58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_1248 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_1248  hypothetical protein  100 
 
 		 284 aa  582  1.0000000000000001e-165  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0789553 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2081  hypothetical protein  95.68 
 
 		 278 aa  550  1e-155  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00119001 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5416  vanillate O-demethylase oxygenase subunit  65.83 
 
 		 283 aa  384  1e-106  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.221202  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3148  hypothetical protein  68.25 
 
 		 288 aa  356  2.9999999999999997e-97  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.282075 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5432  phenylpropionate dioxygenase  59.93 
 
 		 288 aa  339  2.9999999999999998e-92  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2067  hypothetical protein  61.9 
 
 		 286 aa  330  2e-89  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0156668 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1234  hypothetical protein  62.27 
 
 		 286 aa  321  9.000000000000001e-87  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0239219  normal  0.493228 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4462  hypothetical protein  58.39 
 
 		 281 aa  308  5.9999999999999995e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0193122 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6468  hypothetical protein  57.66 
 
 		 281 aa  304  9.000000000000001e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5871  hypothetical protein  51.32 
 
 		 301 aa  242  6e-63  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.789532  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1705  hypothetical protein  46.21 
 
 		 287 aa  229  4e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0851207  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2143  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  37.23 
 
 		 372 aa  135  8e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.444634  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0807  vanillate O-demethylase oxygenase subunit  36.78 
 
 		 331 aa  129  4.0000000000000003e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1136  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  35.71 
 
 		 373 aa  125  6e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.959251  normal  0.28876 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3567  Rieske (2Fe-2S) domain protein  29.78 
 
 		 344 aa  86.3  6e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1389  putative oxygenase  31.86 
 
 		 359 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0787  Rieske (2Fe-2S) protein  29.63 
 
 		 351 aa  82  0.000000000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.466147 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2258  Rieske (2Fe-2S) region  27.48 
 
 		 352 aa  74.7  0.000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.236496  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2305  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  27.48 
 
 		 352 aa  74.7  0.000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.560893  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2297  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  27.48 
 
 		 352 aa  74.7  0.000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.125012  normal  0.643759 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2034  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  25.69 
 
 		 400 aa  73.6  0.000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.967449  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6610  vanillate demethylase oxygenase subunit  30.42 
 
 		 380 aa  68.2  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.581564  normal  0.184804 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2035  hypothetical protein  28.63 
 
 		 345 aa  67.4  0.0000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5685  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  28.83 
 
 		 353 aa  60.1  0.00000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0319041  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4245  Rieske (2Fe-2S) domain protein  27.31 
 
 		 371 aa  58.9  0.00000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4244  Rieske (2Fe-2S) domain protein  21.82 
 
 		 352 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2919  Rieske (2Fe-2S) domain protein  40.58 
 
 		 338 aa  54.3  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.563703  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2036  hypothetical protein  26.14 
 
 		 334 aa  54.7  0.000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.502892  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3968  Rieske (2Fe-2S) domain protein  24.79 
 
 		 360 aa  53.1  0.000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0886212  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4340  Rieske (2Fe-2S) region  26.95 
 
 		 350 aa  52.8  0.000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1185  Rieske (2Fe-2S) domain protein  24.79 
 
 		 364 aa  52.4  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0217  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  24.56 
 
 		 437 aa  52  0.00001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2918  Rieske (2Fe-2S) domain protein  25.93 
 
 		 337 aa  50.8  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.333438  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1718  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  25.93 
 
 		 357 aa  50.8  0.00002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.187317  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2037  Rieske (2Fe-2S) domain protein  25.93 
 
 		 357 aa  50.1  0.00004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.950553  normal  0.781731 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0222  vanillate O-demethylase oxygenase subunit oxidoreductase protein  23.83 
 
 		 342 aa  49.7  0.00006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.0000016692  normal  0.0221534 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1096  Rieske (2Fe-2S) domain protein  27.46 
 
 		 357 aa  49.3  0.00007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0810231  normal  0.184537 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3212  Rieske 2Fe-2S family protein  24.66 
 
 		 341 aa  48.1  0.0002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1261  hypothetical protein  38.71 
 
 		 340 aa  48.1  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0803695 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1488  Rieske (2Fe-2S) protein  25.27 
 
 		 351 aa  47.4  0.0003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0127  Rieske (2Fe-2S) protein  23.53 
 
 		 355 aa  47  0.0004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4769  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  42.5 
 
 		 367 aa  46.2  0.0006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.289545  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0389  putative oxygenase  25.71 
 
 		 345 aa  45.8  0.0009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.767205  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2013  Rieske (2Fe-2S) family oxidoreductase large subunit  38.1 
 
 		 348 aa  45.1  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1370  vanillate monooxygenase  22.75 
 
 		 363 aa  45.4  0.001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2121  hypothetical protein  25.31 
 
 		 345 aa  44.7  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1817  hypothetical protein  25.32 
 
 		 679 aa  44.3  0.002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0487  putative oxygenase  25.31 
 
 		 345 aa  44.7  0.002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.454114  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0804  oxygenase  25.31 
 
 		 342 aa  45.1  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.739183  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1559  vanillate monooxygenase  32.1 
 
 		 347 aa  44.3  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.662697  normal  0.47859 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2725  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  23.67 
 
 		 354 aa  43.9  0.003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0149406 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2590  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  34.92 
 
 		 341 aa  43.1  0.005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.225432 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5546  putative vanillate O-demethylase oxygenase subunit (4-hydroxy- 3-methoxybenzoate demethylase)  30.7 
 
 		 347 aa  43.1  0.005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2051  hypothetical protein  29.6 
 
 		 347 aa  43.1  0.006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2106  hypothetical protein  29.6 
 
 		 349 aa  43.1  0.006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.588734  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5789  Rieske (2Fe-2S) region  28.44 
 
 		 349 aa  43.1  0.006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3416  vanillate monooxygenase  30.68 
 
 		 342 aa  42.7  0.007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0799476 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2285  vanillate monooxygenase  29.46 
 
 		 367 aa  42.4  0.01  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.138524 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>