More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_6021 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011894  Mnod_6021  Rieske (2Fe-2S) domain protein  100 
 
 
344 aa  701    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.174244  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5800  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  86.63 
 
 
354 aa  586  1e-166  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00198597 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0648  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  59.94 
 
 
361 aa  428  1e-119  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.149026 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0627  Rieske (2Fe-2S) domain protein  60.23 
 
 
361 aa  430  1e-119  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0659  Rieske (2Fe-2S) domain protein  60.23 
 
 
361 aa  427  1e-118  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.210033 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3621  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  61.6 
 
 
377 aa  427  1e-118  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0573672 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0481  Rieske (2Fe-2S) iron-sulfur domain-containing protein  38.79 
 
 
353 aa  256  3e-67  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0971818  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2355  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  39.26 
 
 
349 aa  254  1.0000000000000001e-66  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.725754  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1649  Rieske (2Fe-2S) domain protein  34.86 
 
 
370 aa  244  1.9999999999999999e-63  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1676  Rieske (2Fe-2S) domain protein  35.07 
 
 
349 aa  243  5e-63  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.945696  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1064  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  35.69 
 
 
387 aa  241  1e-62  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.43547 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1235  Rieske (2Fe-2S) domain protein  33.91 
 
 
349 aa  233  4.0000000000000004e-60  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2035  hypothetical protein  34.81 
 
 
345 aa  97.8  2e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3574  Rieske (2Fe-2S) region  29.88 
 
 
349 aa  93.6  4e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1557  Rieske (2Fe-2S) domain protein  28.14 
 
 
450 aa  92  1e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0276963  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1530  Rieske (2Fe-2S) domain protein  28.14 
 
 
450 aa  91.7  2e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1130  Rieske (2Fe-2S) domain protein  30.11 
 
 
362 aa  90.9  3e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0812255  normal  0.937672 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1103  Rieske (2Fe-2S) domain protein  30.11 
 
 
362 aa  90.1  4e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0547  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  24.24 
 
 
324 aa  90.5  4e-17  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000394367  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1442  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  25.82 
 
 
324 aa  89.7  7e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000193123  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1488  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  26.07 
 
 
321 aa  89.4  8e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0113839  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1136  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  27.22 
 
 
373 aa  89  1e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.959251  normal  0.28876 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1827  Rieske (2Fe-2S) region  31.17 
 
 
347 aa  89  1e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4769  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  24.92 
 
 
367 aa  89  1e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.289545  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2359  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  33.12 
 
 
410 aa  87  5e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.128163  normal  0.731078 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2979  Rieske (2Fe-2S) domain protein  30.63 
 
 
367 aa  86.3  7e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1535  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  21.86 
 
 
331 aa  86.3  7e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1009  vanillate demethylase  31.95 
 
 
353 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0048453  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4244  Rieske (2Fe-2S) domain protein  33.33 
 
 
352 aa  85.9  0.000000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4257  Rieske (2Fe-2S) domain protein  28.57 
 
 
349 aa  85.1  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1867  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  33.14 
 
 
388 aa  85.1  0.000000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.687816 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3542  vanillate O-demethylase oxygenase subunit  34.13 
 
 
345 aa  84.3  0.000000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.10385 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2036  hypothetical protein  32.14 
 
 
334 aa  84  0.000000000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.502892  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1575  Rieske (2Fe-2S) protein  25.78 
 
 
346 aa  83.2  0.000000000000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.869006  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1184  Rieske (2Fe-2S) domain protein  24.77 
 
 
358 aa  83.2  0.000000000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1016  dioxygenase, iron-sulfur subunit, putative  25.56 
 
 
369 aa  82.8  0.000000000000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.621392  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3952  Rieske (2Fe-2S) protein  27.8 
 
 
340 aa  81.6  0.00000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.13771  normal  0.112958 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0218  Rieske iron-sulfur protein 2Fe-2S subunit  22.29 
 
 
444 aa  80.5  0.00000000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.163513  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0787  Rieske (2Fe-2S) protein  36.73 
 
 
351 aa  81.3  0.00000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.466147 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0993  Rieske (2Fe-2S) region  29.24 
 
 
350 aa  80.9  0.00000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  unclonable  0.00000318811 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1185  Rieske (2Fe-2S) domain protein  32.75 
 
 
364 aa  80.5  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08501  Rieske iron-sulfur protein 2Fe-2S subunit  22.29 
 
 
444 aa  80.1  0.00000000000006  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00185666 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1389  putative oxygenase  37.27 
 
 
359 aa  79.3  0.00000000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0807  vanillate O-demethylase oxygenase subunit  34.32 
 
 
331 aa  79.3  0.00000000000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2825  iron-sulfur cluster-binding protein, Rieske family  30 
 
 
358 aa  79  0.0000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.000971916  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3671  oxidoreductase alpha subunit  33.73 
 
 
407 aa  79  0.0000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0725789  normal 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6483  Rieske (2Fe-2S) region  31.25 
 
 
358 aa  77.8  0.0000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2050  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  27.34 
 
 
327 aa  78.2  0.0000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0319051  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2143  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  26.04 
 
 
372 aa  77.4  0.0000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.444634  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6610  vanillate demethylase oxygenase subunit  25.68 
 
 
380 aa  77.4  0.0000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.581564  normal  0.184804 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1448  Rieske (2Fe-2S) protein  29.27 
 
 
359 aa  77.4  0.0000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0344  Rieske (2Fe-2S) protein  33.33 
 
 
353 aa  77  0.0000000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1303  Rieske (2Fe-2S) region  30.23 
 
 
443 aa  77  0.0000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.418357  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2492  vanillate O-demethylase oxygenase subunit  30.34 
 
 
315 aa  76.3  0.0000000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5789  Rieske (2Fe-2S) region  28.74 
 
 
349 aa  76.3  0.0000000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1488  Rieske (2Fe-2S) protein  31.29 
 
 
351 aa  76.3  0.0000000000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3119  vanillate monooxygenase  31.07 
 
 
358 aa  76.3  0.0000000000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0535  Rieske (2Fe-2S) region  25.26 
 
 
460 aa  75.9  0.0000000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5693  Rieske (2Fe-2S) domain protein  35.09 
 
 
352 aa  75.9  0.0000000000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3246  vanillate monooxygenase  34.12 
 
 
347 aa  75.5  0.000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.546586  normal  0.604076 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4516  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  31.61 
 
 
373 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1550  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  33.33 
 
 
353 aa  75.1  0.000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.276626  normal  0.0604744 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0963  vanillate O-demethylase oxygenase subunit  30.54 
 
 
350 aa  74.3  0.000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3532  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  30.22 
 
 
446 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.048657  normal  0.0515471 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2310  vanillate monooxygenase  30.91 
 
 
362 aa  74.3  0.000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0218143 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2919  Rieske (2Fe-2S) domain protein  29.88 
 
 
338 aa  74.3  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.563703  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2013  Rieske (2Fe-2S) family oxidoreductase large subunit  28.7 
 
 
348 aa  74.3  0.000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3396  vanillate monooxygenase  29.94 
 
 
348 aa  74.3  0.000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00111775  normal  0.0140003 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0741  Rieske (2Fe-2S) protein  23.3 
 
 
382 aa  73.9  0.000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0606248 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3160  Rieske (2Fe-2S) domain protein  32.34 
 
 
347 aa  73.9  0.000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0630  Rieske (2Fe-2S) iron-sulfur domain protein  25 
 
 
330 aa  73.6  0.000000000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4278  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  33.53 
 
 
362 aa  73.6  0.000000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.844018 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1445  Rieske (2Fe-2S) protein  25.3 
 
 
437 aa  73.2  0.000000000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.491711  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0964  Rieske (2Fe-2S) domain protein  26.9 
 
 
468 aa  73.2  0.000000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.1498 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3409  vanillate monooxygenase  25 
 
 
347 aa  73.2  0.000000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0915562 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2672  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  32.74 
 
 
377 aa  73.2  0.000000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0627264  normal  0.0375363 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1576  Rieske (2Fe-2S) region  31.75 
 
 
358 aa  72.8  0.000000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.221742  n/a   
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_43309  predicted protein  30.72 
 
 
492 aa  72.8  0.000000000009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.231154  hitchhiker  0.00124797 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4340  Rieske (2Fe-2S) region  32.73 
 
 
350 aa  72.4  0.00000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2725  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  31.9 
 
 
354 aa  72.4  0.00000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0149406 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4330  vanillate monooxygenase  26.59 
 
 
366 aa  72  0.00000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0440139 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64800  vanillate O-demethylase oxygenase subunit  35.85 
 
 
351 aa  72  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0565633  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0222  vanillate O-demethylase oxygenase subunit oxidoreductase protein  30.95 
 
 
342 aa  71.2  0.00000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.0000016692  normal  0.0221534 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7085  Rieske (2Fe-2S) domain protein  31.01 
 
 
406 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5422  oxidoreductase protein  33.07 
 
 
230 aa  71.6  0.00000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.20856  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1541  vanillate monooxygenase  27.1 
 
 
423 aa  71.2  0.00000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00031597  hitchhiker  0.00167065 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26080  vanillate demethylase subunit A  27.88 
 
 
377 aa  71.6  0.00000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.819244  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1370  vanillate monooxygenase  28.83 
 
 
363 aa  71.6  0.00000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3567  Rieske (2Fe-2S) domain protein  31.58 
 
 
344 aa  72  0.00000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2880  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  30.18 
 
 
377 aa  71.2  0.00000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.150338  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0574  phthalate 4,5-dioxygenase  30.77 
 
 
406 aa  71.2  0.00000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.105836  normal  0.217979 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4103  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  41.18 
 
 
374 aa  71.2  0.00000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0203  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  31.78 
 
 
406 aa  70.9  0.00000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3062  phthalate 4,5-dioxygenase  28.18 
 
 
431 aa  70.9  0.00000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.021682 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4419  Rieske (2Fe-2S) iron-sulfur domain-containing protein  29.81 
 
 
367 aa  70.9  0.00000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.257041  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_07721  Rieske iron-sulfur protein 2Fe-2S subunit  20.34 
 
 
439 aa  70.5  0.00000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.725202  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3509  Rieske (2Fe-2S) domain protein  30.18 
 
 
386 aa  70.5  0.00000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.119894  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0630  Rieske (2Fe-2S) domain protein  26.4 
 
 
353 aa  70.1  0.00000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.494266  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2688  Rieske (2Fe-2S) protein  36.89 
 
 
352 aa  70.1  0.00000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3154  Rieske (2Fe-2S) domain protein  36.75 
 
 
221 aa  69.7  0.00000000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.647374  normal  0.386497 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>