117 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssol_2198 on replicon CP001800
Organism: Sulfolobus solfataricus 98/2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001800  Ssol_2198  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  100 
 
 
134 aa  275  2e-73  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0363167  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0544  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  47.11 
 
 
127 aa  119  9.999999999999999e-27  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.478802  normal  0.402117 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3818  Rieske (2Fe-2S) region  41.75 
 
 
111 aa  82.4  0.000000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0794094  normal  0.0599225 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1314  Rieske (2Fe-2S) region  40.38 
 
 
111 aa  75.5  0.0000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0871721 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0816  benzene/toluene monooxygenase ferredoxin subunit  36.89 
 
 
111 aa  74.7  0.0000000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2541  benzene/toluene monooxygenase ferredoxin subunit  34.95 
 
 
111 aa  72  0.000000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.558987 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4634  Rieske (2Fe-2S) domain protein  37.86 
 
 
111 aa  69.7  0.00000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3558  Rieske (2Fe-2S) domain protein  37.86 
 
 
111 aa  69.7  0.00000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5677  Rieske (2Fe-2S) region  36.89 
 
 
116 aa  69.3  0.00000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3342  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  34.62 
 
 
131 aa  69.3  0.00000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.139334  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1596  toluene-4-monooxygenase system protein C  34.65 
 
 
117 aa  63.5  0.0000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3214  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  35.42 
 
 
137 aa  62.4  0.000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.18886 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0914  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  33.68 
 
 
518 aa  61.6  0.000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0653376  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4859  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  30.19 
 
 
122 aa  62  0.000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0807982  normal  0.0317192 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0213  Rieske (2Fe-2S) protein  31.96 
 
 
126 aa  59.3  0.00000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.225427 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0930  Rieske (2Fe-2S) domain protein  31.25 
 
 
112 aa  58.9  0.00000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00957645 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4027  hypothetical protein  32 
 
 
110 aa  57.8  0.00000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.307444 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4149  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  32.35 
 
 
109 aa  56.6  0.0000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.411915  normal  0.231451 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2708  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  34.78 
 
 
107 aa  55.8  0.0000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2821  Rieske (2Fe-2S) domain protein  31.43 
 
 
106 aa  55.8  0.0000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.541392  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1765  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  31.13 
 
 
112 aa  54.7  0.0000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.538609  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3799  NifU domain-containing protein  28.57 
 
 
291 aa  51.2  0.000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02432  3-phenylpropionate dioxygenase, predicted ferredoxin subunit  30.11 
 
 
106 aa  51.2  0.000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1128  Rieske (2Fe-2S) domain protein  30.11 
 
 
106 aa  51.2  0.000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2135  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  30.11 
 
 
116 aa  51.2  0.000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2692  3-phenylpropionate dioxygenase ferredoxin subunit  30.11 
 
 
106 aa  51.2  0.000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2825  3-phenylpropionate dioxygenase ferredoxin subunit  30.11 
 
 
106 aa  51.2  0.000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1137  3-phenylpropionate dioxygenase ferredoxin subunit  30.11 
 
 
106 aa  51.2  0.000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2693  3-phenylpropionate dioxygenase ferredoxin subunit  30.11 
 
 
106 aa  51.2  0.000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.77141  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3772  3-phenylpropionate dioxygenase ferredoxin subunit  30.11 
 
 
106 aa  51.2  0.000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02396  hypothetical protein  30.11 
 
 
106 aa  51.2  0.000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1985  putative dioxygenase  33.64 
 
 
110 aa  50.8  0.000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.51691  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4762  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  27.97 
 
 
121 aa  50.8  0.000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1197  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  34.44 
 
 
112 aa  50.4  0.000009  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.430122  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5941  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  26.04 
 
 
526 aa  49.7  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2226  Rieske (2Fe-2S) domain protein  34.91 
 
 
114 aa  48.9  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000457155  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3347  Rieske (2Fe-2S) oxidoreductase  29.7 
 
 
102 aa  49.7  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1143  nitrite reductase (NAD(P)H), small subunit  26 
 
 
103 aa  48.9  0.00002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0589  Rieske (2Fe-2S) domain protein  28 
 
 
112 aa  49.3  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2488  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  28.21 
 
 
129 aa  48.5  0.00003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.349012 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2369  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  31.58 
 
 
285 aa  48.1  0.00004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.010436 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0429  plastoquinol--plastocyanin reductase  32.97 
 
 
182 aa  47.8  0.00005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00000311251  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4166  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  28.21 
 
 
129 aa  48.1  0.00005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4288  Rieske (2Fe-2S) domain protein  31 
 
 
105 aa  47.4  0.00006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5207  Rieske (2Fe-2S) domain protein  32.99 
 
 
171 aa  47.4  0.00006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.92121  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1586  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  30 
 
 
107 aa  47.4  0.00007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4301  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  25.96 
 
 
111 aa  47  0.00008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.828362  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0167  Rieske (2Fe-2S) region  27.45 
 
 
119 aa  47  0.00009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2821  Rieske (2Fe-2S) region  25.74 
 
 
102 aa  46.6  0.0001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5285  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  33 
 
 
521 aa  47  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2066  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  29.09 
 
 
121 aa  45.4  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1194  biphenyl 2,3-dioxygenase ferredoxin subunit (BphA3)  25.74 
 
 
109 aa  45.8  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0889683  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2315  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  32.43 
 
 
141 aa  45.4  0.0002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.791717 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0965  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  30.39 
 
 
100 aa  45.4  0.0002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00646524 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0466  Plastoquinol--plastocyanin reductase  34.07 
 
 
182 aa  45.8  0.0002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.434271  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0895  hypothetical protein  27.1 
 
 
315 aa  45.4  0.0003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0773726  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0396  Rieske (2Fe-2S) iron-sulfur domain protein  27.1 
 
 
125 aa  45.1  0.0003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.7121  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4263  hypothetical protein  27.35 
 
 
137 aa  45.4  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.603078 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2961  Rieske (2Fe-2S) iron-sulfur domain protein  33.33 
 
 
111 aa  45.4  0.0003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0394  cytochrome b6-f complex, iron-sulfur subunit  31.87 
 
 
181 aa  44.7  0.0004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.582739  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0303  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  32.14 
 
 
100 aa  44.7  0.0004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000392242  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3016  Rieske (2Fe-2S) iron-sulfur domain protein  32.98 
 
 
142 aa  44.7  0.0004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.690575 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1307  Rieske (2Fe-2S) domain protein  28.77 
 
 
116 aa  44.7  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0144  Rieske (2Fe-2S) domain protein  28.57 
 
 
100 aa  45.1  0.0004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1335  Rieske (2Fe-2S) domain protein  28.77 
 
 
116 aa  44.7  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000656447 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1088  ferredoxin subunit of A ring-hydroxylating dioxygenase oxidoreductase protein  25.51 
 
 
103 aa  44.3  0.0005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.173698  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1502  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  32.39 
 
 
105 aa  44.7  0.0005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.165892 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0969  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  31.63 
 
 
101 aa  44.3  0.0005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0535859  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1970  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  28.71 
 
 
109 aa  44.7  0.0005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.311023 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2796  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  28.3 
 
 
108 aa  44.3  0.0006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.654028  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0845  Rieske 2Fe-2S family protein  33.33 
 
 
103 aa  44.3  0.0006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0586  Rieske 2Fe-2S family protein  28 
 
 
104 aa  44.3  0.0006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1694  Rieske (2Fe-2S) domain protein  27.27 
 
 
105 aa  44.3  0.0006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0361  Plastoquinol--plastocyanin reductase  31.87 
 
 
181 aa  44.3  0.0006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000109538  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1616  Rieske (2Fe-2S) domain protein  32.22 
 
 
101 aa  44.3  0.0006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0526  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  29.25 
 
 
321 aa  43.9  0.0007  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.814974 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2894  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  32.69 
 
 
118 aa  43.9  0.0007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.519291 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3052  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  27.5 
 
 
135 aa  43.9  0.0008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.279296  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2045  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  28.26 
 
 
103 aa  43.5  0.0009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.294291  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6713  putative ferredoxin  31.58 
 
 
96 aa  43.5  0.0009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.491449  normal  0.188584 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07364  beta-1,4-xylosidase (Eurofung)  35.82 
 
 
446 aa  43.5  0.001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2879  nitrite reductase (NAD(P)H)subunit  25.45 
 
 
971 aa  43.1  0.001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1719  plastoquinol--plastocyanin reductase  31.03 
 
 
181 aa  43.1  0.001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00000334249  normal  0.304108 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0161  Rieske (2Fe-2S) domain protein  27.38 
 
 
100 aa  43.5  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000000394797  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3687  Rieske (2Fe-2S) region  26.72 
 
 
129 aa  42.7  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3760  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  26.72 
 
 
129 aa  42.7  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.832483 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3700  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  26.72 
 
 
129 aa  42.7  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1327  Rieske (2Fe-2S) domain protein  29.87 
 
 
106 aa  42.4  0.002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0198751  normal  0.195781 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3228  nitrogen-fixing NifU domain-containing protein  29.11 
 
 
289 aa  42.4  0.002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.769303  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1229  ferredoxin-dependent glutamate synthase  26.25 
 
 
545 aa  42.7  0.002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.610948  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0434  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  30 
 
 
105 aa  42.7  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0329756 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3443  Rieske (2Fe-2S) domain protein  24.68 
 
 
116 aa  42.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.775174 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23360  assimilatory nitrite reductase, small subunit  26 
 
 
108 aa  42.4  0.002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0534419  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0922  methanesulfonate monooxygenase component; iron sulfur protein  28.38 
 
 
242 aa  42  0.003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.738029  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0814  benzene 1,2-dioxygenase, ferredoxin protein  29.29 
 
 
109 aa  42  0.003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1467  Rieske (2Fe-2S) domain protein  25.96 
 
 
107 aa  42  0.003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3163  nitrite reductase [NAD(P)H], small subunit  27.55 
 
 
105 aa  41.6  0.003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.33632  normal  0.290875 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2832  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  25 
 
 
412 aa  41.2  0.004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.000525331  normal  0.958295 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2251  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  27.62 
 
 
104 aa  41.6  0.004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.322428  normal  0.209318 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1282  Rieske (2Fe-2S) domain protein  27.94 
 
 
137 aa  41.6  0.004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.580287  normal  0.705623 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>