42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_4462 on replicon NC_011368
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011368  Rleg2_4462  hypothetical protein  100 
 
 		 281 aa  582  1.0000000000000001e-165  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0193122 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6468  hypothetical protein  96.09 
 
 		 281 aa  563  1e-160  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5416  vanillate O-demethylase oxygenase subunit  56.68 
 
 		 283 aa  319  3e-86  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.221202  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2081  hypothetical protein  59.12 
 
 		 278 aa  310  1e-83  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00119001 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1248  hypothetical protein  58.39 
 
 		 284 aa  308  5.9999999999999995e-83  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0789553 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3148  hypothetical protein  53.48 
 
 		 288 aa  270  2e-71  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.282075 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5432  phenylpropionate dioxygenase  50 
 
 		 288 aa  266  2e-70  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1234  hypothetical protein  50.18 
 
 		 286 aa  264  1e-69  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0239219  normal  0.493228 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2067  hypothetical protein  49.28 
 
 		 286 aa  262  4e-69  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0156668 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5871  hypothetical protein  44.95 
 
 		 301 aa  256  4e-67  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.789532  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1705  hypothetical protein  40 
 
 		 287 aa  210  2e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0851207  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2143  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  38.31 
 
 		 372 aa  120  1.9999999999999998e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.444634  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0807  vanillate O-demethylase oxygenase subunit  36.55 
 
 		 331 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1136  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  35.06 
 
 		 373 aa  109  4.0000000000000004e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.959251  normal  0.28876 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1389  putative oxygenase  29.65 
 
 		 359 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0787  Rieske (2Fe-2S) protein  28.17 
 
 		 351 aa  75.9  0.0000000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.466147 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2297  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  26.61 
 
 		 352 aa  74.7  0.000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.125012  normal  0.643759 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2305  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  26.61 
 
 		 352 aa  74.7  0.000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.560893  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2258  Rieske (2Fe-2S) region  26.61 
 
 		 352 aa  74.7  0.000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.236496  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3567  Rieske (2Fe-2S) domain protein  28.25 
 
 		 344 aa  68.9  0.00000000009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3968  Rieske (2Fe-2S) domain protein  29.22 
 
 		 360 aa  68.2  0.0000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0886212  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4244  Rieske (2Fe-2S) domain protein  27.27 
 
 		 352 aa  66.2  0.0000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2035  hypothetical protein  31.3 
 
 		 345 aa  65.9  0.0000000007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2034  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  26.64 
 
 		 400 aa  65.9  0.0000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.967449  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6610  vanillate demethylase oxygenase subunit  28.96 
 
 		 380 aa  62.8  0.000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.581564  normal  0.184804 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5685  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  28.38 
 
 		 353 aa  59.7  0.00000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0319041  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2918  Rieske (2Fe-2S) domain protein  25.74 
 
 		 337 aa  57.8  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.333438  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3212  Rieske 2Fe-2S family protein  26.87 
 
 		 341 aa  57.4  0.0000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2919  Rieske (2Fe-2S) domain protein  43.48 
 
 		 338 aa  57.8  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.563703  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2013  Rieske (2Fe-2S) family oxidoreductase large subunit  23.67 
 
 		 348 aa  56.2  0.0000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1261  hypothetical protein  28.27 
 
 		 340 aa  55.5  0.0000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0803695 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1718  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  38.74 
 
 		 357 aa  54.3  0.000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.187317  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2036  hypothetical protein  32.26 
 
 		 334 aa  53.9  0.000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.502892  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2037  Rieske (2Fe-2S) domain protein  38.74 
 
 		 357 aa  53.5  0.000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.950553  normal  0.781731 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1096  Rieske (2Fe-2S) domain protein  37.84 
 
 		 357 aa  52.4  0.000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0810231  normal  0.184537 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1185  Rieske (2Fe-2S) domain protein  28.68 
 
 		 364 aa  51.6  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2590  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  26.84 
 
 		 341 aa  52  0.00001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.225432 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3952  Rieske (2Fe-2S) protein  37.68 
 
 		 340 aa  47.4  0.0002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.13771  normal  0.112958 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4245  Rieske (2Fe-2S) domain protein  26.36 
 
 		 371 aa  47.8  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1687  vanillate monooxygenase  29.41 
 
 		 338 aa  43.9  0.003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5546  putative vanillate O-demethylase oxygenase subunit (4-hydroxy- 3-methoxybenzoate demethylase)  30.53 
 
 		 347 aa  43.9  0.003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2285  vanillate monooxygenase  29.46 
 
 		 367 aa  42.4  0.009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.138524 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>