More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_50613 on replicon NC_011700
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011700  PHATRDRAFT_50613  Tic55 component of chloroplast import machinery  100 
 
 
498 aa  1042    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0769  Rieske (2Fe-2S) domain protein  33.7 
 
 
497 aa  236  1.0000000000000001e-60  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0795  Rieske (2Fe-2S) domain protein  32.68 
 
 
497 aa  233  5e-60  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.266613  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1056  Rieske (2Fe-2S) region  32.77 
 
 
499 aa  223  9e-57  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00144994  hitchhiker  0.000116875 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1303  Rieske (2Fe-2S) region  34.61 
 
 
443 aa  213  4.9999999999999996e-54  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.418357  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2958  pheophorbide a oxygenase  32.79 
 
 
442 aa  213  5.999999999999999e-54  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0467803  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3116  Pheophorbide a oxygenase  34.45 
 
 
442 aa  210  4e-53  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3793  pheophorbide a oxygenase  32.04 
 
 
443 aa  206  9e-52  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.726  normal 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_43309  predicted protein  33.25 
 
 
492 aa  201  1.9999999999999998e-50  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.231154  hitchhiker  0.00124797 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2164  cell death suppressor protein Lls1-like  32.06 
 
 
461 aa  192  1e-47  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.909867  normal  0.138548 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_26228  predicted protein  30.18 
 
 
668 aa  191  2e-47  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.281249  normal  0.273766 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2189  Pheophorbide a oxygenase  33.63 
 
 
474 aa  190  5e-47  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00477289 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1781  cell death suppressor protein Lls1-like  32.31 
 
 
456 aa  187  3e-46  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.527136  normal  0.0843855 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2931  Pheophorbide a oxygenase  34.15 
 
 
477 aa  186  1.0000000000000001e-45  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4346  pheophorbide a oxygenase  28.67 
 
 
465 aa  167  5e-40  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.18517  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0964  Rieske (2Fe-2S) domain protein  27.47 
 
 
468 aa  166  1.0000000000000001e-39  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.1498 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0535  Rieske (2Fe-2S) region  27.75 
 
 
460 aa  162  1e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0864  cell death suppressor protein Lls1-like  31.34 
 
 
438 aa  160  3e-38  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.658605  n/a   
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_40637  predicted protein  27.25 
 
 
510 aa  137  4e-31  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1530  Rieske (2Fe-2S) domain protein  25.72 
 
 
450 aa  134  3.9999999999999996e-30  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1557  Rieske (2Fe-2S) domain protein  25.55 
 
 
450 aa  132  2.0000000000000002e-29  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0276963  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3062  phthalate 4,5-dioxygenase  32.95 
 
 
431 aa  94.7  3e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.021682 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1687  Rieske (2Fe-2S) domain protein  29.27 
 
 
449 aa  90.5  7e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5789  Rieske (2Fe-2S) region  29.25 
 
 
349 aa  89  2e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8462  Rieske (2Fe-2S) domain protein  31.5 
 
 
448 aa  89  2e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2359  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  32.24 
 
 
410 aa  88.6  3e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.128163  normal  0.731078 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0127  Rieske (2Fe-2S) protein  32.75 
 
 
355 aa  87.4  5e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2268  Rieske (2Fe-2S) protein  29.82 
 
 
452 aa  87.4  5e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0946291  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5546  putative vanillate O-demethylase oxygenase subunit (4-hydroxy- 3-methoxybenzoate demethylase)  29.5 
 
 
347 aa  87.8  5e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6982  phthalate 4,5-dioxygenase  32.56 
 
 
438 aa  87  7e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2036  hypothetical protein  27.67 
 
 
334 aa  86.7  9e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.502892  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0877  putative dioxygenase  32.57 
 
 
452 aa  86.3  0.000000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.297728  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5685  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  29.02 
 
 
353 aa  85.9  0.000000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0319041  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1175  Phthalate 4,5-dioxygenase  30.81 
 
 
452 aa  85.1  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.769494  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2133  twin-arginine translocation pathway signal  32.99 
 
 
484 aa  84  0.000000000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.395399  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2492  vanillate O-demethylase oxygenase subunit  26.89 
 
 
315 aa  83.6  0.000000000000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3952  Rieske (2Fe-2S) protein  33.33 
 
 
340 aa  82.8  0.00000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.13771  normal  0.112958 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4278  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  32.61 
 
 
362 aa  82.4  0.00000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.844018 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3532  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  30.51 
 
 
446 aa  82  0.00000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.048657  normal  0.0515471 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1064  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  31.72 
 
 
387 aa  81.3  0.00000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.43547 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4257  Rieske (2Fe-2S) domain protein  32.05 
 
 
349 aa  81.3  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3396  vanillate monooxygenase  32.08 
 
 
348 aa  80.9  0.00000000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00111775  normal  0.0140003 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3201  phthalate 4,5-dioxygenase  30.46 
 
 
436 aa  80.5  0.00000000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5548  putative Phthalate 4,5-dioxygenase subunit alpha  30.3 
 
 
439 aa  80.1  0.00000000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1686  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  29.8 
 
 
357 aa  79.3  0.0000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2355  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  29.12 
 
 
349 aa  79.3  0.0000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.725754  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0481  Rieske (2Fe-2S) iron-sulfur domain-containing protein  23.95 
 
 
353 aa  78.6  0.0000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0971818  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3537  aromatic acid dioxygenase alpha subunit  30.37 
 
 
440 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.329598 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0807  vanillate O-demethylase oxygenase subunit  32.31 
 
 
331 aa  78.6  0.0000000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0436  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  30.56 
 
 
326 aa  78.2  0.0000000000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5154  Rieske (2Fe-2S) region  30.68 
 
 
440 aa  78.2  0.0000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.291358  normal  0.277417 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3529  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  28.81 
 
 
433 aa  77.8  0.0000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.551503  normal  0.104416 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1009  vanillate demethylase  29.81 
 
 
353 aa  77.4  0.0000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0048453  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1488  Rieske (2Fe-2S) protein  32.24 
 
 
351 aa  77.4  0.0000000000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3387  Rieske (2Fe-2S) region  26.56 
 
 
369 aa  77.4  0.0000000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.662042  normal  0.0218971 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0627  Rieske (2Fe-2S) domain protein  24.91 
 
 
361 aa  77  0.0000000000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1442  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  29.44 
 
 
324 aa  77  0.0000000000008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000193123  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1488  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  29.44 
 
 
321 aa  77  0.0000000000008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0113839  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4139  Vanillate monooxygenase  27.94 
 
 
347 aa  76.6  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.105569  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0648  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  26.29 
 
 
361 aa  76.3  0.000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.149026 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0659  Rieske (2Fe-2S) domain protein  26.29 
 
 
361 aa  76.3  0.000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.210033 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1067  vanillate monooxygenase  29.84 
 
 
359 aa  75.9  0.000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.535746  normal  0.0980736 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1044  phthalate 4,5-dioxygenase  30.06 
 
 
454 aa  75.9  0.000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.714091 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3024  vanillate monooxygenase  28.72 
 
 
361 aa  75.1  0.000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2137  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  29.31 
 
 
450 aa  75.1  0.000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7085  Rieske (2Fe-2S) domain protein  27.85 
 
 
406 aa  75.1  0.000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26080  vanillate demethylase subunit A  30.43 
 
 
377 aa  74.7  0.000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.819244  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0418  Rieske (2Fe-2S) protein  28.92 
 
 
353 aa  75.1  0.000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.842278  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3542  vanillate O-demethylase oxygenase subunit  30.86 
 
 
345 aa  74.7  0.000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.10385 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1812  Rieske (2Fe-2S) region  27.87 
 
 
383 aa  74.3  0.000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0372125 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1535  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  27.22 
 
 
331 aa  74.3  0.000000000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1136  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  31.55 
 
 
373 aa  74.7  0.000000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.959251  normal  0.28876 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4273  vanillate monooxygenase  30.86 
 
 
350 aa  73.9  0.000000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.35045 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1103  Rieske (2Fe-2S) domain protein  34.48 
 
 
362 aa  74.3  0.000000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0203  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  29.7 
 
 
406 aa  73.9  0.000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4103  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  27.37 
 
 
374 aa  74.3  0.000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2869  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  28.02 
 
 
385 aa  74.3  0.000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.455502  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3574  Rieske (2Fe-2S) region  29.09 
 
 
349 aa  73.9  0.000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3119  vanillate monooxygenase  29 
 
 
358 aa  73.9  0.000000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1355  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  32.2 
 
 
358 aa  73.9  0.000000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7254  Rieske (2Fe-2S) domain protein  29.21 
 
 
430 aa  73.6  0.000000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3266  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  27.03 
 
 
353 aa  73.6  0.000000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0113117 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3212  Rieske 2Fe-2S family protein  31.67 
 
 
341 aa  72.8  0.00000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2035  hypothetical protein  30.48 
 
 
345 aa  73.2  0.00000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1908  Rieske (2Fe-2S) protein  27.05 
 
 
347 aa  72.8  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.127579  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0993  Rieske (2Fe-2S) region  27.88 
 
 
350 aa  72.8  0.00000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  unclonable  0.00000318811 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1016  dioxygenase, iron-sulfur subunit, putative  33.88 
 
 
369 aa  72  0.00000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.621392  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6324  phthalate 4,5-dioxygenase  27.87 
 
 
437 aa  72  0.00000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1445  Rieske (2Fe-2S) protein  29.83 
 
 
437 aa  72.4  0.00000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.491711  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5126  vanillate monooxygenase  29.33 
 
 
352 aa  72  0.00000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4992  Rieske (2Fe-2S) region  30.27 
 
 
366 aa  72  0.00000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2725  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  27.41 
 
 
354 aa  72.8  0.00000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0149406 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4593  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  30.73 
 
 
353 aa  72  0.00000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.743349  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1130  Rieske (2Fe-2S) domain protein  34.48 
 
 
362 aa  72  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0812255  normal  0.937672 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2919  Rieske (2Fe-2S) domain protein  27.75 
 
 
338 aa  71.6  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.563703  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2143  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  30.43 
 
 
372 aa  71.6  0.00000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.444634  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4269  vanillate monooxygenase  31.33 
 
 
351 aa  71.6  0.00000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.846398 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1184  Rieske (2Fe-2S) domain protein  29.65 
 
 
358 aa  71.6  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2050  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  26.67 
 
 
327 aa  71.2  0.00000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0319051  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4769  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  26.27 
 
 
367 aa  71.2  0.00000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.289545  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>