More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_3818 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007298  Daro_3818  Rieske (2Fe-2S) region  100 
 
 
111 aa  228  3e-59  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0794094  normal  0.0599225 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1314  Rieske (2Fe-2S) region  78.38 
 
 
111 aa  191  3e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0871721 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0816  benzene/toluene monooxygenase ferredoxin subunit  62.16 
 
 
111 aa  164  2.9999999999999998e-40  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2541  benzene/toluene monooxygenase ferredoxin subunit  59.46 
 
 
111 aa  160  4.0000000000000004e-39  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.558987 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5677  Rieske (2Fe-2S) region  62.73 
 
 
116 aa  149  1e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4634  Rieske (2Fe-2S) domain protein  61.82 
 
 
111 aa  149  2e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3558  Rieske (2Fe-2S) domain protein  61.82 
 
 
111 aa  149  2e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1596  toluene-4-monooxygenase system protein C  47.42 
 
 
117 aa  99  2e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0213  Rieske (2Fe-2S) protein  37.37 
 
 
126 aa  96.7  9e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.225427 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3342  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  40.91 
 
 
131 aa  96.7  9e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.139334  normal 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4859  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  49.02 
 
 
122 aa  95.5  2e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0807982  normal  0.0317192 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2847  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  41.67 
 
 
120 aa  94  7e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.15292  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4027  hypothetical protein  40.19 
 
 
110 aa  92.4  2e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.307444 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0225  Rieske 2Fe-2S family protein  41.51 
 
 
108 aa  91.3  4e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0375984  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4301  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  38.89 
 
 
111 aa  90.5  6e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.828362  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0930  Rieske (2Fe-2S) domain protein  39.6 
 
 
112 aa  90.1  8e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00957645 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1765  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  38.61 
 
 
112 aa  84  7e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.538609  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2045  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  33.98 
 
 
103 aa  83.2  0.000000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.294291  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2198  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  41.75 
 
 
134 aa  82.4  0.000000000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0363167  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0586  Rieske 2Fe-2S family protein  34.95 
 
 
104 aa  78.2  0.00000000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6713  putative ferredoxin  37.65 
 
 
96 aa  73.6  0.0000000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.491449  normal  0.188584 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0544  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  45 
 
 
127 aa  71.2  0.000000000005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.478802  normal  0.402117 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0922  methanesulfonate monooxygenase component; iron sulfur protein  31.07 
 
 
242 aa  70.5  0.000000000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.738029  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2821  Rieske (2Fe-2S) domain protein  37.5 
 
 
106 aa  63.9  0.0000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.541392  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1985  putative dioxygenase  39.8 
 
 
110 aa  62.4  0.000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.51691  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0969  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  36.46 
 
 
101 aa  62.4  0.000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0535859  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5285  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  41.67 
 
 
521 aa  60.8  0.000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3347  Rieske (2Fe-2S) oxidoreductase  35.35 
 
 
102 aa  60.8  0.000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1616  Rieske (2Fe-2S) domain protein  35.64 
 
 
101 aa  60.5  0.000000009  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1326  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  39.22 
 
 
108 aa  59.7  0.00000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.710748  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1329  putative dioxygenase, ferredoxin reductase component  35 
 
 
521 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0248077 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1194  biphenyl 2,3-dioxygenase ferredoxin subunit (BphA3)  35.24 
 
 
109 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0889683  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3232  Rieske (2Fe-2S) region  31.76 
 
 
102 aa  59.3  0.00000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3294  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  31.76 
 
 
102 aa  59.3  0.00000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.11925 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3243  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  32.1 
 
 
102 aa  59.3  0.00000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.680425  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5415  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  32.32 
 
 
521 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.792379  normal  0.597511 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2292  nitrite reductase [NAD(P)H], small subunit  30.53 
 
 
105 aa  57.4  0.00000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1327  Rieske (2Fe-2S) domain protein  35.71 
 
 
106 aa  56.6  0.0000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0198751  normal  0.195781 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3308  Rieske (2Fe-2S) domain protein  33.33 
 
 
513 aa  56.6  0.0000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.705785 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3163  nitrite reductase [NAD(P)H], small subunit  33.7 
 
 
105 aa  56.6  0.0000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.33632  normal  0.290875 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0396  Rieske (2Fe-2S) iron-sulfur domain protein  30.59 
 
 
125 aa  55.5  0.0000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.7121  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0940  putative Rieske (2Fe-2S) ferredoxin  34.69 
 
 
114 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2087  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  33.33 
 
 
118 aa  55.5  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.72518 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2879  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  33.96 
 
 
107 aa  55.5  0.0000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.388175  normal  0.0551812 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3495  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  30.86 
 
 
100 aa  55.5  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.65589  normal  0.322661 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2741  cytochrome P450  35.44 
 
 
599 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.25917  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2066  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  35.19 
 
 
121 aa  56.2  0.0000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0845  Rieske 2Fe-2S family protein  30.69 
 
 
103 aa  55.5  0.0000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0303  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  39.51 
 
 
100 aa  55.5  0.0000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000392242  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2887  prolyl 4-hydroxylase, alpha subunit  31.63 
 
 
475 aa  55.5  0.0000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0125851  hitchhiker  0.00158698 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0965  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  29.41 
 
 
100 aa  55.5  0.0000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00646524 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3775  Rieske (2Fe-2S) domain protein  36.78 
 
 
107 aa  55.1  0.0000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2151  nitrite reductase [NAD(P)H], small subunit  32.63 
 
 
105 aa  54.7  0.0000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.981833  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14640  ferredoxin subunit of nitrite reductase and ring-hydroxylating dioxygenase  35.48 
 
 
112 aa  54.7  0.0000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.857724  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3214  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  32.29 
 
 
137 aa  54.3  0.0000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.18886 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0716  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  37.25 
 
 
105 aa  54.3  0.0000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.025133  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1996  nitrite reductase  29.47 
 
 
118 aa  54.3  0.0000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0459175  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1969  nitrite reductase (NAD(P)H)  32.61 
 
 
105 aa  53.9  0.0000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.595397  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1948  nitrite reductase  32.61 
 
 
105 aa  53.9  0.0000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2176  nitrite reductase [NAD(P)H], small subunit  32.61 
 
 
105 aa  53.9  0.0000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2145  nitrite reductase [NAD(P)H] small subunit  29.47 
 
 
118 aa  54.3  0.0000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1989  nitrite reductase (NAD(P)H), small subunit  32.61 
 
 
104 aa  54.3  0.0000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2392  protein of unknown function DUF59  32.71 
 
 
238 aa  54.3  0.0000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0914  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  34.78 
 
 
518 aa  53.9  0.0000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0653376  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1662  Rieske (2Fe-2S) protein  35.35 
 
 
125 aa  53.9  0.0000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.282248  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1349  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  32.98 
 
 
95 aa  53.5  0.0000009  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.203828 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3238  Rieske 2Fe-2S family protein  40 
 
 
99 aa  53.1  0.000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00145958  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2871  Rieske (2Fe-2S) region  29.13 
 
 
292 aa  53.1  0.000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2673  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  29 
 
 
649 aa  53.5  0.000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3870  Rieske (2Fe-2S) iron-sulfur domain-containing protein  27.45 
 
 
270 aa  52  0.000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1672  hypothetical protein  35.11 
 
 
106 aa  52.4  0.000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1970  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  29.79 
 
 
546 aa  52.4  0.000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2471  nitrite reductase (NAD(P)H), small subunit  32.63 
 
 
104 aa  52.4  0.000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2423  nitrite reductase (NAD(P)H), small subunit  32.63 
 
 
104 aa  52.4  0.000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1663  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  32.93 
 
 
118 aa  52.4  0.000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1143  nitrite reductase (NAD(P)H), small subunit  29 
 
 
103 aa  51.6  0.000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1018  Rieske (2Fe-2S) region  29.7 
 
 
98 aa  52  0.000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.131503 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3012  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  29.27 
 
 
96 aa  52  0.000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.123081 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2486  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  32.97 
 
 
112 aa  52  0.000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.812063  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0203  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  36.92 
 
 
406 aa  51.2  0.000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5508  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  28.89 
 
 
104 aa  51.2  0.000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.358971 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1004  Rieske (2Fe-2S) iron-sulfur domain protein  32.35 
 
 
101 aa  51.6  0.000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.749918 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0648  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  35.71 
 
 
361 aa  50.8  0.000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.149026 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0659  Rieske (2Fe-2S) domain protein  35.71 
 
 
361 aa  50.8  0.000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.210033 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0161  Rieske (2Fe-2S) domain protein  36.14 
 
 
100 aa  51.2  0.000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000000394797  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1142  Rieske (2Fe-2S) domain protein  33.94 
 
 
114 aa  50.8  0.000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.209918  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3091  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  33.33 
 
 
104 aa  51.2  0.000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.954428 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0207  nitrite reductase (NAD(P)H), small subunit  27.37 
 
 
105 aa  51.2  0.000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7180  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  27.45 
 
 
114 aa  51.2  0.000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.602112 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2338  Rieske (2Fe-2S) domain protein  30.68 
 
 
113 aa  50.8  0.000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.700788 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0144  Rieske (2Fe-2S) domain protein  36.14 
 
 
100 aa  50.8  0.000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3052  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  29.79 
 
 
135 aa  50.4  0.000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.279296  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5985  Ferredoxin subunits of nitrite reductase and ring-hydroxylating dioxygenase-like protein  33 
 
 
105 aa  50.4  0.000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.321987  normal  0.294982 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3194  Rieske (2Fe-2S) region  41.46 
 
 
100 aa  50.4  0.000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  6.5117e-17  hitchhiker  4.2038099999999998e-22 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4103  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  35.38 
 
 
374 aa  50.8  0.000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23360  assimilatory nitrite reductase, small subunit  29.47 
 
 
108 aa  50.4  0.000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0534419  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4149  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  30.39 
 
 
109 aa  50.4  0.000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.411915  normal  0.231451 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0167  Rieske (2Fe-2S) region  34.67 
 
 
119 aa  50.4  0.000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2246  Rieske (2Fe-2S) domain protein  28.89 
 
 
109 aa  50.1  0.000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00879762  normal  0.228447 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1668  assimilatory nitrite reductase [NAD(P)H], small subunit  29.73 
 
 
113 aa  50.1  0.00001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0880692  normal  0.298986 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>