221 aa  100  3e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.647374  normal  0.386497 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1355  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  27.81 
 
 		 358 aa  100  4e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1706  Rieske (2Fe-2S) domain protein  46.83 
 
 		 225 aa  100  5e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0736967  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1559  vanillate monooxygenase  36.31 
 
 		 347 aa  98.2  2e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.662697  normal  0.47859 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0993  Rieske (2Fe-2S) region  28.52 
 
 		 350 aa  98.2  2e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000318811 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1867  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  35.48 
 
 		 388 aa  98.2  2e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.687816 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1261  hypothetical protein  26.69 
 
 		 340 aa  97.4  3e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0803695 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2825  iron-sulfur cluster-binding protein, Rieske family  34.88 
 
 		 358 aa  97.1  4e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.000971916  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1827  Rieske (2Fe-2S) region  33.33 
 
 		 347 aa  97.4  4e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3621  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  28.62 
 
 		 377 aa  97.4  4e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0573672 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0769  Rieske (2Fe-2S) domain protein  36.07 
 
 		 497 aa  97.1  5e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0795  Rieske (2Fe-2S) domain protein  35.57 
 
 		 497 aa  96.3  7e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.266613  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1549  vanillate monooxygenase  29.62 
 
 		 359 aa  95.9  1e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.619122  normal  0.0130812 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3529  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  36.41 
 
 		 433 aa  95.9  1e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.551503  normal  0.104416 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1009  vanillate demethylase  35.2 
 
 		 353 aa  94.7  2e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0048453  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0132  Rieske (2Fe-2S) protein  33.85 
 
 		 343 aa  95.1  2e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64800  vanillate O-demethylase oxygenase subunit  27.83 
 
 		 351 aa  94  4e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0565633  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0535  Rieske (2Fe-2S) region  36.36 
 
 		 460 aa  93.6  5e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2310  vanillate monooxygenase  36 
 
 		 362 aa  93.6  5e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0218143 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0741  Rieske (2Fe-2S) protein  26.78 
 
 		 382 aa  93.2  6e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0606248 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3542  vanillate O-demethylase oxygenase subunit  27.58 
 
 		 345 aa  93.2  6e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.10385 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1687  vanillate monooxygenase  28.35 
 
 		 338 aa  93.6  6e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0627  Rieske (2Fe-2S) domain protein  28.42 
 
 		 361 aa  92.8  9e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2931  Pheophorbide a oxygenase  38.62 
 
 		 477 aa  92  1e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4340  Rieske (2Fe-2S) region  26.99 
 
 		 350 aa  91.7  2e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1056  Rieske (2Fe-2S) region  34.48 
 
 		 499 aa  92  2e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00144994  hitchhiker  0.000116875 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6709  Rieske (2Fe-2S) protein  33.01 
 
 		 373 aa  91.7  2e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3246  vanillate monooxygenase  36.21 
 
 		 347 aa  91.7  2e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.546586  normal  0.604076 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0648  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  28.08 
 
 		 361 aa  91.7  2e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.149026 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0659  Rieske (2Fe-2S) domain protein  28.08 
 
 		 361 aa  90.9  3e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.210033 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4461  Rieske (2Fe-2S) domain protein  44.76 
 
 		 216 aa  90.5  4e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.408386  normal  0.0170957 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5422  oxidoreductase protein  38.89 
 
 		 230 aa  90.1  5e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.20856  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4895  Vanillate monooxygenase  27.35 
 
 		 336 aa  90.1  6e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.802026  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2888  PrnD  32.52 
 
 		 370 aa  90.1  6e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.942193  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6662  dioxygenase, iron-sulfur subunit  35.52 
 
 		 371 aa  89.7  7e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0364205  normal  0.0470201 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4882  phthalate 4,5-dioxygenase  31.78 
 
 		 422 aa  89.4  8e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6469  Rieske (2Fe-2S) domain protein  41.67 
 
 		 217 aa  89.7  8e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4568  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  27.45 
 
 		 356 aa  89.4  9e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.380862  hitchhiker  0.000303241 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7059  Rieske (2Fe-2S) domain protein  27.25 
 
 		 364 aa  89  1e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.2387  normal  0.465604 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1105  Rieske (2Fe-2S) protein  27.04 
 
 		 358 aa  89  1e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.080608  normal  0.368914 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6986  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  31.55 
 
 		 374 aa  89  1e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.529476  normal  0.476808 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6021  Rieske (2Fe-2S) domain protein  27.22 
 
 		 344 aa  89  1e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.174244  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2074  Rieske (2Fe-2S) domain protein  40.18 
 
 		 217 aa  89  1e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.12491  normal  0.0463704 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4103  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  27.45 
 
 		 356 aa  89.4  1e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.119091 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3570  Rieske (2Fe-2S) region  41.46 
 
 		 355 aa  87.8  2e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0161982  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1118  PrnD  31.68 
 
 		 346 aa  88.2  2e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3984  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  31.63 
 
 		 356 aa  88.2  2e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.643695  normal  0.0193847 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4278  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  27.51 
 
 		 362 aa  88.2  2e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.844018 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3626  Rieske (2Fe-2S) domain protein  30.48 
 
 		 362 aa  88.2  2e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.54925  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4709  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  30.93 
 
 		 356 aa  88.2  2e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.700082  normal  0.155037 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>