52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_2081 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011757  Mchl_2081  hypothetical protein  100 
 
 		 278 aa  570  1.0000000000000001e-162  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00119001 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1248  hypothetical protein  95.68 
 
 		 284 aa  550  1e-155  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0789553 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5416  vanillate O-demethylase oxygenase subunit  65.47 
 
 		 283 aa  379  1e-104  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.221202  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3148  hypothetical protein  66.79 
 
 		 288 aa  352  2.9999999999999997e-96  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.282075 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5432  phenylpropionate dioxygenase  59.27 
 
 		 288 aa  331  8e-90  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2067  hypothetical protein  61.17 
 
 		 286 aa  328  6e-89  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0156668 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1234  hypothetical protein  61.9 
 
 		 286 aa  320  1.9999999999999998e-86  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0239219  normal  0.493228 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4462  hypothetical protein  59.12 
 
 		 281 aa  310  1e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0193122 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6468  hypothetical protein  58.39 
 
 		 281 aa  306  2.0000000000000002e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5871  hypothetical protein  51.75 
 
 		 301 aa  241  7e-63  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.789532  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1705  hypothetical protein  45.2 
 
 		 287 aa  226  3e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0851207  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2143  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  37.23 
 
 		 372 aa  134  9.999999999999999e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.444634  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0807  vanillate O-demethylase oxygenase subunit  38.02 
 
 		 331 aa  129  5.0000000000000004e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1136  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  35.71 
 
 		 373 aa  124  2e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.959251  normal  0.28876 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1389  putative oxygenase  31.86 
 
 		 359 aa  87  3e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3567  Rieske (2Fe-2S) domain protein  30.84 
 
 		 344 aa  84.3  0.000000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0787  Rieske (2Fe-2S) protein  30.36 
 
 		 351 aa  80.1  0.00000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.466147 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2305  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  27.94 
 
 		 352 aa  75.1  0.000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.560893  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2258  Rieske (2Fe-2S) region  27.94 
 
 		 352 aa  75.1  0.000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.236496  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2297  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  27.94 
 
 		 352 aa  75.1  0.000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.125012  normal  0.643759 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2034  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  26.46 
 
 		 400 aa  73.9  0.000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.967449  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6610  vanillate demethylase oxygenase subunit  31.25 
 
 		 380 aa  66.6  0.0000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.581564  normal  0.184804 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2035  hypothetical protein  27.88 
 
 		 345 aa  62.8  0.000000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5685  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  27.93 
 
 		 353 aa  58.9  0.00000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0319041  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4245  Rieske (2Fe-2S) domain protein  26.87 
 
 		 371 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2919  Rieske (2Fe-2S) domain protein  40.58 
 
 		 338 aa  54.7  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.563703  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2036  hypothetical protein  26.1 
 
 		 334 aa  53.9  0.000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.502892  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4244  Rieske (2Fe-2S) domain protein  25.11 
 
 		 352 aa  53.5  0.000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2918  Rieske (2Fe-2S) domain protein  24.34 
 
 		 337 aa  53.1  0.000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.333438  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0222  vanillate O-demethylase oxygenase subunit oxidoreductase protein  23.83 
 
 		 342 aa  53.1  0.000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.0000016692  normal  0.0221534 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0217  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  24.37 
 
 		 437 aa  52.8  0.000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4340  Rieske (2Fe-2S) region  26.88 
 
 		 350 aa  52  0.00001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1185  Rieske (2Fe-2S) domain protein  24.56 
 
 		 364 aa  51.2  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3968  Rieske (2Fe-2S) domain protein  24.89 
 
 		 360 aa  50.4  0.00003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0886212  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3212  Rieske 2Fe-2S family protein  24.43 
 
 		 341 aa  48.9  0.00009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1261  hypothetical protein  38.71 
 
 		 340 aa  48.1  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0803695 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1718  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  26.42 
 
 		 357 aa  47.8  0.0002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.187317  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1488  Rieske (2Fe-2S) protein  25.27 
 
 		 351 aa  47.8  0.0002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2037  Rieske (2Fe-2S) domain protein  26.42 
 
 		 357 aa  47  0.0004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.950553  normal  0.781731 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1096  Rieske (2Fe-2S) domain protein  26.42 
 
 		 357 aa  46.6  0.0005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0810231  normal  0.184537 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2013  Rieske (2Fe-2S) family oxidoreductase large subunit  38.1 
 
 		 348 aa  45.1  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0127  Rieske (2Fe-2S) protein  23.74 
 
 		 355 aa  45.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4769  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  40.45 
 
 		 367 aa  45.4  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.289545  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0389  putative oxygenase  24.9 
 
 		 345 aa  44.3  0.002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.767205  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5789  Rieske (2Fe-2S) region  28.44 
 
 		 349 aa  44.7  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1687  vanillate monooxygenase  30.85 
 
 		 338 aa  44.3  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0487  putative oxygenase  24.49 
 
 		 345 aa  43.5  0.004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.454114  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2121  hypothetical protein  24.49 
 
 		 345 aa  43.5  0.004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0804  oxygenase  24.49 
 
 		 342 aa  43.5  0.004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.739183  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2590  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  33.85 
 
 		 341 aa  43.5  0.004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.225432 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2725  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  23.27 
 
 		 354 aa  42.7  0.006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0149406 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1559  vanillate monooxygenase  29.7 
 
 		 347 aa  42.4  0.008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.662697  normal  0.47859 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>