181 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mkms_3760 on replicon NC_008705
Organism: Mycobacterium sp. KMS



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008146  Mmcs_3687  Rieske (2Fe-2S) region  100 
 
 
129 aa  266  7e-71  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3760  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  100 
 
 
129 aa  266  7e-71  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.832483 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3700  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  100 
 
 
129 aa  266  7e-71  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4166  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  89.92 
 
 
129 aa  250  6e-66  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2488  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  89.15 
 
 
129 aa  247  4e-65  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.349012 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3222  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  43.97 
 
 
141 aa  103  8e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0490977  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2249  Rieske (2Fe-2S) iron-sulfur domain protein  38.05 
 
 
127 aa  87.4  5e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4263  hypothetical protein  37.74 
 
 
137 aa  85.9  2e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.603078 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4762  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  31.09 
 
 
121 aa  81.6  0.000000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2731  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  37.7 
 
 
133 aa  79  0.00000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.20873  normal  0.962551 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0473  Rieske (2Fe-2S) domain protein  32.14 
 
 
99 aa  74.3  0.0000000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0073046  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0303  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  33.04 
 
 
100 aa  74.3  0.0000000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000392242  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0534  Rieske (2Fe-2S) region  35.83 
 
 
123 aa  73.2  0.000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2821  Rieske (2Fe-2S) domain protein  38.53 
 
 
106 aa  69.3  0.00000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.541392  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3238  Rieske 2Fe-2S family protein  31.25 
 
 
99 aa  68.6  0.00000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00145958  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1018  Rieske (2Fe-2S) region  32.74 
 
 
98 aa  66.2  0.0000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.131503 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6339  Rieske (2Fe-2S) domain protein  31.53 
 
 
125 aa  65.5  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.515952 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0144  Rieske (2Fe-2S) domain protein  31.25 
 
 
100 aa  65.1  0.0000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0845  Rieske 2Fe-2S family protein  32.74 
 
 
103 aa  64.7  0.0000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3347  Rieske (2Fe-2S) oxidoreductase  32.14 
 
 
102 aa  64.7  0.0000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3214  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  37.17 
 
 
137 aa  64.3  0.0000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.18886 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0161  Rieske (2Fe-2S) domain protein  30.36 
 
 
100 aa  63.5  0.0000000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000000394797  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3194  Rieske (2Fe-2S) region  30.36 
 
 
100 aa  63.2  0.000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  6.5117e-17  hitchhiker  4.2038099999999998e-22 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1911  Rieske (2Fe-2S) domain protein  33.02 
 
 
100 aa  63.5  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1996  Rieske (2Fe-2S) domain protein  33.02 
 
 
100 aa  62  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.664018  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7180  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  28.07 
 
 
114 aa  61.6  0.000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.602112 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2708  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  34.51 
 
 
107 aa  60.8  0.000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1967  Rieske (2Fe-2S) region  31.73 
 
 
96 aa  60.5  0.000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0966264  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3232  Rieske (2Fe-2S) region  32.73 
 
 
102 aa  60.1  0.00000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3294  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  32.73 
 
 
102 aa  60.1  0.00000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.11925 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1989  nitrite reductase [NAD(P)H], small subunit  30.77 
 
 
104 aa  59.3  0.00000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3243  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  33.02 
 
 
102 aa  58.2  0.00000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.680425  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2879  nitrite reductase (NAD(P)H)subunit  30.97 
 
 
971 aa  57.4  0.00000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3495  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  33.02 
 
 
100 aa  57.4  0.00000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.65589  normal  0.322661 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1586  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  33.93 
 
 
107 aa  57  0.00000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2292  nitrite reductase [NAD(P)H], small subunit  27.27 
 
 
105 aa  56.2  0.0000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1616  Rieske (2Fe-2S) domain protein  32.99 
 
 
101 aa  56.6  0.0000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3163  nitrite reductase [NAD(P)H], small subunit  27.27 
 
 
105 aa  56.6  0.0000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.33632  normal  0.290875 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4451  nitrite reductase (NAD(P)H), small subunit  26.32 
 
 
111 aa  56.6  0.0000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.468725  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0207  nitrite reductase (NAD(P)H), small subunit  26.79 
 
 
105 aa  56.2  0.0000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1989  nitrite reductase (NAD(P)H), small subunit  27.27 
 
 
104 aa  56.2  0.0000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0940  putative Rieske (2Fe-2S) ferredoxin  33.64 
 
 
114 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2423  nitrite reductase (NAD(P)H), small subunit  31.25 
 
 
104 aa  55.8  0.0000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2471  nitrite reductase (NAD(P)H), small subunit  31.25 
 
 
104 aa  55.8  0.0000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1969  nitrite reductase (NAD(P)H)  26.45 
 
 
105 aa  55.1  0.0000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.595397  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1948  nitrite reductase  26.45 
 
 
105 aa  55.1  0.0000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1161  Rieske (2Fe-2S) domain protein  31.53 
 
 
374 aa  55.5  0.0000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000071782  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2176  nitrite reductase [NAD(P)H], small subunit  26.45 
 
 
105 aa  55.1  0.0000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5395  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  29.63 
 
 
105 aa  55.1  0.0000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.743699 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1996  nitrite reductase  26.45 
 
 
118 aa  54.7  0.0000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0459175  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2145  nitrite reductase [NAD(P)H] small subunit  26.45 
 
 
118 aa  54.7  0.0000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4275  Rieske (2Fe-2S) region  35.24 
 
 
106 aa  54.7  0.0000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1502  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  30.28 
 
 
105 aa  54.7  0.0000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.165892 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1282  Rieske (2Fe-2S) domain protein  32.26 
 
 
137 aa  53.1  0.000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.580287  normal  0.705623 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0720  Rieske (2Fe-2S) region  30.97 
 
 
109 aa  53.1  0.000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.457021  normal  0.579853 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2677  nitrite reductase (NAD(P)H), small subunit  28.57 
 
 
101 aa  53.1  0.000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2151  nitrite reductase [NAD(P)H], small subunit  26.89 
 
 
105 aa  53.1  0.000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.981833  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3012  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  31.13 
 
 
96 aa  53.1  0.000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.123081 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1001  nitrite reductase (NAD(P)H), small subunit  26.27 
 
 
116 aa  52.8  0.000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2672  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  32.22 
 
 
110 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1079  nitrite reductase (NAD(P)H), small subunit  29.2 
 
 
110 aa  53.1  0.000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0175517  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0914  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  33.04 
 
 
518 aa  53.5  0.000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0653376  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3247  Rieske (2Fe-2S) region  32.74 
 
 
114 aa  52  0.000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000000206921  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5347  Rieske (2Fe-2S) domain protein  30.63 
 
 
105 aa  52.4  0.000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.210101  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2967  nitrite reductase (NAD(P)H) large subunit, NirD  29.25 
 
 
114 aa  52.4  0.000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.476557  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3044  nitrite reductase (NAD(P)H) large subunit, NirD  30.7 
 
 
109 aa  52.4  0.000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.109666  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0469  putative nitrogen-fixing NifU, Rieske (2Fe-2S) region  30.09 
 
 
289 aa  52.8  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.483541  normal  0.014762 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1668  assimilatory nitrite reductase [NAD(P)H], small subunit  27.68 
 
 
113 aa  52.4  0.000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0880692  normal  0.298986 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2166  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  27.72 
 
 
123 aa  52  0.000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.112377 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3120  pyruvate oxidase  31.25 
 
 
656 aa  51.6  0.000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.777401  normal  0.194873 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4625  nitrite reductase (NAD(P)H), small subunit  28.18 
 
 
125 aa  51.6  0.000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.817251  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2308  assimilatory nitrite reductase (NAD(P)H) small subunit  28.57 
 
 
110 aa  51.6  0.000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.619497  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3052  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  29.17 
 
 
135 aa  51.6  0.000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.279296  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2315  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  33.33 
 
 
141 aa  51.2  0.000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.791717 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3156  Rieske (2Fe-2S) domain protein  28.57 
 
 
158 aa  50.4  0.000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2815  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  29.67 
 
 
107 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.717991 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3443  Rieske (2Fe-2S) domain protein  24.6 
 
 
116 aa  49.7  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.775174 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2673  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  26.79 
 
 
649 aa  49.7  0.00001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42200  Rieske type ferredoxin  33.93 
 
 
122 aa  49.3  0.00002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.42204  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41540  assimilatory nitrite reductase small subunit  25.89 
 
 
108 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.369116  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2057  nitrite reductase (NAD(P)H), small subunit  29.57 
 
 
117 aa  49.7  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3526  assimilatory nitrite reductase small subunit  25.89 
 
 
108 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5941  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  29.17 
 
 
526 aa  48.9  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0476  nitrogen-fixing NifU domain protein  28.43 
 
 
286 aa  48.9  0.00003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.140105  normal  0.34365 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1694  Rieske (2Fe-2S) domain protein  29.17 
 
 
105 aa  48.1  0.00004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4522  Rieske (2Fe-2S) region  29.35 
 
 
116 aa  48.1  0.00004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2486  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  26.92 
 
 
112 aa  48.1  0.00004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.812063  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1739  Rieske (2Fe-2S) domain protein  27.19 
 
 
101 aa  47.8  0.00005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1452  nitrite reductase (NAD(P)H), small subunit  25.89 
 
 
112 aa  47.8  0.00006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  hitchhiker  0.00226382  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0396  Rieske (2Fe-2S) iron-sulfur domain protein  27.83 
 
 
125 aa  47.4  0.00006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.7121  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5893  nitrite reductase small subunit  27.36 
 
 
111 aa  47  0.00008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0969  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  26.09 
 
 
101 aa  47  0.00009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0535859  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0591  nitrite reductase [NAD(P)H], small subunit  25.71 
 
 
118 aa  46.6  0.0001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4721  Rieske (2Fe-2S) region  28.83 
 
 
104 aa  46.2  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1335  Rieske (2Fe-2S) domain protein  28.12 
 
 
116 aa  46.2  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000656447 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1143  nitrite reductase (NAD(P)H), small subunit  27.93 
 
 
103 aa  46.6  0.0001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0167  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  28.85 
 
 
109 aa  45.4  0.0002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000930652 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2461  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  26.13 
 
 
104 aa  46.2  0.0002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.601158  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3091  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  27.78 
 
 
104 aa  45.4  0.0002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.954428 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0816  benzene/toluene monooxygenase ferredoxin subunit  25.89 
 
 
111 aa  45.8  0.0002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>