More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_4642 on replicon NC_012857
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010678  Rpic_4510  Rieske (2Fe-2S) domain protein  100 
 
 
355 aa  741    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4642  Rieske (2Fe-2S) domain protein  100 
 
 
355 aa  741    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.44027  normal  0.0329483 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3570  Rieske (2Fe-2S) region  78.59 
 
 
355 aa  607  1e-173  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0161982  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1336  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  71.04 
 
 
355 aa  500  1e-140  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.4835  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2494  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  71.04 
 
 
355 aa  500  1e-140  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0595  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  71.04 
 
 
355 aa  500  1e-140  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0958903  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5591  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  70.25 
 
 
356 aa  499  1e-140  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00790855 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0972  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  71.04 
 
 
355 aa  500  1e-140  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0319  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  71.04 
 
 
355 aa  500  1e-140  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.456896  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1307  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  71.04 
 
 
355 aa  500  1e-140  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.992701  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0175  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  66.38 
 
 
363 aa  498  1e-140  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3984  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  69.94 
 
 
356 aa  499  1e-140  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.643695  normal  0.0193847 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3658  Rieske (2Fe-2S) region  69.94 
 
 
356 aa  498  1e-140  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1234  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  71.04 
 
 
355 aa  500  1e-140  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4709  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  69.94 
 
 
356 aa  498  1e-140  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.700082  normal  0.155037 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1105  Rieske (2Fe-2S) protein  68.9 
 
 
358 aa  494  1e-139  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.080608  normal  0.368914 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1501  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  70.73 
 
 
355 aa  497  1e-139  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4233  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  66.28 
 
 
362 aa  494  1e-139  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4568  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  68.9 
 
 
356 aa  494  9.999999999999999e-139  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.380862  hitchhiker  0.000303241 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4103  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  68.9 
 
 
356 aa  493  9.999999999999999e-139  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.119091 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7059  Rieske (2Fe-2S) domain protein  68.39 
 
 
364 aa  490  1e-137  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.2387  normal  0.465604 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3967  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  62.08 
 
 
347 aa  448  1e-125  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0132  Rieske (2Fe-2S) protein  61.47 
 
 
343 aa  445  1.0000000000000001e-124  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3681  Rieske (2Fe-2S) region  57.19 
 
 
346 aa  382  1e-105  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.2267  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0964  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  58.9 
 
 
341 aa  381  1e-105  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3160  Rieske (2Fe-2S) domain protein  54.89 
 
 
347 aa  357  9.999999999999999e-98  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1442  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  30 
 
 
324 aa  130  4.0000000000000003e-29  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000193123  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1488  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  30.37 
 
 
321 aa  130  4.0000000000000003e-29  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0113839  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1130  Rieske (2Fe-2S) domain protein  37.43 
 
 
362 aa  122  8e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0812255  normal  0.937672 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1103  Rieske (2Fe-2S) domain protein  37.7 
 
 
362 aa  122  8e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1827  Rieske (2Fe-2S) region  31.93 
 
 
347 aa  120  3e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1535  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  28.06 
 
 
331 aa  115  8.999999999999998e-25  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0630  Rieske (2Fe-2S) iron-sulfur domain protein  27.21 
 
 
330 aa  114  3e-24  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4257  Rieske (2Fe-2S) domain protein  39.29 
 
 
349 aa  114  4.0000000000000004e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2036  hypothetical protein  33.75 
 
 
334 aa  113  5e-24  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.502892  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0547  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  28.24 
 
 
324 aa  113  6e-24  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000394367  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2035  hypothetical protein  29.78 
 
 
345 aa  112  1.0000000000000001e-23  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3574  Rieske (2Fe-2S) region  28.49 
 
 
349 aa  110  3e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0222  vanillate O-demethylase oxygenase subunit oxidoreductase protein  35.29 
 
 
342 aa  109  8.000000000000001e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.0000016692  normal  0.0221534 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2904  vanillate O-demethylase, oxygenase subunit  26.76 
 
 
354 aa  108  1e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.179444  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2708  Rieske [2Fe-2S] region  26.26 
 
 
354 aa  108  2e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.104354  normal  0.0620392 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0344  Rieske (2Fe-2S) protein  27.73 
 
 
353 aa  106  6e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1185  Rieske (2Fe-2S) domain protein  34.39 
 
 
364 aa  105  1e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5124  vanillate monooxygenase  38.01 
 
 
359 aa  103  4e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.14115  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1044  phthalate 4,5-dioxygenase  25.98 
 
 
454 aa  103  4e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.714091 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0280  Rieske (2Fe-2S) protein  34.04 
 
 
351 aa  103  4e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.226935  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1352  vanillate monooxygenase  36.16 
 
 
363 aa  101  2e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2725  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  34.12 
 
 
354 aa  101  2e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0149406 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4591  vanillate monooxygenase  36 
 
 
373 aa  101  2e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.672566 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2492  vanillate O-demethylase oxygenase subunit  25.31 
 
 
315 aa  100  3e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1687  vanillate monooxygenase  27.56 
 
 
338 aa  100  4e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3124  Rieske (2Fe-2S) region  36.26 
 
 
359 aa  100  4e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.439622  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5243  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  36.26 
 
 
359 aa  100  4e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5693  Rieske (2Fe-2S) domain protein  35.12 
 
 
352 aa  100  5e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0420  Rieske (2Fe-2S) protein  34.48 
 
 
373 aa  100  5e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3542  vanillate O-demethylase oxygenase subunit  37.57 
 
 
345 aa  100  5e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.10385 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3214  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  33.69 
 
 
347 aa  99.8  6e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0195459 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0127  Rieske (2Fe-2S) protein  27.68 
 
 
355 aa  99.4  9e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5029  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  35.67 
 
 
359 aa  99.4  9e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.773131 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7105  Rieske (2Fe-2S) domain protein  34.42 
 
 
361 aa  98.6  1e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.811582  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1575  Rieske (2Fe-2S) protein  28.24 
 
 
346 aa  98.6  1e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.869006  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5789  Rieske (2Fe-2S) region  31.25 
 
 
349 aa  97.8  2e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3952  Rieske (2Fe-2S) protein  32.82 
 
 
340 aa  97.8  2e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.13771  normal  0.112958 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0336  Rieske (2Fe-2S) protein  25.28 
 
 
370 aa  98.6  2e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2285  vanillate monooxygenase  32.99 
 
 
367 aa  97.8  3e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.138524 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64800  vanillate O-demethylase oxygenase subunit  33.86 
 
 
351 aa  97.8  3e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0565633  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1296  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  31.58 
 
 
367 aa  97.1  4e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.85642 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5154  Rieske (2Fe-2S) region  26.58 
 
 
440 aa  97.1  4e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.291358  normal  0.277417 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5628  vanillate O-demethylase oxygenase subunit  33.86 
 
 
351 aa  96.3  7e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.834519  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3212  Rieske 2Fe-2S family protein  24.84 
 
 
341 aa  95.9  9e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6483  Rieske (2Fe-2S) region  33.14 
 
 
358 aa  95.5  1e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3736  Rieske (2Fe-2S) domain protein  34.71 
 
 
355 aa  95.1  2e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.554225  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4278  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  34.55 
 
 
362 aa  95.1  2e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.844018 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2143  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  33.73 
 
 
372 aa  94.7  2e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.444634  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0436  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  33.77 
 
 
326 aa  94.4  3e-18  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1004  putative vanillate O-demethylase oxygenase subunit A  35.56 
 
 
353 aa  94.4  3e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.413289  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1184  Rieske (2Fe-2S) domain protein  34.52 
 
 
358 aa  94.4  3e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2027  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  34.12 
 
 
355 aa  94  4e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2590  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  24.92 
 
 
341 aa  94  4e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.225432 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1485  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  35.84 
 
 
343 aa  93.6  4e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6309  Rieske (2Fe-2S) domain protein  31.09 
 
 
341 aa  93.6  5e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.241664  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1530  Rieske (2Fe-2S) domain protein  30.85 
 
 
450 aa  93.6  5e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1001  putative vanillate O-demethylase oxygenase subunit A  36.26 
 
 
349 aa  93.2  6e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.8149  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1557  Rieske (2Fe-2S) domain protein  30.85 
 
 
450 aa  93.2  6e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0276963  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3246  vanillate monooxygenase  37.79 
 
 
347 aa  92.8  9e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.546586  normal  0.604076 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2045  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  33.33 
 
 
355 aa  92.4  1e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2979  Rieske (2Fe-2S) domain protein  34.13 
 
 
367 aa  92  1e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1137  vanillate monooxygenase  27.7 
 
 
350 aa  92.4  1e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.684708  hitchhiker  0.000140047 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0844  Rieske (2Fe-2S) region  26.4 
 
 
349 aa  92.4  1e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1543  vanillate monooxygenase  33.14 
 
 
366 aa  91.7  2e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.111008  hitchhiker  0.00152746 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2137  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  31.55 
 
 
450 aa  91.7  2e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3387  Rieske (2Fe-2S) region  34.66 
 
 
369 aa  90.9  3e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.662042  normal  0.0218971 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2170  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  32.94 
 
 
355 aa  90.9  3e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.461217  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10960  ferridoxin oxidoreductase subunit  35 
 
 
370 aa  90.9  3e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4269  vanillate monooxygenase  28.25 
 
 
351 aa  90.5  4e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.846398 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4340  Rieske (2Fe-2S) region  31.16 
 
 
350 aa  90.5  4e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4861  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  29.29 
 
 
365 aa  90.5  4e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.641783  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1009  vanillate demethylase  26.54 
 
 
353 aa  90.5  4e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0048453  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2074  Rieske (2Fe-2S) domain protein  40.98 
 
 
217 aa  89.7  6e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.12491  normal  0.0463704 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2184  vanillate O-demethylase oxygenase, iron-sulfur subunit  26.78 
 
 
347 aa  89.7  6e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>