More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_1064 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010338  Caul_1064  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  100 
 
 
387 aa  795    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.43547 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2355  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  48.75 
 
 
349 aa  347  1e-94  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.725754  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0481  Rieske (2Fe-2S) iron-sulfur domain-containing protein  43.3 
 
 
353 aa  295  7e-79  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0971818  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1676  Rieske (2Fe-2S) domain protein  41.9 
 
 
349 aa  295  1e-78  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.945696  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1649  Rieske (2Fe-2S) domain protein  41.9 
 
 
370 aa  294  1e-78  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1235  Rieske (2Fe-2S) domain protein  38.94 
 
 
349 aa  280  3e-74  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0659  Rieske (2Fe-2S) domain protein  36.57 
 
 
361 aa  249  5e-65  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.210033 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0627  Rieske (2Fe-2S) domain protein  36.9 
 
 
361 aa  249  7e-65  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0648  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  36.29 
 
 
361 aa  248  1e-64  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.149026 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6021  Rieske (2Fe-2S) domain protein  35.69 
 
 
344 aa  241  2e-62  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.174244  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3621  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  35.73 
 
 
377 aa  232  8.000000000000001e-60  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0573672 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5800  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  37.01 
 
 
354 aa  232  9e-60  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00198597 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4769  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  28.33 
 
 
367 aa  106  9e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.289545  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3542  vanillate O-demethylase oxygenase subunit  26.61 
 
 
345 aa  103  4e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.10385 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0547  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  25.08 
 
 
324 aa  100  4e-20  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000394367  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2825  iron-sulfur cluster-binding protein, Rieske family  27.08 
 
 
358 aa  98.2  2e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.000971916  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1009  vanillate demethylase  33.51 
 
 
353 aa  97.1  4e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0048453  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1535  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  24.61 
 
 
331 aa  97.4  4e-19  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0807  vanillate O-demethylase oxygenase subunit  34.44 
 
 
331 aa  96.3  8e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3396  vanillate monooxygenase  35.14 
 
 
348 aa  96.3  8e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00111775  normal  0.0140003 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1442  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  26.57 
 
 
324 aa  93.2  7e-18  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000193123  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2036  hypothetical protein  28.78 
 
 
334 aa  92.8  9e-18  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.502892  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1488  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  26.89 
 
 
321 aa  92.4  1e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0113839  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1067  vanillate monooxygenase  32.45 
 
 
359 aa  92.4  1e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.535746  normal  0.0980736 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1549  vanillate monooxygenase  33.16 
 
 
359 aa  91.3  2e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.619122  normal  0.0130812 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3671  oxidoreductase alpha subunit  31.18 
 
 
407 aa  89.4  9e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0725789  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1550  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  32.35 
 
 
353 aa  89  1e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.276626  normal  0.0604744 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5789  Rieske (2Fe-2S) region  25.29 
 
 
349 aa  87.4  3e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3952  Rieske (2Fe-2S) protein  33.52 
 
 
340 aa  87.8  3e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.13771  normal  0.112958 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4340  Rieske (2Fe-2S) region  31.87 
 
 
350 aa  87.4  4e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1781  cell death suppressor protein Lls1-like  27.82 
 
 
456 aa  86.7  6e-16  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.527136  normal  0.0843855 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3416  vanillate monooxygenase  31.55 
 
 
342 aa  86.7  7e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0799476 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4330  vanillate monooxygenase  36.3 
 
 
366 aa  86.7  7e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0440139 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_43309  predicted protein  28.14 
 
 
492 aa  85.5  0.000000000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.231154  hitchhiker  0.00124797 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0218  Rieske iron-sulfur protein 2Fe-2S subunit  30.83 
 
 
444 aa  85.1  0.000000000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.163513  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1056  Rieske (2Fe-2S) region  29.41 
 
 
499 aa  85.1  0.000000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00144994  hitchhiker  0.000116875 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1557  Rieske (2Fe-2S) domain protein  28.57 
 
 
450 aa  85.1  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0276963  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1575  Rieske (2Fe-2S) protein  32.45 
 
 
346 aa  84.7  0.000000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.869006  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08501  Rieske iron-sulfur protein 2Fe-2S subunit  30.83 
 
 
444 aa  85.1  0.000000000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00185666 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1355  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  35.11 
 
 
358 aa  85.1  0.000000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0769  Rieske (2Fe-2S) domain protein  29.44 
 
 
497 aa  84.7  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2285  vanillate monooxygenase  32.81 
 
 
367 aa  85.5  0.000000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.138524 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3574  Rieske (2Fe-2S) region  30.26 
 
 
349 aa  85.5  0.000000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1016  dioxygenase, iron-sulfur subunit, putative  28.51 
 
 
369 aa  84.3  0.000000000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.621392  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4516  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  26.01 
 
 
373 aa  84.7  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1530  Rieske (2Fe-2S) domain protein  28.02 
 
 
450 aa  84.3  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1184  Rieske (2Fe-2S) domain protein  25.69 
 
 
358 aa  84  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0795  Rieske (2Fe-2S) domain protein  28.97 
 
 
497 aa  84  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.266613  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3409  vanillate monooxygenase  31.18 
 
 
347 aa  83.2  0.000000000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0915562 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0535  Rieske (2Fe-2S) region  25 
 
 
460 aa  82.8  0.000000000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1487  Rieske (2Fe-2S) protein  30.27 
 
 
356 aa  82.8  0.000000000000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1867  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  27.33 
 
 
388 aa  82.4  0.00000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.687816 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1827  Rieske (2Fe-2S) region  30.32 
 
 
347 aa  82.4  0.00000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4257  Rieske (2Fe-2S) domain protein  30.17 
 
 
349 aa  82.4  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1130  Rieske (2Fe-2S) domain protein  28.64 
 
 
362 aa  82  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0812255  normal  0.937672 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0963  vanillate O-demethylase oxygenase subunit  29.86 
 
 
350 aa  82  0.00000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4593  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  30.28 
 
 
353 aa  82.8  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.743349  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1136  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  29.95 
 
 
373 aa  81.6  0.00000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.959251  normal  0.28876 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2164  cell death suppressor protein Lls1-like  28.67 
 
 
461 aa  81.6  0.00000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.909867  normal  0.138548 
 
 
-
 
NC_011700  PHATRDRAFT_50613  Tic55 component of chloroplast import machinery  31.72 
 
 
498 aa  81.3  0.00000000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0741  Rieske (2Fe-2S) protein  25 
 
 
382 aa  81.3  0.00000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0606248 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5126  vanillate monooxygenase  30.28 
 
 
352 aa  81.3  0.00000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0127  Rieske (2Fe-2S) protein  32.98 
 
 
355 aa  81.3  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1488  Rieske (2Fe-2S) protein  35.07 
 
 
351 aa  81.3  0.00000000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2074  Rieske (2Fe-2S) domain protein  35.86 
 
 
217 aa  81.3  0.00000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.12491  normal  0.0463704 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3116  Pheophorbide a oxygenase  26.88 
 
 
442 aa  80.9  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1241  Rieske (2Fe-2S) domain protein  34.87 
 
 
217 aa  80.9  0.00000000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.635525  normal  0.124818 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1370  vanillate monooxygenase  27.17 
 
 
363 aa  80.5  0.00000000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0418  Rieske (2Fe-2S) protein  37.76 
 
 
353 aa  80.5  0.00000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.842278  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1559  vanillate monooxygenase  26.63 
 
 
347 aa  80.5  0.00000000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.662697  normal  0.47859 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5718  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  38.4 
 
 
373 aa  80.5  0.00000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.592667 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5962  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  38.4 
 
 
373 aa  80.5  0.00000000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.314282  normal  0.602397 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1103  Rieske (2Fe-2S) domain protein  28.64 
 
 
362 aa  80.5  0.00000000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4103  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  35.48 
 
 
374 aa  80.1  0.00000000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2035  hypothetical protein  31.18 
 
 
345 aa  80.1  0.00000000000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1552  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  32.72 
 
 
367 aa  80.1  0.00000000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.190198 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3024  vanillate monooxygenase  31.63 
 
 
361 aa  80.1  0.00000000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5354  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  36.76 
 
 
370 aa  80.1  0.00000000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.111829  normal  0.289416 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1303  Rieske (2Fe-2S) region  27.01 
 
 
443 aa  79.7  0.00000000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.418357  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0864  cell death suppressor protein Lls1-like  26.84 
 
 
438 aa  79.7  0.00000000000008  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.658605  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3410  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  34.38 
 
 
357 aa  79.7  0.00000000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0474443 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6610  vanillate demethylase oxygenase subunit  30.43 
 
 
380 aa  79.7  0.00000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.581564  normal  0.184804 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1687  vanillate monooxygenase  30.39 
 
 
338 aa  79.7  0.00000000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_07721  Rieske iron-sulfur protein 2Fe-2S subunit  28.31 
 
 
439 aa  79.3  0.0000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.725202  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2310  vanillate monooxygenase  31.72 
 
 
362 aa  79.3  0.0000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0218143 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0993  Rieske (2Fe-2S) region  30.56 
 
 
350 aa  79.3  0.0000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  unclonable  0.00000318811 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1543  vanillate monooxygenase  32.56 
 
 
366 aa  79  0.0000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.111008  hitchhiker  0.00152746 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6718  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  37.6 
 
 
371 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1001  putative vanillate O-demethylase oxygenase subunit A  30.69 
 
 
349 aa  78.2  0.0000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.8149  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6662  dioxygenase, iron-sulfur subunit  37.6 
 
 
371 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0364205  normal  0.0470201 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1004  putative vanillate O-demethylase oxygenase subunit A  29.38 
 
 
353 aa  78.6  0.0000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.413289  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1812  Rieske (2Fe-2S) region  25.9 
 
 
383 aa  78.6  0.0000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0372125 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0630  Rieske (2Fe-2S) domain protein  36.3 
 
 
353 aa  78.2  0.0000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.494266  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1589  Rieske (2Fe-2S) region  37.6 
 
 
371 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.577114  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6242  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  37.6 
 
 
371 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.718979  normal  0.984052 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3266  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  31.69 
 
 
353 aa  78.6  0.0000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0113117 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0867  Rieske (2Fe-2S) region  29.53 
 
 
357 aa  78.2  0.0000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3793  pheophorbide a oxygenase  26.57 
 
 
443 aa  78.2  0.0000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.726  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3532  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  31.72 
 
 
446 aa  77.4  0.0000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.048657  normal  0.0515471 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0203  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  33.06 
 
 
406 aa  77.4  0.0000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>