More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_3319 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_4719  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  96.64 
 
 
447 aa  894    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.642788  normal  0.301808 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3319  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  100 
 
 
447 aa  925    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.65534 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0324  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  39.49 
 
 
442 aa  273  3e-72  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6872  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  38.69 
 
 
452 aa  269  8e-71  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.558153  normal  0.419879 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0336  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  38.78 
 
 
447 aa  269  8e-71  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.102143  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3695  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  35.1 
 
 
460 aa  243  6e-63  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.036835  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0908  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  36.32 
 
 
441 aa  241  2e-62  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4406  Rieske (2Fe-2S) region  33.41 
 
 
471 aa  221  9.999999999999999e-57  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4787  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  33.41 
 
 
471 aa  221  9.999999999999999e-57  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.819616  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4493  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  33.41 
 
 
471 aa  221  9.999999999999999e-57  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.940392  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1788  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  32.55 
 
 
470 aa  217  2.9999999999999998e-55  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.242227 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0198  Rieske (2Fe-2S) domain protein  32.1 
 
 
449 aa  204  2e-51  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0193  Rieske (2Fe-2S) domain protein  31.87 
 
 
449 aa  201  1.9999999999999998e-50  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.242613  normal  0.0404177 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4962  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  32.08 
 
 
457 aa  201  1.9999999999999998e-50  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3534  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  32.81 
 
 
473 aa  196  9e-49  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3539  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  27.81 
 
 
448 aa  174  1.9999999999999998e-42  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3484  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  32.49 
 
 
469 aa  170  5e-41  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3702  Rieske (2Fe-2S) region  29.16 
 
 
455 aa  169  8e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3775  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  29.16 
 
 
455 aa  169  8e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.37282 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3715  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  29.16 
 
 
455 aa  167  2e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2328  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  28.57 
 
 
456 aa  166  6.9999999999999995e-40  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.459675  normal  0.238108 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4319  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  28.96 
 
 
469 aa  161  2e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.250157 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3546  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  31.41 
 
 
476 aa  159  8e-38  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3505  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  27.35 
 
 
449 aa  159  1e-37  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.231372  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3536  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  29.12 
 
 
444 aa  157  3e-37  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2271  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  28.18 
 
 
443 aa  150  4e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.516645  normal  0.774548 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1988  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  29.03 
 
 
470 aa  144  3e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2261  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  28.22 
 
 
451 aa  134  1.9999999999999998e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.501728 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2260  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  27.94 
 
 
448 aa  125  2e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.665349 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3791  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  33.5 
 
 
362 aa  125  2e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.71996  normal  0.360216 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4184  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  37.11 
 
 
423 aa  119  9.999999999999999e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0979  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  32.99 
 
 
362 aa  117  3e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0962  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  35.64 
 
 
409 aa  117  3.9999999999999997e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.136632  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3723  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  35.57 
 
 
425 aa  117  3.9999999999999997e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3710  Rieske (2Fe-2S) region  35.57 
 
 
425 aa  117  5e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3783  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  35.57 
 
 
425 aa  117  5e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0573009  normal  0.423928 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0407  putative Rieske-type ring dioxygenase  32.83 
 
 
387 aa  116  7.999999999999999e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.523707  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2455  Rieske (2Fe-2S) protein  31.5 
 
 
388 aa  116  7.999999999999999e-25  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4190  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  26.24 
 
 
421 aa  114  4.0000000000000004e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2464  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  26.68 
 
 
425 aa  114  4.0000000000000004e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.31454  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2470  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  36.08 
 
 
430 aa  114  4.0000000000000004e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS02037  putative dioxygenase (alpha subunit) oxidoreductase protein  31.82 
 
 
414 aa  113  6e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.265627 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4357  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  25.52 
 
 
422 aa  113  7.000000000000001e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1560  Rieske (2Fe-2S) region  31.75 
 
 
434 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4137  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  31.5 
 
 
430 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5070  Rieske (2Fe-2S) domain protein  30.28 
 
 
437 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.192805  hitchhiker  0.00646968 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2062  Rieske 2Fe-2S domain protein  30.59 
 
 
374 aa  110  4.0000000000000004e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.901443  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0401  iron-sulfur cluster-binding protein, Rieske family  31.47 
 
 
410 aa  110  5e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0142061  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2370  Rieske (2Fe-2S) domain protein  30.41 
 
 
387 aa  110  5e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3730  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  25.35 
 
 
425 aa  110  5e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3717  Rieske (2Fe-2S) region  25.35 
 
 
425 aa  110  5e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.126427  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4897  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  30.68 
 
 
410 aa  110  5e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.71235 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3790  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  25.35 
 
 
425 aa  110  5e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.199454  normal  0.144005 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4003  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  34.54 
 
 
383 aa  110  6e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6764  putative dioxygenase  32.41 
 
 
414 aa  110  7.000000000000001e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.963222 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4776  Rieske [2Fe-2S] region  30.46 
 
 
432 aa  109  8.000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.115011 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1386  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  30.59 
 
 
374 aa  109  8.000000000000001e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.373829  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01772  predicted 2Fe-2S cluster-containing protein  30.59 
 
 
374 aa  109  9.000000000000001e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1841  Rieske (2Fe-2S) domain protein  30.59 
 
 
374 aa  109  9.000000000000001e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.213142  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01760  hypothetical protein  30.59 
 
 
374 aa  109  9.000000000000001e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2528  Rieske 2Fe-2S domain protein  30.59 
 
 
374 aa  109  9.000000000000001e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0428403  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1890  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  30.59 
 
 
374 aa  109  9.000000000000001e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2028  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  30.59 
 
 
374 aa  109  9.000000000000001e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.121527  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4150  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  31.88 
 
 
384 aa  109  1e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.288761 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0578  Rieske (2Fe-2S) protein  29.72 
 
 
413 aa  107  3e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13182  dioxygenase  33.76 
 
 
382 aa  107  3e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000395149  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3296  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  29.2 
 
 
426 aa  107  5e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.166676  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2194  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  29.22 
 
 
373 aa  107  5e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.143682  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4815  Rieske (2Fe-2S) region  30.63 
 
 
413 aa  106  6e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0953607  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1861  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  30.28 
 
 
413 aa  107  6e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.523473  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1578  iron-sulphur Rieske protein  30.04 
 
 
437 aa  107  6e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6020  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  27.05 
 
 
382 aa  107  6e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0835  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  29.88 
 
 
422 aa  106  7e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3553  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  30.8 
 
 
413 aa  106  7e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2253  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  30.94 
 
 
406 aa  106  7e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.664872  normal  0.256671 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0747  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  29.88 
 
 
422 aa  106  7e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.239242  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71410  putative ring hydroxylating dioxygenase, alpha-subunit  30.52 
 
 
429 aa  106  7e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.306543  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6197  putative ring hydroxylating dioxygenase, alpha-subunit  30.41 
 
 
429 aa  106  7e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0315  Rieske (2Fe-2S) domain protein  30.5 
 
 
430 aa  106  8e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.276992  decreased coverage  0.0000264373 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2115  iron-sulphur Rieske protein  29.88 
 
 
413 aa  106  8e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1831  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  30.14 
 
 
374 aa  106  8e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.279236 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0703  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  29.88 
 
 
422 aa  106  9e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.917605  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0478  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  29.88 
 
 
413 aa  106  9e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1972  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  29.88 
 
 
422 aa  106  9e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0635134  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0999  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  29.88 
 
 
422 aa  106  9e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.75168  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0538  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  32.68 
 
 
432 aa  105  1e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0332131  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3290  Rieske (2Fe-2S) region  28.92 
 
 
413 aa  105  1e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5078  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  28.92 
 
 
413 aa  105  1e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.27977  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1753  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  27.82 
 
 
374 aa  104  2e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000408747 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3062  iron-sulfur cluster-binding protein, rieske family  30.91 
 
 
416 aa  105  2e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.476881  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1516  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  27.82 
 
 
374 aa  104  2e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5015  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  30.68 
 
 
413 aa  105  2e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.277088  normal  0.658452 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0338  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  30.35 
 
 
430 aa  105  2e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000696422  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5207  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  29.32 
 
 
413 aa  105  2e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.114331  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4490  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  30.68 
 
 
413 aa  105  2e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.400487  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1619  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  27.82 
 
 
374 aa  104  2e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2969  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  25.54 
 
 
429 aa  104  3e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.665588  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3306  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  33 
 
 
423 aa  104  3e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.478644  normal  0.259475 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1410  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  27.06 
 
 
423 aa  104  3e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.190649  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0636  Rieske (2Fe-2S) domain protein  28.14 
 
 
455 aa  103  4e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>