More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_2931 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_2931  Pheophorbide a oxygenase  100 
 
 
477 aa  984    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2189  Pheophorbide a oxygenase  63.47 
 
 
474 aa  619  1e-176  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00477289 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4346  pheophorbide a oxygenase  60.65 
 
 
465 aa  614  9.999999999999999e-175  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.18517  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0535  Rieske (2Fe-2S) region  60.63 
 
 
460 aa  586  1e-166  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2164  cell death suppressor protein Lls1-like  57.01 
 
 
461 aa  525  1e-148  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.909867  normal  0.138548 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1781  cell death suppressor protein Lls1-like  56.45 
 
 
456 aa  469  1.0000000000000001e-131  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.527136  normal  0.0843855 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0864  cell death suppressor protein Lls1-like  56.52 
 
 
438 aa  452  1.0000000000000001e-126  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.658605  n/a   
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_43309  predicted protein  48.31 
 
 
492 aa  379  1e-104  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.231154  hitchhiker  0.00124797 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3116  Pheophorbide a oxygenase  37.67 
 
 
442 aa  260  3e-68  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1303  Rieske (2Fe-2S) region  36.94 
 
 
443 aa  251  1e-65  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.418357  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2958  pheophorbide a oxygenase  36.63 
 
 
442 aa  247  4e-64  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0467803  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3793  pheophorbide a oxygenase  35.37 
 
 
443 aa  243  3.9999999999999997e-63  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.726  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1557  Rieske (2Fe-2S) domain protein  34.62 
 
 
450 aa  234  3e-60  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0276963  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1530  Rieske (2Fe-2S) domain protein  34.62 
 
 
450 aa  231  2e-59  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0769  Rieske (2Fe-2S) domain protein  33.76 
 
 
497 aa  224  2e-57  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0795  Rieske (2Fe-2S) domain protein  34.04 
 
 
497 aa  223  8e-57  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.266613  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1056  Rieske (2Fe-2S) region  33.63 
 
 
499 aa  218  1e-55  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00144994  hitchhiker  0.000116875 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_26228  predicted protein  31.33 
 
 
668 aa  196  7e-49  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.281249  normal  0.273766 
 
 
-
 
NC_011700  PHATRDRAFT_50613  Tic55 component of chloroplast import machinery  33.57 
 
 
498 aa  187  4e-46  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0964  Rieske (2Fe-2S) domain protein  29.7 
 
 
468 aa  170  5e-41  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.1498 
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_40637  predicted protein  30.27 
 
 
510 aa  169  1e-40  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2918  Rieske (2Fe-2S) domain protein  30.8 
 
 
337 aa  102  1e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.333438  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5789  Rieske (2Fe-2S) region  28.52 
 
 
349 aa  99.4  1e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0807  vanillate O-demethylase oxygenase subunit  38.67 
 
 
331 aa  98.6  2e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6610  vanillate demethylase oxygenase subunit  34.88 
 
 
380 aa  99  2e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.581564  normal  0.184804 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2919  Rieske (2Fe-2S) domain protein  33.85 
 
 
338 aa  97.4  5e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.563703  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1184  Rieske (2Fe-2S) domain protein  33.87 
 
 
358 aa  94  6e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2037  Rieske (2Fe-2S) domain protein  33.66 
 
 
357 aa  94  6e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.950553  normal  0.781731 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1718  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  33.17 
 
 
357 aa  93.6  8e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.187317  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1185  Rieske (2Fe-2S) domain protein  31.73 
 
 
364 aa  92.8  1e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2036  hypothetical protein  33.51 
 
 
334 aa  92  2e-17  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.502892  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1136  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  38.62 
 
 
373 aa  92  2e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.959251  normal  0.28876 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2825  iron-sulfur cluster-binding protein, Rieske family  27.35 
 
 
358 aa  90.9  4e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.000971916  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2492  vanillate O-demethylase oxygenase subunit  31.02 
 
 
315 aa  91.3  4e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1096  Rieske (2Fe-2S) domain protein  33.17 
 
 
357 aa  91.3  4e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0810231  normal  0.184537 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3671  oxidoreductase alpha subunit  35.23 
 
 
407 aa  90.9  5e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0725789  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2013  Rieske (2Fe-2S) family oxidoreductase large subunit  34.24 
 
 
348 aa  90.5  7e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3952  Rieske (2Fe-2S) protein  33.85 
 
 
340 aa  89.4  1e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.13771  normal  0.112958 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0127  Rieske (2Fe-2S) protein  31.66 
 
 
355 aa  88.6  2e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4516  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  28 
 
 
373 aa  89  2e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2035  hypothetical protein  29.74 
 
 
345 aa  88.2  3e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5546  putative vanillate O-demethylase oxygenase subunit (4-hydroxy- 3-methoxybenzoate demethylase)  33.14 
 
 
347 aa  88.2  3e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26080  vanillate demethylase subunit A  31.28 
 
 
377 aa  88.2  3e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.819244  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1368  vanillate monooxygenase  32.02 
 
 
352 aa  88.2  3e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6483  Rieske (2Fe-2S) region  36.88 
 
 
358 aa  87.8  4e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2143  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  37.19 
 
 
372 aa  87.8  4e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.444634  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1872  Rieske (2Fe-2S) protein  30.23 
 
 
356 aa  87  6e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.171768  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3387  Rieske (2Fe-2S) region  32.02 
 
 
369 aa  87  6e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.662042  normal  0.0218971 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4769  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  33.33 
 
 
367 aa  86.3  0.000000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.289545  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2184  vanillate O-demethylase oxygenase, iron-sulfur subunit  25.99 
 
 
347 aa  86.3  0.000000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5685  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  38.01 
 
 
353 aa  85.1  0.000000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0319041  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3542  vanillate O-demethylase oxygenase subunit  31.98 
 
 
345 aa  84.3  0.000000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.10385 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4257  Rieske (2Fe-2S) domain protein  32.92 
 
 
349 aa  84.3  0.000000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0630  Rieske (2Fe-2S) domain protein  31.12 
 
 
353 aa  84  0.000000000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.494266  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1016  dioxygenase, iron-sulfur subunit, putative  34.13 
 
 
369 aa  83.2  0.000000000000009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.621392  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0336  Rieske (2Fe-2S) protein  27.53 
 
 
370 aa  83.2  0.000000000000009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1137  vanillate monooxygenase  31.52 
 
 
350 aa  82.4  0.00000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.684708  hitchhiker  0.000140047 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2590  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  32.11 
 
 
341 aa  82  0.00000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.225432 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0741  Rieske (2Fe-2S) protein  28.72 
 
 
382 aa  82  0.00000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0606248 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1488  Rieske (2Fe-2S) protein  32.56 
 
 
351 aa  82  0.00000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2050  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  32.8 
 
 
327 aa  82.4  0.00000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0319051  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3416  vanillate monooxygenase  31.21 
 
 
342 aa  81.6  0.00000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0799476 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7105  Rieske (2Fe-2S) domain protein  33.9 
 
 
361 aa  81.3  0.00000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.811582  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4269  vanillate monooxygenase  32.89 
 
 
351 aa  80.5  0.00000000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.846398 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3024  vanillate monooxygenase  34.03 
 
 
361 aa  80.1  0.00000000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4330  vanillate monooxygenase  26.7 
 
 
366 aa  80.5  0.00000000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0440139 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1687  vanillate monooxygenase  31.07 
 
 
338 aa  79.3  0.0000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3968  Rieske (2Fe-2S) domain protein  29.69 
 
 
360 aa  79.3  0.0000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0886212  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2285  vanillate monooxygenase  30.69 
 
 
367 aa  79  0.0000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.138524 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2979  Rieske (2Fe-2S) domain protein  28.57 
 
 
367 aa  79  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1867  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  34.43 
 
 
388 aa  79  0.0000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.687816 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3413  vanillate monooxygenase  31.79 
 
 
345 aa  79  0.0000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.166087 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1370  vanillate monooxygenase  33.55 
 
 
363 aa  78.2  0.0000000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1908  Rieske (2Fe-2S) protein  32.34 
 
 
347 aa  78.2  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.127579  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1009  vanillate demethylase  28.57 
 
 
353 aa  78.2  0.0000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0048453  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1067  vanillate monooxygenase  33.14 
 
 
359 aa  77.8  0.0000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.535746  normal  0.0980736 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3246  vanillate monooxygenase  28.14 
 
 
347 aa  77.8  0.0000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.546586  normal  0.604076 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4139  Vanillate monooxygenase  31.74 
 
 
347 aa  77.8  0.0000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.105569  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1001  putative vanillate O-demethylase oxygenase subunit A  31.4 
 
 
349 aa  77.4  0.0000000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.8149  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3212  Rieske 2Fe-2S family protein  30 
 
 
341 aa  77  0.0000000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5628  vanillate O-demethylase oxygenase subunit  34.69 
 
 
351 aa  77  0.0000000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.834519  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0222  vanillate O-demethylase oxygenase subunit oxidoreductase protein  29.48 
 
 
342 aa  77  0.0000000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.0000016692  normal  0.0221534 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0787  Rieske (2Fe-2S) protein  31.43 
 
 
351 aa  77  0.0000000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.466147 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2137  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  30.9 
 
 
450 aa  76.6  0.0000000000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10960  ferridoxin oxidoreductase subunit  29.32 
 
 
370 aa  76.6  0.0000000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2305  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  32.34 
 
 
352 aa  75.5  0.000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.560893  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3396  vanillate monooxygenase  29.65 
 
 
348 aa  75.1  0.000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00111775  normal  0.0140003 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0919  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  29.95 
 
 
413 aa  75.5  0.000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.40957  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0396  Rieske (2Fe-2S) domain protein  28.49 
 
 
360 aa  75.5  0.000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.547393 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5548  putative Phthalate 4,5-dioxygenase subunit alpha  34.81 
 
 
439 aa  75.5  0.000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2258  Rieske (2Fe-2S) region  32.34 
 
 
352 aa  75.5  0.000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.236496  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2359  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  31.53 
 
 
410 aa  75.5  0.000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.128163  normal  0.731078 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1686  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  31.4 
 
 
357 aa  75.1  0.000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2297  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  32.34 
 
 
352 aa  75.5  0.000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.125012  normal  0.643759 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1004  putative vanillate O-demethylase oxygenase subunit A  30.81 
 
 
353 aa  75.1  0.000000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.413289  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5693  Rieske (2Fe-2S) domain protein  32.37 
 
 
352 aa  75.1  0.000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4895  Vanillate monooxygenase  30.23 
 
 
336 aa  74.7  0.000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.802026  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1541  vanillate monooxygenase  31.89 
 
 
423 aa  73.9  0.000000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00031597  hitchhiker  0.00167065 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2310  vanillate monooxygenase  32.94 
 
 
362 aa  73.9  0.000000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0218143 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1044  phthalate 4,5-dioxygenase  27.68 
 
 
454 aa  73.9  0.000000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.714091 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>